MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_021839	TCT	2	6	2311852	2311857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931631
53002	NC_021839	TGT	2	6	2311918	2311923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931631
53003	NC_021839	GC	3	6	2311924	2311929	0 %	0 %	50 %	50 %	525931631
53004	NC_021839	ACG	2	6	2311938	2311943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931631
53005	NC_021839	CTT	2	6	2311988	2311993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931631
53006	NC_021839	CCG	2	6	2312008	2312013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931631
53007	NC_021839	GAA	2	6	2312040	2312045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931631
53008	NC_021839	CGC	2	6	2312075	2312080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931631
53009	NC_021839	CTT	2	6	2312093	2312098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931631
53010	NC_021839	AAT	3	9	2312139	2312147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931631
53011	NC_021839	CTT	2	6	2312210	2312215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931631
53012	NC_021839	CCG	2	6	2312344	2312349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931631
53013	NC_021839	TA	3	6	2312396	2312401	50 %	50 %	0 %	0 %	525931631
53014	NC_021839	AGC	2	6	2312403	2312408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931631
53015	NC_021839	AAT	3	9	2312433	2312441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931631
53016	NC_021839	CAT	2	6	2312444	2312449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931631
53017	NC_021839	T	6	6	2312453	2312458	0 %	100 %	0 %	0 %	525931631
53018	NC_021839	CTC	2	6	2312482	2312487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53019	NC_021839	TAC	2	6	2312588	2312593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931632
53020	NC_021839	TTC	2	6	2312601	2312606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931632
53021	NC_021839	TA	3	6	2312732	2312737	50 %	50 %	0 %	0 %	525931632
53022	NC_021839	TTC	2	6	2312748	2312753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931632
53023	NC_021839	ATC	2	6	2312785	2312790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931632
53024	NC_021839	AAT	2	6	2312837	2312842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931632
53025	NC_021839	AAT	2	6	2312905	2312910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931632
53026	NC_021839	ATC	2	6	2312970	2312975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931632
53027	NC_021839	ATA	2	6	2313117	2313122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931632
53028	NC_021839	ATA	3	9	2313141	2313149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931632
53029	NC_021839	TAC	2	6	2313152	2313157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931632
53030	NC_021839	ATC	2	6	2313195	2313200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931632
53031	NC_021839	CAT	2	6	2313219	2313224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931632
53032	NC_021839	ATG	2	6	2313252	2313257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931632
53033	NC_021839	ATAA	3	12	2313333	2313344	75 %	25 %	0 %	0 %	525931632
53034	NC_021839	ATA	2	6	2313380	2313385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931632
53035	NC_021839	CTT	3	9	2313410	2313418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931632
53036	NC_021839	AGCGA	2	10	2313436	2313445	40 %	0 %	40 %	20 %	525931632
53037	NC_021839	TCA	2	6	2313478	2313483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931632
53038	NC_021839	AGC	2	6	2313507	2313512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931632
53039	NC_021839	TCT	3	9	2313520	2313528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931632
53040	NC_021839	T	6	6	2313549	2313554	0 %	100 %	0 %	0 %	525931632
53041	NC_021839	AGAAT	2	10	2313558	2313567	60 %	20 %	20 %	0 %	525931632
53042	NC_021839	TCT	2	6	2313619	2313624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931632
53043	NC_021839	ATT	2	6	2313738	2313743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931632
53044	NC_021839	AATAA	2	10	2313747	2313756	80 %	20 %	0 %	0 %	525931632
53045	NC_021839	CTT	2	6	2313917	2313922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931632
53046	NC_021839	T	7	7	2314007	2314013	0 %	100 %	0 %	0 %	525931632
53047	NC_021839	A	7	7	2314090	2314096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53048	NC_021839	TAT	2	6	2314134	2314139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931633
53049	NC_021839	CAG	2	6	2314196	2314201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931633
53050	NC_021839	GAA	2	6	2314235	2314240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931633
53051	NC_021839	TG	3	6	2314332	2314337	0 %	50 %	50 %	0 %	525931633
53052	NC_021839	AAT	2	6	2314344	2314349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931633
53053	NC_021839	A	6	6	2314380	2314385	100 %	0 %	0 %	0 %	525931633
53054	NC_021839	TCT	2	6	2314418	2314423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931633
53055	NC_021839	TTCCA	2	10	2314431	2314440	20 %	40 %	0 %	40 %	525931633
53056	NC_021839	A	7	7	2314482	2314488	100 %	0 %	0 %	0 %	525931633
53057	NC_021839	TTC	2	6	2314513	2314518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931633
53058	NC_021839	ATC	2	6	2314572	2314577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931633
53059	NC_021839	GCC	2	6	2314598	2314603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931633
53060	NC_021839	T	6	6	2314649	2314654	0 %	100 %	0 %	0 %	525931634
53061	NC_021839	T	6	6	2314738	2314743	0 %	100 %	0 %	0 %	525931634
53062	NC_021839	CTT	3	9	2314784	2314792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931634
53063	NC_021839	TAA	2	6	2314803	2314808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931634
53064	NC_021839	CAC	2	6	2314872	2314877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931634
53065	NC_021839	TCG	2	6	2314937	2314942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931634
53066	NC_021839	TCT	2	6	2314963	2314968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931634
53067	NC_021839	CAT	2	6	2315000	2315005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931634
53068	NC_021839	ATC	2	6	2315019	2315024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931634
53069	NC_021839	ATG	2	6	2315025	2315030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931634
53070	NC_021839	GC	3	6	2315056	2315061	0 %	0 %	50 %	50 %	525931634
53071	NC_021839	ATTT	2	8	2315082	2315089	25 %	75 %	0 %	0 %	525931634
53072	NC_021839	AAG	2	6	2315108	2315113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931634
53073	NC_021839	CT	3	6	2315136	2315141	0 %	50 %	0 %	50 %	525931634
53074	NC_021839	ATTC	2	8	2315201	2315208	25 %	50 %	0 %	25 %	525931634
53075	NC_021839	ACA	2	6	2315237	2315242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931634
53076	NC_021839	GTA	2	6	2315245	2315250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931634
53077	NC_021839	TTC	2	6	2315268	2315273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53078	NC_021839	T	6	6	2315304	2315309	0 %	100 %	0 %	0 %	525931635
53079	NC_021839	ACT	2	6	2315321	2315326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931635
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53082	NC_021839	ACG	2	6	2315371	2315376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931635
53083	NC_021839	ATAA	2	8	2315377	2315384	75 %	25 %	0 %	0 %	525931635
53084	NC_021839	AAG	2	6	2315407	2315412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931635
53085	NC_021839	C	6	6	2315442	2315447	0 %	0 %	0 %	100 %	525931635
53086	NC_021839	AAC	2	6	2315519	2315524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931635
53087	NC_021839	ACG	2	6	2315530	2315535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931635
53088	NC_021839	CGA	2	6	2315546	2315551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931635
53089	NC_021839	TAAT	2	8	2315553	2315560	50 %	50 %	0 %	0 %	525931635
53090	NC_021839	ATA	2	6	2315614	2315619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931635
53091	NC_021839	ATA	2	6	2315645	2315650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931635
53092	NC_021839	GTT	2	6	2315687	2315692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931635
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53097	NC_021839	ATT	2	6	2315896	2315901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931635
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53101	NC_021839	ACA	2	6	2316047	2316052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931635
53102	NC_021839	AAT	2	6	2316061	2316066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931635
53103	NC_021839	TAC	2	6	2316090	2316095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931635
53104	NC_021839	TATT	2	8	2316220	2316227	25 %	75 %	0 %	0 %	525931636
53105	NC_021839	TCAT	2	8	2316231	2316238	25 %	50 %	0 %	25 %	525931636
53106	NC_021839	CTG	2	6	2316240	2316245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931636
53107	NC_021839	ATT	2	6	2316260	2316265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931636
53108	NC_021839	AAT	2	6	2316338	2316343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931636
53109	NC_021839	T	7	7	2316487	2316493	0 %	100 %	0 %	0 %	525931636
53110	NC_021839	GAAC	2	8	2316498	2316505	50 %	0 %	25 %	25 %	525931636
53111	NC_021839	CATTA	2	10	2316527	2316536	40 %	40 %	0 %	20 %	525931636
53112	NC_021839	AAT	2	6	2316572	2316577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931636
53113	NC_021839	GAA	2	6	2316585	2316590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931636
53114	NC_021839	ATC	2	6	2316632	2316637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931636
53115	NC_021839	AC	3	6	2316715	2316720	50 %	0 %	0 %	50 %	525931636
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53117	NC_021839	CTT	2	6	2316850	2316855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931636
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53319	NC_021839	TA	3	6	2325777	2325782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53344	NC_021839	AATA	2	8	2326939	2326946	75 %	25 %	0 %	0 %	525931644
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53350	NC_021839	TAA	2	6	2327068	2327073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931644
53351	NC_021839	TTC	2	6	2327100	2327105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931644
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53353	NC_021839	TTAC	2	8	2327133	2327140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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53472	NC_021839	GCT	2	6	2332720	2332725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931650
53473	NC_021839	CTG	2	6	2332757	2332762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931650
53474	NC_021839	CTT	2	6	2332778	2332783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931650
53475	NC_021839	TTG	2	6	2332793	2332798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931650
53476	NC_021839	TGA	2	6	2332815	2332820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931650
53477	NC_021839	CTG	2	6	2332822	2332827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931650
53478	NC_021839	TGC	2	6	2332839	2332844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931650
53479	NC_021839	CTG	2	6	2332859	2332864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931650
53480	NC_021839	CTA	2	6	2332874	2332879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931650
53481	NC_021839	CTT	2	6	2332890	2332895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931650
53482	NC_021839	T	7	7	2332920	2332926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53483	NC_021839	GGT	2	6	2332971	2332976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53484	NC_021839	GT	3	6	2332975	2332980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53485	NC_021839	T	6	6	2333012	2333017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53486	NC_021839	T	6	6	2333033	2333038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53487	NC_021839	ATT	2	6	2333073	2333078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53488	NC_021839	TTTC	2	8	2333091	2333098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53489	NC_021839	TAAA	2	8	2333100	2333107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53490	NC_021839	T	7	7	2333163	2333169	0 %	100 %	0 %	0 %	525931651
53491	NC_021839	CTT	3	9	2333198	2333206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931651
53492	NC_021839	CAC	2	6	2333228	2333233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931651
53493	NC_021839	AGTCCA	2	12	2333263	2333274	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525931651
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53495	NC_021839	CTG	2	6	2333290	2333295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931651
53496	NC_021839	TAT	2	6	2333379	2333384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931651
53497	NC_021839	T	6	6	2333522	2333527	0 %	100 %	0 %	0 %	525931651
53498	NC_021839	T	7	7	2333548	2333554	0 %	100 %	0 %	0 %	525931651
53499	NC_021839	CGTCAA	2	12	2333600	2333611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525931651
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