MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021823	GTTC	2	8	1348692	1348699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31002	NC_021823	CGC	2	6	1348719	1348724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31003	NC_021823	CT	3	6	1348752	1348757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31004	NC_021823	TTGAAT	2	12	1348770	1348781	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_021823	AATTA	2	10	1348834	1348843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_021823	GTTT	2	8	1348847	1348854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31007	NC_021823	TCT	3	9	1348923	1348931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31008	NC_021823	CAA	2	6	1349004	1349009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31009	NC_021823	T	6	6	1349024	1349029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_021823	TA	3	6	1349064	1349069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_021823	TTCT	2	8	1349113	1349120	0 %	75 %	0 %	25 %	525866970
31012	NC_021823	T	6	6	1349148	1349153	0 %	100 %	0 %	0 %	525866970
31013	NC_021823	TG	3	6	1349277	1349282	0 %	50 %	50 %	0 %	525866970
31014	NC_021823	CTC	2	6	1349283	1349288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525866970
31015	NC_021823	T	6	6	1349355	1349360	0 %	100 %	0 %	0 %	525866970
31016	NC_021823	T	6	6	1349387	1349392	0 %	100 %	0 %	0 %	525866970
31017	NC_021823	GAT	2	6	1349425	1349430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866970
31018	NC_021823	TC	3	6	1349462	1349467	0 %	50 %	0 %	50 %	525866970
31019	NC_021823	ATT	2	6	1349480	1349485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866970
31020	NC_021823	TCT	2	6	1349504	1349509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866970
31021	NC_021823	TGC	2	6	1349542	1349547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866970
31022	NC_021823	AGT	2	6	1349638	1349643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866970
31023	NC_021823	ATT	3	9	1349684	1349692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866970
31024	NC_021823	TCT	2	6	1349693	1349698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866970
31025	NC_021823	T	6	6	1349720	1349725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31026	NC_021823	TAG	2	6	1349745	1349750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31027	NC_021823	TTTA	2	8	1349791	1349798	25 %	75 %	0 %	0 %	525866971
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31030	NC_021823	AAC	2	6	1349891	1349896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866971
31031	NC_021823	TTG	2	6	1349898	1349903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866971
31032	NC_021823	CTT	2	6	1349974	1349979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866971
31033	NC_021823	TTGG	2	8	1350001	1350008	0 %	50 %	50 %	0 %	525866971
31034	NC_021823	ACT	2	6	1350108	1350113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866971
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31037	NC_021823	AGAA	2	8	1350308	1350315	75 %	0 %	25 %	0 %	525866971
31038	NC_021823	CAT	2	6	1350366	1350371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866971
31039	NC_021823	GAA	2	6	1350375	1350380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866971
31040	NC_021823	TTC	2	6	1350382	1350387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866971
31041	NC_021823	ATA	2	6	1350397	1350402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866971
31042	NC_021823	TCA	2	6	1350431	1350436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866971
31043	NC_021823	AATT	2	8	1350499	1350506	50 %	50 %	0 %	0 %	525866971
31044	NC_021823	AAGT	2	8	1350540	1350547	50 %	25 %	25 %	0 %	525866971
31045	NC_021823	GAT	2	6	1350606	1350611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866972
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31047	NC_021823	ATGG	2	8	1350693	1350700	25 %	25 %	50 %	0 %	525866972
31048	NC_021823	T	6	6	1350740	1350745	0 %	100 %	0 %	0 %	525866972
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31051	NC_021823	TAA	3	9	1350858	1350866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866972
31052	NC_021823	TAG	2	6	1350884	1350889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866972
31053	NC_021823	TGC	2	6	1350912	1350917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866972
31054	NC_021823	T	6	6	1350969	1350974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31055	NC_021823	ATT	2	6	1350975	1350980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866973
31056	NC_021823	CAAA	2	8	1350990	1350997	75 %	0 %	0 %	25 %	525866973
31057	NC_021823	TC	3	6	1351074	1351079	0 %	50 %	0 %	50 %	525866973
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31061	NC_021823	TCT	2	6	1351292	1351297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866973
31062	NC_021823	TTTC	2	8	1351328	1351335	0 %	75 %	0 %	25 %	525866973
31063	NC_021823	ATA	2	6	1351364	1351369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866973
31064	NC_021823	TAG	2	6	1351370	1351375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866973
31065	NC_021823	GC	3	6	1351468	1351473	0 %	0 %	50 %	50 %	525866973
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31068	NC_021823	TTAA	2	8	1351733	1351740	50 %	50 %	0 %	0 %	525866973
31069	NC_021823	CCA	2	6	1351752	1351757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866973
31070	NC_021823	GTC	2	6	1351780	1351785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866973
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31072	NC_021823	CAT	2	6	1351908	1351913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866973
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31074	NC_021823	CTT	2	6	1352058	1352063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866973
31075	NC_021823	GTT	2	6	1352123	1352128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866973
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31078	NC_021823	AGT	2	6	1352282	1352287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866974
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31085	NC_021823	TAGT	2	8	1352580	1352587	25 %	50 %	25 %	0 %	525866974
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31087	NC_021823	TTCTGT	2	12	1352629	1352640	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525866974
31088	NC_021823	TAC	2	6	1352686	1352691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866974
31089	NC_021823	CTT	2	6	1352706	1352711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866974
31090	NC_021823	T	6	6	1352747	1352752	0 %	100 %	0 %	0 %	525866974
31091	NC_021823	TCCC	2	8	1352802	1352809	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31092	NC_021823	T	6	6	1352872	1352877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_021823	AGC	2	6	1352915	1352920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866975
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31098	NC_021823	GATTA	2	10	1353223	1353232	40 %	40 %	20 %	0 %	525866975
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31101	NC_021823	TGG	2	6	1353474	1353479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866975
31102	NC_021823	CG	3	6	1353494	1353499	0 %	0 %	50 %	50 %	525866975
31103	NC_021823	GATT	2	8	1353521	1353528	25 %	50 %	25 %	0 %	525866975
31104	NC_021823	TGT	2	6	1353533	1353538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866975
31105	NC_021823	A	7	7	1353639	1353645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31106	NC_021823	ATT	2	6	1353675	1353680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866976
31107	NC_021823	T	7	7	1353691	1353697	0 %	100 %	0 %	0 %	525866976
31108	NC_021823	GT	3	6	1353711	1353716	0 %	50 %	50 %	0 %	525866976
31109	NC_021823	ATG	2	6	1353720	1353725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866976
31110	NC_021823	AAGA	2	8	1353810	1353817	75 %	0 %	25 %	0 %	525866976
31111	NC_021823	GAC	2	6	1353882	1353887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866976
31112	NC_021823	AAT	2	6	1353941	1353946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866976
31113	NC_021823	ACG	2	6	1353994	1353999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866976
31114	NC_021823	CCT	2	6	1354044	1354049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31115	NC_021823	TGT	2	6	1354064	1354069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31116	NC_021823	GTTTTT	2	12	1354152	1354163	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525866977
31117	NC_021823	TCC	2	6	1354283	1354288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31118	NC_021823	ACTTT	2	10	1354294	1354303	20 %	60 %	0 %	20 %	525866978
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31243	NC_021823	T	6	6	1360125	1360130	0 %	100 %	0 %	0 %	525866983
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31251	NC_021823	GTC	2	6	1360600	1360605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866984
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31356	NC_021823	TCAGCA	2	12	1365435	1365446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525868522
31357	NC_021823	TCAGCG	2	12	1365483	1365494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525868522
31358	NC_021823	GCATCG	3	18	1365498	1365515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525868522
31359	NC_021823	GCATCC	2	12	1365534	1365545	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31360	NC_021823	GCATCC	2	12	1365558	1365569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31361	NC_021823	GCATCC	3	18	1365750	1365767	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31362	NC_021823	GCATCC	3	18	1365780	1365797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31363	NC_021823	GCATCG	2	12	1366044	1366055	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525868522
31364	NC_021823	GCATCC	2	12	1366116	1366127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31365	NC_021823	GCATCC	2	12	1366146	1366157	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31366	NC_021823	TCAGCA	3	18	1366221	1366238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525868522
31367	NC_021823	GCATCA	2	12	1366260	1366271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525868522
31368	NC_021823	GCATCC	2	12	1366272	1366283	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31369	NC_021823	GCATCC	2	12	1366458	1366469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31370	NC_021823	TCGGCA	2	12	1366491	1366502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525868522
31371	NC_021823	TCCGCA	3	18	1366503	1366520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31372	NC_021823	GCATCC	2	12	1366584	1366595	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31373	NC_021823	GCATCC	2	12	1366638	1366649	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31374	NC_021823	GCATCC	4	24	1366764	1366787	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31375	NC_021823	GCATCC	2	12	1366800	1366811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31376	NC_021823	GCATCC	4	24	1366824	1366847	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31377	NC_021823	GCATCC	2	12	1366950	1366961	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31378	NC_021823	TCCGCA	2	12	1367013	1367024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31379	NC_021823	GCATCC	3	18	1367040	1367057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31380	NC_021823	TCGGCA	2	12	1367067	1367078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525868522
31381	NC_021823	TCGGCA	2	12	1367115	1367126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525868522
31382	NC_021823	TCCGCA	6	36	1367127	1367162	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31383	NC_021823	GCATCC	3	18	1367184	1367201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31384	NC_021823	TCGGCA	2	12	1367247	1367258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525868522
31385	NC_021823	TCCGCA	4	24	1367259	1367282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31386	NC_021823	GCATCC	4	24	1367310	1367333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31387	NC_021823	GCATCC	2	12	1367412	1367423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31388	NC_021823	GCATCC	2	12	1367448	1367459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
31389	NC_021823	GCATCC	2	12	1367562	1367573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525868522
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31391	NC_021823	GTA	2	6	1367697	1367702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868522
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31436	NC_021823	AATG	2	8	1369803	1369810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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