MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_021824	ATCC	2	8	1540203	1540210	25 %	25 %	0 %	50 %	525871058
35002	NC_021824	TG	3	6	1540272	1540277	0 %	50 %	50 %	0 %	525871058
35003	NC_021824	CTT	2	6	1540310	1540315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871058
35004	NC_021824	TCGT	2	8	1540369	1540376	0 %	50 %	25 %	25 %	525871058
35005	NC_021824	GAA	2	6	1540418	1540423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871058
35006	NC_021824	TAAA	2	8	1540428	1540435	75 %	25 %	0 %	0 %	525871058
35007	NC_021824	CAG	2	6	1540440	1540445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871058
35008	NC_021824	AAG	2	6	1540446	1540451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871058
35009	NC_021824	AAT	2	6	1540482	1540487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871058
35010	NC_021824	TGT	2	6	1540513	1540518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35011	NC_021824	TGT	2	6	1540532	1540537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35012	NC_021824	AGTT	2	8	1540572	1540579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35013	NC_021824	CAA	2	6	1540591	1540596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35014	NC_021824	TATC	2	8	1540604	1540611	25 %	50 %	0 %	25 %	525871059
35015	NC_021824	T	7	7	1540622	1540628	0 %	100 %	0 %	0 %	525871059
35016	NC_021824	TTGTC	2	10	1540642	1540651	0 %	60 %	20 %	20 %	525871059
35017	NC_021824	TAGA	2	8	1540657	1540664	50 %	25 %	25 %	0 %	525871059
35018	NC_021824	ATT	2	6	1540683	1540688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871059
35019	NC_021824	T	7	7	1540704	1540710	0 %	100 %	0 %	0 %	525871059
35020	NC_021824	GGT	2	6	1540721	1540726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871059
35021	NC_021824	ACT	2	6	1540754	1540759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871059
35022	NC_021824	TTA	2	6	1540788	1540793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871059
35023	NC_021824	T	6	6	1540809	1540814	0 %	100 %	0 %	0 %	525871059
35024	NC_021824	ATT	2	6	1540902	1540907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871059
35025	NC_021824	TTA	3	9	1540927	1540935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871059
35026	NC_021824	GTA	2	6	1540945	1540950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871059
35027	NC_021824	TTTTTA	2	12	1541022	1541033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525871059
35028	NC_021824	AATTT	2	10	1541062	1541071	40 %	60 %	0 %	0 %	525871059
35029	NC_021824	TTGC	2	8	1541142	1541149	0 %	50 %	25 %	25 %	525871059
35030	NC_021824	A	6	6	1541196	1541201	100 %	0 %	0 %	0 %	525871059
35031	NC_021824	TGG	2	6	1541228	1541233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871059
35032	NC_021824	CAGAAG	2	12	1541257	1541268	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525871059
35033	NC_021824	TGA	2	6	1541300	1541305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871059
35034	NC_021824	TAT	3	9	1541312	1541320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871059
35035	NC_021824	AAT	2	6	1541415	1541420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871059
35036	NC_021824	ATTT	2	8	1541425	1541432	25 %	75 %	0 %	0 %	525871059
35037	NC_021824	A	6	6	1541553	1541558	100 %	0 %	0 %	0 %	525871059
35038	NC_021824	TTA	2	6	1541580	1541585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871059
35039	NC_021824	T	6	6	1541592	1541597	0 %	100 %	0 %	0 %	525871059
35040	NC_021824	AGG	2	6	1541632	1541637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525871059
35041	NC_021824	TTG	2	6	1541662	1541667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871060
35042	NC_021824	AGA	2	6	1541756	1541761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871060
35043	NC_021824	TAA	2	6	1541810	1541815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871060
35044	NC_021824	AT	3	6	1541821	1541826	50 %	50 %	0 %	0 %	525871060
35045	NC_021824	TGGT	2	8	1541836	1541843	0 %	50 %	50 %	0 %	525871060
35046	NC_021824	A	7	7	1541952	1541958	100 %	0 %	0 %	0 %	525871060
35047	NC_021824	AGG	2	6	1542056	1542061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525871060
35048	NC_021824	ACA	2	6	1542146	1542151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871060
35049	NC_021824	AATTGC	2	12	1542170	1542181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525871060
35050	NC_021824	GGC	2	6	1542224	1542229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871060
35051	NC_021824	GGT	2	6	1542267	1542272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871060
35052	NC_021824	GCA	2	6	1542273	1542278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871060
35053	NC_021824	GAT	2	6	1542321	1542326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871060
35054	NC_021824	TTA	2	6	1542343	1542348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871060
35055	NC_021824	A	6	6	1542430	1542435	100 %	0 %	0 %	0 %	525871060
35056	NC_021824	GAA	2	6	1542468	1542473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871060
35057	NC_021824	A	7	7	1542505	1542511	100 %	0 %	0 %	0 %	525871060
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35060	NC_021824	AAGA	2	8	1542608	1542615	75 %	0 %	25 %	0 %	525871061
35061	NC_021824	AAC	2	6	1542657	1542662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871061
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35065	NC_021824	TGC	2	6	1542876	1542881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871061
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35067	NC_021824	CT	3	6	1543029	1543034	0 %	50 %	0 %	50 %	525871061
35068	NC_021824	CTC	2	6	1543059	1543064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871061
35069	NC_021824	TCA	2	6	1543090	1543095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871061
35070	NC_021824	T	6	6	1543149	1543154	0 %	100 %	0 %	0 %	525871061
35071	NC_021824	AG	3	6	1543155	1543160	50 %	0 %	50 %	0 %	525871061
35072	NC_021824	TGGA	2	8	1543178	1543185	25 %	25 %	50 %	0 %	525871061
35073	NC_021824	TAT	3	9	1543424	1543432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871061
35074	NC_021824	GCT	2	6	1543468	1543473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871061
35075	NC_021824	TCT	2	6	1543522	1543527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871061
35076	NC_021824	ACTT	2	8	1543644	1543651	25 %	50 %	0 %	25 %	525871061
35077	NC_021824	CTTT	2	8	1543698	1543705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35078	NC_021824	GAA	2	6	1543774	1543779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35079	NC_021824	A	6	6	1543805	1543810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35080	NC_021824	TAA	2	6	1543847	1543852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35081	NC_021824	CT	3	6	1543933	1543938	0 %	50 %	0 %	50 %	525871062
35082	NC_021824	T	6	6	1543938	1543943	0 %	100 %	0 %	0 %	525871062
35083	NC_021824	CAA	2	6	1543945	1543950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871062
35084	NC_021824	CAA	2	6	1544017	1544022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871062
35085	NC_021824	T	7	7	1544170	1544176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35086	NC_021824	AAT	2	6	1544228	1544233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35087	NC_021824	GTA	2	6	1544294	1544299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35088	NC_021824	GAAA	2	8	1544304	1544311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35089	NC_021824	A	6	6	1544324	1544329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35090	NC_021824	A	6	6	1544350	1544355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35091	NC_021824	CG	3	6	1544365	1544370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35092	NC_021824	TGG	2	6	1544407	1544412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35093	NC_021824	GAGAG	2	10	1544417	1544426	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35094	NC_021824	ATT	2	6	1544451	1544456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871063
35095	NC_021824	ATGCA	2	10	1544467	1544476	40 %	20 %	20 %	20 %	525871063
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35097	NC_021824	CTG	2	6	1544488	1544493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871063
35098	NC_021824	CAAG	2	8	1544499	1544506	50 %	0 %	25 %	25 %	525871063
35099	NC_021824	A	7	7	1544515	1544521	100 %	0 %	0 %	0 %	525871063
35100	NC_021824	T	6	6	1544547	1544552	0 %	100 %	0 %	0 %	525871063
35101	NC_021824	GAT	2	6	1544610	1544615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871063
35102	NC_021824	GGT	2	6	1544689	1544694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35103	NC_021824	T	7	7	1544728	1544734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35104	NC_021824	GAAA	2	8	1544752	1544759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35105	NC_021824	ATTT	2	8	1544803	1544810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35106	NC_021824	GAAA	2	8	1544820	1544827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35107	NC_021824	AGGAAG	2	12	1544849	1544860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35108	NC_021824	GAT	2	6	1544918	1544923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871064
35109	NC_021824	TAA	2	6	1544957	1544962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871064
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35111	NC_021824	GCA	2	6	1545054	1545059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871064
35112	NC_021824	AGA	2	6	1545110	1545115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871064
35113	NC_021824	AACG	2	8	1545174	1545181	50 %	0 %	25 %	25 %	525871064
35114	NC_021824	ACTT	2	8	1545190	1545197	25 %	50 %	0 %	25 %	525871064
35115	NC_021824	TGT	2	6	1545218	1545223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871064
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35117	NC_021824	GTT	2	6	1545264	1545269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871064
35118	NC_021824	GGA	2	6	1545305	1545310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525871064
35119	NC_021824	GAT	2	6	1545316	1545321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871064
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35352	NC_021824	TGA	3	9	1556863	1556871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871077
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35478	NC_021824	TTG	2	6	1561516	1561521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871082
35479	NC_021824	ACC	2	6	1561522	1561527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871082
35480	NC_021824	ATT	2	6	1561546	1561551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871082
35481	NC_021824	ATTG	2	8	1561594	1561601	25 %	50 %	25 %	0 %	525871082
35482	NC_021824	ATTTGG	2	12	1561670	1561681	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525871082
35483	NC_021824	AGC	2	6	1561711	1561716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871082
35484	NC_021824	TTA	2	6	1561772	1561777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871082
35485	NC_021824	TAC	2	6	1561857	1561862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871082
35486	NC_021824	ACT	2	6	1561907	1561912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871082
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35489	NC_021824	CTCA	2	8	1562008	1562015	25 %	25 %	0 %	50 %	525871082
35490	NC_021824	CTT	2	6	1562070	1562075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871082
35491	NC_021824	ACA	2	6	1562177	1562182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871082
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