MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 55772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021725	ACCA	2	8	609991	609998	50 %	0 %	0 %	50 %	523519061
11502	NC_021725	ATCC	2	8	610051	610058	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_021725	CG	4	8	610120	610127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11504	NC_021725	ATC	2	6	610169	610174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519062
11505	NC_021725	GTTG	2	8	610226	610233	0 %	50 %	50 %	0 %	523519062
11506	NC_021725	AAT	2	6	610252	610257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519062
11507	NC_021725	CCACTT	2	12	610338	610349	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	523519062
11508	NC_021725	GC	3	6	610397	610402	0 %	0 %	50 %	50 %	523519062
11509	NC_021725	TGG	2	6	610451	610456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519062
11510	NC_021725	CTG	2	6	610498	610503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11511	NC_021725	CAA	2	6	610614	610619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519062
11512	NC_021725	CAAT	2	8	610704	610711	50 %	25 %	0 %	25 %	523519062
11513	NC_021725	TGG	2	6	610718	610723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519062
11514	NC_021725	AGC	2	6	610772	610777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11515	NC_021725	TTC	2	6	610786	610791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519062
11516	NC_021725	T	7	7	610827	610833	0 %	100 %	0 %	0 %	523519062
11517	NC_021725	TGC	2	6	610843	610848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11518	NC_021725	GTTT	2	8	610955	610962	0 %	75 %	25 %	0 %	523519062
11519	NC_021725	GC	3	6	611020	611025	0 %	0 %	50 %	50 %	523519062
11520	NC_021725	CGT	2	6	611041	611046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11521	NC_021725	A	6	6	611114	611119	100 %	0 %	0 %	0 %	523519062
11522	NC_021725	TGC	2	6	611156	611161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11523	NC_021725	GCT	2	6	611168	611173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11524	NC_021725	TTGG	2	8	611204	611211	0 %	50 %	50 %	0 %	523519062
11525	NC_021725	TCG	2	6	611213	611218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11526	NC_021725	AAAGC	2	10	611247	611256	60 %	0 %	20 %	20 %	523519062
11527	NC_021725	CAC	2	6	611277	611282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519062
11528	NC_021725	AGC	2	6	611383	611388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519062
11529	NC_021725	GTT	2	6	611472	611477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519062
11530	NC_021725	GTT	2	6	611498	611503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519062
11531	NC_021725	GTG	2	6	611675	611680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_021725	TGA	2	6	611706	611711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_021725	AC	3	6	611839	611844	50 %	0 %	0 %	50 %	523519063
11534	NC_021725	GC	3	6	611855	611860	0 %	0 %	50 %	50 %	523519063
11535	NC_021725	A	7	7	611877	611883	100 %	0 %	0 %	0 %	523519063
11536	NC_021725	TGA	3	9	611974	611982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_021725	CAA	2	6	611999	612004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_021725	TTC	2	6	612011	612016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_021725	TGC	2	6	612073	612078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_021725	CTT	2	6	612094	612099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519064
11541	NC_021725	GTGA	2	8	612249	612256	25 %	25 %	50 %	0 %	523519064
11542	NC_021725	ATA	2	6	612314	612319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519064
11543	NC_021725	GTA	2	6	612329	612334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519064
11544	NC_021725	ATG	2	6	612390	612395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519064
11545	NC_021725	CGG	2	6	612418	612423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519064
11546	NC_021725	CAT	2	6	612502	612507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519064
11547	NC_021725	ACA	2	6	612687	612692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519064
11548	NC_021725	CAA	2	6	612703	612708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519064
11549	NC_021725	TTA	2	6	612733	612738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_021725	CGC	2	6	612772	612777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11551	NC_021725	CAG	2	6	612788	612793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_021725	GTT	2	6	612809	612814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_021725	TGA	2	6	612841	612846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519065
11554	NC_021725	CTG	2	6	612905	612910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519065
11555	NC_021725	GGAT	2	8	612953	612960	25 %	25 %	50 %	0 %	523519065
11556	NC_021725	CTGC	2	8	613109	613116	0 %	25 %	25 %	50 %	523519065
11557	NC_021725	T	6	6	613272	613277	0 %	100 %	0 %	0 %	523519065
11558	NC_021725	AGAT	2	8	613438	613445	50 %	25 %	25 %	0 %	523519065
11559	NC_021725	CCG	2	6	613490	613495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519065
11560	NC_021725	ATCA	2	8	613521	613528	50 %	25 %	0 %	25 %	523519065
11561	NC_021725	CCTTT	2	10	613676	613685	0 %	60 %	0 %	40 %	523519065
11562	NC_021725	GCT	2	6	613724	613729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519065
11563	NC_021725	ATA	2	6	613918	613923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519066
11564	NC_021725	AAT	2	6	613929	613934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519066
11565	NC_021725	ACT	2	6	613967	613972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519066
11566	NC_021725	TAA	2	6	614124	614129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519066
11567	NC_021725	GCT	2	6	614198	614203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519066
11568	NC_021725	GCC	3	9	614251	614259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519066
11569	NC_021725	AAC	2	6	614266	614271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519066
11570	NC_021725	GCG	2	6	614393	614398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519066
11571	NC_021725	CAC	2	6	614404	614409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519066
11572	NC_021725	TGA	2	6	614415	614420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519066
11573	NC_021725	TTG	2	6	614580	614585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519066
11574	NC_021725	GCAAA	2	10	614663	614672	60 %	0 %	20 %	20 %	523519066
11575	NC_021725	CCG	2	6	614699	614704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519066
11576	NC_021725	GAT	2	6	614779	614784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519066
11577	NC_021725	AAGG	2	8	614872	614879	50 %	0 %	50 %	0 %	523519066
11578	NC_021725	CCAGG	2	10	614889	614898	20 %	0 %	40 %	40 %	523519066
11579	NC_021725	CCA	2	6	614920	614925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519066
11580	NC_021725	ATC	2	6	614951	614956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519066
11581	NC_021725	CAA	2	6	614973	614978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519066
11582	NC_021725	ATG	2	6	615098	615103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519066
11583	NC_021725	TGG	2	6	615165	615170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519066
11584	NC_021725	CCG	2	6	615206	615211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519066
11585	NC_021725	ATC	2	6	615218	615223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519066
11586	NC_021725	GGC	2	6	615231	615236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519066
11587	NC_021725	CTT	2	6	615266	615271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11588	NC_021725	TTG	2	6	615275	615280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_021725	AGA	2	6	615292	615297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_021725	ATA	2	6	615505	615510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519067
11591	NC_021725	CAT	2	6	615520	615525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519067
11592	NC_021725	CGC	2	6	615563	615568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519067
11593	NC_021725	CAT	2	6	615659	615664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519067
11594	NC_021725	AGC	2	6	615686	615691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519067
11595	NC_021725	AGA	2	6	615718	615723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519067
11596	NC_021725	GCG	2	6	615729	615734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519067
11597	NC_021725	GAC	2	6	615779	615784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519067
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11599	NC_021725	CAA	2	6	615829	615834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519067
11600	NC_021725	CAA	2	6	615871	615876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519067
11601	NC_021725	TGC	2	6	615881	615886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519067
11602	NC_021725	CAA	2	6	615976	615981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519067
11603	NC_021725	GTG	2	6	616030	616035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519067
11604	NC_021725	GAGT	2	8	616046	616053	25 %	25 %	50 %	0 %	523519067
11605	NC_021725	ACC	2	6	616062	616067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519067
11606	NC_021725	ATC	2	6	616087	616092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519067
11607	NC_021725	CAG	2	6	616107	616112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519067
11608	NC_021725	AGCA	2	8	616129	616136	50 %	0 %	25 %	25 %	523519067
11609	NC_021725	CAA	2	6	616148	616153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519067
11610	NC_021725	GCAG	2	8	616163	616170	25 %	0 %	50 %	25 %	523519067
11611	NC_021725	CAGT	2	8	616175	616182	25 %	25 %	25 %	25 %	523519067
11612	NC_021725	ACA	2	6	616288	616293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519067
11613	NC_021725	CAA	2	6	616349	616354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519067
11614	NC_021725	TCGCT	2	10	616394	616403	0 %	40 %	20 %	40 %	523519067
11615	NC_021725	CTG	2	6	616504	616509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519067
11616	NC_021725	TAA	2	6	616514	616519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519067
11617	NC_021725	GCC	2	6	616608	616613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519067
11618	NC_021725	GC	4	8	616641	616648	0 %	0 %	50 %	50 %	523519067
11619	NC_021725	ATG	2	6	616663	616668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519067
11620	NC_021725	TGA	2	6	616709	616714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519067
11621	NC_021725	GAT	2	6	616745	616750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519067
11622	NC_021725	GCC	2	6	616764	616769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519067
11623	NC_021725	CGA	2	6	616784	616789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519067
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11626	NC_021725	CCAT	2	8	617005	617012	25 %	25 %	0 %	50 %	523519067
11627	NC_021725	CCATA	2	10	617027	617036	40 %	20 %	0 %	40 %	523519067
11628	NC_021725	TGA	2	6	617039	617044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519067
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11630	NC_021725	TGC	2	6	617219	617224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519067
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11635	NC_021725	TCGT	2	8	617712	617719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11636	NC_021725	T	7	7	617772	617778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11637	NC_021725	TGAAA	2	10	617799	617808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11638	NC_021725	TAGTC	2	10	617820	617829	20 %	40 %	20 %	20 %	523519068
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11645	NC_021725	TCGT	2	8	618423	618430	0 %	50 %	25 %	25 %	523519068
11646	NC_021725	GCC	2	6	618435	618440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519068
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11652	NC_021725	CCG	2	6	618752	618757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519068
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11655	NC_021725	AGAA	2	8	618961	618968	75 %	0 %	25 %	0 %	523519068
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11658	NC_021725	TTC	2	6	619099	619104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519068
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11660	NC_021725	TCA	3	9	619163	619171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519068
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11670	NC_021725	ATG	2	6	619778	619783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519068
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11672	NC_021725	GGATT	2	10	619973	619982	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11673	NC_021725	TAG	2	6	620005	620010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11675	NC_021725	TAG	2	6	620050	620055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11676	NC_021725	T	7	7	620078	620084	0 %	100 %	0 %	0 %	523519069
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11689	NC_021725	ATA	2	6	620992	620997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11690	NC_021725	ATTA	2	8	621024	621031	50 %	50 %	0 %	0 %	523519071
11691	NC_021725	GACT	2	8	621055	621062	25 %	25 %	25 %	25 %	523519071
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11723	NC_021725	TGA	2	6	622810	622815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11724	NC_021725	GCGA	2	8	622832	622839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11725	NC_021725	A	8	8	623002	623009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11726	NC_021725	GTT	2	6	623054	623059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11727	NC_021725	ACAGC	2	10	623070	623079	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11728	NC_021725	CTG	2	6	623154	623159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519073
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11730	NC_021725	CG	3	6	623216	623221	0 %	0 %	50 %	50 %	523519073
11731	NC_021725	CCG	2	6	623292	623297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519073
11732	NC_021725	GTG	2	6	623408	623413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519073
11733	NC_021725	TGC	2	6	623440	623445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519073
11734	NC_021725	CAGT	2	8	623512	623519	25 %	25 %	25 %	25 %	523519073
11735	NC_021725	TAAC	2	8	623566	623573	50 %	25 %	0 %	25 %	523519073
11736	NC_021725	GTC	2	6	623640	623645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519073
11737	NC_021725	AACA	2	8	623723	623730	75 %	0 %	0 %	25 %	523519073
11738	NC_021725	CGA	2	6	623772	623777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519073
11739	NC_021725	CCA	2	6	623789	623794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519073
11740	NC_021725	AAC	2	6	623901	623906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11741	NC_021725	ACC	2	6	623919	623924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11742	NC_021725	TGC	2	6	623976	623981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519074
11743	NC_021725	GCT	2	6	624036	624041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519074
11744	NC_021725	TGC	2	6	624056	624061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519074
11745	NC_021725	CCG	2	6	624075	624080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519074
11746	NC_021725	GCG	3	9	624117	624125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519074
11747	NC_021725	TTG	2	6	624160	624165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519074
11748	NC_021725	GGC	2	6	624211	624216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519074
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11750	NC_021725	CTGA	2	8	624300	624307	25 %	25 %	25 %	25 %	523519074
11751	NC_021725	CTGATC	2	12	624391	624402	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523519074
11752	NC_021725	TCA	2	6	624446	624451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519074
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11754	NC_021725	TTG	2	6	624632	624637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11755	NC_021725	AGT	2	6	624737	624742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519075
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11766	NC_021725	ACC	2	6	625136	625141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11767	NC_021725	ACA	2	6	625153	625158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519076
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11776	NC_021725	CATG	2	8	625455	625462	25 %	25 %	25 %	25 %	523519077
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11786	NC_021725	GTT	2	6	625895	625900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11787	NC_021725	TAGT	2	8	625903	625910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11789	NC_021725	AT	3	6	625962	625967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11790	NC_021725	TCAG	2	8	625991	625998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11791	NC_021725	TATC	2	8	626034	626041	25 %	50 %	0 %	25 %	523519078
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11842	NC_021725	A	6	6	628330	628335	100 %	0 %	0 %	0 %	523519079
11843	NC_021725	AAACC	2	10	628353	628362	60 %	0 %	0 %	40 %	523519079
11844	NC_021725	TCAT	2	8	628417	628424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11845	NC_021725	GTG	2	6	628507	628512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11846	NC_021725	A	7	7	628547	628553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11847	NC_021725	GAT	2	6	628592	628597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11849	NC_021725	A	6	6	628659	628664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11850	NC_021725	CAA	3	9	628669	628677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11851	NC_021725	TCA	2	6	628713	628718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11853	NC_021725	CGC	2	6	628980	628985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519080
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11855	NC_021725	CGA	2	6	629232	629237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519080
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11858	NC_021725	TCT	2	6	629603	629608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519080
11859	NC_021725	AT	3	6	629783	629788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11860	NC_021725	A	6	6	629795	629800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11861	NC_021725	CGTT	2	8	629803	629810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11862	NC_021725	GTT	2	6	629851	629856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11863	NC_021725	TCA	2	6	629925	629930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11865	NC_021725	GTC	2	6	630009	630014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519081
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11986	NC_021725	CGT	2	6	636573	636578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519087
11987	NC_021725	CA	3	6	636811	636816	50 %	0 %	0 %	50 %	523519087
11988	NC_021725	GCA	2	6	636895	636900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519087
11989	NC_021725	CCAG	2	8	637002	637009	25 %	0 %	25 %	50 %	523519087
11990	NC_021725	TCT	2	6	637156	637161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519088
11991	NC_021725	TTG	2	6	637211	637216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519088
11992	NC_021725	CCCAA	2	10	637234	637243	40 %	0 %	0 %	60 %	523519088
11993	NC_021725	TCA	2	6	637257	637262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519088
11994	NC_021725	CCG	2	6	637319	637324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519088
11995	NC_021725	GCC	2	6	637410	637415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519088
11996	NC_021725	GCA	2	6	637476	637481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519088
11997	NC_021725	ATCGT	2	10	637530	637539	20 %	40 %	20 %	20 %	523519088
11998	NC_021725	CAA	2	6	637625	637630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519088
11999	NC_021725	GCG	2	6	637631	637636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519088
12000	NC_021725	GC	3	6	637648	637653	0 %	0 %	50 %	50 %	523519088

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