MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 55772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_021725	AATGT	2	10	2516384	2516393	40 %	40 %	20 %	0 %	523520924
47003	NC_021725	AAT	2	6	2516580	2516585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520925
47004	NC_021725	TCA	2	6	2516605	2516610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520925
47005	NC_021725	CCGG	2	8	2516689	2516696	0 %	0 %	50 %	50 %	523520925
47006	NC_021725	AAT	3	9	2516724	2516732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520925
47007	NC_021725	AAT	2	6	2516748	2516753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520925
47008	NC_021725	GCC	2	6	2516781	2516786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520925
47009	NC_021725	CAT	2	6	2516906	2516911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520925
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47011	NC_021725	CAG	2	6	2517042	2517047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520925
47012	NC_021725	GCCA	2	8	2517103	2517110	25 %	0 %	25 %	50 %	523520925
47013	NC_021725	ATGA	2	8	2517192	2517199	50 %	25 %	25 %	0 %	523520925
47014	NC_021725	CTT	2	6	2517217	2517222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47015	NC_021725	TTG	2	6	2517266	2517271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47016	NC_021725	CCG	2	6	2517320	2517325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47017	NC_021725	ATC	2	6	2517345	2517350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520926
47018	NC_021725	TAC	2	6	2517588	2517593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520926
47019	NC_021725	GGCA	2	8	2517595	2517602	25 %	0 %	50 %	25 %	523520926
47020	NC_021725	ACC	2	6	2517695	2517700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523520926
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47023	NC_021725	TAG	2	6	2518058	2518063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47024	NC_021725	CG	3	6	2518107	2518112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47025	NC_021725	TGGC	2	8	2518116	2518123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47026	NC_021725	T	6	6	2518143	2518148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47027	NC_021725	CAA	2	6	2518231	2518236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47028	NC_021725	GCTT	2	8	2518247	2518254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47029	NC_021725	TCA	2	6	2518275	2518280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520927
47030	NC_021725	CCAGC	2	10	2518292	2518301	20 %	0 %	20 %	60 %	523520927
47031	NC_021725	CTG	2	6	2518372	2518377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520927
47032	NC_021725	A	7	7	2518401	2518407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47033	NC_021725	ATG	2	6	2518415	2518420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47034	NC_021725	CAT	2	6	2518474	2518479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47035	NC_021725	GTTG	2	8	2518509	2518516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47036	NC_021725	GCC	2	6	2518618	2518623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520928
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47039	NC_021725	GCT	3	9	2518736	2518744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520928
47040	NC_021725	GGC	2	6	2518746	2518751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520928
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47044	NC_021725	TTCG	2	8	2518839	2518846	0 %	50 %	25 %	25 %	523520928
47045	NC_021725	CAG	2	6	2518852	2518857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520928
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47047	NC_021725	TCT	2	6	2518952	2518957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520929
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47052	NC_021725	T	6	6	2519151	2519156	0 %	100 %	0 %	0 %	523520929
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47055	NC_021725	GCT	2	6	2519252	2519257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520929
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47083	NC_021725	TAT	2	6	2520767	2520772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47084	NC_021725	GCAGA	2	10	2520800	2520809	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47085	NC_021725	GACCC	2	10	2520817	2520826	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47086	NC_021725	ACG	2	6	2520829	2520834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47093	NC_021725	TTC	2	6	2521226	2521231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47108	NC_021725	CTG	2	6	2521975	2521980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47110	NC_021725	GCT	2	6	2522030	2522035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47117	NC_021725	GAAC	2	8	2522411	2522418	50 %	0 %	25 %	25 %	523520934
47118	NC_021725	AGA	2	6	2522423	2522428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523520934
47119	NC_021725	AAT	2	6	2522439	2522444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520934
47120	NC_021725	GGCT	2	8	2522469	2522476	0 %	25 %	50 %	25 %	523520934
47121	NC_021725	TTC	2	6	2522530	2522535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520934
47122	NC_021725	GCG	2	6	2522558	2522563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520934
47123	NC_021725	GGTA	2	8	2522623	2522630	25 %	25 %	50 %	0 %	523520934
47124	NC_021725	TGC	2	6	2522636	2522641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520934
47125	NC_021725	TGC	2	6	2522692	2522697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520934
47126	NC_021725	GCT	2	6	2522743	2522748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520934
47127	NC_021725	AGGC	2	8	2522826	2522833	25 %	0 %	50 %	25 %	523520934
47128	NC_021725	GCC	2	6	2522925	2522930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520934
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47131	NC_021725	GCCG	2	8	2523009	2523016	0 %	0 %	50 %	50 %	523520934
47132	NC_021725	CCGA	2	8	2523084	2523091	25 %	0 %	25 %	50 %	523520934
47133	NC_021725	CTTG	2	8	2523098	2523105	0 %	50 %	25 %	25 %	523520934
47134	NC_021725	GCA	2	6	2523140	2523145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520934
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47139	NC_021725	TGC	2	6	2523446	2523451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520935
47140	NC_021725	T	6	6	2523482	2523487	0 %	100 %	0 %	0 %	523520935
47141	NC_021725	GCT	2	6	2523558	2523563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520935
47142	NC_021725	TGT	2	6	2523637	2523642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520935
47143	NC_021725	CGG	2	6	2523663	2523668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520935
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47146	NC_021725	CCT	2	6	2523853	2523858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47147	NC_021725	AAT	2	6	2523865	2523870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47148	NC_021725	TTC	2	6	2523886	2523891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520936
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47155	NC_021725	ATTG	2	8	2524167	2524174	25 %	50 %	25 %	0 %	523520937
47156	NC_021725	AACGG	2	10	2524230	2524239	40 %	0 %	40 %	20 %	523520937
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47170	NC_021725	T	6	6	2524591	2524596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47171	NC_021725	TGC	2	6	2524621	2524626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520938
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47175	NC_021725	GCTC	2	8	2524875	2524882	0 %	25 %	25 %	50 %	523520938
47176	NC_021725	TCTTAT	2	12	2524929	2524940	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	523520938
47177	NC_021725	TTG	2	6	2524978	2524983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47178	NC_021725	ACT	2	6	2524993	2524998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520939
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47181	NC_021725	ACGG	2	8	2525075	2525082	25 %	0 %	50 %	25 %	523520939
47182	NC_021725	AAC	2	6	2525087	2525092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520939
47183	NC_021725	CAA	2	6	2525107	2525112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520939
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47187	NC_021725	TTTC	2	8	2525272	2525279	0 %	75 %	0 %	25 %	523520939
47188	NC_021725	TGT	2	6	2525308	2525313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520939
47189	NC_021725	ATGG	2	8	2525336	2525343	25 %	25 %	50 %	0 %	523520939
47190	NC_021725	ATC	2	6	2525354	2525359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520939
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47192	NC_021725	GTAACA	2	12	2525472	2525483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523520939
47193	NC_021725	TGA	2	6	2525497	2525502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520939
47194	NC_021725	CCT	2	6	2525534	2525539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47195	NC_021725	CGC	2	6	2525578	2525583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520940
47196	NC_021725	CTTG	2	8	2525782	2525789	0 %	50 %	25 %	25 %	523520940
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47199	NC_021725	CCT	2	6	2525962	2525967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47200	NC_021725	AGCT	2	8	2525984	2525991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47201	NC_021725	GTTT	2	8	2526131	2526138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47202	NC_021725	CTT	2	6	2526153	2526158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47203	NC_021725	TCA	2	6	2526228	2526233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520941
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47209	NC_021725	TCC	2	6	2526733	2526738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47210	NC_021725	TAT	2	6	2526744	2526749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520942
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47218	NC_021725	CCT	2	6	2527066	2527071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47219	NC_021725	TGA	3	9	2527194	2527202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520943
47220	NC_021725	AAC	2	6	2527282	2527287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520943
47221	NC_021725	CTT	2	6	2527294	2527299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520943
47222	NC_021725	ACA	2	6	2527337	2527342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520943
47223	NC_021725	ACC	2	6	2527375	2527380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523520943
47224	NC_021725	CG	4	8	2527404	2527411	0 %	0 %	50 %	50 %	523520943
47225	NC_021725	GAC	2	6	2527434	2527439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520943
47226	NC_021725	TCC	2	6	2527464	2527469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47227	NC_021725	GAT	2	6	2527490	2527495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520944
47228	NC_021725	CTT	2	6	2527616	2527621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520944
47229	NC_021725	GT	3	6	2527652	2527657	0 %	50 %	50 %	0 %	523520944
47230	NC_021725	ATT	2	6	2527770	2527775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520945
47231	NC_021725	AGCG	2	8	2527839	2527846	25 %	0 %	50 %	25 %	523520945
47232	NC_021725	TTC	2	6	2527894	2527899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520945
47233	NC_021725	CAG	2	6	2527929	2527934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520945
47234	NC_021725	TTG	2	6	2528019	2528024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520946
47235	NC_021725	CGC	2	6	2528065	2528070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520946
47236	NC_021725	CAC	2	6	2528206	2528211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523520946
47237	NC_021725	GCT	2	6	2528241	2528246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520946
47238	NC_021725	GCC	2	6	2528318	2528323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520946
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47243	NC_021725	CAC	2	6	2528443	2528448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523520947
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47248	NC_021725	GTT	2	6	2528680	2528685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520947
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47263	NC_021725	TGT	2	6	2529426	2529431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47264	NC_021725	TGT	2	6	2529449	2529454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520949
47265	NC_021725	CTT	2	6	2529455	2529460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520949
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47267	NC_021725	TCAC	2	8	2529531	2529538	25 %	25 %	0 %	50 %	523520949
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47272	NC_021725	TCT	2	6	2529667	2529672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520949
47273	NC_021725	T	6	6	2529701	2529706	0 %	100 %	0 %	0 %	523520949
47274	NC_021725	TG	3	6	2529722	2529727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47275	NC_021725	CCT	2	6	2529729	2529734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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47290	NC_021725	GTTATC	2	12	2530632	2530643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523520951
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47310	NC_021725	TAT	2	6	2531572	2531577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520953
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47321	NC_021725	CCT	2	6	2532214	2532219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47322	NC_021725	TAATT	2	10	2532235	2532244	40 %	60 %	0 %	0 %	523520954
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47328	NC_021725	CCT	2	6	2532548	2532553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47329	NC_021725	TAT	2	6	2532559	2532564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47330	NC_021725	TAG	2	6	2532569	2532574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47332	NC_021725	A	6	6	2532762	2532767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47333	NC_021725	TTG	2	6	2532938	2532943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520955
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47337	NC_021725	AT	3	6	2533436	2533441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47338	NC_021725	TTAA	2	8	2533476	2533483	50 %	50 %	0 %	0 %	523520956
47339	NC_021725	CCAA	2	8	2533490	2533497	50 %	0 %	0 %	50 %	523520956
47340	NC_021725	CAA	2	6	2533569	2533574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520956
47341	NC_021725	TGC	2	6	2533579	2533584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520956
47342	NC_021725	GTT	2	6	2533630	2533635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520956
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47344	NC_021725	TCG	2	6	2533779	2533784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520956
47345	NC_021725	ACAA	2	8	2533903	2533910	75 %	0 %	0 %	25 %	523520956
47346	NC_021725	ATA	2	6	2534042	2534047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520956
47347	NC_021725	ATT	3	9	2534068	2534076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47348	NC_021725	CTT	2	6	2534183	2534188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47349	NC_021725	CCG	2	6	2534195	2534200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47350	NC_021725	A	7	7	2534204	2534210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47351	NC_021725	GT	3	6	2534232	2534237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47352	NC_021725	TTC	2	6	2534291	2534296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520957
47353	NC_021725	CTT	2	6	2534317	2534322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520957
47354	NC_021725	CCTG	2	8	2534379	2534386	0 %	25 %	25 %	50 %	523520957
47355	NC_021725	CAT	2	6	2534416	2534421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520957
47356	NC_021725	GCT	2	6	2534476	2534481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520957
47357	NC_021725	TCA	2	6	2534493	2534498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520957
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47374	NC_021725	A	6	6	2535355	2535360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47375	NC_021725	ATC	2	6	2535371	2535376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47378	NC_021725	GACC	2	8	2535607	2535614	25 %	0 %	25 %	50 %	523520958
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47457	NC_021725	T	6	6	2539021	2539026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47458	NC_021725	CA	3	6	2539032	2539037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47459	NC_021725	T	6	6	2539051	2539056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47460	NC_021725	A	7	7	2539062	2539068	100 %	0 %	0 %	0 %	523520962
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47463	NC_021725	A	6	6	2539296	2539301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47464	NC_021725	TGC	2	6	2539413	2539418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520963
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47470	NC_021725	TGT	2	6	2539928	2539933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520963
47471	NC_021725	AGT	2	6	2540046	2540051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520963
47472	NC_021725	TAAAT	2	10	2540065	2540074	60 %	40 %	0 %	0 %	523520963
47473	NC_021725	TGGT	2	8	2540387	2540394	0 %	50 %	50 %	0 %	523520963
47474	NC_021725	ACGATA	2	12	2540440	2540451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523520963
47475	NC_021725	AGT	2	6	2540506	2540511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520963
47476	NC_021725	TGA	2	6	2540526	2540531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520963
47477	NC_021725	ACCTG	2	10	2540534	2540543	20 %	20 %	20 %	40 %	523520963
47478	NC_021725	CAG	2	6	2540613	2540618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520963
47479	NC_021725	CTT	2	6	2540637	2540642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520963
47480	NC_021725	GT	3	6	2540657	2540662	0 %	50 %	50 %	0 %	523520963
47481	NC_021725	GCCT	2	8	2540761	2540768	0 %	25 %	25 %	50 %	523520963
47482	NC_021725	GCT	2	6	2540785	2540790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520963
47483	NC_021725	TCA	2	6	2540816	2540821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520963
47484	NC_021725	TTG	2	6	2540849	2540854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520963
47485	NC_021725	CTT	2	6	2540899	2540904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520963
47486	NC_021725	TGC	2	6	2540911	2540916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520963
47487	NC_021725	TCT	2	6	2540925	2540930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520963
47488	NC_021725	GGT	2	6	2541139	2541144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520963
47489	NC_021725	TGC	2	6	2541295	2541300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520963
47490	NC_021725	GCT	2	6	2541308	2541313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520963
47491	NC_021725	GTTT	2	8	2541329	2541336	0 %	75 %	25 %	0 %	523520963
47492	NC_021725	GGC	2	6	2541374	2541379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520963
47493	NC_021725	GTAAC	2	10	2541429	2541438	40 %	20 %	20 %	20 %	523520963
47494	NC_021725	TCA	2	6	2541644	2541649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520963
47495	NC_021725	AACT	2	8	2541682	2541689	50 %	25 %	0 %	25 %	523520963
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47497	NC_021725	TCT	2	6	2542278	2542283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520963
47498	NC_021725	ATC	2	6	2542324	2542329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520963
47499	NC_021725	TTGGCG	2	12	2542353	2542364	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	523520963
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