MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_021827	GCT	2	6	2539145	2539150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898983
58002	NC_021827	TGC	2	6	2539153	2539158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898983
58003	NC_021827	CCA	2	6	2539319	2539324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525898983
58004	NC_021827	CAT	2	6	2539329	2539334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898983
58005	NC_021827	GTT	2	6	2539361	2539366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898983
58006	NC_021827	CAA	2	6	2539386	2539391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898983
58007	NC_021827	CTT	2	6	2539407	2539412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898983
58008	NC_021827	AGTC	2	8	2539428	2539435	25 %	25 %	25 %	25 %	525898983
58009	NC_021827	TTC	2	6	2539492	2539497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898983
58010	NC_021827	TCT	3	9	2539538	2539546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898983
58011	NC_021827	CATC	2	8	2539548	2539555	25 %	25 %	0 %	50 %	525898983
58012	NC_021827	CCG	2	6	2539572	2539577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525898983
58013	NC_021827	ATG	2	6	2539595	2539600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898983
58014	NC_021827	AAT	2	6	2539637	2539642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898983
58015	NC_021827	ACC	2	6	2539705	2539710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525898983
58016	NC_021827	CA	3	6	2539714	2539719	50 %	0 %	0 %	50 %	525898983
58017	NC_021827	CAA	2	6	2539743	2539748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898983
58018	NC_021827	CAT	2	6	2539762	2539767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898983
58019	NC_021827	AAAT	2	8	2539776	2539783	75 %	25 %	0 %	0 %	525898983
58020	NC_021827	T	6	6	2539789	2539794	0 %	100 %	0 %	0 %	525898983
58021	NC_021827	GCT	2	6	2539796	2539801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898983
58022	NC_021827	AAT	2	6	2539806	2539811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898983
58023	NC_021827	TCA	2	6	2539823	2539828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898983
58024	NC_021827	TTTTC	2	10	2539842	2539851	0 %	80 %	0 %	20 %	525898983
58025	NC_021827	TAA	2	6	2539866	2539871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898983
58026	NC_021827	GTT	2	6	2539926	2539931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898983
58027	NC_021827	AAT	2	6	2539963	2539968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898983
58028	NC_021827	ATA	2	6	2539979	2539984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898983
58029	NC_021827	CAT	2	6	2540038	2540043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898983
58030	NC_021827	TTG	2	6	2540095	2540100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898983
58031	NC_021827	ATA	2	6	2540170	2540175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898983
58032	NC_021827	TGAA	2	8	2540264	2540271	50 %	25 %	25 %	0 %	525898983
58033	NC_021827	AT	3	6	2540316	2540321	50 %	50 %	0 %	0 %	525898983
58034	NC_021827	GTT	2	6	2540378	2540383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898983
58035	NC_021827	ACG	2	6	2540447	2540452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525898983
58036	NC_021827	AAG	2	6	2540485	2540490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898983
58037	NC_021827	GTTT	2	8	2540501	2540508	0 %	75 %	25 %	0 %	525898983
58038	NC_021827	TTTGG	2	10	2540516	2540525	0 %	60 %	40 %	0 %	525898983
58039	NC_021827	CCA	2	6	2540546	2540551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525898983
58040	NC_021827	CCTGGA	2	12	2540552	2540563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525898983
58041	NC_021827	TCC	2	6	2540578	2540583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525898984
58042	NC_021827	TTTC	2	8	2540627	2540634	0 %	75 %	0 %	25 %	525898984
58043	NC_021827	TTC	2	6	2540637	2540642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898984
58044	NC_021827	TTCA	2	8	2540670	2540677	25 %	50 %	0 %	25 %	525898984
58045	NC_021827	ACA	2	6	2540701	2540706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898984
58046	NC_021827	GTT	2	6	2540746	2540751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898984
58047	NC_021827	ATC	2	6	2540811	2540816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
58048	NC_021827	GTT	2	6	2540867	2540872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898984
58049	NC_021827	TCC	2	6	2540877	2540882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525898984
58050	NC_021827	GTT	2	6	2540889	2540894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898984
58051	NC_021827	TGC	2	6	2540970	2540975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898984
58052	NC_021827	TCG	2	6	2540986	2540991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898984
58053	NC_021827	TCT	2	6	2540998	2541003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898984
58054	NC_021827	T	6	6	2541071	2541076	0 %	100 %	0 %	0 %	525898984
58055	NC_021827	CACG	2	8	2541101	2541108	25 %	0 %	25 %	50 %	525898984
58056	NC_021827	ACA	2	6	2541127	2541132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898984
58057	NC_021827	CAT	2	6	2541143	2541148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
58058	NC_021827	GAT	2	6	2541201	2541206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898984
58059	NC_021827	AAAG	2	8	2541295	2541302	75 %	0 %	25 %	0 %	525898984
58060	NC_021827	TGG	2	6	2541309	2541314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525898984
58061	NC_021827	CAG	2	6	2541383	2541388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525898984
58062	NC_021827	ATA	2	6	2541409	2541414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898984
58063	NC_021827	CAG	2	6	2541419	2541424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525898984
58064	NC_021827	CAT	2	6	2541429	2541434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
58065	NC_021827	CAT	2	6	2541441	2541446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
58066	NC_021827	AAGTT	2	10	2541542	2541551	40 %	40 %	20 %	0 %	525898984
58067	NC_021827	CAT	2	6	2541561	2541566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
58068	NC_021827	GTA	2	6	2541610	2541615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898984
58069	NC_021827	CTT	2	6	2541632	2541637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898984
58070	NC_021827	ACT	2	6	2541781	2541786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
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58072	NC_021827	AAC	2	6	2541807	2541812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898984
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58074	NC_021827	CCG	2	6	2541862	2541867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525898984
58075	NC_021827	CAT	3	9	2541900	2541908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
58076	NC_021827	AAC	2	6	2541930	2541935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898984
58077	NC_021827	GAA	2	6	2541961	2541966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898984
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58079	NC_021827	TAAA	2	8	2542197	2542204	75 %	25 %	0 %	0 %	525898984
58080	NC_021827	TCA	2	6	2542277	2542282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
58081	NC_021827	TCA	2	6	2542286	2542291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898984
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58083	NC_021827	T	6	6	2542366	2542371	0 %	100 %	0 %	0 %	525898985
58084	NC_021827	T	6	6	2542434	2542439	0 %	100 %	0 %	0 %	525898985
58085	NC_021827	TCT	2	6	2542490	2542495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898985
58086	NC_021827	TTCC	2	8	2542524	2542531	0 %	50 %	0 %	50 %	525898985
58087	NC_021827	ATAAA	2	10	2542632	2542641	80 %	20 %	0 %	0 %	525898985
58088	NC_021827	CTT	2	6	2542769	2542774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898985
58089	NC_021827	CAT	2	6	2542777	2542782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898985
58090	NC_021827	CTAA	2	8	2542796	2542803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58091	NC_021827	AGGG	2	8	2542913	2542920	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58092	NC_021827	GCTT	2	8	2542968	2542975	0 %	50 %	25 %	25 %	525898986
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58098	NC_021827	TGA	2	6	2543231	2543236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898986
58099	NC_021827	TAT	2	6	2543238	2543243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898986
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58101	NC_021827	TGT	2	6	2543442	2543447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898986
58102	NC_021827	CTG	2	6	2543519	2543524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898986
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58105	NC_021827	AT	3	6	2543571	2543576	50 %	50 %	0 %	0 %	525898986
58106	NC_021827	A	6	6	2543596	2543601	100 %	0 %	0 %	0 %	525898986
58107	NC_021827	A	6	6	2543617	2543622	100 %	0 %	0 %	0 %	525898986
58108	NC_021827	CTG	2	6	2543657	2543662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898986
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58111	NC_021827	ATT	2	6	2543812	2543817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898986
58112	NC_021827	CG	3	6	2543824	2543829	0 %	0 %	50 %	50 %	525898986
58113	NC_021827	TTGGT	2	10	2543885	2543894	0 %	60 %	40 %	0 %	525898986
58114	NC_021827	TTTA	2	8	2543949	2543956	25 %	75 %	0 %	0 %	525898986
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