MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 67388

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52121	NC_021827	CAG	2	6	2282324	2282329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899578
52122	NC_021827	CAC	2	6	2282346	2282351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525899578
52123	NC_021827	GATG	2	8	2282407	2282414	25 %	25 %	50 %	0 %	525899578
52124	NC_021827	ATA	2	6	2282460	2282465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899578
52125	NC_021827	TTC	2	6	2282529	2282534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899578
52126	NC_021827	AGC	2	6	2282556	2282561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899578
52127	NC_021827	TCT	2	6	2282563	2282568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899578
52128	NC_021827	TTG	2	6	2282616	2282621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899578
52129	NC_021827	TCA	2	6	2282638	2282643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899578
52130	NC_021827	AG	3	6	2282709	2282714	50 %	0 %	50 %	0 %	525899578
52131	NC_021827	GCT	2	6	2282779	2282784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899578
52132	NC_021827	GAAG	2	8	2282785	2282792	50 %	0 %	50 %	0 %	525899578
52133	NC_021827	AT	3	6	2282803	2282808	50 %	50 %	0 %	0 %	525899578
52134	NC_021827	TTG	2	6	2282857	2282862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899578
52135	NC_021827	TTC	2	6	2282895	2282900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899578
52136	NC_021827	TCC	2	6	2282925	2282930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52137	NC_021827	TAA	2	6	2282985	2282990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52138	NC_021827	A	6	6	2283072	2283077	100 %	0 %	0 %	0 %	525898757
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52140	NC_021827	TA	3	6	2283090	2283095	50 %	50 %	0 %	0 %	525898757
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52144	NC_021827	ATT	2	6	2283275	2283280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898757
52145	NC_021827	TCC	2	6	2283309	2283314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525898757
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52147	NC_021827	T	6	6	2283351	2283356	0 %	100 %	0 %	0 %	525898757
52148	NC_021827	AAG	2	6	2283423	2283428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898757
52149	NC_021827	ATT	2	6	2283459	2283464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898757
52150	NC_021827	GAT	2	6	2283472	2283477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898757
52151	NC_021827	AGG	2	6	2283549	2283554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525898757
52152	NC_021827	CT	3	6	2283600	2283605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52153	NC_021827	AATC	2	8	2283611	2283618	50 %	25 %	0 %	25 %	525898758
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52158	NC_021827	AATC	2	8	2283884	2283891	50 %	25 %	0 %	25 %	525898758
52159	NC_021827	TAA	2	6	2283920	2283925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898758
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52168	NC_021827	TCC	2	6	2284104	2284109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52169	NC_021827	T	7	7	2284113	2284119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52170	NC_021827	ATGA	2	8	2284132	2284139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52171	NC_021827	ATT	2	6	2284201	2284206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52173	NC_021827	T	7	7	2284240	2284246	0 %	100 %	0 %	0 %	525899579
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52181	NC_021827	A	7	7	2284463	2284469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52182	NC_021827	CTT	2	6	2284493	2284498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52183	NC_021827	TCTA	2	8	2284508	2284515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52184	NC_021827	TAA	2	6	2284533	2284538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52185	NC_021827	AGT	2	6	2284558	2284563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898759
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52218	NC_021827	TTG	2	6	2285542	2285547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898759
52219	NC_021827	CTG	2	6	2285572	2285577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898759
52220	NC_021827	CTT	2	6	2285581	2285586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898759
52221	NC_021827	ATC	2	6	2285603	2285608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898759
52222	NC_021827	ACC	2	6	2285774	2285779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525898759
52223	NC_021827	AAT	2	6	2285867	2285872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898759
52224	NC_021827	GTT	2	6	2285885	2285890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898759
52225	NC_021827	CTT	2	6	2286022	2286027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898759
52226	NC_021827	T	6	6	2286058	2286063	0 %	100 %	0 %	0 %	525898759
52227	NC_021827	TCA	2	6	2286148	2286153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52228	NC_021827	TTA	2	6	2286162	2286167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52229	NC_021827	TTGT	2	8	2286171	2286178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52230	NC_021827	GTT	2	6	2286192	2286197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52231	NC_021827	TTTCAT	2	12	2286216	2286227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52232	NC_021827	A	6	6	2286322	2286327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52233	NC_021827	TAA	2	6	2286360	2286365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52234	NC_021827	ATC	2	6	2286376	2286381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52235	NC_021827	AC	3	6	2286385	2286390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52236	NC_021827	TAT	2	6	2286432	2286437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52237	NC_021827	A	7	7	2286443	2286449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52238	NC_021827	A	8	8	2286512	2286519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52239	NC_021827	TTA	2	6	2286553	2286558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898760
52240	NC_021827	T	6	6	2286580	2286585	0 %	100 %	0 %	0 %	525898760
52241	NC_021827	TCT	2	6	2286614	2286619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898760
52242	NC_021827	GTTCC	2	10	2286657	2286666	0 %	40 %	20 %	40 %	525898760
52243	NC_021827	TCT	2	6	2286788	2286793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898760
52244	NC_021827	GTT	2	6	2286860	2286865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898760
52245	NC_021827	ATC	2	6	2286874	2286879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898760
52246	NC_021827	GAA	2	6	2286945	2286950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898760
52247	NC_021827	GTT	2	6	2286953	2286958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898760
52248	NC_021827	CTT	2	6	2286960	2286965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898760
52249	NC_021827	T	6	6	2286964	2286969	0 %	100 %	0 %	0 %	525898760
52250	NC_021827	CTG	2	6	2286987	2286992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898760
52251	NC_021827	TGC	2	6	2287000	2287005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898760
52252	NC_021827	T	7	7	2287079	2287085	0 %	100 %	0 %	0 %	525898760
52253	NC_021827	T	6	6	2287107	2287112	0 %	100 %	0 %	0 %	525898760
52254	NC_021827	TTC	2	6	2287173	2287178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898760
52255	NC_021827	ATC	2	6	2287208	2287213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898760
52256	NC_021827	GCTT	2	8	2287304	2287311	0 %	50 %	25 %	25 %	525898760
52257	NC_021827	ATA	2	6	2287361	2287366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898760
52258	NC_021827	TTTC	2	8	2287377	2287384	0 %	75 %	0 %	25 %	525898760
52259	NC_021827	TCT	3	9	2287415	2287423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898760
52260	NC_021827	GT	3	6	2287551	2287556	0 %	50 %	50 %	0 %	525898760
52261	NC_021827	AGCA	2	8	2287585	2287592	50 %	0 %	25 %	25 %	525898760
52262	NC_021827	CTG	2	6	2287611	2287616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525898760
52263	NC_021827	TGGTA	2	10	2287690	2287699	20 %	40 %	40 %	0 %	525898760
52264	NC_021827	TAGA	2	8	2287796	2287803	50 %	25 %	25 %	0 %	525898760
52265	NC_021827	ATAA	2	8	2287896	2287903	75 %	25 %	0 %	0 %	525898760
52266	NC_021827	GCC	2	6	2287919	2287924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525898760
52267	NC_021827	ATG	2	6	2287960	2287965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898760
52268	NC_021827	CTC	2	6	2288001	2288006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525898760
52269	NC_021827	ACA	2	6	2288015	2288020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898760
52270	NC_021827	TGT	2	6	2288213	2288218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898760
52271	NC_021827	CTT	2	6	2288330	2288335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898761
52272	NC_021827	ACA	2	6	2288356	2288361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898761
52273	NC_021827	AAG	2	6	2288454	2288459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898761
52274	NC_021827	CGC	2	6	2288460	2288465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525898761
52275	NC_021827	AACC	2	8	2288512	2288519	50 %	0 %	0 %	50 %	525898761
52276	NC_021827	TTC	2	6	2288520	2288525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898761
52277	NC_021827	CA	3	6	2288538	2288543	50 %	0 %	0 %	50 %	525898761
52278	NC_021827	CCG	2	6	2288545	2288550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525898761
52279	NC_021827	GAT	2	6	2288600	2288605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898761
52280	NC_021827	GAA	2	6	2288629	2288634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898761
52281	NC_021827	ATA	2	6	2288688	2288693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898761
52282	NC_021827	T	6	6	2288705	2288710	0 %	100 %	0 %	0 %	525898761
52283	NC_021827	TGA	2	6	2288938	2288943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898761
52284	NC_021827	TAC	2	6	2288951	2288956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898761
52285	NC_021827	AT	3	6	2288968	2288973	50 %	50 %	0 %	0 %	525898761
52286	NC_021827	TCA	2	6	2289052	2289057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898761
52287	NC_021827	TTG	2	6	2289069	2289074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898761
52288	NC_021827	TAATTC	2	12	2289075	2289086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525898761
52289	NC_021827	ACT	2	6	2289118	2289123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898761
52290	NC_021827	ACTG	2	8	2289135	2289142	25 %	25 %	25 %	25 %	525898761
52291	NC_021827	GAA	2	6	2289158	2289163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898761
52292	NC_021827	TAAT	2	8	2289257	2289264	50 %	50 %	0 %	0 %	525898761
52293	NC_021827	TTC	2	6	2289270	2289275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898761
52294	NC_021827	CTA	2	6	2289309	2289314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52295	NC_021827	ACA	2	6	2289427	2289432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898762
52296	NC_021827	ATT	2	6	2289487	2289492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898762
52297	NC_021827	T	6	6	2289491	2289496	0 %	100 %	0 %	0 %	525898762
52298	NC_021827	TTCA	2	8	2289519	2289526	25 %	50 %	0 %	25 %	525898762
52299	NC_021827	TAA	2	6	2289544	2289549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898762
52300	NC_021827	TCA	2	6	2289565	2289570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898762
52301	NC_021827	TC	3	6	2289600	2289605	0 %	50 %	0 %	50 %	525898762
52302	NC_021827	TCT	2	6	2289607	2289612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898762
52303	NC_021827	GTG	2	6	2289671	2289676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525898762
52304	NC_021827	TTTC	2	8	2289911	2289918	0 %	75 %	0 %	25 %	525898762
52305	NC_021827	AAT	2	6	2289939	2289944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898762
52306	NC_021827	T	6	6	2290031	2290036	0 %	100 %	0 %	0 %	525898762
52307	NC_021827	A	6	6	2290038	2290043	100 %	0 %	0 %	0 %	525898762
52308	NC_021827	AT	3	6	2290090	2290095	50 %	50 %	0 %	0 %	525898762
52309	NC_021827	GCA	2	6	2290180	2290185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525898762
52310	NC_021827	CAA	2	6	2290206	2290211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898762
52311	NC_021827	ATTC	2	8	2290224	2290231	25 %	50 %	0 %	25 %	525898762
52312	NC_021827	TCC	2	6	2290235	2290240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525898763
52313	NC_021827	GC	3	6	2290263	2290268	0 %	0 %	50 %	50 %	525898763
52314	NC_021827	TCCA	2	8	2290405	2290412	25 %	25 %	0 %	50 %	525898763
52315	NC_021827	A	6	6	2290418	2290423	100 %	0 %	0 %	0 %	525898763
52316	NC_021827	TCGT	2	8	2290491	2290498	0 %	50 %	25 %	25 %	525898763
52317	NC_021827	CTT	2	6	2290500	2290505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898763
52318	NC_021827	ATC	2	6	2290571	2290576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898763
52319	NC_021827	T	6	6	2290599	2290604	0 %	100 %	0 %	0 %	525898763
52320	NC_021827	GAA	2	6	2290700	2290705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898763
52321	NC_021827	GTA	2	6	2290738	2290743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898763
52322	NC_021827	TA	3	6	2290742	2290747	50 %	50 %	0 %	0 %	525898763
52323	NC_021827	AAAATT	2	12	2290948	2290959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898763
52324	NC_021827	T	7	7	2290977	2290983	0 %	100 %	0 %	0 %	525898763
52325	NC_021827	CTA	2	6	2291031	2291036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898763
52326	NC_021827	ATT	2	6	2291176	2291181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898763
52327	NC_021827	ACC	2	6	2291347	2291352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525898763
52328	NC_021827	A	6	6	2291353	2291358	100 %	0 %	0 %	0 %	525898763
52329	NC_021827	ATT	2	6	2291368	2291373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898763
52330	NC_021827	ATA	2	6	2291392	2291397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898763
52331	NC_021827	TAC	3	9	2291418	2291426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898763
52332	NC_021827	ATA	2	6	2291480	2291485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898763
52333	NC_021827	CAT	2	6	2291577	2291582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525898763
52334	NC_021827	TAATC	2	10	2291654	2291663	40 %	40 %	0 %	20 %	525898763
52335	NC_021827	AC	3	6	2291739	2291744	50 %	0 %	0 %	50 %	525898763
52336	NC_021827	ACG	2	6	2291746	2291751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525898763
52337	NC_021827	CTT	2	6	2291802	2291807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525898764
52338	NC_021827	GAA	2	6	2291821	2291826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525898764
52339	NC_021827	ATA	2	6	2291837	2291842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898764
52340	NC_021827	TCTG	2	8	2291986	2291993	0 %	50 %	25 %	25 %	525898764
52341	NC_021827	GCA	2	6	2292039	2292044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525898764
52342	NC_021827	TAAGC	2	10	2292151	2292160	40 %	20 %	20 %	20 %	525898764
52343	NC_021827	GAT	2	6	2292238	2292243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525898764
52344	NC_021827	A	6	6	2292250	2292255	100 %	0 %	0 %	0 %	525898764
52345	NC_021827	ATT	2	6	2292274	2292279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898764
52346	NC_021827	TGG	2	6	2292363	2292368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525898764
52347	NC_021827	AAT	2	6	2292373	2292378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898764
52348	NC_021827	TAA	2	6	2292384	2292389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898764
52349	NC_021827	CAA	2	6	2292417	2292422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525898764
52350	NC_021827	ACGA	2	8	2292447	2292454	50 %	0 %	25 %	25 %	525898764
52351	NC_021827	AGC	2	6	2292499	2292504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525898764
52352	NC_021827	TAAA	3	12	2292520	2292531	75 %	25 %	0 %	0 %	525898764
52353	NC_021827	TGT	2	6	2292559	2292564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898764
52354	NC_021827	TA	3	6	2292568	2292573	50 %	50 %	0 %	0 %	525898764
52355	NC_021827	TAT	2	6	2292597	2292602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525898764
52356	NC_021827	TAA	2	6	2292643	2292648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525898765
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52358	NC_021827	TTG	2	6	2292757	2292762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898765
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52477	NC_021827	TTG	2	6	2297922	2297927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525898769
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