MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

< Previous12...2223242526272829303132...136137Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021823	TTTAT	2	10	563200	563209	20 %	80 %	0 %	0 %	525868413
13002	NC_021823	TTA	2	6	563227	563232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868413
13003	NC_021823	GAAT	2	8	563276	563283	50 %	25 %	25 %	0 %	525868413
13004	NC_021823	A	6	6	563396	563401	100 %	0 %	0 %	0 %	525868413
13005	NC_021823	TAAA	2	8	563423	563430	75 %	25 %	0 %	0 %	525868413
13006	NC_021823	A	6	6	563428	563433	100 %	0 %	0 %	0 %	525868413
13007	NC_021823	TGC	2	6	563523	563528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868413
13008	NC_021823	ATC	2	6	563579	563584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868413
13009	NC_021823	GAT	2	6	563631	563636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868413
13010	NC_021823	CAAA	2	8	563668	563675	75 %	0 %	0 %	25 %	525868413
13011	NC_021823	CTT	2	6	563693	563698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868413
13012	NC_021823	TGG	2	6	563714	563719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868413
13013	NC_021823	A	7	7	563737	563743	100 %	0 %	0 %	0 %	525868413
13014	NC_021823	GTCT	2	8	563756	563763	0 %	50 %	25 %	25 %	525868413
13015	NC_021823	GTT	2	6	563770	563775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868413
13016	NC_021823	GAAG	2	8	563784	563791	50 %	0 %	50 %	0 %	525868413
13017	NC_021823	ATT	2	6	563861	563866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868413
13018	NC_021823	AGA	2	6	563871	563876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868413
13019	NC_021823	AAC	2	6	563877	563882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868413
13020	NC_021823	ATA	2	6	563933	563938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868413
13021	NC_021823	CTA	2	6	563942	563947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868413
13022	NC_021823	GAA	3	9	563956	563964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868413
13023	NC_021823	A	7	7	564013	564019	100 %	0 %	0 %	0 %	525868413
13024	NC_021823	GTT	2	6	564039	564044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868413
13025	NC_021823	TAT	2	6	564045	564050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868413
13026	NC_021823	TTA	2	6	564089	564094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868413
13027	NC_021823	A	7	7	564131	564137	100 %	0 %	0 %	0 %	525868413
13028	NC_021823	A	7	7	564142	564148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_021823	T	6	6	564177	564182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_021823	AGA	2	6	564231	564236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868414
13031	NC_021823	TTA	2	6	564241	564246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868414
13032	NC_021823	TAT	2	6	564277	564282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868414
13033	NC_021823	TAT	2	6	564289	564294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868414
13034	NC_021823	AGTTT	2	10	564306	564315	20 %	60 %	20 %	0 %	525868414
13035	NC_021823	CTA	2	6	564340	564345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868414
13036	NC_021823	AAC	2	6	564370	564375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868414
13037	NC_021823	AAT	2	6	564413	564418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868414
13038	NC_021823	GAA	2	6	564438	564443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868414
13039	NC_021823	GAA	2	6	564450	564455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868414
13040	NC_021823	TAAA	2	8	564481	564488	75 %	25 %	0 %	0 %	525868414
13041	NC_021823	A	6	6	564492	564497	100 %	0 %	0 %	0 %	525868414
13042	NC_021823	A	6	6	564573	564578	100 %	0 %	0 %	0 %	525868414
13043	NC_021823	AAG	2	6	564580	564585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868414
13044	NC_021823	ATT	2	6	564717	564722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868414
13045	NC_021823	A	8	8	564786	564793	100 %	0 %	0 %	0 %	525868414
13046	NC_021823	A	6	6	564840	564845	100 %	0 %	0 %	0 %	525868414
13047	NC_021823	TGT	2	6	564854	564859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868414
13048	NC_021823	A	6	6	564883	564888	100 %	0 %	0 %	0 %	525868414
13049	NC_021823	ATG	2	6	564915	564920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868414
13050	NC_021823	TGGAG	2	10	564972	564981	20 %	20 %	60 %	0 %	525868414
13051	NC_021823	AATTT	2	10	564997	565006	40 %	60 %	0 %	0 %	525868414
13052	NC_021823	AAAT	2	8	565021	565028	75 %	25 %	0 %	0 %	525868414
13053	NC_021823	A	7	7	565046	565052	100 %	0 %	0 %	0 %	525868414
13054	NC_021823	A	7	7	565110	565116	100 %	0 %	0 %	0 %	525868414
13055	NC_021823	ATT	2	6	565155	565160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868414
13056	NC_021823	TGA	2	6	565162	565167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868414
13057	NC_021823	CTGG	2	8	565176	565183	0 %	25 %	50 %	25 %	525868414
13058	NC_021823	TAG	2	6	565294	565299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868414
13059	NC_021823	ATTA	2	8	565304	565311	50 %	50 %	0 %	0 %	525868414
13060	NC_021823	GCA	2	6	565314	565319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525868414
13061	NC_021823	CTTTTT	2	12	565324	565335	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525868414
13062	NC_021823	AAG	2	6	565402	565407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868414
13063	NC_021823	CA	3	6	565430	565435	50 %	0 %	0 %	50 %	525868414
13064	NC_021823	TGG	2	6	565541	565546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868414
13065	NC_021823	TTTTA	2	10	565553	565562	20 %	80 %	0 %	0 %	525868414
13066	NC_021823	CAA	2	6	565573	565578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868414
13067	NC_021823	TTTA	2	8	565589	565596	25 %	75 %	0 %	0 %	525868414
13068	NC_021823	GA	3	6	565642	565647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_021823	ACA	2	6	565794	565799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866307
13070	NC_021823	TGC	2	6	565811	565816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866307
13071	NC_021823	AACC	2	8	565828	565835	50 %	0 %	0 %	50 %	525866307
13072	NC_021823	ATTA	2	8	565844	565851	50 %	50 %	0 %	0 %	525866307
13073	NC_021823	TAA	2	6	565853	565858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866307
13074	NC_021823	A	6	6	565857	565862	100 %	0 %	0 %	0 %	525866307
13075	NC_021823	ATT	2	6	565914	565919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866307
13076	NC_021823	TAATT	2	10	565931	565940	40 %	60 %	0 %	0 %	525866307
13077	NC_021823	ACA	2	6	565985	565990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866307
13078	NC_021823	GTG	2	6	566086	566091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866307
13079	NC_021823	ACA	3	9	566093	566101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866307
13080	NC_021823	ATTT	2	8	566141	566148	25 %	75 %	0 %	0 %	525866307
13081	NC_021823	ATT	2	6	566196	566201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866307
13082	NC_021823	ATTT	2	8	566203	566210	25 %	75 %	0 %	0 %	525866307
13083	NC_021823	GTC	2	6	566241	566246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866307
13084	NC_021823	A	7	7	566329	566335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_021823	GAT	2	6	566541	566546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866308
13086	NC_021823	AAG	2	6	566552	566557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866308
13087	NC_021823	TCA	2	6	566567	566572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866308
13088	NC_021823	CATC	2	8	566609	566616	25 %	25 %	0 %	50 %	525866308
13089	NC_021823	AAT	2	6	566673	566678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866308
13090	NC_021823	TCT	2	6	566683	566688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866308
13091	NC_021823	TCT	2	6	566701	566706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866308
13092	NC_021823	CAT	2	6	566733	566738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866308
13093	NC_021823	TAAAC	2	10	566782	566791	60 %	20 %	0 %	20 %	525866308
13094	NC_021823	T	6	6	566792	566797	0 %	100 %	0 %	0 %	525866308
13095	NC_021823	GTT	2	6	566819	566824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866308
13096	NC_021823	AGT	2	6	566901	566906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866308
13097	NC_021823	TGCAA	2	10	566926	566935	40 %	20 %	20 %	20 %	525866308
13098	NC_021823	TAA	2	6	566978	566983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866308
13099	NC_021823	AGA	2	6	566997	567002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866308
13100	NC_021823	TAA	2	6	567020	567025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866308
13101	NC_021823	TAA	2	6	567038	567043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866308
13102	NC_021823	ATC	2	6	567084	567089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866308
13103	NC_021823	GTC	2	6	567135	567140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866308
13104	NC_021823	TCT	2	6	567181	567186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866308
13105	NC_021823	TTA	2	6	567223	567228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866308
13106	NC_021823	TTC	2	6	567231	567236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866308
13107	NC_021823	CAA	2	6	567248	567253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866308
13108	NC_021823	CAA	2	6	567262	567267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866308
13109	NC_021823	CTT	2	6	567278	567283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866308
13110	NC_021823	AATT	2	8	567291	567298	50 %	50 %	0 %	0 %	525866308
13111	NC_021823	ATGC	2	8	567327	567334	25 %	25 %	25 %	25 %	525866308
13112	NC_021823	CCT	2	6	567341	567346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_021823	T	6	6	567346	567351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_021823	TGC	2	6	567441	567446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_021823	TAA	2	6	567592	567597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866309
13116	NC_021823	GAT	2	6	567616	567621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866309
13117	NC_021823	T	6	6	567662	567667	0 %	100 %	0 %	0 %	525866309
13118	NC_021823	T	6	6	567724	567729	0 %	100 %	0 %	0 %	525866309
13119	NC_021823	AAT	2	6	567777	567782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866309
13120	NC_021823	TTCTT	2	10	567783	567792	0 %	80 %	0 %	20 %	525866309
13121	NC_021823	TTC	2	6	567821	567826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866309
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13123	NC_021823	AATA	2	8	567855	567862	75 %	25 %	0 %	0 %	525866309
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13492	NC_021823	T	6	6	583073	583078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13493	NC_021823	TCGC	2	8	583123	583130	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13494	NC_021823	A	6	6	583132	583137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13495	NC_021823	A	6	6	583203	583208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_021823	ACT	2	6	583213	583218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13498	NC_021823	TAT	2	6	583268	583273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868416
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13500	NC_021823	ATG	2	6	583450	583455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868416

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