MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 68153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_021825	ATC	2	6	2797379	2797384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880587
64002	NC_021825	A	6	6	2797390	2797395	100 %	0 %	0 %	0 %	525880587
64003	NC_021825	ATA	2	6	2797406	2797411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880587
64004	NC_021825	CCG	2	6	2797426	2797431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880587
64005	NC_021825	AGC	2	6	2797466	2797471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880587
64006	NC_021825	TAT	2	6	2797489	2797494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880587
64007	NC_021825	ATC	2	6	2797505	2797510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880587
64008	NC_021825	CCG	2	6	2797588	2797593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880587
64009	NC_021825	CAGATT	2	12	2797633	2797644	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525880587
64010	NC_021825	T	6	6	2797682	2797687	0 %	100 %	0 %	0 %	525880587
64011	NC_021825	ATC	2	6	2797691	2797696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880587
64012	NC_021825	CAA	2	6	2797811	2797816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880587
64013	NC_021825	AAT	2	6	2797829	2797834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880587
64014	NC_021825	AT	3	6	2797928	2797933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64015	NC_021825	ATA	2	6	2797941	2797946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64016	NC_021825	ATA	2	6	2797984	2797989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64017	NC_021825	AG	3	6	2797990	2797995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64018	NC_021825	TC	3	6	2798010	2798015	0 %	50 %	0 %	50 %	525880588
64019	NC_021825	TTA	3	9	2798016	2798024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880588
64020	NC_021825	GTT	2	6	2798118	2798123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880588
64021	NC_021825	CTC	2	6	2798191	2798196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880588
64022	NC_021825	T	7	7	2798215	2798221	0 %	100 %	0 %	0 %	525880588
64023	NC_021825	GCA	2	6	2798222	2798227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880588
64024	NC_021825	CAG	2	6	2798238	2798243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880588
64025	NC_021825	A	6	6	2798262	2798267	100 %	0 %	0 %	0 %	525880588
64026	NC_021825	TCT	2	6	2798291	2798296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880588
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64028	NC_021825	TCA	2	6	2798360	2798365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880588
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64030	NC_021825	ATTTTT	2	12	2798419	2798430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525880588
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64032	NC_021825	TTA	2	6	2798472	2798477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880588
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64034	NC_021825	TCA	2	6	2798510	2798515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880588
64035	NC_021825	TAA	2	6	2798520	2798525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880588
64036	NC_021825	TCT	2	6	2798597	2798602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880588
64037	NC_021825	AATC	2	8	2798626	2798633	50 %	25 %	0 %	25 %	525880588
64038	NC_021825	GATA	2	8	2798729	2798736	50 %	25 %	25 %	0 %	525880588
64039	NC_021825	CAA	2	6	2798751	2798756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880588
64040	NC_021825	A	7	7	2798764	2798770	100 %	0 %	0 %	0 %	525880588
64041	NC_021825	ATC	2	6	2798801	2798806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880588
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64046	NC_021825	T	6	6	2798885	2798890	0 %	100 %	0 %	0 %	525880588
64047	NC_021825	TAG	2	6	2798934	2798939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880588
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64049	NC_021825	TAT	2	6	2799034	2799039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64050	NC_021825	AAC	2	6	2799088	2799093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64051	NC_021825	AGA	2	6	2799098	2799103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64052	NC_021825	AGC	2	6	2799104	2799109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64053	NC_021825	AT	3	6	2799118	2799123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64054	NC_021825	GCT	2	6	2799124	2799129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64055	NC_021825	CAT	2	6	2799137	2799142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880045
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64057	NC_021825	TCT	2	6	2799191	2799196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880045
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64059	NC_021825	TCA	2	6	2799242	2799247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880045
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64061	NC_021825	AGT	2	6	2799268	2799273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880045
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64070	NC_021825	GTT	2	6	2799703	2799708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880045
64071	NC_021825	T	6	6	2799730	2799735	0 %	100 %	0 %	0 %	525880045
64072	NC_021825	GCA	2	6	2799737	2799742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880045
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64077	NC_021825	GT	3	6	2799991	2799996	0 %	50 %	50 %	0 %	525880045
64078	NC_021825	GTTTTA	2	12	2800068	2800079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525880045
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64080	NC_021825	ATTGTC	2	12	2800139	2800150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525880045
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64082	NC_021825	ACC	2	6	2800171	2800176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880045
64083	NC_021825	TAC	2	6	2800203	2800208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880045
64084	NC_021825	TAA	2	6	2800236	2800241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880045
64085	NC_021825	GTC	2	6	2800258	2800263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880045
64086	NC_021825	CTT	2	6	2800415	2800420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64087	NC_021825	ATTT	2	8	2800425	2800432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64088	NC_021825	A	9	9	2800439	2800447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64089	NC_021825	TCAA	2	8	2800453	2800460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64090	NC_021825	TAT	2	6	2800543	2800548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64091	NC_021825	GTT	2	6	2800564	2800569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64092	NC_021825	T	7	7	2800568	2800574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64093	NC_021825	AAAAT	2	10	2800683	2800692	80 %	20 %	0 %	0 %	525880046
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64099	NC_021825	GC	3	6	2800986	2800991	0 %	0 %	50 %	50 %	525880046
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64102	NC_021825	TCAA	2	8	2801115	2801122	50 %	25 %	0 %	25 %	525880046
64103	NC_021825	TCG	2	6	2801238	2801243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880046
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64105	NC_021825	CCTT	2	8	2801278	2801285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64106	NC_021825	A	6	6	2801369	2801374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64107	NC_021825	ATT	2	6	2801411	2801416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880047
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64111	NC_021825	CTT	2	6	2801528	2801533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880047
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64114	NC_021825	CCA	2	6	2801638	2801643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880047
64115	NC_021825	GCA	2	6	2801644	2801649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880047
64116	NC_021825	GCTACA	2	12	2801650	2801661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880047
64117	NC_021825	TGC	2	6	2801664	2801669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880047
64118	NC_021825	TTC	3	9	2801685	2801693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880047
64119	NC_021825	CTT	2	6	2801732	2801737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880047
64120	NC_021825	TTC	2	6	2801754	2801759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880047
64121	NC_021825	TCC	2	6	2801783	2801788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64122	NC_021825	AAT	2	6	2801789	2801794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64123	NC_021825	T	6	6	2801799	2801804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64124	NC_021825	TTTG	2	8	2801820	2801827	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64125	NC_021825	CTT	2	6	2801858	2801863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880048
64126	NC_021825	CTT	2	6	2801867	2801872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880048
64127	NC_021825	TAG	2	6	2801891	2801896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880048
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64133	NC_021825	CAA	2	6	2802414	2802419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64134	NC_021825	A	6	6	2802418	2802423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64135	NC_021825	AGCT	2	8	2802606	2802613	25 %	25 %	25 %	25 %	525880049
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64148	NC_021825	T	7	7	2803194	2803200	0 %	100 %	0 %	0 %	525880049
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64152	NC_021825	AC	3	6	2803322	2803327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64153	NC_021825	TTTTG	2	10	2803468	2803477	0 %	80 %	20 %	0 %	525880050
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64164	NC_021825	CCT	2	6	2803764	2803769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64165	NC_021825	TA	3	6	2803841	2803846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64166	NC_021825	ATT	2	6	2803876	2803881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64181	NC_021825	AAT	2	6	2804385	2804390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64182	NC_021825	CTT	2	6	2804538	2804543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880052
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64190	NC_021825	TCT	3	9	2804807	2804815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880052
64191	NC_021825	AGTA	2	8	2804907	2804914	50 %	25 %	25 %	0 %	525880052
64192	NC_021825	T	7	7	2804930	2804936	0 %	100 %	0 %	0 %	525880052
64193	NC_021825	ATT	2	6	2804939	2804944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880052
64194	NC_021825	GCA	2	6	2804951	2804956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64196	NC_021825	TCC	2	6	2804974	2804979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64197	NC_021825	A	6	6	2804999	2805004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64198	NC_021825	TAA	2	6	2805084	2805089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880053
64199	NC_021825	ACT	2	6	2805137	2805142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880053
64200	NC_021825	TAA	2	6	2805144	2805149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880053
64201	NC_021825	TACTGT	2	12	2805151	2805162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525880053
64202	NC_021825	ATGTA	2	10	2805284	2805293	40 %	40 %	20 %	0 %	525880054
64203	NC_021825	TTC	2	6	2805318	2805323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880054
64204	NC_021825	TTTC	2	8	2805337	2805344	0 %	75 %	0 %	25 %	525880054
64205	NC_021825	TCT	2	6	2805409	2805414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880054
64206	NC_021825	A	6	6	2805458	2805463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64207	NC_021825	ATATAA	2	12	2805480	2805491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64208	NC_021825	T	6	6	2805517	2805522	0 %	100 %	0 %	0 %	525880055
64209	NC_021825	TCA	2	6	2805536	2805541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880055
64210	NC_021825	T	6	6	2805547	2805552	0 %	100 %	0 %	0 %	525880055
64211	NC_021825	T	6	6	2805585	2805590	0 %	100 %	0 %	0 %	525880055
64212	NC_021825	GAA	2	6	2805594	2805599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880055
64213	NC_021825	CTT	2	6	2805647	2805652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880055
64214	NC_021825	TCT	2	6	2805724	2805729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880055
64215	NC_021825	GCT	2	6	2805739	2805744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880055
64216	NC_021825	TAA	2	6	2805762	2805767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880055
64217	NC_021825	AGTCC	2	10	2805768	2805777	20 %	20 %	20 %	40 %	525880055
64218	NC_021825	ATC	2	6	2805780	2805785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880055
64219	NC_021825	ATT	2	6	2805816	2805821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880055
64220	NC_021825	TTC	2	6	2805832	2805837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880055
64221	NC_021825	CCG	2	6	2805857	2805862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880055
64222	NC_021825	CTGT	2	8	2805870	2805877	0 %	50 %	25 %	25 %	525880055
64223	NC_021825	CTT	2	6	2805911	2805916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880055
64224	NC_021825	ATC	2	6	2805955	2805960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880055
64225	NC_021825	CTT	2	6	2805962	2805967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880055
64226	NC_021825	TACT	2	8	2806036	2806043	25 %	50 %	0 %	25 %	525880055
64227	NC_021825	A	6	6	2806045	2806050	100 %	0 %	0 %	0 %	525880055
64228	NC_021825	TTC	2	6	2806101	2806106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880055
64229	NC_021825	TCT	2	6	2806158	2806163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64230	NC_021825	CTC	2	6	2806211	2806216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880056
64231	NC_021825	TTC	2	6	2806283	2806288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880056
64232	NC_021825	CGACTT	2	12	2806504	2806515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525880056
64233	NC_021825	CCAT	2	8	2806606	2806613	25 %	25 %	0 %	50 %	525880056
64234	NC_021825	CAA	2	6	2806615	2806620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880056
64235	NC_021825	CAA	2	6	2806699	2806704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880056
64236	NC_021825	CATC	2	8	2806908	2806915	25 %	25 %	0 %	50 %	525880057
64237	NC_021825	CTA	2	6	2806928	2806933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880057
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64340	NC_021825	ACGTAC	2	12	2811773	2811784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880061
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64342	NC_021825	ATT	2	6	2811804	2811809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64343	NC_021825	ATT	2	6	2811820	2811825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880062
64344	NC_021825	CTT	2	6	2811859	2811864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880062
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64346	NC_021825	A	7	7	2812109	2812115	100 %	0 %	0 %	0 %	525880062
64347	NC_021825	GAA	2	6	2812168	2812173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880062
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64350	NC_021825	TCC	2	6	2812302	2812307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880063
64351	NC_021825	AGCG	2	8	2812329	2812336	25 %	0 %	50 %	25 %	525880063
64352	NC_021825	GCG	2	6	2812499	2812504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525880063
64353	NC_021825	CAC	2	6	2812557	2812562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880063
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64469	NC_021825	TGTTC	2	10	2818096	2818105	0 %	60 %	20 %	20 %	525880066
64470	NC_021825	CTT	2	6	2818136	2818141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880066
64471	NC_021825	CAT	2	6	2818188	2818193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880066
64472	NC_021825	TGT	2	6	2818194	2818199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64473	NC_021825	TCC	2	6	2818201	2818206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64474	NC_021825	TCA	2	6	2818219	2818224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880067
64475	NC_021825	TCT	2	6	2818271	2818276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880067
64476	NC_021825	CTTCT	2	10	2818299	2818308	0 %	60 %	0 %	40 %	525880067
64477	NC_021825	A	6	6	2818310	2818315	100 %	0 %	0 %	0 %	525880067
64478	NC_021825	ATTC	2	8	2818338	2818345	25 %	50 %	0 %	25 %	525880067
64479	NC_021825	T	6	6	2818347	2818352	0 %	100 %	0 %	0 %	525880067
64480	NC_021825	CTT	2	6	2818419	2818424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880067
64481	NC_021825	AAT	2	6	2818432	2818437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880067
64482	NC_021825	TCA	2	6	2818446	2818451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880067
64483	NC_021825	TA	3	6	2818652	2818657	50 %	50 %	0 %	0 %	525880067
64484	NC_021825	TGT	2	6	2818714	2818719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880067
64485	NC_021825	GC	3	6	2818751	2818756	0 %	0 %	50 %	50 %	525880067
64486	NC_021825	CA	3	6	2818777	2818782	50 %	0 %	0 %	50 %	525880067
64487	NC_021825	AAT	2	6	2818874	2818879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880067
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64497	NC_021825	CATT	2	8	2819238	2819245	25 %	50 %	0 %	25 %	525880067
64498	NC_021825	TCA	2	6	2819278	2819283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880068
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64500	NC_021825	CTC	2	6	2819307	2819312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880068

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