MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_021839	AACCAA	2	12	2422937	2422948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931735
55502	NC_021839	GAAA	2	8	2422966	2422973	75 %	0 %	25 %	0 %	525931735
55503	NC_021839	TAC	2	6	2422998	2423003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931735
55504	NC_021839	T	6	6	2423004	2423009	0 %	100 %	0 %	0 %	525931735
55505	NC_021839	AAT	2	6	2423065	2423070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931735
55506	NC_021839	AAG	2	6	2423194	2423199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931735
55507	NC_021839	CAT	2	6	2423217	2423222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931735
55508	NC_021839	GCT	2	6	2423236	2423241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931735
55509	NC_021839	AGTA	2	8	2423256	2423263	50 %	25 %	25 %	0 %	525931735
55510	NC_021839	AAT	2	6	2423292	2423297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931735
55511	NC_021839	TAA	2	6	2423327	2423332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931735
55512	NC_021839	T	6	6	2423351	2423356	0 %	100 %	0 %	0 %	525931735
55513	NC_021839	CGT	2	6	2423409	2423414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931735
55514	NC_021839	TGC	2	6	2423430	2423435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931735
55515	NC_021839	ATC	2	6	2423448	2423453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931735
55516	NC_021839	ATC	2	6	2423458	2423463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931735
55517	NC_021839	AAT	2	6	2423514	2423519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931735
55518	NC_021839	ACT	2	6	2423527	2423532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931735
55519	NC_021839	CTA	2	6	2423542	2423547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931735
55520	NC_021839	CTG	2	6	2423582	2423587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931735
55521	NC_021839	AAT	2	6	2423634	2423639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55522	NC_021839	TAA	2	6	2423647	2423652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55523	NC_021839	A	7	7	2423651	2423657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55524	NC_021839	CAA	2	6	2423661	2423666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55525	NC_021839	CAA	2	6	2423669	2423674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55526	NC_021839	ATT	2	6	2423694	2423699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931736
55527	NC_021839	CA	3	6	2423713	2423718	50 %	0 %	0 %	50 %	525931736
55528	NC_021839	ATTT	2	8	2423727	2423734	25 %	75 %	0 %	0 %	525931736
55529	NC_021839	TGT	2	6	2423762	2423767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931736
55530	NC_021839	ACA	2	6	2423775	2423780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931736
55531	NC_021839	ATT	2	6	2423815	2423820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931736
55532	NC_021839	CAA	2	6	2423832	2423837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931736
55533	NC_021839	TCA	2	6	2423876	2423881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931736
55534	NC_021839	CTC	2	6	2423911	2423916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931736
55535	NC_021839	GC	3	6	2423919	2423924	0 %	0 %	50 %	50 %	525931736
55536	NC_021839	TCTTT	2	10	2423941	2423950	0 %	80 %	0 %	20 %	525931736
55537	NC_021839	TC	3	6	2424006	2424011	0 %	50 %	0 %	50 %	525931736
55538	NC_021839	CAC	2	6	2424052	2424057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931736
55539	NC_021839	TCAA	2	8	2424074	2424081	50 %	25 %	0 %	25 %	525931736
55540	NC_021839	ACAT	2	8	2424116	2424123	50 %	25 %	0 %	25 %	525931736
55541	NC_021839	GCC	2	6	2424125	2424130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931736
55542	NC_021839	TA	3	6	2424160	2424165	50 %	50 %	0 %	0 %	525931736
55543	NC_021839	TTCC	2	8	2424175	2424182	0 %	50 %	0 %	50 %	525931736
55544	NC_021839	AAC	2	6	2424194	2424199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931736
55545	NC_021839	ATC	3	9	2424256	2424264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931736
55546	NC_021839	ATC	2	6	2424266	2424271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931736
55547	NC_021839	AAT	3	9	2424322	2424330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931736
55548	NC_021839	CTT	2	6	2424355	2424360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931736
55549	NC_021839	AAT	2	6	2424456	2424461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931736
55550	NC_021839	TAA	2	6	2424558	2424563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931736
55551	NC_021839	GCT	2	6	2424567	2424572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931736
55552	NC_021839	TCT	2	6	2424573	2424578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931736
55553	NC_021839	A	7	7	2424584	2424590	100 %	0 %	0 %	0 %	525931736
55554	NC_021839	CACCC	2	10	2424591	2424600	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
55555	NC_021839	TTA	2	6	2424607	2424612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55556	NC_021839	TAC	2	6	2424635	2424640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55557	NC_021839	ATA	2	6	2424656	2424661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55558	NC_021839	ATT	2	6	2424668	2424673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55559	NC_021839	A	7	7	2424686	2424692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55560	NC_021839	AT	3	6	2424726	2424731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55561	NC_021839	CGA	2	6	2424759	2424764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55562	NC_021839	CCTT	2	8	2424767	2424774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55563	NC_021839	GCA	2	6	2424809	2424814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55564	NC_021839	A	7	7	2424828	2424834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55565	NC_021839	CAGG	2	8	2424843	2424850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55566	NC_021839	AAT	2	6	2424910	2424915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55567	NC_021839	GTT	2	6	2425046	2425051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55568	NC_021839	CT	3	6	2425061	2425066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55569	NC_021839	AGA	2	6	2425076	2425081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55570	NC_021839	T	6	6	2425110	2425115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55571	NC_021839	TCGA	2	8	2425126	2425133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55572	NC_021839	ATC	2	6	2425190	2425195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55573	NC_021839	GAA	2	6	2425216	2425221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55574	NC_021839	G	6	6	2425241	2425246	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55575	NC_021839	CA	3	6	2425282	2425287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55576	NC_021839	AAC	2	6	2425314	2425319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55577	NC_021839	GT	3	6	2425333	2425338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55578	NC_021839	CTC	2	6	2425368	2425373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55579	NC_021839	ACG	2	6	2425417	2425422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55580	NC_021839	CGA	2	6	2425497	2425502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55581	NC_021839	ACC	2	6	2425612	2425617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55582	NC_021839	TCCA	2	8	2425704	2425711	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55583	NC_021839	AGG	2	6	2425748	2425753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55584	NC_021839	GTA	2	6	2425836	2425841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55585	NC_021839	CCA	2	6	2425844	2425849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55586	NC_021839	CCT	2	6	2425853	2425858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55587	NC_021839	CCTA	2	8	2425888	2425895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55588	NC_021839	TC	3	6	2426008	2426013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55589	NC_021839	GCC	2	6	2426105	2426110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55590	NC_021839	CTC	2	6	2426153	2426158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55591	NC_021839	CT	3	6	2426263	2426268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55592	NC_021839	TC	3	6	2426343	2426348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55593	NC_021839	TC	3	6	2426363	2426368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55594	NC_021839	TAC	2	6	2426403	2426408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55595	NC_021839	TTCC	2	8	2426462	2426469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55596	NC_021839	CACT	2	8	2426516	2426523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55597	NC_021839	TGT	2	6	2426615	2426620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55598	NC_021839	CGCCTA	2	12	2426625	2426636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55599	NC_021839	CTT	2	6	2426723	2426728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55600	NC_021839	CCA	2	6	2426765	2426770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55601	NC_021839	TGG	2	6	2426920	2426925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55602	NC_021839	AT	3	6	2426984	2426989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55603	NC_021839	TGG	2	6	2427004	2427009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55604	NC_021839	GA	3	6	2427184	2427189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55605	NC_021839	CGTG	2	8	2427255	2427262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55606	NC_021839	AGTA	2	8	2427276	2427283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55607	NC_021839	TTACC	2	10	2427284	2427293	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55608	NC_021839	CAA	2	6	2427403	2427408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55609	NC_021839	ACT	2	6	2427467	2427472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55610	NC_021839	TCC	2	6	2427588	2427593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55611	NC_021839	CCG	2	6	2427620	2427625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55612	NC_021839	CTTT	2	8	2427715	2427722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55613	NC_021839	AAG	2	6	2427754	2427759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55614	NC_021839	CTT	2	6	2427764	2427769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55615	NC_021839	TCGC	2	8	2427789	2427796	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55616	NC_021839	TCC	2	6	2427828	2427833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55617	NC_021839	CTT	2	6	2427992	2427997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55618	NC_021839	GTT	2	6	2428068	2428073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55619	NC_021839	GAT	2	6	2428095	2428100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55620	NC_021839	GAT	2	6	2428131	2428136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55621	NC_021839	TGG	2	6	2428218	2428223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55622	NC_021839	CCT	2	6	2428248	2428253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55623	NC_021839	ATT	2	6	2428307	2428312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55624	NC_021839	AGAA	2	8	2428328	2428335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55625	NC_021839	AG	3	6	2428477	2428482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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55993	NC_021839	AGA	2	6	2443884	2443889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55994	NC_021839	AATC	2	8	2443901	2443908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55995	NC_021839	TAG	2	6	2443924	2443929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55996	NC_021839	ATGCT	2	10	2443980	2443989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55997	NC_021839	A	6	6	2444003	2444008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55998	NC_021839	AGT	2	6	2444024	2444029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55999	NC_021839	AACT	2	8	2444117	2444124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56000	NC_021839	GAA	2	6	2444152	2444157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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