MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus CNRZ32

Total Repeats: 48539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021744	GAA	2	6	600618	600623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706996
13002	NC_021744	TGA	2	6	600660	600665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706996
13003	NC_021744	AAG	2	6	600673	600678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706996
13004	NC_021744	GGA	2	6	600780	600785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_021744	T	6	6	600803	600808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_021744	TAT	2	6	600812	600817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_021744	TAAT	2	8	600825	600832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_021744	ATA	2	6	600840	600845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_021744	AGG	2	6	600863	600868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021744	ATCA	2	8	600882	600889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13011	NC_021744	TTA	2	6	600894	600899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_021744	GAAA	2	8	601173	601180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_021744	GCT	2	6	601301	601306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_021744	ATC	2	6	601308	601313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_021744	AGT	2	6	601345	601350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021744	TTAAG	2	10	601422	601431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021744	ACA	2	6	601579	601584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_021744	AGA	2	6	601668	601673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_021744	GA	3	6	601683	601688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_021744	ATC	2	6	601710	601715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_021744	AGT	2	6	601897	601902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_021744	ATG	2	6	602019	602024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_021744	AGC	2	6	602032	602037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_021744	GTG	2	6	602073	602078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_021744	AAG	2	6	602079	602084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_021744	AACA	2	8	602096	602103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_021744	AGT	2	6	602115	602120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_021744	GAT	2	6	602154	602159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_021744	ATTT	2	8	602234	602241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_021744	TTGC	2	8	602272	602279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13031	NC_021744	GAT	2	6	602299	602304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021744	T	6	6	602362	602367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021744	GA	3	6	602373	602378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_021744	GAT	2	6	602380	602385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_021744	GAA	2	6	602472	602477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_021744	AGA	3	9	602527	602535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021744	TTG	2	6	602551	602556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_021744	TGC	2	6	602582	602587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_021744	CGC	2	6	602624	602629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_021744	ATT	2	6	602631	602636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_021744	AAG	2	6	602677	602682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_021744	CGAT	2	8	602698	602705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13043	NC_021744	GTATT	2	10	602784	602793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_021744	GAA	2	6	602858	602863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_021744	GCT	2	6	602864	602869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_021744	TGA	2	6	602920	602925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_021744	TTG	3	9	602997	603005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_021744	TG	3	6	603134	603139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_021744	CAAG	2	8	603166	603173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13050	NC_021744	AATG	2	8	603184	603191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_021744	TGC	2	6	603235	603240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_021744	ATT	2	6	603272	603277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_021744	ATT	2	6	603362	603367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_021744	T	6	6	603420	603425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_021744	GAT	2	6	603443	603448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_021744	GAA	2	6	603461	603466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_021744	AAT	2	6	603467	603472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021744	CTTG	2	8	603529	603536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_021744	CTTG	2	8	603598	603605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13060	NC_021744	AAG	2	6	603624	603629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_021744	TGA	2	6	603654	603659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_021744	TGA	2	6	603712	603717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021744	AAAT	2	8	603744	603751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021744	A	6	6	603818	603823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021744	GCTTA	2	10	603840	603849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13066	NC_021744	GAT	2	6	603872	603877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_021744	GATTT	2	10	603902	603911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_021744	GCT	2	6	603959	603964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_021744	ACC	2	6	604014	604019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_021744	ATG	2	6	604071	604076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_021744	TAC	2	6	604107	604112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_021744	AAG	2	6	604116	604121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_021744	ATGGTG	2	12	604219	604230	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_021744	ATG	2	6	604234	604239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_021744	AAGC	2	8	604251	604258	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13076	NC_021744	TGC	2	6	604307	604312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_021744	GAT	2	6	604329	604334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_021744	ATG	2	6	604449	604454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_021744	GCTGG	2	10	604460	604469	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13080	NC_021744	GCCA	2	8	604523	604530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_021744	CAT	2	6	604562	604567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_021744	CTT	2	6	604598	604603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_021744	GCG	3	9	604606	604614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_021744	TATC	2	8	604628	604635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_021744	CTT	2	6	604743	604748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_021744	ATC	2	6	604852	604857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_021744	GTT	2	6	604945	604950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_021744	AGA	2	6	605005	605010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_021744	A	6	6	605044	605049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_021744	T	7	7	605068	605074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_021744	ATT	2	6	605090	605095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_021744	T	6	6	605121	605126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_021744	ACG	2	6	605170	605175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13096	NC_021744	TTGA	2	8	605284	605291	25 %	50 %	25 %	0 %	525706997
13097	NC_021744	CAT	2	6	605300	605305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706997
13098	NC_021744	ACCA	2	8	605366	605373	50 %	0 %	0 %	50 %	525706997
13099	NC_021744	CAT	2	6	605439	605444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706997
13100	NC_021744	ATA	2	6	605468	605473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706997
13101	NC_021744	GTT	2	6	605512	605517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706997
13102	NC_021744	AAG	2	6	605572	605577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706997
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13104	NC_021744	AGA	2	6	605718	605723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706997
13105	NC_021744	CAT	2	6	605730	605735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706997
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13107	NC_021744	ATT	2	6	605879	605884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706997
13108	NC_021744	ATT	2	6	605909	605914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706997
13109	NC_021744	TGA	2	6	605966	605971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706997
13110	NC_021744	TCA	2	6	605980	605985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706997
13111	NC_021744	ATTT	2	8	605986	605993	25 %	75 %	0 %	0 %	525706997
13112	NC_021744	CAA	2	6	606132	606137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525706997
13113	NC_021744	CAA	2	6	606157	606162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525706997
13114	NC_021744	TA	3	6	606297	606302	50 %	50 %	0 %	0 %	525706998
13115	NC_021744	AGC	2	6	606395	606400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525706998
13116	NC_021744	TGA	2	6	606423	606428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706998
13117	NC_021744	T	6	6	606429	606434	0 %	100 %	0 %	0 %	525706998
13118	NC_021744	TAT	2	6	606553	606558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706998
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13120	NC_021744	TAT	2	6	606618	606623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706998
13121	NC_021744	TTC	2	6	606668	606673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525706998
13122	NC_021744	GTT	2	6	606698	606703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706998
13123	NC_021744	TTA	2	6	606746	606751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706998
13124	NC_021744	TGCGAT	2	12	606892	606903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525706998
13125	NC_021744	TGA	2	6	606912	606917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706998
13126	NC_021744	T	6	6	606972	606977	0 %	100 %	0 %	0 %	525706998
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13128	NC_021744	GAA	2	6	607114	607119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706998
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13357	NC_021744	GCTTAC	2	12	617532	617543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525707007
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13367	NC_021744	GATC	2	8	617897	617904	25 %	25 %	25 %	25 %	525707007
13368	NC_021744	CTT	2	6	618020	618025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525707007
13369	NC_021744	GCT	2	6	618039	618044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525707007
13370	NC_021744	TGC	2	6	618062	618067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525707007
13371	NC_021744	AAG	2	6	618204	618209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525707007
13372	NC_021744	AAG	2	6	618246	618251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525707007
13373	NC_021744	ATGGT	2	10	618265	618274	20 %	40 %	40 %	0 %	525707007
13374	NC_021744	AAG	2	6	618312	618317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525707007
13375	NC_021744	GTT	2	6	618318	618323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525707007
13376	NC_021744	GAT	2	6	618324	618329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525707007
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13378	NC_021744	GTA	2	6	618489	618494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13379	NC_021744	GGCT	2	8	618590	618597	0 %	25 %	50 %	25 %	525707008
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13382	NC_021744	AAGG	2	8	618666	618673	50 %	0 %	50 %	0 %	525707008
13383	NC_021744	GCT	2	6	618690	618695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525707008
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13386	NC_021744	CTG	2	6	618772	618777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525707008
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13399	NC_021744	AAAT	2	8	619434	619441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13400	NC_021744	T	6	6	619470	619475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13401	NC_021744	A	6	6	619480	619485	100 %	0 %	0 %	0 %	525707009
13402	NC_021744	AGAA	2	8	619543	619550	75 %	0 %	25 %	0 %	525707009
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13420	NC_021744	A	8	8	620166	620173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13421	NC_021744	T	6	6	620184	620189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13422	NC_021744	T	6	6	620199	620204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13423	NC_021744	CAAGAA	2	12	620248	620259	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525707010
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13439	NC_021744	TA	3	6	620951	620956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13440	NC_021744	GTG	2	6	620968	620973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13449	NC_021744	AAG	2	6	621365	621370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13457	NC_021744	CTAAA	2	10	621677	621686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13458	NC_021744	A	6	6	621739	621744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13461	NC_021744	TTA	2	6	621807	621812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13463	NC_021744	CAC	2	6	621919	621924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13465	NC_021744	A	7	7	621988	621994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13466	NC_021744	CAATGT	2	12	622004	622015	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13467	NC_021744	CTTAA	2	10	622016	622025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13468	NC_021744	T	7	7	622051	622057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13469	NC_021744	TATC	2	8	622068	622075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13470	NC_021744	TCT	2	6	622085	622090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13471	NC_021744	CAA	2	6	622096	622101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13472	NC_021744	A	6	6	622100	622105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13473	NC_021744	TAT	2	6	622113	622118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525707011
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13475	NC_021744	CATT	2	8	622444	622451	25 %	50 %	0 %	25 %	525707011
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13477	NC_021744	AT	3	6	622679	622684	50 %	50 %	0 %	0 %	525707011
13478	NC_021744	A	7	7	622820	622826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13479	NC_021744	CTAA	2	8	622842	622849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13480	NC_021744	AAAG	2	8	622852	622859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13481	NC_021744	TTA	2	6	622861	622866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13482	NC_021744	ATGA	2	8	622910	622917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13483	NC_021744	AATT	2	8	622925	622932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13484	NC_021744	A	7	7	622983	622989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13485	NC_021744	AGAA	2	8	622995	623002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13486	NC_021744	ATGA	2	8	623013	623020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_021744	TCAA	2	8	623050	623057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13488	NC_021744	ACA	2	6	623090	623095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13489	NC_021744	TCA	2	6	623267	623272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13490	NC_021744	AGC	2	6	623293	623298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13491	NC_021744	ATC	2	6	623322	623327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13492	NC_021744	AG	3	6	623355	623360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13493	NC_021744	TGATT	2	10	623366	623375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_021744	A	6	6	623377	623382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13495	NC_021744	GAT	2	6	623432	623437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_021744	TTC	2	6	623481	623486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13497	NC_021744	CTAC	2	8	623503	623510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13498	NC_021744	ACT	2	6	623596	623601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13499	NC_021744	TTTC	2	8	623685	623692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13500	NC_021744	TCATG	2	10	623765	623774	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

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