MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 55772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_021725	TCA	2	6	2356783	2356788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520757
44002	NC_021725	ATC	2	6	2356824	2356829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520757
44003	NC_021725	AAGT	2	8	2356862	2356869	50 %	25 %	25 %	0 %	523520757
44004	NC_021725	CAT	2	6	2356977	2356982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520757
44005	NC_021725	GAT	2	6	2357030	2357035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520757
44006	NC_021725	TCT	2	6	2357062	2357067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520757
44007	NC_021725	CAA	2	6	2357087	2357092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520757
44008	NC_021725	TTG	2	6	2357210	2357215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520757
44009	NC_021725	AGTG	2	8	2357243	2357250	25 %	25 %	50 %	0 %	523520757
44010	NC_021725	TAG	2	6	2357413	2357418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520757
44011	NC_021725	CATAC	2	10	2357492	2357501	40 %	20 %	0 %	40 %	523520757
44012	NC_021725	CTTA	2	8	2357649	2357656	25 %	50 %	0 %	25 %	523520757
44013	NC_021725	CG	3	6	2357681	2357686	0 %	0 %	50 %	50 %	523520757
44014	NC_021725	TCA	2	6	2357728	2357733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520757
44015	NC_021725	CAT	2	6	2357769	2357774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520757
44016	NC_021725	AAACG	2	10	2357825	2357834	60 %	0 %	20 %	20 %	523520757
44017	NC_021725	ACTT	2	8	2357945	2357952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44018	NC_021725	GAT	2	6	2358071	2358076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44019	NC_021725	TG	3	6	2358091	2358096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44020	NC_021725	ACGC	2	8	2358140	2358147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44021	NC_021725	TCG	2	6	2358151	2358156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44022	NC_021725	TCA	2	6	2358170	2358175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44023	NC_021725	TAA	2	6	2358212	2358217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44024	NC_021725	GGT	2	6	2358227	2358232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44025	NC_021725	GTTGCA	2	12	2358270	2358281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44026	NC_021725	AT	3	6	2358377	2358382	50 %	50 %	0 %	0 %	523520758
44027	NC_021725	CTG	2	6	2358387	2358392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520758
44028	NC_021725	GC	3	6	2358426	2358431	0 %	0 %	50 %	50 %	523520758
44029	NC_021725	TGA	2	6	2358463	2358468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520758
44030	NC_021725	TGAGC	2	10	2358535	2358544	20 %	20 %	40 %	20 %	523520758
44031	NC_021725	GC	3	6	2358553	2358558	0 %	0 %	50 %	50 %	523520758
44032	NC_021725	AC	3	6	2358694	2358699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44033	NC_021725	AAGAA	2	10	2358768	2358777	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44034	NC_021725	ATT	2	6	2358791	2358796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44035	NC_021725	TAA	2	6	2358828	2358833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44036	NC_021725	CTT	2	6	2358844	2358849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44037	NC_021725	TTG	2	6	2358896	2358901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520759
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44039	NC_021725	TAAC	2	8	2358924	2358931	50 %	25 %	0 %	25 %	523520759
44040	NC_021725	TTC	2	6	2359067	2359072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520759
44041	NC_021725	AGT	2	6	2359197	2359202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520759
44042	NC_021725	TTC	2	6	2359207	2359212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520759
44043	NC_021725	GCC	2	6	2359283	2359288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520759
44044	NC_021725	TTG	2	6	2359297	2359302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520759
44045	NC_021725	TTC	2	6	2359376	2359381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520759
44046	NC_021725	TAG	2	6	2359506	2359511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520759
44047	NC_021725	TTCA	2	8	2359576	2359583	25 %	50 %	0 %	25 %	523520759
44048	NC_021725	TGA	2	6	2359633	2359638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520759
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44050	NC_021725	CTG	2	6	2359655	2359660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520759
44051	NC_021725	TGC	2	6	2359668	2359673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520759
44052	NC_021725	TGC	2	6	2359686	2359691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520759
44053	NC_021725	ACT	2	6	2359696	2359701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520759
44054	NC_021725	TGCA	2	8	2359704	2359711	25 %	25 %	25 %	25 %	523520759
44055	NC_021725	CAA	2	6	2359734	2359739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520759
44056	NC_021725	TTTAG	2	10	2359828	2359837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44057	NC_021725	TCAAA	2	10	2359842	2359851	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44058	NC_021725	A	7	7	2359849	2359855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44059	NC_021725	TAT	2	6	2359871	2359876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44060	NC_021725	T	6	6	2359890	2359895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44061	NC_021725	AG	3	6	2359958	2359963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44062	NC_021725	ATAC	2	8	2360010	2360017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44063	NC_021725	TCG	2	6	2360077	2360082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520760
44064	NC_021725	GATC	2	8	2360168	2360175	25 %	25 %	25 %	25 %	523520760
44065	NC_021725	CGC	2	6	2360216	2360221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520760
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44071	NC_021725	GAA	2	6	2360756	2360761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523520760
44072	NC_021725	GCCG	2	8	2360898	2360905	0 %	0 %	50 %	50 %	523520760
44073	NC_021725	ACA	2	6	2360920	2360925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520760
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44079	NC_021725	GTA	2	6	2361284	2361289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520761
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44087	NC_021725	GCG	2	6	2361815	2361820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520761
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44089	NC_021725	TGT	2	6	2361844	2361849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520761
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44091	NC_021725	CG	3	6	2361955	2361960	0 %	0 %	50 %	50 %	523520761
44092	NC_021725	GAA	2	6	2361992	2361997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523520761
44093	NC_021725	TCGAG	2	10	2362102	2362111	20 %	20 %	40 %	20 %	523520761
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44098	NC_021725	TTA	2	6	2362434	2362439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520762
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44100	NC_021725	TTGA	2	8	2362570	2362577	25 %	50 %	25 %	0 %	523520762
44101	NC_021725	GCT	2	6	2362654	2362659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520762
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44103	NC_021725	CTG	3	9	2362673	2362681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520762
44104	NC_021725	TGC	2	6	2362698	2362703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520762
44105	NC_021725	TGC	2	6	2362722	2362727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520762
44106	NC_021725	TCT	2	6	2362745	2362750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520762
44107	NC_021725	GAT	2	6	2362779	2362784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520762
44108	NC_021725	TAC	2	6	2362810	2362815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520762
44109	NC_021725	CTT	2	6	2362854	2362859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520762
44110	NC_021725	TTG	2	6	2362907	2362912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520762
44111	NC_021725	CTG	2	6	2362937	2362942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520762
44112	NC_021725	TCT	2	6	2362964	2362969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520762
44113	NC_021725	GAT	2	6	2363004	2363009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520762
44114	NC_021725	AAT	2	6	2363147	2363152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520762
44115	NC_021725	T	6	6	2363192	2363197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44116	NC_021725	GCT	2	6	2363210	2363215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44117	NC_021725	CAT	2	6	2363262	2363267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44118	NC_021725	GAT	2	6	2363359	2363364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520763
44119	NC_021725	TTG	2	6	2363385	2363390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520763
44120	NC_021725	CAG	2	6	2363447	2363452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520763
44121	NC_021725	GTG	2	6	2363486	2363491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520763
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44165	NC_021725	GTCA	2	8	2365790	2365797	25 %	25 %	25 %	25 %	523520766
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44182	NC_021725	GTGA	2	8	2366387	2366394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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44197	NC_021725	TTAG	2	8	2367233	2367240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44198	NC_021725	A	6	6	2367251	2367256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44199	NC_021725	A	7	7	2367310	2367316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44200	NC_021725	GAT	2	6	2367371	2367376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44203	NC_021725	TCC	2	6	2367594	2367599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44229	NC_021725	GAA	2	6	2369339	2369344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44230	NC_021725	AGC	2	6	2369414	2369419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44231	NC_021725	TGC	2	6	2369454	2369459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44232	NC_021725	CAAA	2	8	2369494	2369501	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44233	NC_021725	A	6	6	2369505	2369510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44234	NC_021725	CAA	2	6	2369572	2369577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520772
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44236	NC_021725	TA	3	6	2369647	2369652	50 %	50 %	0 %	0 %	523520772
44237	NC_021725	CAA	2	6	2369837	2369842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44238	NC_021725	TCA	2	6	2369894	2369899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520773
44239	NC_021725	GCG	2	6	2369910	2369915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520773
44240	NC_021725	CGATCA	2	12	2370005	2370016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523520773
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44245	NC_021725	T	6	6	2370507	2370512	0 %	100 %	0 %	0 %	523520773
44246	NC_021725	ATT	2	6	2370589	2370594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520773
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44267	NC_021725	ATC	2	6	2371432	2371437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520774
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44301	NC_021725	GCC	2	6	2373308	2373313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44302	NC_021725	CCTT	2	8	2373392	2373399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44303	NC_021725	A	6	6	2373529	2373534	100 %	0 %	0 %	0 %	523520776
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44337	NC_021725	ATA	2	6	2375348	2375353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44338	NC_021725	T	6	6	2375389	2375394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44339	NC_021725	CA	3	6	2375414	2375419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44340	NC_021725	A	7	7	2375462	2375468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44341	NC_021725	ATC	2	6	2375474	2375479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44342	NC_021725	AAG	2	6	2375609	2375614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523520779
44343	NC_021725	ATT	2	6	2375623	2375628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520779
44344	NC_021725	CG	3	6	2375721	2375726	0 %	0 %	50 %	50 %	523520779
44345	NC_021725	CAC	2	6	2375742	2375747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523520779
44346	NC_021725	CTGCT	2	10	2375764	2375773	0 %	40 %	20 %	40 %	523520779
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44352	NC_021725	TTAC	2	8	2376097	2376104	25 %	50 %	0 %	25 %	523520780
44353	NC_021725	CGC	2	6	2376145	2376150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520780
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44355	NC_021725	TGG	2	6	2376198	2376203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520780
44356	NC_021725	CATC	2	8	2376204	2376211	25 %	25 %	0 %	50 %	523520780
44357	NC_021725	TGC	2	6	2376267	2376272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520780
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44442	NC_021725	AACCT	2	10	2380999	2381008	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44443	NC_021725	A	6	6	2381012	2381017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44444	NC_021725	CCTG	2	8	2381055	2381062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44445	NC_021725	A	6	6	2381081	2381086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44448	NC_021725	AACC	2	8	2381226	2381233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44449	NC_021725	A	6	6	2381251	2381256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44450	NC_021725	GAT	2	6	2381307	2381312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44452	NC_021725	TTTTA	2	10	2381338	2381347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44453	NC_021725	GTC	2	6	2381417	2381422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44454	NC_021725	A	6	6	2381455	2381460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44455	NC_021725	T	6	6	2381463	2381468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44456	NC_021725	CA	3	6	2381491	2381496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44457	NC_021725	GC	3	6	2381517	2381522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44458	NC_021725	TTC	2	6	2381566	2381571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520785
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44465	NC_021725	CAT	2	6	2382323	2382328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520785
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44472	NC_021725	CAAT	2	8	2382820	2382827	50 %	25 %	0 %	25 %	523520785
44473	NC_021725	GCA	2	6	2382905	2382910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520785
44474	NC_021725	TGT	2	6	2382923	2382928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520785
44475	NC_021725	AATA	2	8	2382937	2382944	75 %	25 %	0 %	0 %	523520785
44476	NC_021725	CCGT	2	8	2382956	2382963	0 %	25 %	25 %	50 %	523520785
44477	NC_021725	CA	3	6	2383226	2383231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44478	NC_021725	CGC	2	6	2383295	2383300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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44480	NC_021725	A	6	6	2383374	2383379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44481	NC_021725	TCA	2	6	2383433	2383438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44485	NC_021725	CAG	2	6	2383663	2383668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520786
44486	NC_021725	TTC	2	6	2383672	2383677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520786
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44491	NC_021725	GC	3	6	2384148	2384153	0 %	0 %	50 %	50 %	523520786
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44500	NC_021725	TCAA	2	8	2384426	2384433	50 %	25 %	0 %	25 %	523520787

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