MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_021823	CTTG	2	8	1877996	1878003	0 %	50 %	25 %	25 %	525867435
43002	NC_021823	GAT	2	6	1878098	1878103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867435
43003	NC_021823	TGC	2	6	1878147	1878152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867435
43004	NC_021823	TCG	2	6	1878159	1878164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867435
43005	NC_021823	TTC	2	6	1878171	1878176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867435
43006	NC_021823	AATT	2	8	1878197	1878204	50 %	50 %	0 %	0 %	525867435
43007	NC_021823	CGC	2	6	1878266	1878271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867435
43008	NC_021823	AAG	2	6	1878312	1878317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867435
43009	NC_021823	TCA	2	6	1878331	1878336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867435
43010	NC_021823	TCT	2	6	1878448	1878453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867435
43011	NC_021823	ATAGA	2	10	1878457	1878466	60 %	20 %	20 %	0 %	525867435
43012	NC_021823	CTG	2	6	1878488	1878493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867435
43013	NC_021823	GAG	2	6	1878509	1878514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525867435
43014	NC_021823	TGT	2	6	1878568	1878573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867435
43015	NC_021823	TCA	2	6	1878592	1878597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867435
43016	NC_021823	TCC	2	6	1878619	1878624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525867436
43017	NC_021823	TTA	2	6	1878644	1878649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867436
43018	NC_021823	GTA	2	6	1878656	1878661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867436
43019	NC_021823	AAT	2	6	1878718	1878723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867436
43020	NC_021823	TTGA	2	8	1878724	1878731	25 %	50 %	25 %	0 %	525867436
43021	NC_021823	TCA	2	6	1878755	1878760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867436
43022	NC_021823	GCAATA	2	12	1878761	1878772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525867436
43023	NC_021823	A	6	6	1878824	1878829	100 %	0 %	0 %	0 %	525867436
43024	NC_021823	ATA	2	6	1878956	1878961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867436
43025	NC_021823	GCG	2	6	1878962	1878967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525867436
43026	NC_021823	TTG	2	6	1879009	1879014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867436
43027	NC_021823	CAT	2	6	1879018	1879023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867436
43028	NC_021823	TAA	2	6	1879026	1879031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867436
43029	NC_021823	GCG	2	6	1879103	1879108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525867436
43030	NC_021823	ATTTCC	2	12	1879212	1879223	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525867436
43031	NC_021823	CACT	2	8	1879339	1879346	25 %	25 %	0 %	50 %	525867436
43032	NC_021823	CCA	2	6	1879348	1879353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43033	NC_021823	TGTT	2	8	1879366	1879373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43034	NC_021823	TAAT	2	8	1879378	1879385	50 %	50 %	0 %	0 %	525868573
43035	NC_021823	TAT	2	6	1879386	1879391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868573
43036	NC_021823	ATG	2	6	1879409	1879414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868573
43037	NC_021823	AAT	2	6	1879428	1879433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868573
43038	NC_021823	TTGTTC	2	12	1879519	1879530	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525868573
43039	NC_021823	CTT	2	6	1879560	1879565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868573
43040	NC_021823	TC	3	6	1879601	1879606	0 %	50 %	0 %	50 %	525868573
43041	NC_021823	CTT	2	6	1879620	1879625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43042	NC_021823	T	6	6	1879628	1879633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43043	NC_021823	TA	3	6	1879636	1879641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43044	NC_021823	TAAT	2	8	1879671	1879678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43045	NC_021823	T	6	6	1879768	1879773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43046	NC_021823	AT	3	6	1879801	1879806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43047	NC_021823	ATTT	2	8	1879808	1879815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43048	NC_021823	ATC	2	6	1879821	1879826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43049	NC_021823	TGT	3	9	1879903	1879911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868574
43050	NC_021823	T	6	6	1879913	1879918	0 %	100 %	0 %	0 %	525868574
43051	NC_021823	TCG	2	6	1879969	1879974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868574
43052	NC_021823	GATAAA	2	12	1879984	1879995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525868574
43053	NC_021823	T	7	7	1879996	1880002	0 %	100 %	0 %	0 %	525868574
43054	NC_021823	TAA	2	6	1880010	1880015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868574
43055	NC_021823	T	6	6	1880022	1880027	0 %	100 %	0 %	0 %	525868574
43056	NC_021823	T	6	6	1880150	1880155	0 %	100 %	0 %	0 %	525868574
43057	NC_021823	TC	3	6	1880174	1880179	0 %	50 %	0 %	50 %	525868574
43058	NC_021823	GTG	2	6	1880213	1880218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868574
43059	NC_021823	TCCA	2	8	1880236	1880243	25 %	25 %	0 %	50 %	525868574
43060	NC_021823	ATA	2	6	1880269	1880274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868574
43061	NC_021823	T	6	6	1880297	1880302	0 %	100 %	0 %	0 %	525868574
43062	NC_021823	CTT	2	6	1880390	1880395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868574
43063	NC_021823	CTC	2	6	1880411	1880416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868574
43064	NC_021823	ATTA	2	8	1880424	1880431	50 %	50 %	0 %	0 %	525868574
43065	NC_021823	AATGAT	2	12	1880458	1880469	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43066	NC_021823	TAA	2	6	1880470	1880475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43067	NC_021823	A	7	7	1880474	1880480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43068	NC_021823	T	6	6	1880521	1880526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43069	NC_021823	TATT	2	8	1880536	1880543	25 %	75 %	0 %	0 %	525868575
43070	NC_021823	TTGT	2	8	1880552	1880559	0 %	75 %	25 %	0 %	525868575
43071	NC_021823	TGG	2	6	1880625	1880630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868575
43072	NC_021823	TTC	2	6	1880646	1880651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868575
43073	NC_021823	TCT	2	6	1880677	1880682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868575
43074	NC_021823	ATT	2	6	1880708	1880713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868576
43075	NC_021823	TAT	2	6	1880812	1880817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868576
43076	NC_021823	ATCA	2	8	1880830	1880837	50 %	25 %	0 %	25 %	525868576
43077	NC_021823	T	7	7	1880853	1880859	0 %	100 %	0 %	0 %	525868577
43078	NC_021823	T	6	6	1880894	1880899	0 %	100 %	0 %	0 %	525868577
43079	NC_021823	TG	3	6	1880907	1880912	0 %	50 %	50 %	0 %	525868577
43080	NC_021823	T	6	6	1881020	1881025	0 %	100 %	0 %	0 %	525868577
43081	NC_021823	T	6	6	1881064	1881069	0 %	100 %	0 %	0 %	525868577
43082	NC_021823	TTGA	2	8	1881098	1881105	25 %	50 %	25 %	0 %	525868577
43083	NC_021823	TA	3	6	1881155	1881160	50 %	50 %	0 %	0 %	525868577
43084	NC_021823	TAA	2	6	1881163	1881168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868577
43085	NC_021823	CCTT	2	8	1881236	1881243	0 %	50 %	0 %	50 %	525868578
43086	NC_021823	ATTG	2	8	1881261	1881268	25 %	50 %	25 %	0 %	525868578
43087	NC_021823	T	6	6	1881411	1881416	0 %	100 %	0 %	0 %	525868578
43088	NC_021823	ATA	2	6	1881500	1881505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868578
43089	NC_021823	GCT	2	6	1881507	1881512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868578
43090	NC_021823	ACT	2	6	1881546	1881551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868578
43091	NC_021823	TTC	2	6	1881552	1881557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868578
43092	NC_021823	TTCG	2	8	1881579	1881586	0 %	50 %	25 %	25 %	525868578
43093	NC_021823	TTC	2	6	1881624	1881629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43094	NC_021823	T	6	6	1881724	1881729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43095	NC_021823	CTG	2	6	1881740	1881745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43096	NC_021823	ATT	3	9	1881897	1881905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867437
43097	NC_021823	CGT	2	6	1881992	1881997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867437
43098	NC_021823	T	7	7	1882050	1882056	0 %	100 %	0 %	0 %	525867437
43099	NC_021823	CTG	2	6	1882076	1882081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867437
43100	NC_021823	ACA	2	6	1882093	1882098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867437
43101	NC_021823	CTT	2	6	1882115	1882120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867437
43102	NC_021823	CTG	2	6	1882175	1882180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867437
43103	NC_021823	CACGA	2	10	1882233	1882242	40 %	0 %	20 %	40 %	525867437
43104	NC_021823	TCA	2	6	1882244	1882249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867437
43105	NC_021823	TCC	2	6	1882257	1882262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868579
43106	NC_021823	TCA	2	6	1882290	1882295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868579
43107	NC_021823	CCA	2	6	1882384	1882389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525868579
43108	NC_021823	TTC	3	9	1882409	1882417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868579
43109	NC_021823	T	7	7	1882510	1882516	0 %	100 %	0 %	0 %	525868579
43110	NC_021823	CTG	2	6	1882602	1882607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868580
43111	NC_021823	TCG	2	6	1882643	1882648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868580
43112	NC_021823	TCG	2	6	1882652	1882657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868580
43113	NC_021823	CAT	2	6	1882705	1882710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868580
43114	NC_021823	TCT	2	6	1882744	1882749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868581
43115	NC_021823	TTA	2	6	1882757	1882762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868581
43116	NC_021823	TTC	2	6	1882821	1882826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868581
43117	NC_021823	TTC	2	6	1882833	1882838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868581
43118	NC_021823	CAA	2	6	1882955	1882960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868581
43119	NC_021823	A	7	7	1882959	1882965	100 %	0 %	0 %	0 %	525868581
43120	NC_021823	AT	3	6	1882992	1882997	50 %	50 %	0 %	0 %	525868581
43121	NC_021823	TCAT	2	8	1883005	1883012	25 %	50 %	0 %	25 %	525868581
43122	NC_021823	T	6	6	1883027	1883032	0 %	100 %	0 %	0 %	525868581
43123	NC_021823	T	6	6	1883056	1883061	0 %	100 %	0 %	0 %	525868581
43124	NC_021823	TGAT	2	8	1883111	1883118	25 %	50 %	25 %	0 %	525868581
43125	NC_021823	CGCC	2	8	1883125	1883132	0 %	0 %	25 %	75 %	525868581
43126	NC_021823	CGT	2	6	1883259	1883264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868582
43127	NC_021823	TCATAA	2	12	1883295	1883306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525868582
43128	NC_021823	CAC	2	6	1883368	1883373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867438
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43130	NC_021823	ACTT	2	8	1883597	1883604	25 %	50 %	0 %	25 %	525868583
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43144	NC_021823	TCTA	2	8	1884125	1884132	25 %	50 %	0 %	25 %	525868584
43145	NC_021823	TA	3	6	1884160	1884165	50 %	50 %	0 %	0 %	525868584
43146	NC_021823	AAAT	2	8	1884281	1884288	75 %	25 %	0 %	0 %	525868584
43147	NC_021823	CTT	2	6	1884302	1884307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868584
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43151	NC_021823	TCC	2	6	1884424	1884429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43217	NC_021823	ATTT	2	8	1887346	1887353	25 %	75 %	0 %	0 %	525867441
43218	NC_021823	TGCTT	2	10	1887377	1887386	0 %	60 %	20 %	20 %	525867441
43219	NC_021823	ATGCTG	2	12	1887469	1887480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525867441
43220	NC_021823	ACCA	2	8	1887506	1887513	50 %	0 %	0 %	50 %	525867441
43221	NC_021823	CAT	2	6	1887563	1887568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867441
43222	NC_021823	CTTT	2	8	1887583	1887590	0 %	75 %	0 %	25 %	525867441
43223	NC_021823	CTT	2	6	1887622	1887627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867441
43224	NC_021823	GTCT	2	8	1887683	1887690	0 %	50 %	25 %	25 %	525867441
43225	NC_021823	ATG	2	6	1887735	1887740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867441
43226	NC_021823	CGCT	2	8	1887811	1887818	0 %	25 %	25 %	50 %	525867441
43227	NC_021823	TCTTT	2	10	1887832	1887841	0 %	80 %	0 %	20 %	525867441
43228	NC_021823	AT	3	6	1887852	1887857	50 %	50 %	0 %	0 %	525867441
43229	NC_021823	T	6	6	1887872	1887877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43230	NC_021823	GC	3	6	1887927	1887932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43231	NC_021823	T	6	6	1887947	1887952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43232	NC_021823	ATC	2	6	1887978	1887983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43233	NC_021823	T	6	6	1888009	1888014	0 %	100 %	0 %	0 %	525867442
43234	NC_021823	CCT	2	6	1888100	1888105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868587
43235	NC_021823	CTC	2	6	1888125	1888130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868587
43236	NC_021823	TCTG	2	8	1888178	1888185	0 %	50 %	25 %	25 %	525868587
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43238	NC_021823	TC	3	6	1888266	1888271	0 %	50 %	0 %	50 %	525868587
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43479	NC_021823	ACC	2	6	1897657	1897662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867448
43480	NC_021823	CAC	2	6	1897686	1897691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867448
43481	NC_021823	AT	3	6	1897760	1897765	50 %	50 %	0 %	0 %	525867448
43482	NC_021823	GCGATA	2	12	1897904	1897915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525867448
43483	NC_021823	CCA	2	6	1897919	1897924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867448
43484	NC_021823	TTG	2	6	1897975	1897980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867448
43485	NC_021823	CTT	2	6	1898061	1898066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867448
43486	NC_021823	TTC	2	6	1898074	1898079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867448
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43492	NC_021823	TTG	2	6	1898405	1898410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867448
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43496	NC_021823	CAT	2	6	1898577	1898582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867448
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43499	NC_021823	TCA	2	6	1898726	1898731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867448
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