MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021824	GTT	2	6	243702	243707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869982
5502	NC_021824	TCA	2	6	243711	243716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869982
5503	NC_021824	CAC	2	6	243779	243784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869982
5504	NC_021824	GAA	2	6	243856	243861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869982
5505	NC_021824	TCA	2	6	243874	243879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869982
5506	NC_021824	AGC	2	6	243902	243907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869982
5507	NC_021824	TG	3	6	243919	243924	0 %	50 %	50 %	0 %	525869982
5508	NC_021824	T	6	6	244151	244156	0 %	100 %	0 %	0 %	525869982
5509	NC_021824	TTC	2	6	244229	244234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869982
5510	NC_021824	GCA	2	6	244381	244386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869982
5511	NC_021824	AAT	2	6	244415	244420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869982
5512	NC_021824	T	7	7	244488	244494	0 %	100 %	0 %	0 %	525869982
5513	NC_021824	GTT	2	6	244510	244515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869982
5514	NC_021824	AAT	2	6	244612	244617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869983
5515	NC_021824	TGCT	2	8	244654	244661	0 %	50 %	25 %	25 %	525869983
5516	NC_021824	TCT	2	6	244775	244780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869983
5517	NC_021824	GC	3	6	244817	244822	0 %	0 %	50 %	50 %	525869983
5518	NC_021824	AAT	2	6	244858	244863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869983
5519	NC_021824	GTT	2	6	244905	244910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869983
5520	NC_021824	CCA	2	6	244916	244921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869983
5521	NC_021824	CCA	2	6	244992	244997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869983
5522	NC_021824	CAA	2	6	245061	245066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869983
5523	NC_021824	GTC	2	6	245103	245108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869983
5524	NC_021824	AT	3	6	245118	245123	50 %	50 %	0 %	0 %	525869983
5525	NC_021824	T	7	7	245123	245129	0 %	100 %	0 %	0 %	525869983
5526	NC_021824	ACAAA	2	10	245133	245142	80 %	0 %	0 %	20 %	525869983
5527	NC_021824	TCT	2	6	245165	245170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869983
5528	NC_021824	CAA	2	6	245229	245234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869983
5529	NC_021824	A	6	6	245310	245315	100 %	0 %	0 %	0 %	525869983
5530	NC_021824	CATT	2	8	245369	245376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_021824	TAT	2	6	245380	245385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_021824	CATC	2	8	245394	245401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_021824	AT	3	6	245449	245454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021824	ATTTT	2	10	245487	245496	20 %	80 %	0 %	0 %	525869984
5535	NC_021824	TTG	3	9	245502	245510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869984
5536	NC_021824	ATT	2	6	245528	245533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869984
5537	NC_021824	AAG	2	6	245559	245564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869984
5538	NC_021824	ATTA	2	8	245605	245612	50 %	50 %	0 %	0 %	525869984
5539	NC_021824	CCA	2	6	245646	245651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869984
5540	NC_021824	GCT	2	6	245684	245689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869984
5541	NC_021824	ATT	3	9	245729	245737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869984
5542	NC_021824	AAC	2	6	245761	245766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869984
5543	NC_021824	AGC	2	6	245767	245772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869984
5544	NC_021824	TACTT	2	10	245842	245851	20 %	60 %	0 %	20 %	525869984
5545	NC_021824	ACAA	2	8	245931	245938	75 %	0 %	0 %	25 %	525869984
5546	NC_021824	CAA	2	6	245969	245974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869984
5547	NC_021824	AACA	2	8	245975	245982	75 %	0 %	0 %	25 %	525869984
5548	NC_021824	TTG	2	6	246048	246053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869984
5549	NC_021824	A	6	6	246126	246131	100 %	0 %	0 %	0 %	525869984
5550	NC_021824	ACT	2	6	246228	246233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_021824	AG	3	6	246244	246249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_021824	CG	3	6	246284	246289	0 %	0 %	50 %	50 %	525869985
5553	NC_021824	CGG	2	6	246309	246314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869985
5554	NC_021824	GTA	2	6	246344	246349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869985
5555	NC_021824	ACT	2	6	246366	246371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869985
5556	NC_021824	AAAC	2	8	246388	246395	75 %	0 %	0 %	25 %	525869985
5557	NC_021824	ACT	2	6	246437	246442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869985
5558	NC_021824	GAA	2	6	246458	246463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869985
5559	NC_021824	TTA	2	6	246479	246484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869985
5560	NC_021824	A	6	6	246498	246503	100 %	0 %	0 %	0 %	525869985
5561	NC_021824	GAT	2	6	246560	246565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869985
5562	NC_021824	TTA	2	6	246566	246571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869985
5563	NC_021824	AG	3	6	246602	246607	50 %	0 %	50 %	0 %	525869985
5564	NC_021824	CTTA	2	8	246679	246686	25 %	50 %	0 %	25 %	525869985
5565	NC_021824	AAC	2	6	246704	246709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869985
5566	NC_021824	ACT	2	6	246827	246832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869985
5567	NC_021824	CAG	2	6	246852	246857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869985
5568	NC_021824	TCAT	2	8	246912	246919	25 %	50 %	0 %	25 %	525869985
5569	NC_021824	A	7	7	246970	246976	100 %	0 %	0 %	0 %	525869985
5570	NC_021824	TACT	2	8	246999	247006	25 %	50 %	0 %	25 %	525869985
5571	NC_021824	ATT	2	6	247122	247127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869985
5572	NC_021824	AAGAA	2	10	247149	247158	80 %	0 %	20 %	0 %	525869985
5573	NC_021824	TGC	2	6	247199	247204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869986
5574	NC_021824	AGG	2	6	247219	247224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525869986
5575	NC_021824	CTT	2	6	247244	247249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869986
5576	NC_021824	CTA	2	6	247253	247258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869986
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5578	NC_021824	AGTT	2	8	247275	247282	25 %	50 %	25 %	0 %	525869986
5579	NC_021824	T	6	6	247281	247286	0 %	100 %	0 %	0 %	525869986
5580	NC_021824	A	6	6	247344	247349	100 %	0 %	0 %	0 %	525869986
5581	NC_021824	TAT	2	6	247359	247364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869986
5582	NC_021824	TCGC	2	8	247417	247424	0 %	25 %	25 %	50 %	525869986
5583	NC_021824	GCG	2	6	247481	247486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869986
5584	NC_021824	TTTGC	2	10	247513	247522	0 %	60 %	20 %	20 %	525869986
5585	NC_021824	AT	3	6	247556	247561	50 %	50 %	0 %	0 %	525869986
5586	NC_021824	TA	3	6	247590	247595	50 %	50 %	0 %	0 %	525869986
5587	NC_021824	ATCA	2	8	247668	247675	50 %	25 %	0 %	25 %	525869986
5588	NC_021824	TGC	2	6	247694	247699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869986
5589	NC_021824	GTTA	2	8	247704	247711	25 %	50 %	25 %	0 %	525869986
5590	NC_021824	TCT	2	6	247720	247725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869986
5591	NC_021824	CA	3	6	247782	247787	50 %	0 %	0 %	50 %	525869986
5592	NC_021824	AAC	2	6	247789	247794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869986
5593	NC_021824	TCA	2	6	247835	247840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869986
5594	NC_021824	TTC	2	6	247911	247916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869986
5595	NC_021824	AG	3	6	247951	247956	50 %	0 %	50 %	0 %	525869986
5596	NC_021824	CAT	2	6	247997	248002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869986
5597	NC_021824	ATC	2	6	248016	248021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869986
5598	NC_021824	TCG	2	6	248077	248082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869986
5599	NC_021824	TAAA	2	8	248126	248133	75 %	25 %	0 %	0 %	525869986
5600	NC_021824	TC	3	6	248138	248143	0 %	50 %	0 %	50 %	525869986
5601	NC_021824	TTG	2	6	248148	248153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869986
5602	NC_021824	GTA	2	6	248216	248221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869986
5603	NC_021824	GTTA	2	8	248259	248266	25 %	50 %	25 %	0 %	525869986
5604	NC_021824	TCCC	2	8	248283	248290	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5605	NC_021824	A	7	7	248341	248347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_021824	CAAA	2	8	248373	248380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_021824	A	7	7	248378	248384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_021824	GCCT	2	8	248385	248392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_021824	TAT	2	6	248486	248491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869987
5610	NC_021824	AAT	2	6	248503	248508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869987
5611	NC_021824	T	6	6	248542	248547	0 %	100 %	0 %	0 %	525869987
5612	NC_021824	ACC	2	6	248563	248568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869987
5613	NC_021824	CAT	2	6	248595	248600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869987
5614	NC_021824	TTC	2	6	248636	248641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869987
5615	NC_021824	TAC	2	6	248677	248682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869987
5616	NC_021824	AGC	2	6	248707	248712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869987
5617	NC_021824	GAC	2	6	248718	248723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869987
5618	NC_021824	T	6	6	248740	248745	0 %	100 %	0 %	0 %	525869987
5619	NC_021824	CAA	2	6	248766	248771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869987
5620	NC_021824	TGT	2	6	248800	248805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869987
5621	NC_021824	GTA	2	6	248847	248852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869987
5622	NC_021824	CCT	2	6	248906	248911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_021824	TCA	2	6	249001	249006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869988
5624	NC_021824	CTGTA	2	10	249035	249044	20 %	40 %	20 %	20 %	525869988
5625	NC_021824	GAAC	2	8	249075	249082	50 %	0 %	25 %	25 %	525869988
5626	NC_021824	TTC	2	6	249095	249100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869988
5627	NC_021824	TCT	2	6	249135	249140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869988
5628	NC_021824	GTTAA	2	10	249177	249186	40 %	40 %	20 %	0 %	525869988
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5630	NC_021824	CTT	2	6	249235	249240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869988
5631	NC_021824	CAG	2	6	249406	249411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869988
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5633	NC_021824	ACCACG	2	12	249419	249430	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525869988
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5635	NC_021824	TAC	2	6	249539	249544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869988
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5641	NC_021824	CTG	2	6	249703	249708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869988
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5647	NC_021824	CT	3	6	249910	249915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5648	NC_021824	CTA	2	6	249942	249947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5657	NC_021824	CCT	2	6	250369	250374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5658	NC_021824	TAT	2	6	250379	250384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869990
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5700	NC_021824	TTA	2	6	252247	252252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5722	NC_021824	T	6	6	253266	253271	0 %	100 %	0 %	0 %	525869994
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5874	NC_021824	CTT	2	6	260422	260427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870010
5875	NC_021824	CAG	2	6	260452	260457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870010
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5877	NC_021824	GAT	2	6	260612	260617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870010
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5882	NC_021824	GTA	2	6	260824	260829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870010
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5885	NC_021824	ATTT	2	8	260946	260953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5886	NC_021824	GAATT	2	10	260979	260988	40 %	40 %	20 %	0 %	525870011
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5904	NC_021824	TCC	2	6	261882	261887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5984	NC_021824	TAAT	3	12	265694	265705	50 %	50 %	0 %	0 %	525870017
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