MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 67131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_021824	TTA	2	6	2248639	2248644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871670
51502	NC_021824	AGA	2	6	2248662	2248667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871670
51503	NC_021824	A	6	6	2248672	2248677	100 %	0 %	0 %	0 %	525871670
51504	NC_021824	TGG	2	6	2248779	2248784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871670
51505	NC_021824	GAT	2	6	2248789	2248794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871670
51506	NC_021824	TGAA	2	8	2248911	2248918	50 %	25 %	25 %	0 %	525871670
51507	NC_021824	AGT	2	6	2248961	2248966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871671
51508	NC_021824	TTA	2	6	2249022	2249027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871671
51509	NC_021824	TTG	2	6	2249035	2249040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871671
51510	NC_021824	CAA	2	6	2249073	2249078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871671
51511	NC_021824	CGA	2	6	2249092	2249097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871671
51512	NC_021824	TTC	2	6	2249123	2249128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871671
51513	NC_021824	CGC	2	6	2249192	2249197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871671
51514	NC_021824	ACA	2	6	2249241	2249246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871671
51515	NC_021824	TGG	2	6	2249300	2249305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871671
51516	NC_021824	ATT	2	6	2249310	2249315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871671
51517	NC_021824	TA	3	6	2249321	2249326	50 %	50 %	0 %	0 %	525871671
51518	NC_021824	CTG	2	6	2249338	2249343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871671
51519	NC_021824	TGT	2	6	2249363	2249368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871671
51520	NC_021824	CAA	2	6	2249391	2249396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871671
51521	NC_021824	TTATC	2	10	2249409	2249418	20 %	60 %	0 %	20 %	525871671
51522	NC_021824	TTA	2	6	2249422	2249427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871671
51523	NC_021824	A	7	7	2249431	2249437	100 %	0 %	0 %	0 %	525871671
51524	NC_021824	ATC	2	6	2249457	2249462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871671
51525	NC_021824	A	6	6	2249464	2249469	100 %	0 %	0 %	0 %	525871671
51526	NC_021824	TAAT	2	8	2249486	2249493	50 %	50 %	0 %	0 %	525871671
51527	NC_021824	CAT	2	6	2249549	2249554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871672
51528	NC_021824	AAC	2	6	2249571	2249576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871672
51529	NC_021824	TTGT	2	8	2249643	2249650	0 %	75 %	25 %	0 %	525871672
51530	NC_021824	ATG	2	6	2249680	2249685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871672
51531	NC_021824	CGG	2	6	2249752	2249757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871672
51532	NC_021824	TGC	2	6	2249784	2249789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871672
51533	NC_021824	AT	3	6	2249803	2249808	50 %	50 %	0 %	0 %	525871672
51534	NC_021824	GTT	2	6	2249812	2249817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871672
51535	NC_021824	GTT	2	6	2249824	2249829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871672
51536	NC_021824	CTT	2	6	2249867	2249872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
51537	NC_021824	GAA	2	6	2249933	2249938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871672
51538	NC_021824	TTCT	2	8	2249978	2249985	0 %	75 %	0 %	25 %	525871672
51539	NC_021824	GAT	2	6	2249990	2249995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871672
51540	NC_021824	GTT	2	6	2250001	2250006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871672
51541	NC_021824	TTTTTC	2	12	2250075	2250086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525871672
51542	NC_021824	TTC	2	6	2250117	2250122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
51543	NC_021824	GC	3	6	2250180	2250185	0 %	0 %	50 %	50 %	525871672
51544	NC_021824	ACC	2	6	2250267	2250272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871672
51545	NC_021824	GC	3	6	2250321	2250326	0 %	0 %	50 %	50 %	525871672
51546	NC_021824	AAG	2	6	2250337	2250342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871672
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51549	NC_021824	AT	3	6	2250412	2250417	50 %	50 %	0 %	0 %	525871672
51550	NC_021824	ATAAC	2	10	2250430	2250439	60 %	20 %	0 %	20 %	525871672
51551	NC_021824	CTG	2	6	2250464	2250469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871672
51552	NC_021824	GAT	2	6	2250539	2250544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871672
51553	NC_021824	GCA	2	6	2250559	2250564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871672
51554	NC_021824	ACC	2	6	2250582	2250587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871672
51555	NC_021824	TCACG	2	10	2250647	2250656	20 %	20 %	20 %	40 %	525871672
51556	NC_021824	CTT	2	6	2250659	2250664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
51557	NC_021824	TCT	2	6	2250676	2250681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
51558	NC_021824	AGT	2	6	2250717	2250722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871672
51559	NC_021824	TTC	2	6	2250745	2250750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
51560	NC_021824	TTCTTT	2	12	2250855	2250866	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525871672
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51562	NC_021824	TTC	2	6	2250975	2250980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
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51564	NC_021824	T	6	6	2251031	2251036	0 %	100 %	0 %	0 %	525871672
51565	NC_021824	AAT	2	6	2251155	2251160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871672
51566	NC_021824	TGA	2	6	2251192	2251197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871672
51567	NC_021824	AAT	2	6	2251212	2251217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871672
51568	NC_021824	CGG	2	6	2251225	2251230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871672
51569	NC_021824	ATC	2	6	2251248	2251253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871672
51570	NC_021824	TCA	2	6	2251267	2251272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871672
51571	NC_021824	CA	3	6	2251373	2251378	50 %	0 %	0 %	50 %	525871672
51572	NC_021824	TA	3	6	2251396	2251401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51573	NC_021824	T	7	7	2251417	2251423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51574	NC_021824	TATCA	2	10	2251433	2251442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51575	NC_021824	CTTT	2	8	2251451	2251458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51576	NC_021824	GAAA	2	8	2251470	2251477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51577	NC_021824	A	7	7	2251475	2251481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51578	NC_021824	T	7	7	2251531	2251537	0 %	100 %	0 %	0 %	525872587
51579	NC_021824	AATT	2	8	2251693	2251700	50 %	50 %	0 %	0 %	525872587
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51581	NC_021824	GCA	2	6	2251808	2251813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872587
51582	NC_021824	GCA	2	6	2251838	2251843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872587
51583	NC_021824	CCG	2	6	2251895	2251900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525872587
51584	NC_021824	ACC	2	6	2251912	2251917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525872587
51585	NC_021824	GTAT	2	8	2251918	2251925	25 %	50 %	25 %	0 %	525872587
51586	NC_021824	ACC	2	6	2251969	2251974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525872587
51587	NC_021824	TAA	2	6	2251998	2252003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872587
51588	NC_021824	AAGA	2	8	2252024	2252031	75 %	0 %	25 %	0 %	525872587
51589	NC_021824	ATCA	2	8	2252035	2252042	50 %	25 %	0 %	25 %	525872587
51590	NC_021824	GAT	2	6	2252100	2252105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872587
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51592	NC_021824	AGT	2	6	2252196	2252201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872587
51593	NC_021824	ATTT	2	8	2252205	2252212	25 %	75 %	0 %	0 %	525872587
51594	NC_021824	TTC	2	6	2252278	2252283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872587
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51600	NC_021824	CTA	2	6	2252550	2252555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872587
51601	NC_021824	AGT	2	6	2252575	2252580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872587
51602	NC_021824	AAT	2	6	2252614	2252619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872587
51603	NC_021824	ATTT	2	8	2252715	2252722	25 %	75 %	0 %	0 %	525872587
51604	NC_021824	TCC	2	6	2252723	2252728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51605	NC_021824	TC	3	6	2252735	2252740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51606	NC_021824	CT	4	8	2252764	2252771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51607	NC_021824	AGA	2	6	2252834	2252839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51608	NC_021824	AAT	3	9	2252978	2252986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51609	NC_021824	ATT	2	6	2253049	2253054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51610	NC_021824	T	6	6	2253053	2253058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51611	NC_021824	ATT	2	6	2253067	2253072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51612	NC_021824	A	6	6	2253099	2253104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51613	NC_021824	ATT	2	6	2253161	2253166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871673
51614	NC_021824	GTG	2	6	2253261	2253266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871673
51615	NC_021824	CGG	3	9	2253289	2253297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871673
51616	NC_021824	TGT	2	6	2253352	2253357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871673
51617	NC_021824	TTA	3	9	2253363	2253371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871673
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51970	NC_021824	CAT	2	6	2269403	2269408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871685
51971	NC_021824	AAT	2	6	2269465	2269470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871685
51972	NC_021824	CTT	2	6	2269520	2269525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871685
51973	NC_021824	TAA	2	6	2269527	2269532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871685
51974	NC_021824	CAT	2	6	2269547	2269552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871685
51975	NC_021824	TAA	2	6	2269565	2269570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871685
51976	NC_021824	TAACC	2	10	2269605	2269614	40 %	20 %	0 %	40 %	525871685
51977	NC_021824	TTTC	2	8	2269673	2269680	0 %	75 %	0 %	25 %	525871685
51978	NC_021824	CAT	2	6	2269706	2269711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871685
51979	NC_021824	CAT	2	6	2269817	2269822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871685
51980	NC_021824	CCAA	2	8	2269864	2269871	50 %	0 %	0 %	50 %	525871685
51981	NC_021824	CGT	2	6	2269884	2269889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871685
51982	NC_021824	ATGA	2	8	2269893	2269900	50 %	25 %	25 %	0 %	525871685
51983	NC_021824	GCCT	2	8	2270001	2270008	0 %	25 %	25 %	50 %	525871685
51984	NC_021824	A	6	6	2270031	2270036	100 %	0 %	0 %	0 %	525871685
51985	NC_021824	TCG	2	6	2270039	2270044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871685
51986	NC_021824	CGG	2	6	2270058	2270063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871685
51987	NC_021824	TCC	2	6	2270131	2270136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871685
51988	NC_021824	CTT	2	6	2270138	2270143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871685
51989	NC_021824	CTT	2	6	2270171	2270176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871685
51990	NC_021824	TGT	2	6	2270193	2270198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871685
51991	NC_021824	CGT	2	6	2270235	2270240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871685
51992	NC_021824	CAA	2	6	2270245	2270250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871685
51993	NC_021824	CCA	2	6	2270251	2270256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871685
51994	NC_021824	CTT	2	6	2270270	2270275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871685
51995	NC_021824	AAT	2	6	2270303	2270308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871685
51996	NC_021824	CTT	2	6	2270336	2270341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871685
51997	NC_021824	TTC	2	6	2270481	2270486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871685
51998	NC_021824	T	6	6	2270502	2270507	0 %	100 %	0 %	0 %	525871685
51999	NC_021824	GAA	2	6	2270516	2270521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871685
52000	NC_021824	AGT	2	6	2270565	2270570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871685

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