MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_021823	CTT	2	6	1661958	1661963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38002	NC_021823	ACT	2	6	1661983	1661988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38003	NC_021823	TAA	2	6	1661993	1661998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38004	NC_021823	AAC	2	6	1661999	1662004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38005	NC_021823	ATTCAA	2	12	1662109	1662120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38006	NC_021823	ATC	2	6	1662204	1662209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38007	NC_021823	TAAA	2	8	1662231	1662238	75 %	25 %	0 %	0 %	525867261
38008	NC_021823	T	6	6	1662244	1662249	0 %	100 %	0 %	0 %	525867261
38009	NC_021823	TGC	2	6	1662271	1662276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867261
38010	NC_021823	TGG	2	6	1662331	1662336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525867261
38011	NC_021823	TAA	2	6	1662343	1662348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867261
38012	NC_021823	TCA	2	6	1662429	1662434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867261
38013	NC_021823	AAT	2	6	1662473	1662478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867261
38014	NC_021823	TTGC	2	8	1662488	1662495	0 %	50 %	25 %	25 %	525867261
38015	NC_021823	CT	3	6	1662499	1662504	0 %	50 %	0 %	50 %	525867261
38016	NC_021823	AAG	2	6	1662554	1662559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867261
38017	NC_021823	ACA	2	6	1662596	1662601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867261
38018	NC_021823	TAA	2	6	1662660	1662665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867261
38019	NC_021823	AAC	2	6	1662695	1662700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867261
38020	NC_021823	CGC	2	6	1662739	1662744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867261
38021	NC_021823	CAG	2	6	1662750	1662755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867261
38022	NC_021823	A	6	6	1662857	1662862	100 %	0 %	0 %	0 %	525867261
38023	NC_021823	T	6	6	1662904	1662909	0 %	100 %	0 %	0 %	525867261
38024	NC_021823	GAA	2	6	1662910	1662915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867261
38025	NC_021823	ATC	2	6	1662953	1662958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867261
38026	NC_021823	AGAGC	2	10	1662965	1662974	40 %	0 %	40 %	20 %	525867261
38027	NC_021823	AATA	2	8	1663004	1663011	75 %	25 %	0 %	0 %	525867261
38028	NC_021823	ATC	2	6	1663052	1663057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867261
38029	NC_021823	CAT	2	6	1663074	1663079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867261
38030	NC_021823	ATC	2	6	1663171	1663176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867261
38031	NC_021823	A	6	6	1663187	1663192	100 %	0 %	0 %	0 %	525867261
38032	NC_021823	AAT	2	6	1663231	1663236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867261
38033	NC_021823	AAC	2	6	1663249	1663254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867261
38034	NC_021823	TC	3	6	1663302	1663307	0 %	50 %	0 %	50 %	525867261
38035	NC_021823	CGC	2	6	1663330	1663335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867261
38036	NC_021823	CAA	2	6	1663431	1663436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867261
38037	NC_021823	ATCA	2	8	1663444	1663451	50 %	25 %	0 %	25 %	525867261
38038	NC_021823	AAC	2	6	1663469	1663474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867261
38039	NC_021823	AAGG	2	8	1663484	1663491	50 %	0 %	50 %	0 %	525867261
38040	NC_021823	T	7	7	1663512	1663518	0 %	100 %	0 %	0 %	525867261
38041	NC_021823	T	6	6	1663547	1663552	0 %	100 %	0 %	0 %	525867261
38042	NC_021823	TAC	2	6	1663557	1663562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867261
38043	NC_021823	TTTTC	2	10	1663623	1663632	0 %	80 %	0 %	20 %	525867262
38044	NC_021823	CTT	2	6	1663698	1663703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867262
38045	NC_021823	TCCA	2	8	1663742	1663749	25 %	25 %	0 %	50 %	525867262
38046	NC_021823	TAAA	2	8	1663755	1663762	75 %	25 %	0 %	0 %	525867262
38047	NC_021823	GCA	2	6	1663785	1663790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867262
38048	NC_021823	CGTAA	2	10	1663848	1663857	40 %	20 %	20 %	20 %	525867262
38049	NC_021823	TCTGG	2	10	1663928	1663937	0 %	40 %	40 %	20 %	525867262
38050	NC_021823	GTA	2	6	1663966	1663971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867262
38051	NC_021823	ATC	2	6	1664017	1664022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867262
38052	NC_021823	TTC	2	6	1664054	1664059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867262
38053	NC_021823	CAC	2	6	1664065	1664070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867262
38054	NC_021823	ATT	2	6	1664107	1664112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867262
38055	NC_021823	TCT	2	6	1664144	1664149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867262
38056	NC_021823	TCA	2	6	1664154	1664159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867262
38057	NC_021823	CTC	2	6	1664165	1664170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38058	NC_021823	GAC	2	6	1664182	1664187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38059	NC_021823	A	7	7	1664211	1664217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38060	NC_021823	CAA	2	6	1664226	1664231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38061	NC_021823	A	7	7	1664230	1664236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38062	NC_021823	ATTT	2	8	1664266	1664273	25 %	75 %	0 %	0 %	525867263
38063	NC_021823	TTC	2	6	1664274	1664279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867263
38064	NC_021823	TTC	2	6	1664398	1664403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867263
38065	NC_021823	CAG	2	6	1664441	1664446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867263
38066	NC_021823	AT	3	6	1664536	1664541	50 %	50 %	0 %	0 %	525867263
38067	NC_021823	GAT	2	6	1664786	1664791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867263
38068	NC_021823	TAG	2	6	1664802	1664807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867263
38069	NC_021823	GCT	2	6	1664830	1664835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867263
38070	NC_021823	TGT	2	6	1664889	1664894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867263
38071	NC_021823	CCA	2	6	1664953	1664958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867263
38072	NC_021823	TCT	2	6	1664989	1664994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867263
38073	NC_021823	GCG	2	6	1664996	1665001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525867263
38074	NC_021823	T	7	7	1665041	1665047	0 %	100 %	0 %	0 %	525867263
38075	NC_021823	AT	3	6	1665109	1665114	50 %	50 %	0 %	0 %	525867263
38076	NC_021823	T	6	6	1665210	1665215	0 %	100 %	0 %	0 %	525867263
38077	NC_021823	T	6	6	1665225	1665230	0 %	100 %	0 %	0 %	525867263
38078	NC_021823	TAAA	2	8	1665232	1665239	75 %	25 %	0 %	0 %	525867263
38079	NC_021823	TAA	2	6	1665249	1665254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867263
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38081	NC_021823	ATT	2	6	1665395	1665400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38082	NC_021823	AT	3	6	1665458	1665463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38083	NC_021823	GAAA	2	8	1665531	1665538	75 %	0 %	25 %	0 %	525867264
38084	NC_021823	A	6	6	1665536	1665541	100 %	0 %	0 %	0 %	525867264
38085	NC_021823	TAG	2	6	1665593	1665598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867264
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38088	NC_021823	GGA	2	6	1665729	1665734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525867264
38089	NC_021823	TTA	2	6	1665765	1665770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867264
38090	NC_021823	CCGT	2	8	1665804	1665811	0 %	25 %	25 %	50 %	525867264
38091	NC_021823	A	6	6	1665820	1665825	100 %	0 %	0 %	0 %	525867264
38092	NC_021823	TAG	2	6	1665827	1665832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867264
38093	NC_021823	AAG	2	6	1665845	1665850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867264
38094	NC_021823	GTT	2	6	1665943	1665948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867264
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38096	NC_021823	AACAT	2	10	1666004	1666013	60 %	20 %	0 %	20 %	525867264
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38100	NC_021823	AC	3	6	1666160	1666165	50 %	0 %	0 %	50 %	525867264
38101	NC_021823	TAATT	2	10	1666236	1666245	40 %	60 %	0 %	0 %	525867264
38102	NC_021823	AGA	2	6	1666383	1666388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867264
38103	NC_021823	ATC	2	6	1666426	1666431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867264
38104	NC_021823	A	6	6	1666436	1666441	100 %	0 %	0 %	0 %	525867264
38105	NC_021823	TC	3	6	1666472	1666477	0 %	50 %	0 %	50 %	525867264
38106	NC_021823	CTT	2	6	1666500	1666505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867264
38107	NC_021823	ATT	2	6	1666548	1666553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867264
38108	NC_021823	GAA	2	6	1666577	1666582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867264
38109	NC_021823	ATG	2	6	1666601	1666606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867264
38110	NC_021823	GCA	2	6	1666651	1666656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867264
38111	NC_021823	TCA	2	6	1666664	1666669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867264
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38113	NC_021823	AAC	2	6	1666725	1666730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867264
38114	NC_021823	A	6	6	1666739	1666744	100 %	0 %	0 %	0 %	525867264
38115	NC_021823	TGA	2	6	1666794	1666799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867265
38116	NC_021823	A	6	6	1666826	1666831	100 %	0 %	0 %	0 %	525867265
38117	NC_021823	AGA	2	6	1666839	1666844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867265
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38225	NC_021823	TGC	2	6	1671325	1671330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867269
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38229	NC_021823	T	7	7	1671541	1671547	0 %	100 %	0 %	0 %	525867269
38230	NC_021823	T	6	6	1671565	1671570	0 %	100 %	0 %	0 %	525867269
38231	NC_021823	ATC	2	6	1671630	1671635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867269
38232	NC_021823	TCA	2	6	1671636	1671641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38233	NC_021823	AGCT	2	8	1671657	1671664	25 %	25 %	25 %	25 %	525867270
38234	NC_021823	T	6	6	1671685	1671690	0 %	100 %	0 %	0 %	525867270
38235	NC_021823	CAT	2	6	1671691	1671696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867270
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38237	NC_021823	AAAT	2	8	1671738	1671745	75 %	25 %	0 %	0 %	525867270
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