MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_021824	CCA	2	6	2428167	2428172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871813
55502	NC_021824	TTTG	2	8	2428218	2428225	0 %	75 %	25 %	0 %	525871813
55503	NC_021824	TG	3	6	2428224	2428229	0 %	50 %	50 %	0 %	525871813
55504	NC_021824	CAT	2	6	2428285	2428290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871813
55505	NC_021824	AAT	2	6	2428328	2428333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871813
55506	NC_021824	ATA	2	6	2428377	2428382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871813
55507	NC_021824	TCCAT	2	10	2428437	2428446	20 %	40 %	0 %	40 %	525871813
55508	NC_021824	TTC	2	6	2428481	2428486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871813
55509	NC_021824	CGA	2	6	2428557	2428562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871813
55510	NC_021824	TCA	2	6	2428575	2428580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871813
55511	NC_021824	AAT	2	6	2428625	2428630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871813
55512	NC_021824	CCG	3	9	2428659	2428667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871813
55513	NC_021824	ATC	2	6	2428713	2428718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871813
55514	NC_021824	TCCC	2	8	2428727	2428734	0 %	25 %	0 %	75 %	525871814
55515	NC_021824	TAT	2	6	2428773	2428778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871814
55516	NC_021824	TAA	2	6	2428806	2428811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871814
55517	NC_021824	TTTCTG	2	12	2428863	2428874	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525871814
55518	NC_021824	AGT	2	6	2428904	2428909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871814
55519	NC_021824	ACA	2	6	2428934	2428939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871814
55520	NC_021824	GAT	2	6	2429001	2429006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871814
55521	NC_021824	TCT	2	6	2429015	2429020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871814
55522	NC_021824	TGC	2	6	2429158	2429163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871814
55523	NC_021824	GTT	2	6	2429171	2429176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871814
55524	NC_021824	CTT	2	6	2429232	2429237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871814
55525	NC_021824	T	6	6	2429244	2429249	0 %	100 %	0 %	0 %	525871814
55526	NC_021824	TCT	2	6	2429267	2429272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871814
55527	NC_021824	TTTC	2	8	2429292	2429299	0 %	75 %	0 %	25 %	525871814
55528	NC_021824	TAG	2	6	2429311	2429316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871814
55529	NC_021824	ACC	2	6	2429356	2429361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871814
55530	NC_021824	CAA	2	6	2429373	2429378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871814
55531	NC_021824	CCG	2	6	2429414	2429419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871814
55532	NC_021824	ATG	2	6	2429431	2429436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871814
55533	NC_021824	TGCA	2	8	2429467	2429474	25 %	25 %	25 %	25 %	525871814
55534	NC_021824	GAA	2	6	2429528	2429533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871815
55535	NC_021824	CTT	2	6	2429579	2429584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871815
55536	NC_021824	TAC	2	6	2429609	2429614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871815
55537	NC_021824	GAA	2	6	2429656	2429661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871815
55538	NC_021824	TTC	2	6	2429672	2429677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871815
55539	NC_021824	CAT	2	6	2429737	2429742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871815
55540	NC_021824	GAA	2	6	2429821	2429826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871815
55541	NC_021824	AGT	2	6	2429931	2429936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871815
55542	NC_021824	GGC	2	6	2429948	2429953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871815
55543	NC_021824	TTTTC	2	10	2429971	2429980	0 %	80 %	0 %	20 %	525871815
55544	NC_021824	CGTGC	2	10	2430008	2430017	0 %	20 %	40 %	40 %	525871815
55545	NC_021824	T	6	6	2430019	2430024	0 %	100 %	0 %	0 %	525871815
55546	NC_021824	GTT	2	6	2430036	2430041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871815
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55548	NC_021824	CAA	2	6	2430184	2430189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871815
55549	NC_021824	T	6	6	2430406	2430411	0 %	100 %	0 %	0 %	525871815
55550	NC_021824	GTTGT	2	10	2430667	2430676	0 %	60 %	40 %	0 %	525871815
55551	NC_021824	T	7	7	2430728	2430734	0 %	100 %	0 %	0 %	525871815
55552	NC_021824	ATTA	2	8	2430743	2430750	50 %	50 %	0 %	0 %	525871815
55553	NC_021824	TGAT	2	8	2430764	2430771	25 %	50 %	25 %	0 %	525871815
55554	NC_021824	ATG	2	6	2430786	2430791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871815
55555	NC_021824	T	6	6	2430817	2430822	0 %	100 %	0 %	0 %	525871815
55556	NC_021824	T	6	6	2430824	2430829	0 %	100 %	0 %	0 %	525871815
55557	NC_021824	GTC	2	6	2430849	2430854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871816
55558	NC_021824	ATGA	2	8	2430882	2430889	50 %	25 %	25 %	0 %	525871816
55559	NC_021824	CATC	2	8	2430895	2430902	25 %	25 %	0 %	50 %	525871816
55560	NC_021824	CTG	2	6	2430913	2430918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871816
55561	NC_021824	GTT	2	6	2430972	2430977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871816
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55564	NC_021824	T	6	6	2431141	2431146	0 %	100 %	0 %	0 %	525871816
55565	NC_021824	TAA	2	6	2431244	2431249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871816
55566	NC_021824	TAT	2	6	2431291	2431296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871816
55567	NC_021824	ATGC	2	8	2431447	2431454	25 %	25 %	25 %	25 %	525871816
55568	NC_021824	GCT	2	6	2431515	2431520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871816
55569	NC_021824	TTC	2	6	2431553	2431558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871816
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55572	NC_021824	GGT	2	6	2431635	2431640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871816
55573	NC_021824	CAT	2	6	2431696	2431701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871816
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55583	NC_021824	CG	3	6	2432459	2432464	0 %	0 %	50 %	50 %	525871817
55584	NC_021824	AATT	2	8	2432472	2432479	50 %	50 %	0 %	0 %	525871817
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55587	NC_021824	CATTT	2	10	2432590	2432599	20 %	60 %	0 %	20 %	525871817
55588	NC_021824	TGA	2	6	2432611	2432616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871817
55589	NC_021824	AGA	2	6	2432682	2432687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871817
55590	NC_021824	TGTT	2	8	2432715	2432722	0 %	75 %	25 %	0 %	525871817
55591	NC_021824	T	6	6	2432724	2432729	0 %	100 %	0 %	0 %	525871817
55592	NC_021824	T	6	6	2432747	2432752	0 %	100 %	0 %	0 %	525871817
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55602	NC_021824	CG	3	6	2433092	2433097	0 %	0 %	50 %	50 %	525871817
55603	NC_021824	CTT	2	6	2433098	2433103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871817
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55606	NC_021824	CTT	2	6	2433245	2433250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871817
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55615	NC_021824	GTT	2	6	2433502	2433507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871817
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55618	NC_021824	ATT	2	6	2433613	2433618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871817
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55857	NC_021824	CAA	2	6	2444858	2444863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55858	NC_021824	CTT	2	6	2444908	2444913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55859	NC_021824	CGA	2	6	2444970	2444975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55860	NC_021824	AAAGC	2	10	2444997	2445006	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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55973	NC_021824	TTGT	2	8	2450229	2450236	0 %	75 %	25 %	0 %	525871831
55974	NC_021824	CATCGC	2	12	2450240	2450251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525871831
55975	NC_021824	TGC	2	6	2450252	2450257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871831
55976	NC_021824	CAA	3	9	2450299	2450307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871831
55977	NC_021824	TGG	2	6	2450309	2450314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871831
55978	NC_021824	GTA	2	6	2450345	2450350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871831
55979	NC_021824	TAC	2	6	2450375	2450380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871831
55980	NC_021824	AGT	2	6	2450439	2450444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871831
55981	NC_021824	TAAAGG	2	12	2450461	2450472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525871831
55982	NC_021824	TAG	2	6	2450590	2450595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871831
55983	NC_021824	AAT	2	6	2450630	2450635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871831
55984	NC_021824	TTC	2	6	2450709	2450714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55985	NC_021824	A	6	6	2450728	2450733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55986	NC_021824	AAT	2	6	2450765	2450770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55987	NC_021824	A	6	6	2450819	2450824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55988	NC_021824	TAA	3	9	2450850	2450858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871832
55989	NC_021824	TCT	2	6	2450864	2450869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871832
55990	NC_021824	TCGT	2	8	2450902	2450909	0 %	50 %	25 %	25 %	525871832
55991	NC_021824	CT	3	6	2450959	2450964	0 %	50 %	0 %	50 %	525871832
55992	NC_021824	AGCA	2	8	2450977	2450984	50 %	0 %	25 %	25 %	525871832
55993	NC_021824	CTAC	2	8	2451008	2451015	25 %	25 %	0 %	50 %	525871832
55994	NC_021824	GCAC	2	8	2451038	2451045	25 %	0 %	25 %	50 %	525871832
55995	NC_021824	CAT	2	6	2451066	2451071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871832
55996	NC_021824	T	7	7	2451085	2451091	0 %	100 %	0 %	0 %	525871832
55997	NC_021824	GAATG	2	10	2451103	2451112	40 %	20 %	40 %	0 %	525871832
55998	NC_021824	ATC	2	6	2451145	2451150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871832
55999	NC_021824	ATC	2	6	2451163	2451168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871832
56000	NC_021824	AATATC	2	12	2451181	2451192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525871832

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