MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 68153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021825	TAT	3	9	662444	662452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878243
15002	NC_021825	ATG	2	6	662474	662479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878243
15003	NC_021825	ACT	2	6	662585	662590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878243
15004	NC_021825	GCTG	2	8	662670	662677	0 %	25 %	50 %	25 %	525878243
15005	NC_021825	TTA	2	6	662729	662734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878243
15006	NC_021825	CTT	2	6	662827	662832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525878243
15007	NC_021825	CTT	2	6	662924	662929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525878243
15008	NC_021825	AGT	2	6	663006	663011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878243
15009	NC_021825	CATT	2	8	663028	663035	25 %	50 %	0 %	25 %	525878243
15010	NC_021825	A	6	6	663084	663089	100 %	0 %	0 %	0 %	525878243
15011	NC_021825	TTA	2	6	663101	663106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878243
15012	NC_021825	TGA	2	6	663164	663169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878243
15013	NC_021825	TA	3	6	663214	663219	50 %	50 %	0 %	0 %	525878243
15014	NC_021825	TGC	2	6	663444	663449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525878243
15015	NC_021825	TTA	3	9	663455	663463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878243
15016	NC_021825	AAGA	2	8	663508	663515	75 %	0 %	25 %	0 %	525878243
15017	NC_021825	GCG	2	6	663523	663528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525878243
15018	NC_021825	TAC	2	6	663548	663553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878243
15019	NC_021825	GCA	2	6	663567	663572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525878243
15020	NC_021825	TAA	2	6	663633	663638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878243
15021	NC_021825	GCG	2	6	663693	663698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525878243
15022	NC_021825	GAG	2	6	663729	663734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525878243
15023	NC_021825	ATG	2	6	663781	663786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878243
15024	NC_021825	CGAG	2	8	663832	663839	25 %	0 %	50 %	25 %	525878243
15025	NC_021825	TTA	2	6	663856	663861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878243
15026	NC_021825	GAA	2	6	663904	663909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878243
15027	NC_021825	AGAAA	2	10	663913	663922	80 %	0 %	20 %	0 %	525878243
15028	NC_021825	TTTA	2	8	664013	664020	25 %	75 %	0 %	0 %	525878243
15029	NC_021825	GAGC	2	8	664030	664037	25 %	0 %	50 %	25 %	525878243
15030	NC_021825	A	6	6	664057	664062	100 %	0 %	0 %	0 %	525878243
15031	NC_021825	ATG	2	6	664070	664075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878243
15032	NC_021825	ACAA	2	8	664083	664090	75 %	0 %	0 %	25 %	525878243
15033	NC_021825	ACT	2	6	664133	664138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878243
15034	NC_021825	GAAA	2	8	664161	664168	75 %	0 %	25 %	0 %	525878243
15035	NC_021825	TAA	2	6	664225	664230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878243
15036	NC_021825	A	6	6	664229	664234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_021825	T	6	6	664249	664254	0 %	100 %	0 %	0 %	525878244
15038	NC_021825	T	7	7	664267	664273	0 %	100 %	0 %	0 %	525878244
15039	NC_021825	ATC	2	6	664274	664279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878244
15040	NC_021825	ATA	2	6	664283	664288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878244
15041	NC_021825	AAT	2	6	664289	664294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878244
15042	NC_021825	TCG	2	6	664312	664317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525878244
15043	NC_021825	TCTTTT	2	12	664329	664340	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525878244
15044	NC_021825	GTTA	2	8	664343	664350	25 %	50 %	25 %	0 %	525878244
15045	NC_021825	AGT	2	6	664410	664415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878244
15046	NC_021825	AGAT	2	8	664438	664445	50 %	25 %	25 %	0 %	525878244
15047	NC_021825	TAC	2	6	664483	664488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878244
15048	NC_021825	T	7	7	664501	664507	0 %	100 %	0 %	0 %	525878244
15049	NC_021825	CAT	2	6	664771	664776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878244
15050	NC_021825	T	6	6	664896	664901	0 %	100 %	0 %	0 %	525878244
15051	NC_021825	GCCC	2	8	664949	664956	0 %	0 %	25 %	75 %	525878244
15052	NC_021825	AAT	2	6	664965	664970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878244
15053	NC_021825	TGCG	2	8	664976	664983	0 %	25 %	50 %	25 %	525878244
15054	NC_021825	AAT	2	6	665071	665076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878244
15055	NC_021825	CTG	2	6	665086	665091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525878244
15056	NC_021825	ACC	2	6	665115	665120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525878244
15057	NC_021825	T	6	6	665177	665182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_021825	TTA	2	6	665225	665230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_021825	AAT	2	6	665250	665255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_021825	AGTATT	2	12	665271	665282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_021825	T	7	7	665301	665307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_021825	TATAG	2	10	665334	665343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_021825	AAGT	2	8	665360	665367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_021825	ATT	2	6	665410	665415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878245
15065	NC_021825	AGC	2	6	665463	665468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525878245
15066	NC_021825	CAT	2	6	665502	665507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878245
15067	NC_021825	ATAAA	2	10	665516	665525	80 %	20 %	0 %	0 %	525878245
15068	NC_021825	TTA	2	6	665606	665611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878245
15069	NC_021825	AGC	2	6	665631	665636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525878245
15070	NC_021825	ACTTGG	2	12	665709	665720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525878245
15071	NC_021825	ACAA	2	8	665819	665826	75 %	0 %	0 %	25 %	525878245
15072	NC_021825	TTCAT	2	10	665902	665911	20 %	60 %	0 %	20 %	525878245
15073	NC_021825	CAA	2	6	665920	665925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525878245
15074	NC_021825	AGG	2	6	665940	665945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525878245
15075	NC_021825	AGA	2	6	665961	665966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878246
15076	NC_021825	GAT	2	6	665989	665994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878246
15077	NC_021825	TTG	2	6	666013	666018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525878246
15078	NC_021825	ATTG	2	8	666052	666059	25 %	50 %	25 %	0 %	525878246
15079	NC_021825	TTC	2	6	666108	666113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525878246
15080	NC_021825	AATT	2	8	666140	666147	50 %	50 %	0 %	0 %	525878246
15081	NC_021825	CGTT	2	8	666159	666166	0 %	50 %	25 %	25 %	525878246
15082	NC_021825	AGC	2	6	666178	666183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525878246
15083	NC_021825	CAC	2	6	666185	666190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525878246
15084	NC_021825	TTTG	2	8	666205	666212	0 %	75 %	25 %	0 %	525878246
15085	NC_021825	ATT	2	6	666261	666266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878246
15086	NC_021825	AGA	2	6	666276	666281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878246
15087	NC_021825	CGC	2	6	666370	666375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525878246
15088	NC_021825	ATG	2	6	666424	666429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878246
15089	NC_021825	ACT	2	6	666465	666470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878246
15090	NC_021825	A	6	6	666491	666496	100 %	0 %	0 %	0 %	525878246
15091	NC_021825	CATTAA	2	12	666552	666563	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525878247
15092	NC_021825	GGA	2	6	666572	666577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525878247
15093	NC_021825	AGA	2	6	666580	666585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878247
15094	NC_021825	AGC	2	6	666592	666597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525878247
15095	NC_021825	ACAA	2	8	666610	666617	75 %	0 %	0 %	25 %	525878247
15096	NC_021825	TAAATT	2	12	666733	666744	50 %	50 %	0 %	0 %	525878247
15097	NC_021825	A	6	6	666819	666824	100 %	0 %	0 %	0 %	525878247
15098	NC_021825	GAA	2	6	666838	666843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878247
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15101	NC_021825	TAA	2	6	666904	666909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878247
15102	NC_021825	A	7	7	666986	666992	100 %	0 %	0 %	0 %	525878247
15103	NC_021825	GAA	2	6	666998	667003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878247
15104	NC_021825	AAT	2	6	667010	667015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878247
15105	NC_021825	AGT	2	6	667147	667152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878247
15106	NC_021825	TCTA	2	8	667162	667169	25 %	50 %	0 %	25 %	525878247
15107	NC_021825	TAT	2	6	667243	667248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878247
15108	NC_021825	TGA	2	6	667249	667254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878247
15109	NC_021825	A	6	6	667265	667270	100 %	0 %	0 %	0 %	525878247
15110	NC_021825	ATT	2	6	667296	667301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878247
15111	NC_021825	GAGG	2	8	667321	667328	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_021825	CTA	2	6	667460	667465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878248
15113	NC_021825	TATT	2	8	667557	667564	25 %	75 %	0 %	0 %	525878248
15114	NC_021825	T	6	6	667566	667571	0 %	100 %	0 %	0 %	525878248
15115	NC_021825	TGC	2	6	667633	667638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525878248
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15117	NC_021825	AGT	2	6	667748	667753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878248
15118	NC_021825	ATC	2	6	667772	667777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878248
15119	NC_021825	TCGC	2	8	667847	667854	0 %	25 %	25 %	50 %	525878248
15120	NC_021825	ATT	2	6	667946	667951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878248
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15122	NC_021825	GA	3	6	668059	668064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15242	NC_021825	AATTC	2	10	673682	673691	40 %	40 %	0 %	20 %	525878255
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15367	NC_021825	TTA	2	6	679471	679476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525878261
15368	NC_021825	AGA	2	6	679562	679567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878261
15369	NC_021825	AAG	2	6	679576	679581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525878261
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15390	NC_021825	TTCA	2	8	680441	680448	25 %	50 %	0 %	25 %	525878261
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15487	NC_021825	A	6	6	684754	684759	100 %	0 %	0 %	0 %	525878263
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15490	NC_021825	CAG	2	6	684937	684942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525878263
15491	NC_021825	AAT	2	6	684954	684959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525878263
15492	NC_021825	TAC	2	6	685048	685053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525878263
15493	NC_021825	AT	3	6	685073	685078	50 %	50 %	0 %	0 %	525878263
15494	NC_021825	AGT	2	6	685140	685145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525878263
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