MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 55772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021725	GCT	2	6	528454	528459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518986
10003	NC_021725	CGC	2	6	528602	528607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518986
10004	NC_021725	AGC	3	9	528735	528743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518986
10005	NC_021725	TGAT	2	8	528888	528895	25 %	50 %	25 %	0 %	523518986
10006	NC_021725	CT	3	6	529005	529010	0 %	50 %	0 %	50 %	523518986
10007	NC_021725	AAG	2	6	529040	529045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518986
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10009	NC_021725	TGG	2	6	529221	529226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518986
10010	NC_021725	CCT	3	9	529264	529272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523518986
10011	NC_021725	T	6	6	529278	529283	0 %	100 %	0 %	0 %	523518986
10012	NC_021725	ATCAA	2	10	529326	529335	60 %	20 %	0 %	20 %	523518986
10013	NC_021725	A	6	6	529404	529409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021725	TTG	2	6	529441	529446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518987
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10021	NC_021725	CCG	2	6	529867	529872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518987
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10029	NC_021725	TGT	2	6	530327	530332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_021725	AAAAG	2	10	530350	530359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10032	NC_021725	GAAA	2	8	530403	530410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021725	A	6	6	530469	530474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_021725	ATTG	2	8	530479	530486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_021725	CAA	2	6	530534	530539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10037	NC_021725	A	6	6	530711	530716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10039	NC_021725	GTT	2	6	530841	530846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_021725	CAA	2	6	530884	530889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518988
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10089	NC_021725	ATGCA	2	10	533173	533182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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10112	NC_021725	AAGGTT	2	12	534411	534422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518991
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10118	NC_021725	CAT	2	6	534694	534699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518991
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10122	NC_021725	CGG	2	6	534837	534842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518991
10123	NC_021725	GCG	2	6	534849	534854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518991
10124	NC_021725	TTGG	2	8	534863	534870	0 %	50 %	50 %	0 %	523518991
10125	NC_021725	CTG	2	6	534901	534906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518991
10126	NC_021725	CTTTAA	2	12	534956	534967	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	523518991
10127	NC_021725	TTG	2	6	534992	534997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518991
10128	NC_021725	TGC	2	6	535004	535009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518991
10129	NC_021725	TTC	2	6	535013	535018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518991
10130	NC_021725	GGT	2	6	535046	535051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518991
10131	NC_021725	GC	3	6	535178	535183	0 %	0 %	50 %	50 %	523518991
10132	NC_021725	TGC	2	6	535223	535228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518991
10133	NC_021725	AGC	2	6	535244	535249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518991
10134	NC_021725	ATG	2	6	535338	535343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518991
10135	NC_021725	CCT	2	6	535444	535449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10136	NC_021725	GCAT	2	8	535475	535482	25 %	25 %	25 %	25 %	523518992
10137	NC_021725	CG	3	6	535555	535560	0 %	0 %	50 %	50 %	523518992
10138	NC_021725	GAT	2	6	535585	535590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518992
10139	NC_021725	ATG	2	6	535635	535640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518992
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10141	NC_021725	A	6	6	535682	535687	100 %	0 %	0 %	0 %	523518993
10142	NC_021725	TGC	2	6	535728	535733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518993
10143	NC_021725	CGC	2	6	535795	535800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518993
10144	NC_021725	CGA	2	6	535863	535868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518993
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10147	NC_021725	A	6	6	535998	536003	100 %	0 %	0 %	0 %	523518993
10148	NC_021725	GAT	2	6	536093	536098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518993
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10150	NC_021725	ACC	2	6	536187	536192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518993
10151	NC_021725	GAC	2	6	536200	536205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518993
10152	NC_021725	GCT	2	6	536218	536223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518993
10153	NC_021725	ATC	2	6	536226	536231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518993
10154	NC_021725	TGA	2	6	536302	536307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518993
10155	NC_021725	GCG	2	6	536311	536316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518993
10156	NC_021725	GAT	2	6	536320	536325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518993
10157	NC_021725	GCAG	2	8	536374	536381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10158	NC_021725	TGAAAA	2	12	536424	536435	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	523518994
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10160	NC_021725	ATC	2	6	536525	536530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518994
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10164	NC_021725	ATC	2	6	536590	536595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518994
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10174	NC_021725	GCG	2	6	537314	537319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518995
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10177	NC_021725	TTC	2	6	537447	537452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518995
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10179	NC_021725	TTG	2	6	537604	537609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518995
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10181	NC_021725	TCAT	2	8	537829	537836	25 %	50 %	0 %	25 %	523518995
10182	NC_021725	A	6	6	537897	537902	100 %	0 %	0 %	0 %	523518995
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10187	NC_021725	CGG	2	6	538167	538172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518995
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10197	NC_021725	AT	3	6	538810	538815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10198	NC_021725	GTA	2	6	538821	538826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10199	NC_021725	TA	4	8	538825	538832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10200	NC_021725	TTTCA	2	10	538977	538986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10201	NC_021725	AAT	2	6	538989	538994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10202	NC_021725	GTT	2	6	539033	539038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10203	NC_021725	ATG	2	6	539052	539057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10206	NC_021725	AGCG	2	8	539246	539253	25 %	0 %	50 %	25 %	523518997
10207	NC_021725	TGC	2	6	539331	539336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518997
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10215	NC_021725	T	7	7	539845	539851	0 %	100 %	0 %	0 %	523518997
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10217	NC_021725	GTCA	2	8	539947	539954	25 %	25 %	25 %	25 %	523518997
10218	NC_021725	AGT	2	6	539987	539992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518997
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10221	NC_021725	CACC	2	8	540160	540167	25 %	0 %	0 %	75 %	523518997
10222	NC_021725	CG	3	6	540224	540229	0 %	0 %	50 %	50 %	523518997
10223	NC_021725	ACT	2	6	540363	540368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518997
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10225	NC_021725	TCA	2	6	540554	540559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518998
10226	NC_021725	CTTT	2	8	540609	540616	0 %	75 %	0 %	25 %	523518998
10227	NC_021725	GAG	2	6	540617	540622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523518998
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10230	NC_021725	AGC	2	6	540849	540854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518999
10231	NC_021725	ATGA	2	8	540856	540863	50 %	25 %	25 %	0 %	523518999
10232	NC_021725	TAT	2	6	540901	540906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518999
10233	NC_021725	GTT	2	6	540918	540923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518999
10234	NC_021725	GAT	2	6	540946	540951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518999
10235	NC_021725	GCA	2	6	541044	541049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518999
10236	NC_021725	TGC	2	6	541059	541064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518999
10237	NC_021725	GTG	2	6	541065	541070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518999
10238	NC_021725	TGA	2	6	541083	541088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518999
10239	NC_021725	GCA	2	6	541186	541191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518999
10240	NC_021725	TTGA	2	8	541243	541250	25 %	50 %	25 %	0 %	523518999
10241	NC_021725	CGGATA	2	12	541328	541339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523518999
10242	NC_021725	A	6	6	541390	541395	100 %	0 %	0 %	0 %	523518999
10243	NC_021725	TTA	2	6	541411	541416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518999
10244	NC_021725	GCG	2	6	541511	541516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518999
10245	NC_021725	GCG	2	6	541518	541523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518999
10246	NC_021725	GCG	2	6	541612	541617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518999
10247	NC_021725	A	6	6	541681	541686	100 %	0 %	0 %	0 %	523518999
10248	NC_021725	CTG	2	6	541704	541709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518999
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10251	NC_021725	A	6	6	541822	541827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_021725	GCC	2	6	541906	541911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10253	NC_021725	CTTG	2	8	541943	541950	0 %	50 %	25 %	25 %	523519000
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10275	NC_021725	AGTC	2	8	543276	543283	25 %	25 %	25 %	25 %	523519001
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10291	NC_021725	A	6	6	543801	543806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10303	NC_021725	CAA	2	6	544770	544775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10304	NC_021725	A	6	6	544774	544779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10305	NC_021725	TCGC	2	8	544793	544800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10306	NC_021725	GCCATA	2	12	545103	545114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523519003
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10320	NC_021725	GTAA	2	8	546020	546027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10321	NC_021725	A	6	6	546031	546036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10353	NC_021725	CTG	2	6	548141	548146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519007
10354	NC_021725	GGCA	2	8	548170	548177	25 %	0 %	50 %	25 %	523519007
10355	NC_021725	GTTT	2	8	548229	548236	0 %	75 %	25 %	0 %	523519007
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10358	NC_021725	TGA	2	6	548322	548327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519007
10359	NC_021725	GCTG	2	8	548368	548375	0 %	25 %	50 %	25 %	523519007
10360	NC_021725	GCTTA	2	10	548436	548445	20 %	40 %	20 %	20 %	523519007
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10485	NC_021725	GTC	2	6	554603	554608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519013
10486	NC_021725	CAG	2	6	554615	554620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519013
10487	NC_021725	ATG	2	6	554687	554692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519013
10488	NC_021725	CAT	2	6	554744	554749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519013
10489	NC_021725	CGC	2	6	554784	554789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519013
10490	NC_021725	TAT	2	6	554793	554798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519013
10491	NC_021725	CAG	2	6	554959	554964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519013
10492	NC_021725	GCG	2	6	554984	554989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519013
10493	NC_021725	TGG	2	6	555029	555034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519013
10494	NC_021725	GAT	2	6	555043	555048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519013
10495	NC_021725	CGC	2	6	555059	555064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519013
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10499	NC_021725	AGC	2	6	555461	555466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519014
10500	NC_021725	GCT	2	6	555557	555562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519014

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