MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_021823	TTG	2	6	2210648	2210653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868619
50502	NC_021823	ATT	2	6	2210661	2210666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50503	NC_021823	TAA	2	6	2210680	2210685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50504	NC_021823	A	7	7	2210698	2210704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50505	NC_021823	ATTC	2	8	2210744	2210751	25 %	50 %	0 %	25 %	525867740
50506	NC_021823	CAA	2	6	2210782	2210787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867740
50507	NC_021823	TAA	2	6	2210827	2210832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867740
50508	NC_021823	T	6	6	2210863	2210868	0 %	100 %	0 %	0 %	525867740
50509	NC_021823	TGGC	2	8	2211045	2211052	0 %	25 %	50 %	25 %	525867740
50510	NC_021823	TCC	2	6	2211180	2211185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525867740
50511	NC_021823	CGC	2	6	2211236	2211241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867740
50512	NC_021823	GCA	2	6	2211288	2211293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867740
50513	NC_021823	AAAT	2	8	2211350	2211357	75 %	25 %	0 %	0 %	525867740
50514	NC_021823	CGT	2	6	2211367	2211372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867740
50515	NC_021823	CTT	2	6	2211403	2211408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867740
50516	NC_021823	TAA	2	6	2211443	2211448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867740
50517	NC_021823	ATT	2	6	2211470	2211475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867740
50518	NC_021823	TTC	2	6	2211518	2211523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867741
50519	NC_021823	GTT	2	6	2211609	2211614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867741
50520	NC_021823	TCC	2	6	2211641	2211646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525867741
50521	NC_021823	CTG	2	6	2211676	2211681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867741
50522	NC_021823	AAT	2	6	2211769	2211774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867741
50523	NC_021823	CTT	2	6	2211781	2211786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867741
50524	NC_021823	GAA	2	6	2211946	2211951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867741
50525	NC_021823	CCA	3	9	2211978	2211986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867741
50526	NC_021823	CAG	2	6	2212006	2212011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867741
50527	NC_021823	CAC	2	6	2212028	2212033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867741
50528	NC_021823	CTT	2	6	2212042	2212047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867741
50529	NC_021823	CTG	2	6	2212048	2212053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867741
50530	NC_021823	CG	3	6	2212093	2212098	0 %	0 %	50 %	50 %	525867741
50531	NC_021823	CCA	2	6	2212102	2212107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867741
50532	NC_021823	A	6	6	2212140	2212145	100 %	0 %	0 %	0 %	525867741
50533	NC_021823	ATT	2	6	2212160	2212165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867741
50534	NC_021823	T	6	6	2212187	2212192	0 %	100 %	0 %	0 %	525867741
50535	NC_021823	CA	3	6	2212215	2212220	50 %	0 %	0 %	50 %	525867742
50536	NC_021823	T	6	6	2212232	2212237	0 %	100 %	0 %	0 %	525867742
50537	NC_021823	CTG	2	6	2212259	2212264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867742
50538	NC_021823	CTG	2	6	2212289	2212294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867742
50539	NC_021823	ATC	2	6	2212356	2212361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867742
50540	NC_021823	ATG	2	6	2212443	2212448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867742
50541	NC_021823	A	6	6	2212499	2212504	100 %	0 %	0 %	0 %	525867742
50542	NC_021823	CG	3	6	2212544	2212549	0 %	0 %	50 %	50 %	525867742
50543	NC_021823	CGC	2	6	2212563	2212568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867742
50544	NC_021823	CACT	2	8	2212586	2212593	25 %	25 %	0 %	50 %	525867742
50545	NC_021823	TA	3	6	2212619	2212624	50 %	50 %	0 %	0 %	525867742
50546	NC_021823	ACT	2	6	2212645	2212650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867742
50547	NC_021823	GCT	2	6	2212753	2212758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867742
50548	NC_021823	TGTC	2	8	2212790	2212797	0 %	50 %	25 %	25 %	525867742
50549	NC_021823	TTTCGT	2	12	2212854	2212865	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525867742
50550	NC_021823	CCT	2	6	2212919	2212924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525867743
50551	NC_021823	T	6	6	2212926	2212931	0 %	100 %	0 %	0 %	525867743
50552	NC_021823	GAA	2	6	2212962	2212967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867743
50553	NC_021823	T	6	6	2212968	2212973	0 %	100 %	0 %	0 %	525867743
50554	NC_021823	TCA	2	6	2213011	2213016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867743
50555	NC_021823	T	6	6	2213034	2213039	0 %	100 %	0 %	0 %	525867743
50556	NC_021823	AGGCC	2	10	2213053	2213062	20 %	0 %	40 %	40 %	525867743
50557	NC_021823	CAC	2	6	2213102	2213107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867743
50558	NC_021823	GCA	2	6	2213155	2213160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867743
50559	NC_021823	TTGT	2	8	2213235	2213242	0 %	75 %	25 %	0 %	525867743
50560	NC_021823	ATA	2	6	2213244	2213249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867743
50561	NC_021823	TG	3	6	2213352	2213357	0 %	50 %	50 %	0 %	525867743
50562	NC_021823	GAAT	2	8	2213359	2213366	50 %	25 %	25 %	0 %	525867743
50563	NC_021823	CG	3	6	2213400	2213405	0 %	0 %	50 %	50 %	525867743
50564	NC_021823	TCT	2	6	2213416	2213421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867743
50565	NC_021823	ATA	2	6	2213556	2213561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867743
50566	NC_021823	GAT	2	6	2213577	2213582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867743
50567	NC_021823	TTCAG	2	10	2213587	2213596	20 %	40 %	20 %	20 %	525867743
50568	NC_021823	TCCCA	2	10	2213606	2213615	20 %	20 %	0 %	60 %	525867743
50569	NC_021823	AAG	2	6	2213617	2213622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867743
50570	NC_021823	CCG	2	6	2213711	2213716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867743
50571	NC_021823	ATC	2	6	2213784	2213789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867743
50572	NC_021823	ATC	2	6	2213799	2213804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867743
50573	NC_021823	GTT	2	6	2213870	2213875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867743
50574	NC_021823	T	6	6	2213915	2213920	0 %	100 %	0 %	0 %	525867743
50575	NC_021823	A	6	6	2213934	2213939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50576	NC_021823	CCTCTT	2	12	2213940	2213951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50577	NC_021823	AAG	2	6	2214085	2214090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867744
50578	NC_021823	ATA	2	6	2214097	2214102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867744
50579	NC_021823	CAA	2	6	2214116	2214121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867744
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50582	NC_021823	GAA	2	6	2214204	2214209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867744
50583	NC_021823	TTG	2	6	2214221	2214226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867744
50584	NC_021823	GAT	2	6	2214303	2214308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867744
50585	NC_021823	TTG	2	6	2214377	2214382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867744
50586	NC_021823	TTC	2	6	2214541	2214546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867744
50587	NC_021823	TAA	2	6	2214599	2214604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867744
50588	NC_021823	T	6	6	2214630	2214635	0 %	100 %	0 %	0 %	525867744
50589	NC_021823	CAT	2	6	2214656	2214661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867744
50590	NC_021823	AAG	2	6	2214820	2214825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867744
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50592	NC_021823	CAT	2	6	2214903	2214908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867744
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50594	NC_021823	TAA	2	6	2214951	2214956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867744
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50600	NC_021823	TAA	2	6	2215169	2215174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867744
50601	NC_021823	TCT	2	6	2215190	2215195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867744
50602	NC_021823	A	6	6	2215248	2215253	100 %	0 %	0 %	0 %	525867744
50603	NC_021823	TAA	2	6	2215271	2215276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867744
50604	NC_021823	T	7	7	2215283	2215289	0 %	100 %	0 %	0 %	525867744
50605	NC_021823	T	7	7	2215296	2215302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50606	NC_021823	TATT	2	8	2215315	2215322	25 %	75 %	0 %	0 %	525867745
50607	NC_021823	GTT	2	6	2215364	2215369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867745
50608	NC_021823	ACT	2	6	2215377	2215382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867745
50609	NC_021823	ATA	2	6	2215434	2215439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867745
50610	NC_021823	CATT	2	8	2215444	2215451	25 %	50 %	0 %	25 %	525867745
50611	NC_021823	GAGC	2	8	2215452	2215459	25 %	0 %	50 %	25 %	525867745
50612	NC_021823	CATT	2	8	2215522	2215529	25 %	50 %	0 %	25 %	525867745
50613	NC_021823	CA	3	6	2215561	2215566	50 %	0 %	0 %	50 %	525867745
50614	NC_021823	TCT	2	6	2215619	2215624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867746
50615	NC_021823	GAAT	2	8	2215625	2215632	50 %	25 %	25 %	0 %	525867746
50616	NC_021823	T	6	6	2215635	2215640	0 %	100 %	0 %	0 %	525867746
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50618	NC_021823	T	6	6	2215674	2215679	0 %	100 %	0 %	0 %	525867746
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50973	NC_021823	GAA	2	6	2232072	2232077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867760
50974	NC_021823	TGC	2	6	2232120	2232125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867760
50975	NC_021823	GCT	3	9	2232151	2232159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867760
50976	NC_021823	AAT	2	6	2232174	2232179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867760
50977	NC_021823	TTG	2	6	2232210	2232215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867760
50978	NC_021823	TAA	2	6	2232248	2232253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867760
50979	NC_021823	CTTT	2	8	2232305	2232312	0 %	75 %	0 %	25 %	525867760
50980	NC_021823	ATA	2	6	2232349	2232354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867760
50981	NC_021823	TCC	2	6	2232425	2232430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50982	NC_021823	T	6	6	2232431	2232436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50983	NC_021823	ATG	2	6	2232446	2232451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50984	NC_021823	TTTA	2	8	2232477	2232484	25 %	75 %	0 %	0 %	525867761
50985	NC_021823	TTC	2	6	2232499	2232504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867761
50986	NC_021823	TTC	2	6	2232511	2232516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867761
50987	NC_021823	CATACC	2	12	2232517	2232528	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525867761
50988	NC_021823	AAG	2	6	2232537	2232542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867761
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50991	NC_021823	GTT	2	6	2232584	2232589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867761
50992	NC_021823	TGC	2	6	2232622	2232627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867761
50993	NC_021823	GTT	2	6	2232664	2232669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867761
50994	NC_021823	TAC	2	6	2232700	2232705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867761
50995	NC_021823	TCC	2	6	2232767	2232772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50996	NC_021823	TAAT	2	8	2232773	2232780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50997	NC_021823	TGC	2	6	2232781	2232786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50998	NC_021823	T	7	7	2232811	2232817	0 %	100 %	0 %	0 %	525867762
50999	NC_021823	GCTG	2	8	2232932	2232939	0 %	25 %	50 %	25 %	525867762
51000	NC_021823	T	6	6	2233254	2233259	0 %	100 %	0 %	0 %	525867762

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