MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021824	ATTT	2	8	536745	536752	25 %	75 %	0 %	0 %	525870245
12003	NC_021824	A	6	6	536806	536811	100 %	0 %	0 %	0 %	525870245
12004	NC_021824	TCA	2	6	536816	536821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870245
12005	NC_021824	TGG	2	6	536835	536840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870245
12006	NC_021824	TGG	2	6	536844	536849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870245
12007	NC_021824	AT	3	6	536880	536885	50 %	50 %	0 %	0 %	525870245
12008	NC_021824	CTT	2	6	536919	536924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870245
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12013	NC_021824	GTA	2	6	537208	537213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870245
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12023	NC_021824	TGT	2	6	537655	537660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870246
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12108	NC_021824	TAG	2	6	541137	541142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872310
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12245	NC_021824	ATA	2	6	546911	546916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870252
12246	NC_021824	CAA	2	6	546975	546980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870252
12247	NC_021824	GTT	2	6	547027	547032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870252
12248	NC_021824	ATT	2	6	547078	547083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870252
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12267	NC_021824	A	6	6	548092	548097	100 %	0 %	0 %	0 %	525870252
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12329	NC_021824	A	7	7	551354	551360	100 %	0 %	0 %	0 %	525870254
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12351	NC_021824	AGA	2	6	552392	552397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12352	NC_021824	C	6	6	552417	552422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12353	NC_021824	A	7	7	552450	552456	100 %	0 %	0 %	0 %	525872314
12354	NC_021824	GAA	2	6	552457	552462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872314
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12356	NC_021824	CAG	2	6	552528	552533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872314
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12358	NC_021824	TGG	2	6	552560	552565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872314
12359	NC_021824	TTATT	2	10	552576	552585	20 %	80 %	0 %	0 %	525872314
12360	NC_021824	ATG	3	9	552630	552638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872314
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12362	NC_021824	TTGT	2	8	552749	552756	0 %	75 %	25 %	0 %	525872314
12363	NC_021824	TTA	2	6	552762	552767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872314
12364	NC_021824	TG	3	6	552826	552831	0 %	50 %	50 %	0 %	525872314
12365	NC_021824	TTG	2	6	552834	552839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872314
12366	NC_021824	TTA	3	9	552840	552848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872314
12367	NC_021824	GTT	2	6	552849	552854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872314
12368	NC_021824	AGTG	2	8	552859	552866	25 %	25 %	50 %	0 %	525872314
12369	NC_021824	ATTT	2	8	552938	552945	25 %	75 %	0 %	0 %	525872314
12370	NC_021824	AG	3	6	553009	553014	50 %	0 %	50 %	0 %	525872314
12371	NC_021824	ATTT	2	8	553021	553028	25 %	75 %	0 %	0 %	525872314
12372	NC_021824	TTTA	2	8	553036	553043	25 %	75 %	0 %	0 %	525872314
12373	NC_021824	AAC	2	6	553066	553071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872314
12374	NC_021824	A	6	6	553097	553102	100 %	0 %	0 %	0 %	525872314
12375	NC_021824	TGG	2	6	553126	553131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872314
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12378	NC_021824	GCA	2	6	553178	553183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872314
12379	NC_021824	GGT	2	6	553211	553216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872314
12380	NC_021824	TAT	2	6	553231	553236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872314
12381	NC_021824	TTA	3	9	553263	553271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872314
12382	NC_021824	TTATGT	2	12	553278	553289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525872314
12383	NC_021824	TAG	2	6	553296	553301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872314
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12385	NC_021824	AT	3	6	553534	553539	50 %	50 %	0 %	0 %	525872314
12386	NC_021824	ATT	2	6	553661	553666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872314
12387	NC_021824	A	6	6	553719	553724	100 %	0 %	0 %	0 %	525872314
12388	NC_021824	TTG	2	6	553758	553763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872314
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12390	NC_021824	GA	3	6	553806	553811	50 %	0 %	50 %	0 %	525872314
12391	NC_021824	TTC	2	6	553835	553840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872315
12392	NC_021824	A	6	6	553842	553847	100 %	0 %	0 %	0 %	525872315
12393	NC_021824	TAT	2	6	553895	553900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872315
12394	NC_021824	TTG	2	6	553957	553962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872315
12395	NC_021824	GTT	2	6	554001	554006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872315
12396	NC_021824	AT	3	6	554036	554041	50 %	50 %	0 %	0 %	525872315
12397	NC_021824	TGA	2	6	554048	554053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872315
12398	NC_021824	ACG	2	6	554077	554082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872315
12399	NC_021824	ACGT	2	8	554134	554141	25 %	25 %	25 %	25 %	525872315
12400	NC_021824	GAT	2	6	554208	554213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872315
12401	NC_021824	A	6	6	554224	554229	100 %	0 %	0 %	0 %	525872315
12402	NC_021824	AGG	2	6	554282	554287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525872315
12403	NC_021824	AGA	2	6	554327	554332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872315
12404	NC_021824	TTA	2	6	554337	554342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872315
12405	NC_021824	A	6	6	554413	554418	100 %	0 %	0 %	0 %	525872315
12406	NC_021824	ATTT	2	8	554439	554446	25 %	75 %	0 %	0 %	525872315
12407	NC_021824	ATA	2	6	554470	554475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872315
12408	NC_021824	GTA	2	6	554499	554504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872315
12409	NC_021824	GAT	2	6	554520	554525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872315
12410	NC_021824	ATAAA	2	10	554614	554623	80 %	20 %	0 %	0 %	525872315
12411	NC_021824	GAA	2	6	554652	554657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872315
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12413	NC_021824	GAA	2	6	554697	554702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872315
12414	NC_021824	CGAC	2	8	554705	554712	25 %	0 %	25 %	50 %	525872315
12415	NC_021824	GCA	2	6	554715	554720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872315
12416	NC_021824	ATTA	2	8	554727	554734	50 %	50 %	0 %	0 %	525872315
12417	NC_021824	TGG	2	6	554747	554752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872315
12418	NC_021824	ATG	2	6	554782	554787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872315
12419	NC_021824	TGGT	2	8	554833	554840	0 %	50 %	50 %	0 %	525872315
12420	NC_021824	TGG	2	6	554864	554869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872315
12421	NC_021824	GAG	2	6	554911	554916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525872315
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12423	NC_021824	CAA	2	6	554994	554999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872316
12424	NC_021824	A	6	6	555010	555015	100 %	0 %	0 %	0 %	525872316
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12430	NC_021824	ATTA	2	8	555251	555258	50 %	50 %	0 %	0 %	525872316
12431	NC_021824	GTT	2	6	555264	555269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872316
12432	NC_021824	GAT	2	6	555279	555284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872316
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12434	NC_021824	CCAA	2	8	555300	555307	50 %	0 %	0 %	50 %	525872316
12435	NC_021824	AGA	2	6	555332	555337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872316
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12439	NC_021824	TTG	2	6	555603	555608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872316
12440	NC_021824	AT	3	6	555701	555706	50 %	50 %	0 %	0 %	525872316
12441	NC_021824	TGA	2	6	555707	555712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872316
12442	NC_021824	GCA	2	6	555723	555728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872316
12443	NC_021824	AGC	2	6	555752	555757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872316
12444	NC_021824	AAAG	2	8	555771	555778	75 %	0 %	25 %	0 %	525872316
12445	NC_021824	AAT	2	6	555794	555799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872316
12446	NC_021824	ATT	2	6	555852	555857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872316
12447	NC_021824	TAG	2	6	555864	555869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872316
12448	NC_021824	AGG	2	6	555952	555957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12449	NC_021824	GGC	2	6	556073	556078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525872317
12450	NC_021824	TGG	2	6	556080	556085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872317
12451	NC_021824	CAA	2	6	556096	556101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872317
12452	NC_021824	AAG	2	6	556109	556114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872317
12453	NC_021824	ATG	3	9	556226	556234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872317
12454	NC_021824	T	6	6	556260	556265	0 %	100 %	0 %	0 %	525872317
12455	NC_021824	GTG	2	6	556289	556294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872317
12456	NC_021824	TCT	2	6	556323	556328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872317
12457	NC_021824	A	7	7	556371	556377	100 %	0 %	0 %	0 %	525872317
12458	NC_021824	TAC	2	6	556402	556407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872317
12459	NC_021824	ATTTT	2	10	556418	556427	20 %	80 %	0 %	0 %	525872317
12460	NC_021824	GTT	2	6	556433	556438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872317
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12462	NC_021824	GAAG	2	8	556495	556502	50 %	0 %	50 %	0 %	525872317
12463	NC_021824	A	7	7	556542	556548	100 %	0 %	0 %	0 %	525872317
12464	NC_021824	AAAC	2	8	556601	556608	75 %	0 %	0 %	25 %	525872317
12465	NC_021824	GTT	2	6	556651	556656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872317
12466	NC_021824	GAA	2	6	556745	556750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872317
12467	NC_021824	TTA	2	6	556790	556795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872317
12468	NC_021824	AG	3	6	556803	556808	50 %	0 %	50 %	0 %	525872317
12469	NC_021824	GCT	2	6	556864	556869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872317
12470	NC_021824	TTA	2	6	556901	556906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872317
12471	NC_021824	TGA	2	6	556920	556925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872317
12472	NC_021824	AAAGAT	2	12	556930	556941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525872317
12473	NC_021824	GGC	2	6	557014	557019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525872317
12474	NC_021824	TTAA	2	8	557183	557190	50 %	50 %	0 %	0 %	525872318
12475	NC_021824	CAA	3	9	557232	557240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872318
12476	NC_021824	T	6	6	557242	557247	0 %	100 %	0 %	0 %	525872318
12477	NC_021824	ACA	2	6	557291	557296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872318
12478	NC_021824	GAA	2	6	557372	557377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872318
12479	NC_021824	ATT	2	6	557390	557395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872318
12480	NC_021824	A	6	6	557441	557446	100 %	0 %	0 %	0 %	525872318
12481	NC_021824	ATTT	2	8	557465	557472	25 %	75 %	0 %	0 %	525872318
12482	NC_021824	T	7	7	557470	557476	0 %	100 %	0 %	0 %	525872318
12483	NC_021824	TGC	2	6	557497	557502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872318
12484	NC_021824	GAT	2	6	557600	557605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872318
12485	NC_021824	TACG	2	8	557620	557627	25 %	25 %	25 %	25 %	525872318
12486	NC_021824	GACAT	2	10	557631	557640	40 %	20 %	20 %	20 %	525872318
12487	NC_021824	ATA	3	9	557715	557723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872318
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12489	NC_021824	TGAAAT	2	12	557767	557778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525872318
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