MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021827	ATT	2	6	174651	174656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896925
4003	NC_021827	TGT	2	6	174665	174670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896925
4004	NC_021827	TCT	2	6	174691	174696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896925
4005	NC_021827	CTT	2	6	174725	174730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896925
4006	NC_021827	GTT	2	6	174736	174741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896925
4007	NC_021827	AAT	2	6	174765	174770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896925
4008	NC_021827	GCT	2	6	174799	174804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896925
4009	NC_021827	T	6	6	174806	174811	0 %	100 %	0 %	0 %	525896925
4010	NC_021827	ATC	2	6	174931	174936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896925
4011	NC_021827	AAC	2	6	174984	174989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896925
4012	NC_021827	ATC	2	6	175005	175010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896925
4013	NC_021827	TG	3	6	175106	175111	0 %	50 %	50 %	0 %	525896925
4014	NC_021827	T	6	6	175112	175117	0 %	100 %	0 %	0 %	525896925
4015	NC_021827	TAT	2	6	175121	175126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896925
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4017	NC_021827	TTCA	2	8	175231	175238	25 %	50 %	0 %	25 %	525896925
4018	NC_021827	T	6	6	175259	175264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021827	A	6	6	175316	175321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021827	TGTA	2	8	175356	175363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021827	TTG	2	6	175375	175380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021827	GTT	2	6	175407	175412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896926
4023	NC_021827	TCT	2	6	175440	175445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896926
4024	NC_021827	ATC	2	6	175516	175521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896926
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4027	NC_021827	TTA	2	6	175693	175698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021827	ATA	2	6	175792	175797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899327
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4030	NC_021827	A	6	6	175885	175890	100 %	0 %	0 %	0 %	525899327
4031	NC_021827	TAT	2	6	175913	175918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899327
4032	NC_021827	A	6	6	175930	175935	100 %	0 %	0 %	0 %	525899327
4033	NC_021827	ATTT	2	8	175970	175977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021827	GGC	2	6	176090	176095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896927
4035	NC_021827	ATC	2	6	176109	176114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896927
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4037	NC_021827	AGT	2	6	176281	176286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896927
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4040	NC_021827	GAC	2	6	176366	176371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896927
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4042	NC_021827	CAA	2	6	176486	176491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896927
4043	NC_021827	TGAT	2	8	176494	176501	25 %	50 %	25 %	0 %	525896927
4044	NC_021827	CCA	2	6	176536	176541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896927
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4053	NC_021827	TAA	2	6	176820	176825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
4054	NC_021827	AAT	2	6	176829	176834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
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4057	NC_021827	TTTG	2	8	176901	176908	0 %	75 %	25 %	0 %	525896927
4058	NC_021827	TTC	2	6	176919	176924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896927
4059	NC_021827	TCA	2	6	176932	176937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896927
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4062	NC_021827	T	6	6	177080	177085	0 %	100 %	0 %	0 %	525896927
4063	NC_021827	GAAA	2	8	177202	177209	75 %	0 %	25 %	0 %	525896927
4064	NC_021827	CTA	2	6	177251	177256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896927
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4068	NC_021827	ATAAA	2	10	177473	177482	80 %	20 %	0 %	0 %	525899328
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4072	NC_021827	CAT	2	6	177655	177660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
4073	NC_021827	CAT	2	6	177752	177757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
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4077	NC_021827	TTCA	2	8	177983	177990	25 %	50 %	0 %	25 %	525896928
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4080	NC_021827	ATC	2	6	178067	178072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
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4082	NC_021827	TTCC	2	8	178114	178121	0 %	50 %	0 %	50 %	525896928
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4098	NC_021827	T	6	6	179041	179046	0 %	100 %	0 %	0 %	525896929
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4105	NC_021827	ATT	2	6	179231	179236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896929
4106	NC_021827	A	6	6	179265	179270	100 %	0 %	0 %	0 %	525896929
4107	NC_021827	T	6	6	179309	179314	0 %	100 %	0 %	0 %	525896929
4108	NC_021827	ACCTTT	2	12	179315	179326	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525896929
4109	NC_021827	TAAT	2	8	179391	179398	50 %	50 %	0 %	0 %	525896930
4110	NC_021827	TTCTGC	2	12	179404	179415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525896930
4111	NC_021827	TG	3	6	179435	179440	0 %	50 %	50 %	0 %	525896930
4112	NC_021827	TAA	2	6	179550	179555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896930
4113	NC_021827	GCC	2	6	179597	179602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896930
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4117	NC_021827	CGC	2	6	179779	179784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896930
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4123	NC_021827	TTA	2	6	180035	180040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896930
4124	NC_021827	CAA	2	6	180066	180071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896930
4125	NC_021827	TTC	2	6	180148	180153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896930
4126	NC_021827	TCAT	2	8	180158	180165	25 %	50 %	0 %	25 %	525896930
4127	NC_021827	TCAT	2	8	180224	180231	25 %	50 %	0 %	25 %	525896930
4128	NC_021827	CCG	2	6	180446	180451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896930
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4130	NC_021827	AATCA	2	10	180499	180508	60 %	20 %	0 %	20 %	525896930
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4132	NC_021827	TCC	2	6	180623	180628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896930
4133	NC_021827	AAAT	2	8	180668	180675	75 %	25 %	0 %	0 %	525896930
4134	NC_021827	ATT	2	6	180718	180723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896930
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4151	NC_021827	T	7	7	181346	181352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_021827	CATAA	2	10	181386	181395	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4153	NC_021827	TAAC	2	8	181399	181406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4154	NC_021827	TCA	2	6	181410	181415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_021827	TAT	2	6	181417	181422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_021827	TCA	2	6	181443	181448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_021827	A	7	7	181470	181476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_021827	TAAT	2	8	181513	181520	50 %	50 %	0 %	0 %	525896931
4159	NC_021827	GAT	2	6	181524	181529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896931
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4163	NC_021827	AAT	2	6	181766	181771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896931
4164	NC_021827	CTT	2	6	181772	181777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896931
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4229	NC_021827	A	6	6	184482	184487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_021827	T	6	6	184503	184508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_021827	TAAG	2	8	184584	184591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_021827	A	6	6	184602	184607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_021827	TTA	2	6	184647	184652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896935
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4235	NC_021827	TTA	2	6	184714	184719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896935
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4238	NC_021827	CTAAG	2	10	184844	184853	40 %	20 %	20 %	20 %	525896935
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4242	NC_021827	ATTTC	2	10	184943	184952	20 %	60 %	0 %	20 %	525896935
4243	NC_021827	TTTTG	2	10	185093	185102	0 %	80 %	20 %	0 %	525896935
4244	NC_021827	TGA	2	6	185112	185117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896935
4245	NC_021827	ATT	2	6	185124	185129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896935
4246	NC_021827	CTA	2	6	185140	185145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896935
4247	NC_021827	TGC	2	6	185156	185161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896935
4248	NC_021827	TAT	2	6	185162	185167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896935
4249	NC_021827	TGA	2	6	185169	185174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896935
4250	NC_021827	ATC	2	6	185184	185189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896935
4251	NC_021827	CTA	2	6	185216	185221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896935
4252	NC_021827	ATA	2	6	185222	185227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896935
4253	NC_021827	T	7	7	185281	185287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_021827	TA	3	6	185293	185298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_021827	AATA	2	8	185310	185317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_021827	CTTC	2	8	185325	185332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_021827	A	6	6	185372	185377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_021827	ATTT	2	8	185412	185419	25 %	75 %	0 %	0 %	525896936
4259	NC_021827	TTC	2	6	185420	185425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896936
4260	NC_021827	CAA	2	6	185428	185433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896936
4261	NC_021827	GTA	2	6	185437	185442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896936
4262	NC_021827	ACG	2	6	185513	185518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896936
4263	NC_021827	T	6	6	185549	185554	0 %	100 %	0 %	0 %	525896936
4264	NC_021827	AAG	2	6	185555	185560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896936
4265	NC_021827	AAGTA	2	10	185599	185608	60 %	20 %	20 %	0 %	525896936
4266	NC_021827	T	6	6	185615	185620	0 %	100 %	0 %	0 %	525896936
4267	NC_021827	TCC	2	6	185642	185647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896936
4268	NC_021827	TCC	2	6	185661	185666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4269	NC_021827	TCA	2	6	185713	185718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896937
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4271	NC_021827	ATTTTG	2	12	185775	185786	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525896937
4272	NC_021827	TTG	2	6	185790	185795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896937
4273	NC_021827	TAT	2	6	185855	185860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896937
4274	NC_021827	ATT	2	6	185862	185867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896937
4275	NC_021827	GTT	2	6	185868	185873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896937
4276	NC_021827	CCGCCA	2	12	185896	185907	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525896937
4277	NC_021827	CT	3	6	185938	185943	0 %	50 %	0 %	50 %	525896937
4278	NC_021827	CGT	2	6	185975	185980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896937
4279	NC_021827	CGCC	2	8	186017	186024	0 %	0 %	25 %	75 %	525896937
4280	NC_021827	TTC	2	6	186034	186039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896937
4281	NC_021827	ACA	2	6	186076	186081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896937
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4284	NC_021827	TAC	2	6	186216	186221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896937
4285	NC_021827	TCA	2	6	186227	186232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896937
4286	NC_021827	CCT	2	6	186244	186249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4287	NC_021827	TGAA	2	8	186278	186285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_021827	CTT	3	9	186294	186302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896938
4289	NC_021827	ATC	2	6	186325	186330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896938
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4292	NC_021827	T	6	6	186520	186525	0 %	100 %	0 %	0 %	525896938
4293	NC_021827	TCT	2	6	186530	186535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896938
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4296	NC_021827	CCT	2	6	186593	186598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4297	NC_021827	ACCAT	2	10	186631	186640	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4298	NC_021827	AAT	2	6	186695	186700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4299	NC_021827	CTAA	2	8	186737	186744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4300	NC_021827	C	6	6	186906	186911	0 %	0 %	0 %	100 %	525896939
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4305	NC_021827	TA	3	6	187195	187200	50 %	50 %	0 %	0 %	525896939
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4324	NC_021827	GA	3	6	188137	188142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4325	NC_021827	A	7	7	188156	188162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4326	NC_021827	ATT	2	6	188171	188176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896940
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4328	NC_021827	TAC	2	6	188253	188258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896940
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4333	NC_021827	TTTA	2	8	188496	188503	25 %	75 %	0 %	0 %	525896940
4334	NC_021827	TCT	2	6	188524	188529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896940
4335	NC_021827	CTG	2	6	188585	188590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896940
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4340	NC_021827	AAAAT	2	10	188797	188806	80 %	20 %	0 %	0 %	525896940
4341	NC_021827	TAA	2	6	188819	188824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896940
4342	NC_021827	CCA	2	6	188828	188833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896940
4343	NC_021827	CACT	2	8	188836	188843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4344	NC_021827	CTTTT	2	10	188846	188855	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4345	NC_021827	T	7	7	188852	188858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4346	NC_021827	CAAGT	2	10	188882	188891	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4347	NC_021827	TTAT	2	8	188914	188921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4348	NC_021827	ACT	2	6	188941	188946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899329
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4354	NC_021827	ATGTC	2	10	189167	189176	20 %	40 %	20 %	20 %	525899329
4355	NC_021827	CGTA	2	8	189180	189187	25 %	25 %	25 %	25 %	525899329
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4359	NC_021827	T	6	6	189361	189366	0 %	100 %	0 %	0 %	525899329
4360	NC_021827	AAT	2	6	189412	189417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899329
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4362	NC_021827	TGT	2	6	189511	189516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899329
4363	NC_021827	A	6	6	189560	189565	100 %	0 %	0 %	0 %	525899329
4364	NC_021827	GTT	3	9	189566	189574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899329
4365	NC_021827	TTAA	2	8	189617	189624	50 %	50 %	0 %	0 %	525899329
4366	NC_021827	CCG	2	6	189786	189791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525899330
4367	NC_021827	ATCTTT	2	12	189866	189877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525899330
4368	NC_021827	ATC	2	6	189881	189886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899330
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4370	NC_021827	AGC	2	6	189938	189943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899330
4371	NC_021827	CT	3	6	189999	190004	0 %	50 %	0 %	50 %	525899330
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4373	NC_021827	TAT	2	6	190046	190051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899330
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4498	NC_021827	TTG	2	6	194931	194936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896941
4499	NC_021827	T	6	6	195005	195010	0 %	100 %	0 %	0 %	525896941
4500	NC_021827	TAA	2	6	195087	195092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896941

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