MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021824	TTA	2	6	513477	513482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870226
11502	NC_021824	CG	3	6	513490	513495	0 %	0 %	50 %	50 %	525870226
11503	NC_021824	TAA	2	6	513499	513504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870226
11504	NC_021824	TGA	2	6	513520	513525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870226
11505	NC_021824	ACAA	2	8	513604	513611	75 %	0 %	0 %	25 %	525870226
11506	NC_021824	TAAA	2	8	513672	513679	75 %	25 %	0 %	0 %	525870226
11507	NC_021824	ATG	2	6	513683	513688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870226
11508	NC_021824	A	7	7	513707	513713	100 %	0 %	0 %	0 %	525870226
11509	NC_021824	GCT	2	6	513752	513757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870226
11510	NC_021824	GC	4	8	513760	513767	0 %	0 %	50 %	50 %	525870226
11511	NC_021824	TTC	2	6	513832	513837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870226
11512	NC_021824	TGG	2	6	513886	513891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870226
11513	NC_021824	GAA	2	6	513995	514000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870226
11514	NC_021824	TGG	2	6	514036	514041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870226
11515	NC_021824	ATTA	2	8	514075	514082	50 %	50 %	0 %	0 %	525870226
11516	NC_021824	ACT	2	6	514123	514128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870226
11517	NC_021824	ACC	2	6	514192	514197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870226
11518	NC_021824	TA	3	6	514236	514241	50 %	50 %	0 %	0 %	525870226
11519	NC_021824	AGA	2	6	514255	514260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870226
11520	NC_021824	AAC	2	6	514335	514340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870226
11521	NC_021824	ACT	2	6	514375	514380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870226
11522	NC_021824	TCG	2	6	514453	514458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870226
11523	NC_021824	TAA	2	6	514505	514510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870226
11524	NC_021824	TAA	2	6	514523	514528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_021824	TTA	2	6	514534	514539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_021824	TAAA	2	8	514642	514649	75 %	25 %	0 %	0 %	525870227
11527	NC_021824	CAT	2	6	514660	514665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870227
11528	NC_021824	TTG	2	6	514690	514695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870227
11529	NC_021824	TCG	2	6	514739	514744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
11530	NC_021824	ATGA	2	8	514758	514765	50 %	25 %	25 %	0 %	525870227
11531	NC_021824	A	6	6	514794	514799	100 %	0 %	0 %	0 %	525870227
11532	NC_021824	TTG	2	6	514810	514815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870227
11533	NC_021824	GGC	2	6	514952	514957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870227
11534	NC_021824	CTT	2	6	515004	515009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870227
11535	NC_021824	TAA	2	6	515018	515023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870227
11536	NC_021824	ACTT	2	8	515098	515105	25 %	50 %	0 %	25 %	525870227
11537	NC_021824	CAA	2	6	515140	515145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870227
11538	NC_021824	CCA	2	6	515156	515161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870227
11539	NC_021824	AT	3	6	515234	515239	50 %	50 %	0 %	0 %	525870227
11540	NC_021824	CTG	2	6	515260	515265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
11541	NC_021824	GAT	2	6	515267	515272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11542	NC_021824	GAA	2	6	515349	515354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11543	NC_021824	TTA	2	6	515380	515385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870227
11544	NC_021824	TAAA	2	8	515404	515411	75 %	25 %	0 %	0 %	525870227
11545	NC_021824	GC	3	6	515412	515417	0 %	0 %	50 %	50 %	525870227
11546	NC_021824	GAA	2	6	515450	515455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11547	NC_021824	TCG	2	6	515522	515527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
11548	NC_021824	AAT	2	6	515553	515558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870227
11549	NC_021824	ACT	2	6	515583	515588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870227
11550	NC_021824	ATC	2	6	515620	515625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870227
11551	NC_021824	ATT	2	6	515659	515664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870227
11552	NC_021824	AGT	2	6	515678	515683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11553	NC_021824	TCG	2	6	515687	515692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
11554	NC_021824	GC	4	8	515724	515731	0 %	0 %	50 %	50 %	525870227
11555	NC_021824	ATA	2	6	515764	515769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870227
11556	NC_021824	ATT	2	6	515778	515783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870227
11557	NC_021824	AATT	2	8	515785	515792	50 %	50 %	0 %	0 %	525870227
11558	NC_021824	AAG	2	6	515821	515826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11559	NC_021824	TGA	2	6	515830	515835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11560	NC_021824	ACAA	2	8	515854	515861	75 %	0 %	0 %	25 %	525870227
11561	NC_021824	A	6	6	515914	515919	100 %	0 %	0 %	0 %	525870227
11562	NC_021824	GAA	3	9	515922	515930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11563	NC_021824	ATTA	2	8	515948	515955	50 %	50 %	0 %	0 %	525870227
11564	NC_021824	TGA	3	9	515978	515986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11565	NC_021824	ATT	2	6	516000	516005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870227
11566	NC_021824	GAA	2	6	516009	516014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11567	NC_021824	AGA	2	6	516017	516022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11568	NC_021824	CGT	2	6	516048	516053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
11569	NC_021824	TGAAGA	2	12	516086	516097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525870227
11570	NC_021824	GAA	3	9	516108	516116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11571	NC_021824	ACTA	2	8	516128	516135	50 %	25 %	0 %	25 %	525870227
11572	NC_021824	CGT	2	6	516183	516188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
11573	NC_021824	GGT	2	6	516189	516194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870227
11574	NC_021824	GAT	2	6	516225	516230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11575	NC_021824	TTG	2	6	516244	516249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870227
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11577	NC_021824	ATC	2	6	516357	516362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870227
11578	NC_021824	ACTT	2	8	516364	516371	25 %	50 %	0 %	25 %	525870227
11579	NC_021824	TGA	2	6	516425	516430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11580	NC_021824	TAC	2	6	516446	516451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870227
11581	NC_021824	ATCT	2	8	516608	516615	25 %	50 %	0 %	25 %	525870227
11582	NC_021824	AGA	2	6	516623	516628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11583	NC_021824	GCT	2	6	516654	516659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
11584	NC_021824	GAT	2	6	516720	516725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11585	NC_021824	AAAC	2	8	516762	516769	75 %	0 %	0 %	25 %	525870227
11586	NC_021824	GGT	2	6	516801	516806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870227
11587	NC_021824	GAA	2	6	516876	516881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11588	NC_021824	TGA	2	6	516983	516988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11589	NC_021824	AGA	3	9	517025	517033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11590	NC_021824	GAA	2	6	517050	517055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11591	NC_021824	CA	3	6	517073	517078	50 %	0 %	0 %	50 %	525870227
11592	NC_021824	TGA	2	6	517085	517090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
11593	NC_021824	AGA	2	6	517121	517126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
11594	NC_021824	T	6	6	517180	517185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_021824	AGT	2	6	517296	517301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870228
11596	NC_021824	AATC	2	8	517326	517333	50 %	25 %	0 %	25 %	525870228
11597	NC_021824	AGC	2	6	517335	517340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870228
11598	NC_021824	TAT	2	6	517343	517348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
11599	NC_021824	ATTA	2	8	517383	517390	50 %	50 %	0 %	0 %	525870228
11600	NC_021824	CTA	2	6	517402	517407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870228
11601	NC_021824	ATTA	2	8	517557	517564	50 %	50 %	0 %	0 %	525870228
11602	NC_021824	ACA	2	6	517586	517591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870228
11603	NC_021824	GAA	2	6	517687	517692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870228
11604	NC_021824	AGGTT	2	10	517826	517835	20 %	40 %	40 %	0 %	525870228
11605	NC_021824	AAG	2	6	517892	517897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870228
11606	NC_021824	TGAT	2	8	517985	517992	25 %	50 %	25 %	0 %	525870228
11607	NC_021824	GAA	2	6	518029	518034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870228
11608	NC_021824	TGC	2	6	518160	518165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870228
11609	NC_021824	TTA	2	6	518174	518179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
11610	NC_021824	ACA	2	6	518193	518198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870228
11611	NC_021824	CGG	2	6	518247	518252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870228
11612	NC_021824	GAG	2	6	518353	518358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525870228
11613	NC_021824	TTA	2	6	518408	518413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
11614	NC_021824	GAT	2	6	518509	518514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870228
11615	NC_021824	GGACG	2	10	518544	518553	20 %	0 %	60 %	20 %	525870228
11616	NC_021824	ATG	2	6	518627	518632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870228
11617	NC_021824	CAT	2	6	518647	518652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870228
11618	NC_021824	ATT	2	6	518724	518729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
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11620	NC_021824	AAT	2	6	518857	518862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870229
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11743	NC_021824	TGT	2	6	525031	525036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870233
11744	NC_021824	TGG	2	6	525037	525042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870233
11745	NC_021824	CTT	2	6	525100	525105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
11746	NC_021824	A	6	6	525207	525212	100 %	0 %	0 %	0 %	525870233
11747	NC_021824	TTC	2	6	525224	525229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
11748	NC_021824	GTT	2	6	525239	525244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870233
11749	NC_021824	GTTT	2	8	525254	525261	0 %	75 %	25 %	0 %	525870233
11750	NC_021824	CGT	2	6	525299	525304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870233
11751	NC_021824	ACA	2	6	525402	525407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870233
11752	NC_021824	CTA	2	6	525409	525414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870233
11753	NC_021824	TCC	2	6	525496	525501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525870233
11754	NC_021824	GAATG	2	10	525527	525536	40 %	20 %	40 %	0 %	525870233
11755	NC_021824	GAT	2	6	525542	525547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870233
11756	NC_021824	TGTC	2	8	525642	525649	0 %	50 %	25 %	25 %	525870233
11757	NC_021824	TTC	3	9	525650	525658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
11758	NC_021824	TCT	2	6	525678	525683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
11759	NC_021824	ATT	2	6	525701	525706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870233
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11762	NC_021824	AGG	2	6	525834	525839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525870233
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11764	NC_021824	GGCT	2	8	525993	526000	0 %	25 %	50 %	25 %	525870234
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11769	NC_021824	TTC	2	6	526255	526260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870234
11770	NC_021824	CTA	2	6	526264	526269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870234
11771	NC_021824	TATT	2	8	526370	526377	25 %	75 %	0 %	0 %	525870234
11772	NC_021824	TGT	2	6	526404	526409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870234
11773	NC_021824	ATTTTC	2	12	526414	526425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525870234
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11775	NC_021824	TTG	2	6	526521	526526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870235
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11778	NC_021824	TTCA	2	8	526628	526635	25 %	50 %	0 %	25 %	525870235
11779	NC_021824	CGC	2	6	526714	526719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525870235
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11782	NC_021824	AT	3	6	526855	526860	50 %	50 %	0 %	0 %	525872307
11783	NC_021824	TAATT	2	10	526905	526914	40 %	60 %	0 %	0 %	525872307
11784	NC_021824	ATA	2	6	526962	526967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872307
11785	NC_021824	CTG	2	6	527029	527034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872307
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11793	NC_021824	TTA	2	6	527394	527399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872307
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11802	NC_021824	T	6	6	527816	527821	0 %	100 %	0 %	0 %	525872307
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11807	NC_021824	A	6	6	527908	527913	100 %	0 %	0 %	0 %	525872307
11808	NC_021824	TAA	2	6	527917	527922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872307
11809	NC_021824	T	7	7	527945	527951	0 %	100 %	0 %	0 %	525872307
11810	NC_021824	T	6	6	527962	527967	0 %	100 %	0 %	0 %	525872307
11811	NC_021824	CTC	2	6	527968	527973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11812	NC_021824	T	8	8	528036	528043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11813	NC_021824	A	6	6	528098	528103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11814	NC_021824	ATT	2	6	528110	528115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11815	NC_021824	GAG	2	6	528172	528177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11816	NC_021824	TGC	2	6	528235	528240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870236
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11822	NC_021824	TGA	2	6	528496	528501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870236
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11830	NC_021824	GCT	2	6	528818	528823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870236
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11839	NC_021824	CTA	2	6	529123	529128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870236
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11846	NC_021824	A	6	6	529493	529498	100 %	0 %	0 %	0 %	525870236
11847	NC_021824	ATA	2	6	529527	529532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870236
11848	NC_021824	GAA	2	6	529558	529563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870236
11849	NC_021824	A	6	6	529562	529567	100 %	0 %	0 %	0 %	525870236
11850	NC_021824	A	6	6	529583	529588	100 %	0 %	0 %	0 %	525870236
11851	NC_021824	AT	3	6	529621	529626	50 %	50 %	0 %	0 %	525870236
11852	NC_021824	TCA	2	6	529642	529647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11853	NC_021824	ATTTT	2	10	529660	529669	20 %	80 %	0 %	0 %	525870237
11854	NC_021824	CG	3	6	529680	529685	0 %	0 %	50 %	50 %	525870237
11855	NC_021824	CAA	2	6	529702	529707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870237
11856	NC_021824	T	7	7	529738	529744	0 %	100 %	0 %	0 %	525870237
11857	NC_021824	ATT	2	6	529773	529778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870237
11858	NC_021824	T	6	6	529854	529859	0 %	100 %	0 %	0 %	525870237
11859	NC_021824	TTC	2	6	529903	529908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870237
11860	NC_021824	T	6	6	529923	529928	0 %	100 %	0 %	0 %	525870237
11861	NC_021824	CAA	2	6	529988	529993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870237
11862	NC_021824	GGATT	2	10	530005	530014	20 %	40 %	40 %	0 %	525870237
11863	NC_021824	GCA	2	6	530072	530077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870237
11864	NC_021824	CATT	2	8	530141	530148	25 %	50 %	0 %	25 %	525870237
11865	NC_021824	T	6	6	530227	530232	0 %	100 %	0 %	0 %	525870237
11866	NC_021824	CCAA	2	8	530304	530311	50 %	0 %	0 %	50 %	525870237
11867	NC_021824	GAAC	2	8	530338	530345	50 %	0 %	25 %	25 %	525870237
11868	NC_021824	GTT	2	6	530359	530364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870237
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11871	NC_021824	TTA	2	6	530609	530614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11872	NC_021824	A	6	6	530657	530662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11873	NC_021824	CG	3	6	530701	530706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11874	NC_021824	TAT	3	9	530750	530758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870238
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11906	NC_021824	AAG	2	6	532381	532386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11907	NC_021824	GTTA	2	8	532427	532434	25 %	50 %	25 %	0 %	525870241
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11973	NC_021824	GCA	2	6	535312	535317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870244
11974	NC_021824	ATT	2	6	535327	535332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870244
11975	NC_021824	GGA	2	6	535342	535347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525870244
11976	NC_021824	ATGGA	2	10	535363	535372	40 %	20 %	40 %	0 %	525870244
11977	NC_021824	AAAT	2	8	535440	535447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11978	NC_021824	A	7	7	535456	535462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11979	NC_021824	AT	3	6	535487	535492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11980	NC_021824	TCA	2	6	535498	535503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11981	NC_021824	A	6	6	535604	535609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11982	NC_021824	AGGA	2	8	535618	535625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11983	NC_021824	GTC	2	6	535627	535632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11984	NC_021824	CGG	2	6	535677	535682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870245
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