MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021823	AAG	2	6	260515	260520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866037
6002	NC_021823	T	7	7	260579	260585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021823	AAAG	2	8	260593	260600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_021823	AT	4	8	260631	260638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021823	TAT	2	6	260641	260646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021823	TAAT	2	8	260674	260681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021823	A	6	6	260739	260744	100 %	0 %	0 %	0 %	525866038
6008	NC_021823	A	7	7	260746	260752	100 %	0 %	0 %	0 %	525866038
6009	NC_021823	AAAT	2	8	260754	260761	75 %	25 %	0 %	0 %	525866038
6010	NC_021823	ATTT	2	8	260845	260852	25 %	75 %	0 %	0 %	525866038
6011	NC_021823	GAA	2	6	260933	260938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866038
6012	NC_021823	CTTAT	2	10	261123	261132	20 %	60 %	0 %	20 %	525866038
6013	NC_021823	GAA	2	6	261147	261152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866038
6014	NC_021823	GCA	2	6	261167	261172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866038
6015	NC_021823	AAC	2	6	261216	261221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866038
6016	NC_021823	TGA	2	6	261349	261354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866038
6017	NC_021823	AGT	3	9	261397	261405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866038
6018	NC_021823	GCT	2	6	261470	261475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866038
6019	NC_021823	ATC	2	6	261525	261530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866038
6020	NC_021823	ATT	2	6	261580	261585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866038
6021	NC_021823	GATG	2	8	261586	261593	25 %	25 %	50 %	0 %	525866038
6022	NC_021823	CT	3	6	261614	261619	0 %	50 %	0 %	50 %	525866038
6023	NC_021823	ATC	2	6	261626	261631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866038
6024	NC_021823	TAAG	2	8	261684	261691	50 %	25 %	25 %	0 %	525866038
6025	NC_021823	TAT	2	6	261701	261706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866038
6026	NC_021823	CAG	2	6	261750	261755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866038
6027	NC_021823	AT	3	6	261757	261762	50 %	50 %	0 %	0 %	525866038
6028	NC_021823	TGT	2	6	261834	261839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866038
6029	NC_021823	CG	3	6	261906	261911	0 %	0 %	50 %	50 %	525866038
6030	NC_021823	ATG	2	6	261932	261937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866038
6031	NC_021823	GAA	2	6	261988	261993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866038
6032	NC_021823	AGG	2	6	262001	262006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021823	CAA	2	6	262018	262023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866039
6034	NC_021823	AAAT	2	8	262028	262035	75 %	25 %	0 %	0 %	525866039
6035	NC_021823	CAA	2	6	262050	262055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866039
6036	NC_021823	TTA	2	6	262089	262094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866039
6037	NC_021823	ATTGG	2	10	262174	262183	20 %	40 %	40 %	0 %	525866039
6038	NC_021823	TCATT	2	10	262225	262234	20 %	60 %	0 %	20 %	525866039
6039	NC_021823	TAT	2	6	262244	262249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866039
6040	NC_021823	GCT	2	6	262296	262301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866039
6041	NC_021823	A	6	6	262320	262325	100 %	0 %	0 %	0 %	525866039
6042	NC_021823	TTTA	2	8	262334	262341	25 %	75 %	0 %	0 %	525866039
6043	NC_021823	T	7	7	262347	262353	0 %	100 %	0 %	0 %	525866039
6044	NC_021823	TAT	2	6	262363	262368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866039
6045	NC_021823	TGA	3	9	262507	262515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866039
6046	NC_021823	ATG	2	6	262542	262547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866039
6047	NC_021823	AAC	2	6	262676	262681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866039
6048	NC_021823	CTA	2	6	262769	262774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866039
6049	NC_021823	GGA	2	6	262794	262799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525866039
6050	NC_021823	TAAA	2	8	262879	262886	75 %	25 %	0 %	0 %	525866039
6051	NC_021823	AGG	2	6	262904	262909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525866039
6052	NC_021823	A	7	7	262933	262939	100 %	0 %	0 %	0 %	525866040
6053	NC_021823	TTAGT	2	10	262980	262989	20 %	60 %	20 %	0 %	525866040
6054	NC_021823	CAA	2	6	263034	263039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866040
6055	NC_021823	TGG	2	6	263161	263166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866040
6056	NC_021823	TTC	2	6	263183	263188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866040
6057	NC_021823	A	6	6	263234	263239	100 %	0 %	0 %	0 %	525866040
6058	NC_021823	ATG	2	6	263267	263272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866040
6059	NC_021823	CAG	2	6	263277	263282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866040
6060	NC_021823	TCTT	2	8	263300	263307	0 %	75 %	0 %	25 %	525866040
6061	NC_021823	TGG	2	6	263356	263361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866040
6062	NC_021823	TACT	2	8	263377	263384	25 %	50 %	0 %	25 %	525866040
6063	NC_021823	T	6	6	263441	263446	0 %	100 %	0 %	0 %	525866040
6064	NC_021823	GTT	2	6	263490	263495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866040
6065	NC_021823	AAT	2	6	263560	263565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866040
6066	NC_021823	GGCT	2	8	263575	263582	0 %	25 %	50 %	25 %	525866040
6067	NC_021823	A	6	6	263622	263627	100 %	0 %	0 %	0 %	525866040
6068	NC_021823	TGA	2	6	263628	263633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866040
6069	NC_021823	CTT	2	6	263652	263657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866040
6070	NC_021823	TAT	2	6	263724	263729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866040
6071	NC_021823	TATT	2	8	263733	263740	25 %	75 %	0 %	0 %	525866040
6072	NC_021823	TAAA	2	8	263785	263792	75 %	25 %	0 %	0 %	525866040
6073	NC_021823	A	7	7	263795	263801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_021823	A	6	6	263817	263822	100 %	0 %	0 %	0 %	525868383
6075	NC_021823	GTT	2	6	263849	263854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868383
6076	NC_021823	TGG	2	6	263873	263878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868383
6077	NC_021823	AGT	2	6	263889	263894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868383
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6079	NC_021823	TAA	2	6	263984	263989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868383
6080	NC_021823	AGA	2	6	264035	264040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6081	NC_021823	ATT	2	6	264044	264049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868383
6082	NC_021823	ATT	2	6	264081	264086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868383
6083	NC_021823	AGA	2	6	264158	264163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6084	NC_021823	GATG	2	8	264173	264180	25 %	25 %	50 %	0 %	525868383
6085	NC_021823	GAA	2	6	264189	264194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6086	NC_021823	GAAA	2	8	264200	264207	75 %	0 %	25 %	0 %	525868383
6087	NC_021823	TAA	2	6	264269	264274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868383
6088	NC_021823	A	6	6	264273	264278	100 %	0 %	0 %	0 %	525868383
6089	NC_021823	TTA	2	6	264279	264284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868383
6090	NC_021823	AAG	2	6	264286	264291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6091	NC_021823	ACC	2	6	264302	264307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525868383
6092	NC_021823	CTG	2	6	264331	264336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868383
6093	NC_021823	A	6	6	264340	264345	100 %	0 %	0 %	0 %	525868383
6094	NC_021823	TGGGA	2	10	264354	264363	20 %	20 %	60 %	0 %	525868383
6095	NC_021823	GTT	2	6	264404	264409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868383
6096	NC_021823	ATTCA	2	10	264470	264479	40 %	40 %	0 %	20 %	525868383
6097	NC_021823	TGA	2	6	264551	264556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868383
6098	NC_021823	AAG	2	6	264583	264588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6099	NC_021823	TAA	2	6	264626	264631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868383
6100	NC_021823	AGA	2	6	264635	264640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6101	NC_021823	GTA	2	6	264654	264659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868383
6102	NC_021823	ACC	2	6	264662	264667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525868383
6103	NC_021823	GTG	2	6	264767	264772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868383
6104	NC_021823	TGGT	2	8	264815	264822	0 %	50 %	50 %	0 %	525868383
6105	NC_021823	CAAA	2	8	264829	264836	75 %	0 %	0 %	25 %	525868383
6106	NC_021823	TGC	2	6	264839	264844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868383
6107	NC_021823	ATT	2	6	264874	264879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868383
6108	NC_021823	AAG	2	6	265027	265032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6109	NC_021823	AGA	2	6	265049	265054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868383
6110	NC_021823	GA	4	8	265053	265060	50 %	0 %	50 %	0 %	525868383
6111	NC_021823	TAAA	2	8	265061	265068	75 %	25 %	0 %	0 %	525868383
6112	NC_021823	ATA	2	6	265186	265191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868384
6113	NC_021823	ATT	2	6	265201	265206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868384
6114	NC_021823	TGG	2	6	265222	265227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868384
6115	NC_021823	A	7	7	265256	265262	100 %	0 %	0 %	0 %	525868384
6116	NC_021823	AT	3	6	265292	265297	50 %	50 %	0 %	0 %	525868384
6117	NC_021823	ATA	2	6	265300	265305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868384
6118	NC_021823	ATG	2	6	265342	265347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868384
6119	NC_021823	TA	3	6	265381	265386	50 %	50 %	0 %	0 %	525868384
6120	NC_021823	AGA	2	6	265412	265417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868384
6121	NC_021823	TAT	2	6	265503	265508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868384
6122	NC_021823	CATT	2	8	265531	265538	25 %	50 %	0 %	25 %	525868384
6123	NC_021823	TTCT	2	8	265540	265547	0 %	75 %	0 %	25 %	525868384
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6125	NC_021823	AGA	2	6	265649	265654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868384
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6252	NC_021823	ATG	2	6	270127	270132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866044
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6378	NC_021823	ACA	2	6	275276	275281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866050
6379	NC_021823	GAA	2	6	275353	275358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866050
6380	NC_021823	AAT	2	6	275371	275376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866050
6381	NC_021823	CGT	2	6	275502	275507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866050
6382	NC_021823	TCC	2	6	275534	275539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525866050
6383	NC_021823	GTT	2	6	275546	275551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866050
6384	NC_021823	GCC	2	6	275567	275572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525866050
6385	NC_021823	AT	3	6	275573	275578	50 %	50 %	0 %	0 %	525866050
6386	NC_021823	TTTTC	2	10	275769	275778	0 %	80 %	0 %	20 %	525866050
6387	NC_021823	GTC	2	6	275824	275829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866051
6388	NC_021823	GTC	3	9	275833	275841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866051
6389	NC_021823	ATC	2	6	275845	275850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866051
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6391	NC_021823	TTG	2	6	275881	275886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866051
6392	NC_021823	CTT	2	6	275892	275897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866051
6393	NC_021823	TGC	2	6	275935	275940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866051
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6404	NC_021823	AGC	2	6	276328	276333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866051
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6406	NC_021823	TAG	2	6	276393	276398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866051
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6410	NC_021823	AAT	3	9	276484	276492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866051
6411	NC_021823	TAC	2	6	276573	276578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866051
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6413	NC_021823	TCCC	2	8	276639	276646	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6414	NC_021823	A	7	7	276666	276672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6415	NC_021823	ATG	2	6	276685	276690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6437	NC_021823	ATC	2	6	277755	277760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6441	NC_021823	ACA	2	6	277926	277931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6442	NC_021823	TTCA	2	8	278037	278044	25 %	50 %	0 %	25 %	525866054
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6445	NC_021823	CAT	2	6	278180	278185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866054
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6447	NC_021823	TAT	2	6	278243	278248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866054
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6449	NC_021823	TTC	2	6	278311	278316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866054
6450	NC_021823	AGGT	2	8	278323	278330	25 %	25 %	50 %	0 %	525866054
6451	NC_021823	TTC	2	6	278349	278354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866054
6452	NC_021823	T	6	6	278388	278393	0 %	100 %	0 %	0 %	525866054
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6456	NC_021823	TCT	2	6	278527	278532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866054
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6459	NC_021823	TCA	2	6	278713	278718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866054
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6461	NC_021823	AG	3	6	278893	278898	50 %	0 %	50 %	0 %	525866054
6462	NC_021823	AGA	2	6	278911	278916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866054
6463	NC_021823	TTTC	2	8	278939	278946	0 %	75 %	0 %	25 %	525866054
6464	NC_021823	GC	3	6	278947	278952	0 %	0 %	50 %	50 %	525866054
6465	NC_021823	TTCC	2	8	279005	279012	0 %	50 %	0 %	50 %	525866054
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6469	NC_021823	AGT	2	6	279136	279141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866054
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6483	NC_021823	TTC	2	6	279957	279962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866054
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6488	NC_021823	TAT	2	6	280094	280099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866054
6489	NC_021823	A	6	6	280121	280126	100 %	0 %	0 %	0 %	525866054
6490	NC_021823	TGG	2	6	280143	280148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866054
6491	NC_021823	AAATA	2	10	280170	280179	80 %	20 %	0 %	0 %	525866054
6492	NC_021823	TG	3	6	280256	280261	0 %	50 %	50 %	0 %	525866054
6493	NC_021823	TTA	2	6	280279	280284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866054
6494	NC_021823	ATA	2	6	280306	280311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866054
6495	NC_021823	CAG	2	6	280322	280327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866054
6496	NC_021823	TGTA	2	8	280410	280417	25 %	50 %	25 %	0 %	525866054
6497	NC_021823	TGG	2	6	280425	280430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866054
6498	NC_021823	GCT	2	6	280441	280446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866054
6499	NC_021823	ATC	2	6	280494	280499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866054
6500	NC_021823	CTT	2	6	280507	280512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866054

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