MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021824	T	7	7	154815	154821	0 %	100 %	0 %	0 %	525869900
3502	NC_021824	GAA	2	6	154867	154872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869900
3503	NC_021824	AAGC	2	8	154886	154893	50 %	0 %	25 %	25 %	525869900
3504	NC_021824	CAA	2	6	154897	154902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869900
3505	NC_021824	GCC	2	6	154925	154930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869900
3506	NC_021824	ATT	2	6	154940	154945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869900
3507	NC_021824	ATC	2	6	154949	154954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869900
3508	NC_021824	TTTTA	2	10	154982	154991	20 %	80 %	0 %	0 %	525869900
3509	NC_021824	GCT	2	6	155043	155048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869900
3510	NC_021824	CGA	2	6	155098	155103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869900
3511	NC_021824	CTG	2	6	155128	155133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869900
3512	NC_021824	TGAA	2	8	155226	155233	50 %	25 %	25 %	0 %	525869900
3513	NC_021824	CTT	2	6	155275	155280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869900
3514	NC_021824	CTC	2	6	155312	155317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525869900
3515	NC_021824	ATT	2	6	155343	155348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869900
3516	NC_021824	GCT	2	6	155377	155382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869900
3517	NC_021824	T	6	6	155431	155436	0 %	100 %	0 %	0 %	525869900
3518	NC_021824	AT	3	6	155471	155476	50 %	50 %	0 %	0 %	525869901
3519	NC_021824	ACC	2	6	155501	155506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869901
3520	NC_021824	T	6	6	155532	155537	0 %	100 %	0 %	0 %	525869901
3521	NC_021824	TAC	2	6	155544	155549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869901
3522	NC_021824	T	6	6	155558	155563	0 %	100 %	0 %	0 %	525869901
3523	NC_021824	T	6	6	155568	155573	0 %	100 %	0 %	0 %	525869901
3524	NC_021824	AAG	2	6	155623	155628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869901
3525	NC_021824	CT	3	6	155644	155649	0 %	50 %	0 %	50 %	525869901
3526	NC_021824	GTT	2	6	155685	155690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869901
3527	NC_021824	TGCT	2	8	155721	155728	0 %	50 %	25 %	25 %	525869901
3528	NC_021824	AATT	2	8	155746	155753	50 %	50 %	0 %	0 %	525869901
3529	NC_021824	CAA	2	6	155793	155798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869901
3530	NC_021824	TAA	2	6	155839	155844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869901
3531	NC_021824	TGA	2	6	156116	156121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869901
3532	NC_021824	ACT	2	6	156155	156160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021824	CCT	2	6	156161	156166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_021824	CAT	2	6	156207	156212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021824	TAG	2	6	156406	156411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021824	TAT	2	6	156416	156421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021824	GCTTT	2	10	156477	156486	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3538	NC_021824	ATAAA	2	10	156490	156499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021824	ATT	2	6	156545	156550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869902
3540	NC_021824	CCAT	2	8	156554	156561	25 %	25 %	0 %	50 %	525869902
3541	NC_021824	ATT	2	6	156583	156588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869902
3542	NC_021824	ACA	2	6	156625	156630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869902
3543	NC_021824	A	6	6	156664	156669	100 %	0 %	0 %	0 %	525869902
3544	NC_021824	TTATA	2	10	156702	156711	40 %	60 %	0 %	0 %	525869902
3545	NC_021824	GAC	2	6	156742	156747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869902
3546	NC_021824	A	6	6	156792	156797	100 %	0 %	0 %	0 %	525869902
3547	NC_021824	A	6	6	156807	156812	100 %	0 %	0 %	0 %	525869902
3548	NC_021824	TGT	2	6	156819	156824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869902
3549	NC_021824	GGA	2	6	156841	156846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525869902
3550	NC_021824	GGC	2	6	156862	156867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869902
3551	NC_021824	TTG	2	6	156944	156949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869902
3552	NC_021824	A	6	6	157021	157026	100 %	0 %	0 %	0 %	525869902
3553	NC_021824	AGT	2	6	157041	157046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869902
3554	NC_021824	TTG	2	6	157058	157063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869902
3555	NC_021824	ACG	2	6	157067	157072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869902
3556	NC_021824	T	6	6	157083	157088	0 %	100 %	0 %	0 %	525869902
3557	NC_021824	AAG	2	6	157130	157135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869902
3558	NC_021824	A	8	8	157231	157238	100 %	0 %	0 %	0 %	525869903
3559	NC_021824	CTA	2	6	157254	157259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869903
3560	NC_021824	ATT	2	6	157261	157266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869903
3561	NC_021824	TGA	3	9	157279	157287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869903
3562	NC_021824	CTA	2	6	157320	157325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869903
3563	NC_021824	TTC	2	6	157326	157331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869903
3564	NC_021824	AGA	2	6	157336	157341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869903
3565	NC_021824	TGA	2	6	157399	157404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869903
3566	NC_021824	ACA	2	6	157526	157531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869903
3567	NC_021824	TCAA	2	8	157604	157611	50 %	25 %	0 %	25 %	525869903
3568	NC_021824	ACT	2	6	157612	157617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869903
3569	NC_021824	ATC	2	6	157743	157748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_021824	T	6	6	157749	157754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021824	T	8	8	157758	157765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021824	TAA	2	6	157781	157786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021824	CAA	2	6	157841	157846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021824	AT	3	6	157889	157894	50 %	50 %	0 %	0 %	525869904
3575	NC_021824	TGA	2	6	157907	157912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869904
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3577	NC_021824	GCA	2	6	157924	157929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869904
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3579	NC_021824	AAAAC	2	10	158028	158037	80 %	0 %	0 %	20 %	525869904
3580	NC_021824	GCA	2	6	158040	158045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869904
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3583	NC_021824	AGA	3	9	158360	158368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869904
3584	NC_021824	ATT	2	6	158386	158391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869904
3585	NC_021824	A	7	7	158513	158519	100 %	0 %	0 %	0 %	525869904
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3587	NC_021824	TCT	2	6	158649	158654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869904
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3589	NC_021824	AACTT	2	10	158706	158715	40 %	40 %	0 %	20 %	525869904
3590	NC_021824	TCAA	2	8	158716	158723	50 %	25 %	0 %	25 %	525869904
3591	NC_021824	CTTAA	2	10	158775	158784	40 %	40 %	0 %	20 %	525869904
3592	NC_021824	TATT	2	8	158810	158817	25 %	75 %	0 %	0 %	525869904
3593	NC_021824	TGA	2	6	158828	158833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869904
3594	NC_021824	GAAT	2	8	158855	158862	50 %	25 %	25 %	0 %	525869904
3595	NC_021824	TGA	2	6	158867	158872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869904
3596	NC_021824	AAC	2	6	158884	158889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869904
3597	NC_021824	GCA	2	6	158901	158906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869904
3598	NC_021824	A	7	7	158950	158956	100 %	0 %	0 %	0 %	525869904
3599	NC_021824	CAA	2	6	158960	158965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021824	TAA	2	6	158967	158972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021824	GTT	2	6	158976	158981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021824	TTTTCG	2	12	158992	159003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525869905
3603	NC_021824	T	6	6	159009	159014	0 %	100 %	0 %	0 %	525869905
3604	NC_021824	CAA	2	6	159066	159071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869905
3605	NC_021824	TAA	3	9	159091	159099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869905
3606	NC_021824	TAA	2	6	159103	159108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869905
3607	NC_021824	AGT	2	6	159121	159126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869905
3608	NC_021824	TCT	2	6	159277	159282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869905
3609	NC_021824	A	7	7	159292	159298	100 %	0 %	0 %	0 %	525869905
3610	NC_021824	ATA	2	6	159323	159328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869905
3611	NC_021824	CTG	2	6	159471	159476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869905
3612	NC_021824	CAA	2	6	159501	159506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869905
3613	NC_021824	AAAGC	2	10	159519	159528	60 %	0 %	20 %	20 %	525869905
3614	NC_021824	AAT	2	6	159553	159558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869905
3615	NC_021824	ACC	2	6	159565	159570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869905
3616	NC_021824	CAA	2	6	159618	159623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869905
3617	NC_021824	AAT	2	6	159628	159633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869905
3618	NC_021824	TAA	2	6	159687	159692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869905
3619	NC_021824	AGC	2	6	159730	159735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869905
3620	NC_021824	AT	3	6	159777	159782	50 %	50 %	0 %	0 %	525869905
3621	NC_021824	AAT	3	9	159802	159810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869905
3622	NC_021824	AAAT	2	8	159821	159828	75 %	25 %	0 %	0 %	525869905
3623	NC_021824	ATC	2	6	159863	159868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869905
3624	NC_021824	T	6	6	160044	160049	0 %	100 %	0 %	0 %	525869906
3625	NC_021824	TTTA	2	8	160061	160068	25 %	75 %	0 %	0 %	525869906
3626	NC_021824	TTCT	2	8	160075	160082	0 %	75 %	0 %	25 %	525869906
3627	NC_021824	ATCTAA	2	12	160109	160120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525869906
3628	NC_021824	AGC	2	6	160253	160258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869906
3629	NC_021824	CCTA	2	8	160277	160284	25 %	25 %	0 %	50 %	525869906
3630	NC_021824	GCC	2	6	160301	160306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869906
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3632	NC_021824	ACC	2	6	160367	160372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869906
3633	NC_021824	CG	3	6	160375	160380	0 %	0 %	50 %	50 %	525869906
3634	NC_021824	ATC	2	6	160433	160438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869906
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3637	NC_021824	AAC	2	6	160569	160574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869906
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3640	NC_021824	TCTT	2	8	160665	160672	0 %	75 %	0 %	25 %	525869906
3641	NC_021824	AT	3	6	160713	160718	50 %	50 %	0 %	0 %	525869906
3642	NC_021824	ACTA	2	8	160721	160728	50 %	25 %	0 %	25 %	525869906
3643	NC_021824	TGC	2	6	160752	160757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869906
3644	NC_021824	CTT	2	6	160790	160795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869906
3645	NC_021824	T	6	6	160830	160835	0 %	100 %	0 %	0 %	525869906
3646	NC_021824	CATTT	2	10	160877	160886	20 %	60 %	0 %	20 %	525869906
3647	NC_021824	TTTC	2	8	160933	160940	0 %	75 %	0 %	25 %	525869906
3648	NC_021824	CAA	2	6	160955	160960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869906
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3653	NC_021824	CTT	2	6	161158	161163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869906
3654	NC_021824	TAA	2	6	161209	161214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869907
3655	NC_021824	A	7	7	161237	161243	100 %	0 %	0 %	0 %	525869907
3656	NC_021824	GC	4	8	161314	161321	0 %	0 %	50 %	50 %	525869907
3657	NC_021824	ATG	2	6	161510	161515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869907
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3660	NC_021824	AAC	2	6	161602	161607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869907
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3662	NC_021824	GCAT	2	8	161766	161773	25 %	25 %	25 %	25 %	525869907
3663	NC_021824	ACA	2	6	161796	161801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869907
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3669	NC_021824	TAT	2	6	161929	161934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3670	NC_021824	A	6	6	161981	161986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3671	NC_021824	GAAT	2	8	162028	162035	50 %	25 %	25 %	0 %	525869908
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3722	NC_021824	A	6	6	163833	163838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3723	NC_021824	TAGG	2	8	163880	163887	25 %	25 %	50 %	0 %	525869910
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3740	NC_021824	TCT	2	6	164672	164677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869911
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3744	NC_021824	AGC	2	6	164923	164928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869911
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3997	NC_021824	A	7	7	177035	177041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_021824	A	6	6	177063	177068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_021824	CTT	2	6	177151	177156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869925
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