MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_021824	ATTTG	2	10	2381546	2381555	20 %	60 %	20 %	0 %	525871774
54502	NC_021824	TAA	2	6	2381580	2381585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871774
54503	NC_021824	CAA	2	6	2381634	2381639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871774
54504	NC_021824	ATT	2	6	2381686	2381691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871774
54505	NC_021824	AC	3	6	2381742	2381747	50 %	0 %	0 %	50 %	525871774
54506	NC_021824	TAG	2	6	2381838	2381843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871774
54507	NC_021824	CAA	2	6	2381957	2381962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54508	NC_021824	A	7	7	2381961	2381967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54509	NC_021824	AAT	2	6	2381974	2381979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54510	NC_021824	GTT	2	6	2382121	2382126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54511	NC_021824	CT	3	6	2382136	2382141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54512	NC_021824	AGA	2	6	2382151	2382156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54513	NC_021824	T	6	6	2382185	2382190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54514	NC_021824	TCGA	2	8	2382201	2382208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54515	NC_021824	ATC	2	6	2382265	2382270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54516	NC_021824	GAA	2	6	2382291	2382296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54517	NC_021824	G	6	6	2382316	2382321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54518	NC_021824	CA	3	6	2382357	2382362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54519	NC_021824	AAC	2	6	2382389	2382394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54520	NC_021824	GT	3	6	2382408	2382413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54521	NC_021824	CTC	2	6	2382443	2382448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54522	NC_021824	ACG	2	6	2382492	2382497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54523	NC_021824	CGA	2	6	2382572	2382577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54524	NC_021824	ACC	2	6	2382687	2382692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54525	NC_021824	TCCA	2	8	2382779	2382786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54526	NC_021824	AGG	2	6	2382823	2382828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54527	NC_021824	GTA	2	6	2382911	2382916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54528	NC_021824	CCA	2	6	2382919	2382924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54529	NC_021824	CCT	2	6	2382928	2382933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54530	NC_021824	CCTA	2	8	2382963	2382970	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54531	NC_021824	TC	3	6	2383083	2383088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54532	NC_021824	GCC	2	6	2383180	2383185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54533	NC_021824	CTC	2	6	2383228	2383233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54534	NC_021824	CT	3	6	2383338	2383343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54535	NC_021824	TC	3	6	2383418	2383423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54536	NC_021824	TC	3	6	2383438	2383443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54537	NC_021824	TAC	2	6	2383478	2383483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54538	NC_021824	TTCC	2	8	2383537	2383544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54539	NC_021824	CACT	2	8	2383591	2383598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54540	NC_021824	TGT	2	6	2383690	2383695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54541	NC_021824	CGCCTA	2	12	2383700	2383711	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54542	NC_021824	CTT	2	6	2383798	2383803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54543	NC_021824	CCA	2	6	2383840	2383845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54544	NC_021824	TGG	2	6	2383995	2384000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54545	NC_021824	AT	3	6	2384059	2384064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54546	NC_021824	TGG	2	6	2384079	2384084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54547	NC_021824	GA	3	6	2384259	2384264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54548	NC_021824	CGTG	2	8	2384330	2384337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54549	NC_021824	AGTA	2	8	2384351	2384358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54550	NC_021824	TTACC	2	10	2384359	2384368	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54551	NC_021824	CAA	2	6	2384478	2384483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54552	NC_021824	ACT	2	6	2384542	2384547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54553	NC_021824	TCC	2	6	2384663	2384668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54554	NC_021824	CCG	2	6	2384695	2384700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54555	NC_021824	CTTT	2	8	2384790	2384797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54556	NC_021824	AAG	2	6	2384828	2384833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54557	NC_021824	CTT	2	6	2384838	2384843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54558	NC_021824	TCGC	2	8	2384863	2384870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54559	NC_021824	TCC	2	6	2384902	2384907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54560	NC_021824	CTT	2	6	2385066	2385071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54561	NC_021824	GTT	2	6	2385142	2385147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54562	NC_021824	GAT	2	6	2385169	2385174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54563	NC_021824	GAT	2	6	2385205	2385210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54564	NC_021824	ATAA	2	8	2385228	2385235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54565	NC_021824	AACA	2	8	2385284	2385291	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54566	NC_021824	AGA	2	6	2385330	2385335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54567	NC_021824	TTTCCT	2	12	2385351	2385362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54568	NC_021824	AGG	2	6	2385368	2385373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54569	NC_021824	CGG	2	6	2385441	2385446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54570	NC_021824	GTG	2	6	2385495	2385500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54571	NC_021824	GT	3	6	2385510	2385515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54572	NC_021824	GT	3	6	2385679	2385684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54573	NC_021824	ATG	2	6	2385704	2385709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54574	NC_021824	TCC	2	6	2385730	2385735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54575	NC_021824	CACGA	2	10	2385828	2385837	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54576	NC_021824	GAC	2	6	2385841	2385846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54577	NC_021824	CAC	2	6	2385854	2385859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54578	NC_021824	TTC	2	6	2385929	2385934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54579	NC_021824	GCA	2	6	2386048	2386053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54580	NC_021824	AG	3	6	2386168	2386173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54581	NC_021824	TCC	2	6	2386193	2386198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54582	NC_021824	CTC	2	6	2386239	2386244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54583	NC_021824	GC	4	8	2386326	2386333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54584	NC_021824	GCT	2	6	2386383	2386388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54585	NC_021824	TTC	2	6	2386456	2386461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54586	NC_021824	AAC	2	6	2386465	2386470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54587	NC_021824	CTT	2	6	2386492	2386497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54588	NC_021824	GCG	2	6	2386505	2386510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54589	NC_021824	CTG	2	6	2386551	2386556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54590	NC_021824	CAGG	2	8	2386779	2386786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54591	NC_021824	TCC	2	6	2386839	2386844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54592	NC_021824	GTTC	2	8	2386845	2386852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54593	NC_021824	CGC	2	6	2386872	2386877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54594	NC_021824	CT	3	6	2386905	2386910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54595	NC_021824	TTGAAT	2	12	2386923	2386934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54596	NC_021824	AATTA	2	10	2386987	2386996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54597	NC_021824	GTTT	2	8	2387000	2387007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54598	NC_021824	TCT	3	9	2387076	2387084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54599	NC_021824	CAA	2	6	2387157	2387162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54600	NC_021824	TGA	2	6	2387181	2387186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54601	NC_021824	TA	3	6	2387216	2387221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54602	NC_021824	TTCT	2	8	2387265	2387272	0 %	75 %	0 %	25 %	525871775
54603	NC_021824	T	6	6	2387300	2387305	0 %	100 %	0 %	0 %	525871775
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54605	NC_021824	T	6	6	2387507	2387512	0 %	100 %	0 %	0 %	525871775
54606	NC_021824	GAT	2	6	2387568	2387573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871775
54607	NC_021824	GAT	2	6	2387577	2387582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871775
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54609	NC_021824	AGT	2	6	2387790	2387795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871775
54610	NC_021824	ATT	3	9	2387836	2387844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871775
54611	NC_021824	TCT	2	6	2387845	2387850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871775
54612	NC_021824	TCA	2	6	2387855	2387860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871775
54613	NC_021824	T	6	6	2387875	2387880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54614	NC_021824	TAG	2	6	2387900	2387905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54615	NC_021824	AAATGG	2	12	2387907	2387918	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54616	NC_021824	TGTT	2	8	2387944	2387951	0 %	75 %	25 %	0 %	525871776
54617	NC_021824	ATA	2	6	2387961	2387966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871776
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54622	NC_021824	ATC	2	6	2388180	2388185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871776
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54981	NC_021824	GCATCA	2	12	2404548	2404559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525872594
54982	NC_021824	GCATCG	3	18	2404596	2404613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525872594
54983	NC_021824	GCATCA	3	18	2404656	2404673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525872594
54984	NC_021824	GCATCC	2	12	2404680	2404691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525872594
54985	NC_021824	GCATCC	2	12	2404740	2404751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525872594
54986	NC_021824	TCAGCG	2	12	2404785	2404796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525872594
54987	NC_021824	GTA	2	6	2404827	2404832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872594
54988	NC_021824	AGC	2	6	2404895	2404900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872594
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