MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 68153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_021825	CTTA	2	8	2307268	2307275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53002	NC_021825	TAAA	2	8	2307313	2307320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53003	NC_021825	TTCT	2	8	2307361	2307368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53004	NC_021825	TA	3	6	2307540	2307545	50 %	50 %	0 %	0 %	525880501
53005	NC_021825	TA	3	6	2307681	2307686	50 %	50 %	0 %	0 %	525880501
53006	NC_021825	TGGT	2	8	2307693	2307700	0 %	50 %	50 %	0 %	525880501
53007	NC_021825	TTCA	2	8	2307711	2307718	25 %	50 %	0 %	25 %	525880501
53008	NC_021825	CA	3	6	2307717	2307722	50 %	0 %	0 %	50 %	525880501
53009	NC_021825	TTC	2	6	2307754	2307759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880501
53010	NC_021825	TAGT	2	8	2307764	2307771	25 %	50 %	25 %	0 %	525880501
53011	NC_021825	A	6	6	2307826	2307831	100 %	0 %	0 %	0 %	525880501
53012	NC_021825	TTA	3	9	2307856	2307864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880501
53013	NC_021825	GTT	2	6	2307924	2307929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880501
53014	NC_021825	ACAA	2	8	2307934	2307941	75 %	0 %	0 %	25 %	525880501
53015	NC_021825	TCTATT	2	12	2307984	2307995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525880501
53016	NC_021825	TTAG	2	8	2308015	2308022	25 %	50 %	25 %	0 %	525880501
53017	NC_021825	TAT	2	6	2308121	2308126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880501
53018	NC_021825	TAC	2	6	2308338	2308343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880501
53019	NC_021825	ATT	2	6	2308356	2308361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880501
53020	NC_021825	T	8	8	2308360	2308367	0 %	100 %	0 %	0 %	525880501
53021	NC_021825	AAAT	2	8	2308388	2308395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53022	NC_021825	AAT	2	6	2308519	2308524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53023	NC_021825	CTT	2	6	2308559	2308564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53024	NC_021825	TGT	2	6	2308565	2308570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53025	NC_021825	TCG	2	6	2308603	2308608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53026	NC_021825	T	6	6	2308611	2308616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53027	NC_021825	A	7	7	2308621	2308627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53028	NC_021825	T	7	7	2308645	2308651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53029	NC_021825	TATT	2	8	2308653	2308660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53030	NC_021825	AAG	2	6	2308683	2308688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53031	NC_021825	CAA	2	6	2308702	2308707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53032	NC_021825	AT	3	6	2308726	2308731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53033	NC_021825	GCT	2	6	2308748	2308753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53034	NC_021825	T	6	6	2308809	2308814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53035	NC_021825	CTT	2	6	2308846	2308851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53036	NC_021825	GTATA	2	10	2308883	2308892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53037	NC_021825	GTTTTG	2	12	2308945	2308956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53038	NC_021825	GTAA	2	8	2309058	2309065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53039	NC_021825	CAAAA	2	10	2309110	2309119	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53040	NC_021825	GTAG	2	8	2309200	2309207	25 %	25 %	50 %	0 %	525879668
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53042	NC_021825	ACG	2	6	2309234	2309239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879668
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53048	NC_021825	CAA	2	6	2309516	2309521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53049	NC_021825	CATT	2	8	2309523	2309530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53050	NC_021825	TAA	2	6	2309536	2309541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53051	NC_021825	TC	3	6	2309569	2309574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53052	NC_021825	T	7	7	2309619	2309625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53053	NC_021825	A	6	6	2309644	2309649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53054	NC_021825	GCT	2	6	2309736	2309741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879669
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53067	NC_021825	A	7	7	2310496	2310502	100 %	0 %	0 %	0 %	525880502
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53070	NC_021825	TGA	2	6	2310661	2310666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880502
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53092	NC_021825	GTA	2	6	2311635	2311640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879671
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53115	NC_021825	T	6	6	2312740	2312745	0 %	100 %	0 %	0 %	525879673
53116	NC_021825	CAT	2	6	2312769	2312774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879673
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53119	NC_021825	AAAAT	2	10	2312857	2312866	80 %	20 %	0 %	0 %	525879673
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53122	NC_021825	CTT	2	6	2312916	2312921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879673
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53222	NC_021825	GCATCC	2	12	2317623	2317634	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525880503
53223	NC_021825	GCATCA	3	18	2317635	2317652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
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53225	NC_021825	TCGGCG	2	12	2317704	2317715	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525880503
53226	NC_021825	TCAGCA	5	30	2317752	2317781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53227	NC_021825	TCAGCG	2	12	2317782	2317793	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525880503
53228	NC_021825	TCGGCA	2	12	2317806	2317817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525880503
53229	NC_021825	GCATCA	2	12	2317839	2317850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53230	NC_021825	GCATCA	2	12	2317857	2317868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53231	NC_021825	GCATCA	3	18	2317887	2317904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53232	NC_021825	GCGTCA	2	12	2317965	2317976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525880503
53233	NC_021825	GCGTCA	2	12	2317983	2317994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525880503
53234	NC_021825	GCATCA	2	12	2318001	2318012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53235	NC_021825	GCATCA	3	18	2318025	2318042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53236	NC_021825	GCATCA	4	24	2318061	2318084	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53237	NC_021825	GCATCC	2	12	2318127	2318138	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525880503
53238	NC_021825	GCGTCG	2	12	2318145	2318156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525880503
53239	NC_021825	TCGGCA	2	12	2318214	2318225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525880503
53240	NC_021825	TCAGCA	2	12	2318226	2318237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53241	NC_021825	TCCGCA	2	12	2318238	2318249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525880503
53242	NC_021825	GCATCC	2	12	2318253	2318264	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525880503
53243	NC_021825	GCATCA	2	12	2318265	2318276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53244	NC_021825	GCATCG	3	18	2318313	2318330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525880503
53245	NC_021825	GCATCA	3	18	2318367	2318384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53246	NC_021825	GCATCC	2	12	2318391	2318402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525880503
53247	NC_021825	GCATCC	2	12	2318451	2318462	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525880503
53248	NC_021825	GCATCA	2	12	2318487	2318498	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53249	NC_021825	GTA	2	6	2318538	2318543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880503
53250	NC_021825	AGC	2	6	2318606	2318611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525880503
53251	NC_021825	CAT	2	6	2318626	2318631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880503
53252	NC_021825	TAC	2	6	2318695	2318700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880503
53253	NC_021825	CAACTC	2	12	2318701	2318712	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525880503
53254	NC_021825	CTA	2	6	2318748	2318753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880503
53255	NC_021825	AAT	2	6	2318805	2318810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880503
53256	NC_021825	AGA	2	6	2318888	2318893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525880503
53257	NC_021825	GCACTA	2	12	2318937	2318948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525880503
53258	NC_021825	TAA	2	6	2319020	2319025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880503
53259	NC_021825	TTG	2	6	2319031	2319036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880503
53260	NC_021825	CAT	2	6	2319110	2319115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880503
53261	NC_021825	GTT	2	6	2319117	2319122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880503
53262	NC_021825	TAA	2	6	2319127	2319132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880503
53263	NC_021825	AATT	2	8	2319140	2319147	50 %	50 %	0 %	0 %	525880503
53264	NC_021825	T	6	6	2319200	2319205	0 %	100 %	0 %	0 %	525880503
53265	NC_021825	CAT	2	6	2319206	2319211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880503
53266	NC_021825	AATC	2	8	2319226	2319233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53267	NC_021825	TAA	2	6	2319291	2319296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53268	NC_021825	CCCT	2	8	2319362	2319369	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53269	NC_021825	TA	3	6	2319419	2319424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53270	NC_021825	A	6	6	2319463	2319468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53271	NC_021825	TTC	2	6	2319627	2319632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53272	NC_021825	A	9	9	2319655	2319663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53273	NC_021825	T	6	6	2319684	2319689	0 %	100 %	0 %	0 %	525879679
53274	NC_021825	T	7	7	2319703	2319709	0 %	100 %	0 %	0 %	525879679
53275	NC_021825	GTT	2	6	2319711	2319716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879679
53276	NC_021825	T	6	6	2319718	2319723	0 %	100 %	0 %	0 %	525879679
53277	NC_021825	TCA	2	6	2319788	2319793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879679
53278	NC_021825	ATCA	2	8	2319844	2319851	50 %	25 %	0 %	25 %	525879679
53279	NC_021825	T	6	6	2319853	2319858	0 %	100 %	0 %	0 %	525879679
53280	NC_021825	TGC	2	6	2319871	2319876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879679
53281	NC_021825	T	6	6	2319892	2319897	0 %	100 %	0 %	0 %	525879679
53282	NC_021825	A	7	7	2320063	2320069	100 %	0 %	0 %	0 %	525879679
53283	NC_021825	TAA	2	6	2320101	2320106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879679
53284	NC_021825	TG	3	6	2320175	2320180	0 %	50 %	50 %	0 %	525879679
53285	NC_021825	TCA	2	6	2320203	2320208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879679
53286	NC_021825	GTAT	2	8	2320303	2320310	25 %	50 %	25 %	0 %	525879679
53287	NC_021825	TAGT	2	8	2320383	2320390	25 %	50 %	25 %	0 %	525879679
53288	NC_021825	GTT	2	6	2320397	2320402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879679
53289	NC_021825	TAATT	2	10	2320441	2320450	40 %	60 %	0 %	0 %	525879679
53290	NC_021825	TCT	2	6	2320502	2320507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879679
53291	NC_021825	TCC	2	6	2320522	2320527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525879679
53292	NC_021825	CCCCTG	2	12	2320551	2320562	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525879679
53293	NC_021825	TTCT	2	8	2320584	2320591	0 %	75 %	0 %	25 %	525879679
53294	NC_021825	CCT	2	6	2320592	2320597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53295	NC_021825	CTT	2	6	2320606	2320611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53296	NC_021825	GTTG	2	8	2320634	2320641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53297	NC_021825	A	7	7	2320687	2320693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53298	NC_021825	T	6	6	2320766	2320771	0 %	100 %	0 %	0 %	525879680
53299	NC_021825	GCC	2	6	2320778	2320783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525879680
53300	NC_021825	TCA	2	6	2320798	2320803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879680
53301	NC_021825	T	7	7	2320804	2320810	0 %	100 %	0 %	0 %	525879680
53302	NC_021825	TCT	2	6	2320883	2320888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879680
53303	NC_021825	TGA	2	6	2320897	2320902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879680
53304	NC_021825	GTT	2	6	2320963	2320968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879680
53305	NC_021825	ATC	2	6	2320970	2320975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879680
53306	NC_021825	TGT	2	6	2320984	2320989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879680
53307	NC_021825	TTTG	2	8	2321003	2321010	0 %	75 %	25 %	0 %	525879680
53308	NC_021825	CAT	2	6	2321018	2321023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879680
53309	NC_021825	AGT	2	6	2321028	2321033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525879680
53310	NC_021825	TTG	2	6	2321060	2321065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879680
53311	NC_021825	AAG	2	6	2321076	2321081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525879680
53312	NC_021825	TGT	2	6	2321098	2321103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879680
53313	NC_021825	T	6	6	2321110	2321115	0 %	100 %	0 %	0 %	525879680
53314	NC_021825	T	6	6	2321131	2321136	0 %	100 %	0 %	0 %	525879680
53315	NC_021825	TGGA	2	8	2321216	2321223	25 %	25 %	50 %	0 %	525879680
53316	NC_021825	T	6	6	2321242	2321247	0 %	100 %	0 %	0 %	525879680
53317	NC_021825	CAC	3	9	2321305	2321313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525879680
53318	NC_021825	ACA	2	6	2321415	2321420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525879680
53319	NC_021825	TTTC	2	8	2321446	2321453	0 %	75 %	0 %	25 %	525879680
53320	NC_021825	GAC	2	6	2321494	2321499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879680
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53323	NC_021825	TTGC	2	8	2321615	2321622	0 %	50 %	25 %	25 %	525879680
53324	NC_021825	CTG	2	6	2321665	2321670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879680
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53326	NC_021825	TAA	2	6	2321705	2321710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879680
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53338	NC_021825	T	7	7	2322203	2322209	0 %	100 %	0 %	0 %	525879681
53339	NC_021825	TTC	2	6	2322224	2322229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879681
53340	NC_021825	TTC	2	6	2322245	2322250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879681
53341	NC_021825	TTC	2	6	2322296	2322301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879681
53342	NC_021825	ATC	2	6	2322323	2322328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525879681
53343	NC_021825	ATA	2	6	2322332	2322337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879681
53344	NC_021825	TGT	2	6	2322362	2322367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879681
53345	NC_021825	ATA	2	6	2322391	2322396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525879681
53346	NC_021825	TCT	2	6	2322412	2322417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525879681
53347	NC_021825	CT	3	6	2322435	2322440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53348	NC_021825	AAGG	2	8	2322476	2322483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53349	NC_021825	A	6	6	2322497	2322502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53350	NC_021825	ATT	2	6	2322536	2322541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525879682
53351	NC_021825	GTC	2	6	2322606	2322611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525879682
53352	NC_021825	CGA	2	6	2322629	2322634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525879682
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53354	NC_021825	GTT	2	6	2322730	2322735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525879682
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53473	NC_021825	TG	3	6	2327731	2327736	0 %	50 %	50 %	0 %	525879684
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53476	NC_021825	TAA	2	6	2327829	2327834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53477	NC_021825	GCT	2	6	2327869	2327874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53478	NC_021825	CAA	2	6	2327887	2327892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53485	NC_021825	ATT	2	6	2328273	2328278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53500	NC_021825	CTTCTA	2	12	2328914	2328925	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525879686

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