MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 68153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_021825	A	6	6	2352447	2352452	100 %	0 %	0 %	0 %	525879707
54002	NC_021825	CTT	2	6	2352481	2352486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879707
54003	NC_021825	A	6	6	2352512	2352517	100 %	0 %	0 %	0 %	525879707
54004	NC_021825	TAA	2	6	2352518	2352523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879707
54005	NC_021825	ATT	2	6	2352532	2352537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525879707
54006	NC_021825	AAT	2	6	2352558	2352563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879707
54007	NC_021825	TAT	2	6	2352666	2352671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525879707
54008	NC_021825	GC	3	6	2352678	2352683	0 %	0 %	50 %	50 %	525879707
54009	NC_021825	GAA	2	6	2352728	2352733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525879707
54010	NC_021825	TGA	2	6	2352797	2352802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879707
54011	NC_021825	A	6	6	2352821	2352826	100 %	0 %	0 %	0 %	525879707
54012	NC_021825	TTCC	2	8	2352834	2352841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54013	NC_021825	T	6	6	2352850	2352855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54014	NC_021825	ACTTT	2	10	2352885	2352894	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54015	NC_021825	T	6	6	2352892	2352897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54016	NC_021825	GAT	2	6	2352906	2352911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54017	NC_021825	TTA	2	6	2352927	2352932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525879708
54018	NC_021825	CTG	2	6	2353000	2353005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879708
54019	NC_021825	GTG	2	6	2353015	2353020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525879708
54020	NC_021825	A	7	7	2353056	2353062	100 %	0 %	0 %	0 %	525879708
54021	NC_021825	TAG	2	6	2353166	2353171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879708
54022	NC_021825	GGT	2	6	2353179	2353184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525879708
54023	NC_021825	TAC	2	6	2353244	2353249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879708
54024	NC_021825	ATG	2	6	2353257	2353262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879708
54025	NC_021825	CTG	2	6	2353288	2353293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879708
54026	NC_021825	CTG	2	6	2353330	2353335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879708
54027	NC_021825	AT	3	6	2353381	2353386	50 %	50 %	0 %	0 %	525879708
54028	NC_021825	AGA	2	6	2353388	2353393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525879708
54029	NC_021825	GTTCCA	2	12	2353431	2353442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525879708
54030	NC_021825	A	6	6	2353468	2353473	100 %	0 %	0 %	0 %	525879708
54031	NC_021825	AAG	2	6	2353524	2353529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54032	NC_021825	CTT	2	6	2353550	2353555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54033	NC_021825	TTC	2	6	2353582	2353587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879709
54034	NC_021825	TCA	2	6	2353654	2353659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879709
54035	NC_021825	TTC	2	6	2353692	2353697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879709
54036	NC_021825	GTT	2	6	2353703	2353708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879709
54037	NC_021825	ACT	2	6	2353750	2353755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879709
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54039	NC_021825	CCA	2	6	2353801	2353806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525879709
54040	NC_021825	AAATC	2	10	2353811	2353820	60 %	20 %	0 %	20 %	525879709
54041	NC_021825	ACT	2	6	2353831	2353836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879709
54042	NC_021825	TCAC	2	8	2353930	2353937	25 %	25 %	0 %	50 %	525879709
54043	NC_021825	GCA	2	6	2353942	2353947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879709
54044	NC_021825	CAG	2	6	2353958	2353963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879709
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54047	NC_021825	AT	3	6	2354079	2354084	50 %	50 %	0 %	0 %	525879709
54048	NC_021825	TAA	2	6	2354151	2354156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879709
54049	NC_021825	GC	3	6	2354235	2354240	0 %	0 %	50 %	50 %	525879710
54050	NC_021825	TCG	2	6	2354316	2354321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879710
54051	NC_021825	A	6	6	2354361	2354366	100 %	0 %	0 %	0 %	525879710
54052	NC_021825	TGT	2	6	2354379	2354384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879710
54053	NC_021825	TCT	2	6	2354391	2354396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879710
54054	NC_021825	ACG	2	6	2354415	2354420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879710
54055	NC_021825	TTA	2	6	2354485	2354490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525879710
54056	NC_021825	TGTC	2	8	2354506	2354513	0 %	50 %	25 %	25 %	525879710
54057	NC_021825	ACTTGT	2	12	2354516	2354527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525879710
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54060	NC_021825	CAT	2	6	2354603	2354608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879710
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54062	NC_021825	CCA	2	6	2354616	2354621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525879710
54063	NC_021825	GCCAA	2	10	2354658	2354667	40 %	0 %	20 %	40 %	525879710
54064	NC_021825	AAG	2	6	2354715	2354720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525879710
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54066	NC_021825	TTG	2	6	2354732	2354737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879710
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54070	NC_021825	CTT	2	6	2354839	2354844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879710
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54074	NC_021825	AAAT	2	8	2354973	2354980	75 %	25 %	0 %	0 %	525879711
54075	NC_021825	CGC	2	6	2355063	2355068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525879711
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54078	NC_021825	GTCC	2	8	2355234	2355241	0 %	25 %	25 %	50 %	525879711
54079	NC_021825	TTGC	2	8	2355258	2355265	0 %	50 %	25 %	25 %	525879711
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54085	NC_021825	TTC	2	6	2356008	2356013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879712
54086	NC_021825	CATT	2	8	2356097	2356104	25 %	50 %	0 %	25 %	525879712
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54090	NC_021825	AATT	2	8	2356491	2356498	50 %	50 %	0 %	0 %	525879712
54091	NC_021825	TCT	2	6	2356571	2356576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54092	NC_021825	GTT	2	6	2356596	2356601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879713
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54103	NC_021825	TCTACT	2	12	2357525	2357536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525879713
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54109	NC_021825	TCT	2	6	2357813	2357818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879713
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54112	NC_021825	GTCG	2	8	2357989	2357996	0 %	25 %	50 %	25 %	525879713
54113	NC_021825	TTA	3	9	2358011	2358019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525879713
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54116	NC_021825	CAA	2	6	2358296	2358301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525879713
54117	NC_021825	TA	3	6	2358411	2358416	50 %	50 %	0 %	0 %	525879713
54118	NC_021825	AGA	2	6	2358417	2358422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525879713
54119	NC_021825	ATCT	2	8	2358427	2358434	25 %	50 %	0 %	25 %	525879713
54120	NC_021825	GTT	2	6	2358450	2358455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879713
54121	NC_021825	GCT	3	9	2358479	2358487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879713
54122	NC_021825	GAA	2	6	2358490	2358495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525879713
54123	NC_021825	ATC	2	6	2358502	2358507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879713
54124	NC_021825	CTT	2	6	2358558	2358563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879713
54125	NC_021825	CAA	2	6	2358568	2358573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525879713
54126	NC_021825	CTT	2	6	2358618	2358623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879713
54127	NC_021825	CGA	2	6	2358680	2358685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879713
54128	NC_021825	AAAGC	2	10	2358707	2358716	60 %	0 %	20 %	20 %	525879713
54129	NC_021825	CAA	2	6	2358729	2358734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525879713
54130	NC_021825	GTT	2	6	2358767	2358772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879713
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54135	NC_021825	ACAA	2	8	2359096	2359103	75 %	0 %	0 %	25 %	525879713
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54143	NC_021825	TTCA	2	8	2359378	2359385	25 %	50 %	0 %	25 %	525879713
54144	NC_021825	T	6	6	2359417	2359422	0 %	100 %	0 %	0 %	525879713
54145	NC_021825	CAG	2	6	2359476	2359481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879713
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54147	NC_021825	CTT	3	9	2359671	2359679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879713
54148	NC_021825	CTG	2	6	2359719	2359724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879713
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54150	NC_021825	TCA	2	6	2359816	2359821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879714
54151	NC_021825	TCA	2	6	2359833	2359838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879714
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54154	NC_021825	TG	3	6	2359951	2359956	0 %	50 %	50 %	0 %	525879714
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54166	NC_021825	GGAA	2	8	2360609	2360616	50 %	0 %	50 %	0 %	525879714
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54177	NC_021825	CTT	2	6	2361045	2361050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879715
54178	NC_021825	TTCG	2	8	2361127	2361134	0 %	50 %	25 %	25 %	525879715
54179	NC_021825	TA	3	6	2361150	2361155	50 %	50 %	0 %	0 %	525879715
54180	NC_021825	AGC	2	6	2361193	2361198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879715
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54185	NC_021825	G	6	6	2361320	2361325	0 %	0 %	100 %	0 %	525879715
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54188	NC_021825	CCCG	2	8	2361413	2361420	0 %	0 %	25 %	75 %	525879715
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54190	NC_021825	GACA	2	8	2361465	2361472	50 %	0 %	25 %	25 %	525879715
54191	NC_021825	CTT	2	6	2361558	2361563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879715
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54194	NC_021825	CTT	2	6	2361729	2361734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879715
54195	NC_021825	TTG	2	6	2361774	2361779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879715
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54199	NC_021825	AATT	2	8	2362003	2362010	50 %	50 %	0 %	0 %	525879715
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54201	NC_021825	T	6	6	2362136	2362141	0 %	100 %	0 %	0 %	525879715
54202	NC_021825	CTA	2	6	2362256	2362261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879716
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54204	NC_021825	CTTT	2	8	2362372	2362379	0 %	75 %	0 %	25 %	525879716
54205	NC_021825	TGT	2	6	2362411	2362416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879716
54206	NC_021825	TCA	2	6	2362456	2362461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879716
54207	NC_021825	TAAG	2	8	2362467	2362474	50 %	25 %	25 %	0 %	525879716
54208	NC_021825	TCG	2	6	2362495	2362500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879716
54209	NC_021825	TC	3	6	2362507	2362512	0 %	50 %	0 %	50 %	525879716
54210	NC_021825	AGT	2	6	2362657	2362662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879716
54211	NC_021825	CATC	2	8	2362684	2362691	25 %	25 %	0 %	50 %	525879716
54212	NC_021825	CCG	2	6	2362693	2362698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525879716
54213	NC_021825	TCT	2	6	2362744	2362749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879716
54214	NC_021825	AAC	2	6	2362854	2362859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525879716
54215	NC_021825	A	6	6	2362920	2362925	100 %	0 %	0 %	0 %	525879716
54216	NC_021825	T	6	6	2362962	2362967	0 %	100 %	0 %	0 %	525879716
54217	NC_021825	GCC	2	6	2362984	2362989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525879716
54218	NC_021825	TAA	2	6	2362995	2363000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879716
54219	NC_021825	ACA	2	6	2363036	2363041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525879716
54220	NC_021825	T	6	6	2363100	2363105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54221	NC_021825	T	7	7	2363117	2363123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54222	NC_021825	GCC	2	6	2363237	2363242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525879717
54223	NC_021825	ACT	2	6	2363250	2363255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879717
54224	NC_021825	AAT	2	6	2363270	2363275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879717
54225	NC_021825	ATTTT	2	10	2363301	2363310	20 %	80 %	0 %	0 %	525879717
54226	NC_021825	ATC	2	6	2363313	2363318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879717
54227	NC_021825	GCC	2	6	2363366	2363371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525879717
54228	NC_021825	CTG	2	6	2363377	2363382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879717
54229	NC_021825	CTC	2	6	2363449	2363454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525879717
54230	NC_021825	AACA	2	8	2363459	2363466	75 %	0 %	0 %	25 %	525879717
54231	NC_021825	TA	3	6	2363470	2363475	50 %	50 %	0 %	0 %	525879717
54232	NC_021825	GGT	2	6	2363523	2363528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525879717
54233	NC_021825	CCG	2	6	2363529	2363534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525879717
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54235	NC_021825	AGT	2	6	2363628	2363633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879717
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