MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021823	TCT	3	9	997876	997884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866680
23003	NC_021823	TAA	2	6	997902	997907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866680
23004	NC_021823	AGC	2	6	997935	997940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866680
23005	NC_021823	T	7	7	997949	997955	0 %	100 %	0 %	0 %	525866680
23006	NC_021823	ATG	2	6	998013	998018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866680
23007	NC_021823	CTC	2	6	998099	998104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525868500
23008	NC_021823	AAT	2	6	998112	998117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868500
23009	NC_021823	TTG	2	6	998133	998138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868500
23010	NC_021823	T	6	6	998144	998149	0 %	100 %	0 %	0 %	525868500
23011	NC_021823	AAT	2	6	998151	998156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868500
23012	NC_021823	CTT	2	6	998177	998182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868500
23013	NC_021823	ACT	2	6	998185	998190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868500
23014	NC_021823	AAT	2	6	998205	998210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868500
23015	NC_021823	TCT	2	6	998257	998262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868500
23016	NC_021823	ACA	2	6	998299	998304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868500
23017	NC_021823	TTTGT	2	10	998314	998323	0 %	80 %	20 %	0 %	525868500
23018	NC_021823	ATT	2	6	998340	998345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868500
23019	NC_021823	TAA	2	6	998357	998362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868500
23020	NC_021823	TTTA	2	8	998373	998380	25 %	75 %	0 %	0 %	525868500
23021	NC_021823	TCT	2	6	998392	998397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868500
23022	NC_021823	TCG	2	6	998416	998421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868500
23023	NC_021823	AAT	2	6	998522	998527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868500
23024	NC_021823	GTTGT	2	10	998549	998558	0 %	60 %	40 %	0 %	525868500
23025	NC_021823	GT	3	6	998562	998567	0 %	50 %	50 %	0 %	525868500
23026	NC_021823	ATT	2	6	998605	998610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868500
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23028	NC_021823	GAT	2	6	998678	998683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868500
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23031	NC_021823	CAT	2	6	998723	998728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868500
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23033	NC_021823	TGTT	2	8	998784	998791	0 %	75 %	25 %	0 %	525868500
23034	NC_021823	GTT	2	6	998821	998826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868500
23035	NC_021823	ATG	2	6	998845	998850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868500
23036	NC_021823	TCT	2	6	998857	998862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868500
23037	NC_021823	TCT	2	6	998869	998874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868500
23038	NC_021823	A	6	6	998920	998925	100 %	0 %	0 %	0 %	525868500
23039	NC_021823	GTA	2	6	999004	999009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868500
23040	NC_021823	ACTTCT	2	12	999013	999024	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525868500
23041	NC_021823	CCATT	2	10	999027	999036	20 %	40 %	0 %	40 %	525868500
23042	NC_021823	CTT	2	6	999077	999082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23043	NC_021823	TCA	2	6	999105	999110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866681
23044	NC_021823	A	6	6	999141	999146	100 %	0 %	0 %	0 %	525866681
23045	NC_021823	AGT	2	6	999177	999182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866681
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23048	NC_021823	GTT	2	6	999316	999321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866681
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23050	NC_021823	CGT	2	6	999554	999559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866681
23051	NC_021823	T	7	7	999587	999593	0 %	100 %	0 %	0 %	525866681
23052	NC_021823	TTA	2	6	999682	999687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866681
23053	NC_021823	ACC	2	6	999735	999740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866681
23054	NC_021823	TTC	2	6	999807	999812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866681
23055	NC_021823	CTT	2	6	999851	999856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866681
23056	NC_021823	TTG	2	6	999915	999920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866681
23057	NC_021823	CGCC	2	8	999922	999929	0 %	0 %	25 %	75 %	525866681
23058	NC_021823	GAA	2	6	999936	999941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866681
23059	NC_021823	TCC	3	9	999972	999980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525866681
23060	NC_021823	GCC	2	6	999987	999992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525866681
23061	NC_021823	CAC	2	6	999998	1000003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866681
23062	NC_021823	CCG	2	6	1000006	1000011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525866681
23063	NC_021823	TCA	2	6	1000111	1000116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866681
23064	NC_021823	CTT	2	6	1000124	1000129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866681
23065	NC_021823	GAT	2	6	1000142	1000147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866681
23066	NC_021823	T	7	7	1000173	1000179	0 %	100 %	0 %	0 %	525866681
23067	NC_021823	TGT	2	6	1000306	1000311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23068	NC_021823	CCTTA	2	10	1000366	1000375	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23069	NC_021823	A	6	6	1000375	1000380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23070	NC_021823	ATT	2	6	1000382	1000387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866682
23071	NC_021823	GTC	3	9	1000398	1000406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866682
23072	NC_021823	CTT	2	6	1000412	1000417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866682
23073	NC_021823	CTA	2	6	1000430	1000435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866682
23074	NC_021823	CGT	2	6	1000436	1000441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866682
23075	NC_021823	GAG	2	6	1000448	1000453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525866682
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23077	NC_021823	GCC	2	6	1000470	1000475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525866682
23078	NC_021823	TTG	2	6	1000482	1000487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866682
23079	NC_021823	CTG	2	6	1000490	1000495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866682
23080	NC_021823	AGAT	2	8	1000518	1000525	50 %	25 %	25 %	0 %	525866682
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23082	NC_021823	CTT	2	6	1000592	1000597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866682
23083	NC_021823	GCT	2	6	1000612	1000617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866682
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23085	NC_021823	CTT	4	12	1000631	1000642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866682
23086	NC_021823	TTG	2	6	1000702	1000707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866682
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23088	NC_021823	T	6	6	1000772	1000777	0 %	100 %	0 %	0 %	525866682
23089	NC_021823	TTC	2	6	1000782	1000787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866682
23090	NC_021823	GAA	2	6	1000801	1000806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866682
23091	NC_021823	TAA	2	6	1000811	1000816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866682
23092	NC_021823	CG	3	6	1000851	1000856	0 %	0 %	50 %	50 %	525866682
23093	NC_021823	GTG	2	6	1000916	1000921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866682
23094	NC_021823	TGGT	2	8	1001013	1001020	0 %	50 %	50 %	0 %	525866682
23095	NC_021823	GCT	2	6	1001026	1001031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866682
23096	NC_021823	AGT	2	6	1001140	1001145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866682
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23099	NC_021823	CCA	2	6	1001290	1001295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866682
23100	NC_021823	TCA	2	6	1001395	1001400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866682
23101	NC_021823	AAGTG	2	10	1001428	1001437	40 %	20 %	40 %	0 %	525866682
23102	NC_021823	TG	3	6	1001476	1001481	0 %	50 %	50 %	0 %	525866682
23103	NC_021823	T	6	6	1001502	1001507	0 %	100 %	0 %	0 %	525866682
23104	NC_021823	T	6	6	1001577	1001582	0 %	100 %	0 %	0 %	525866682
23105	NC_021823	CTA	2	6	1001591	1001596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866682
23106	NC_021823	GAT	2	6	1001604	1001609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866682
23107	NC_021823	T	7	7	1001609	1001615	0 %	100 %	0 %	0 %	525866682
23108	NC_021823	CAG	2	6	1001648	1001653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866682
23109	NC_021823	GATA	2	8	1001691	1001698	50 %	25 %	25 %	0 %	525866682
23110	NC_021823	ACC	3	9	1001709	1001717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866682
23111	NC_021823	TCTGTT	2	12	1001743	1001754	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525866682
23112	NC_021823	CCATA	2	10	1001759	1001768	40 %	20 %	0 %	40 %	525866682
23113	NC_021823	TGC	2	6	1001775	1001780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866682
23114	NC_021823	TAA	2	6	1001795	1001800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866682
23115	NC_021823	TTG	2	6	1001840	1001845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866682
23116	NC_021823	TCT	2	6	1001917	1001922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866682
23117	NC_021823	AAT	2	6	1001972	1001977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866682
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23340	NC_021823	ATA	2	6	1011673	1011678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23342	NC_021823	A	6	6	1011741	1011746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23343	NC_021823	TAG	2	6	1011788	1011793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23345	NC_021823	AGC	2	6	1011831	1011836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23346	NC_021823	GCTC	2	8	1011908	1011915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23347	NC_021823	TAG	2	6	1011934	1011939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23349	NC_021823	TAGC	2	8	1011987	1011994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23350	NC_021823	ACA	2	6	1012001	1012006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23351	NC_021823	TTG	2	6	1012012	1012017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23352	NC_021823	T	6	6	1012050	1012055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23353	NC_021823	TAAT	2	8	1012062	1012069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23354	NC_021823	T	6	6	1012101	1012106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23355	NC_021823	ATT	2	6	1012121	1012126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23356	NC_021823	TA	3	6	1012204	1012209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23357	NC_021823	AATTG	2	10	1012242	1012251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23358	NC_021823	GATG	2	8	1012263	1012270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23359	NC_021823	T	6	6	1012322	1012327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23479	NC_021823	TCT	3	9	1017305	1017313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866697
23480	NC_021823	AAC	2	6	1017409	1017414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866697
23481	NC_021823	CCT	2	6	1017435	1017440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23482	NC_021823	CTT	2	6	1017613	1017618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866698
23483	NC_021823	TTG	2	6	1017702	1017707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866698
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23491	NC_021823	TGT	3	9	1017845	1017853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866698
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