MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 53710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_021723	AGA	2	6	2201214	2201219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517739
41003	NC_021723	TGC	2	6	2201272	2201277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517739
41004	NC_021723	TCA	2	6	2201357	2201362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517739
41005	NC_021723	CGT	2	6	2201365	2201370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517739
41006	NC_021723	CAT	2	6	2201407	2201412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517740
41007	NC_021723	GTT	2	6	2201441	2201446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517740
41008	NC_021723	AAACCG	2	12	2201488	2201499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	523517740
41009	NC_021723	AAT	2	6	2201591	2201596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517740
41010	NC_021723	GCA	2	6	2201613	2201618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517740
41011	NC_021723	CAA	2	6	2201626	2201631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517740
41012	NC_021723	CTGG	2	8	2201638	2201645	0 %	25 %	50 %	25 %	523517740
41013	NC_021723	AGC	3	9	2201667	2201675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517740
41014	NC_021723	CAC	2	6	2201699	2201704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517740
41015	NC_021723	CAG	2	6	2201708	2201713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517740
41016	NC_021723	ATT	2	6	2201750	2201755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517740
41017	NC_021723	GC	3	6	2201759	2201764	0 %	0 %	50 %	50 %	523517740
41018	NC_021723	ATC	2	6	2201781	2201786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517740
41019	NC_021723	ACCA	2	8	2201834	2201841	50 %	0 %	0 %	50 %	523517740
41020	NC_021723	GTG	2	6	2201877	2201882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517740
41021	NC_021723	GCA	2	6	2201989	2201994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517740
41022	NC_021723	GTT	2	6	2202027	2202032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517740
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41024	NC_021723	TAA	2	6	2202098	2202103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517740
41025	NC_021723	CCTC	2	8	2202117	2202124	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41026	NC_021723	GCC	2	6	2202335	2202340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517741
41027	NC_021723	TGC	2	6	2202354	2202359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517741
41028	NC_021723	TGA	2	6	2202404	2202409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517741
41029	NC_021723	CCAA	2	8	2202501	2202508	50 %	0 %	0 %	50 %	523517741
41030	NC_021723	ATC	2	6	2202539	2202544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517741
41031	NC_021723	AAT	2	6	2202576	2202581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517741
41032	NC_021723	TAA	2	6	2202606	2202611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517741
41033	NC_021723	CGA	2	6	2202701	2202706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517741
41034	NC_021723	CCGC	2	8	2202757	2202764	0 %	0 %	25 %	75 %	523517741
41035	NC_021723	CAT	2	6	2202784	2202789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517741
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41038	NC_021723	CT	3	6	2202908	2202913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41039	NC_021723	ACC	2	6	2203182	2203187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41040	NC_021723	A	6	6	2203199	2203204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41041	NC_021723	CAA	2	6	2203264	2203269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41042	NC_021723	CAA	2	6	2203271	2203276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41043	NC_021723	ATA	2	6	2203383	2203388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517742
41044	NC_021723	CAT	2	6	2203406	2203411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517742
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41051	NC_021723	TGC	3	9	2203607	2203615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517742
41052	NC_021723	GCT	2	6	2203617	2203622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517742
41053	NC_021723	CCAT	2	8	2203624	2203631	25 %	25 %	0 %	50 %	523517742
41054	NC_021723	ATA	2	6	2203640	2203645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517742
41055	NC_021723	A	7	7	2203664	2203670	100 %	0 %	0 %	0 %	523517742
41056	NC_021723	CAT	3	9	2203733	2203741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517742
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41059	NC_021723	TTCCG	2	10	2203892	2203901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41060	NC_021723	GCA	2	6	2203902	2203907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41062	NC_021723	GTG	2	6	2204016	2204021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41063	NC_021723	TGC	2	6	2204070	2204075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41064	NC_021723	T	7	7	2204173	2204179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41065	NC_021723	TTTTA	2	10	2204184	2204193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41068	NC_021723	A	7	7	2204346	2204352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41069	NC_021723	CCG	2	6	2204606	2204611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517743
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41071	NC_021723	CACG	2	8	2204645	2204652	25 %	0 %	25 %	50 %	523517743
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41089	NC_021723	ATC	2	6	2205482	2205487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517744
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41101	NC_021723	TTCCG	2	10	2205964	2205973	0 %	40 %	20 %	40 %	523517744
41102	NC_021723	TTC	2	6	2205985	2205990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517744
41103	NC_021723	CACC	2	8	2206033	2206040	25 %	0 %	0 %	75 %	523517744
41104	NC_021723	TCA	2	6	2206119	2206124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517744
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41106	NC_021723	CATT	2	8	2206260	2206267	25 %	50 %	0 %	25 %	523517745
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41108	NC_021723	CAAC	2	8	2206329	2206336	50 %	0 %	0 %	50 %	523517745
41109	NC_021723	GCA	2	6	2206343	2206348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517745
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41114	NC_021723	CAAT	2	8	2206731	2206738	50 %	25 %	0 %	25 %	523517745
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41118	NC_021723	TAT	2	6	2206914	2206919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517745
41119	NC_021723	CAA	2	6	2206963	2206968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517745
41120	NC_021723	TG	3	6	2207092	2207097	0 %	50 %	50 %	0 %	523517745
41121	NC_021723	TGC	2	6	2207114	2207119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517745
41122	NC_021723	ATAA	2	8	2207138	2207145	75 %	25 %	0 %	0 %	523517746
41123	NC_021723	TTTGAT	2	12	2207247	2207258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	523517746
41124	NC_021723	CGC	2	6	2207266	2207271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517746
41125	NC_021723	TGT	2	6	2207284	2207289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517746
41126	NC_021723	ATC	2	6	2207375	2207380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517746
41127	NC_021723	CGC	2	6	2207387	2207392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517746
41128	NC_021723	CTG	2	6	2207408	2207413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517746
41129	NC_021723	TTCT	2	8	2207450	2207457	0 %	75 %	0 %	25 %	523517746
41130	NC_021723	CTGTT	2	10	2207496	2207505	0 %	60 %	20 %	20 %	523517747
41131	NC_021723	GGC	2	6	2207579	2207584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517747
41132	NC_021723	GCT	2	6	2207624	2207629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517747
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41134	NC_021723	TAA	2	6	2207787	2207792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517747
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41138	NC_021723	A	6	6	2208048	2208053	100 %	0 %	0 %	0 %	523517747
41139	NC_021723	CAT	2	6	2208204	2208209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517747
41140	NC_021723	GAT	2	6	2208218	2208223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517747
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41142	NC_021723	CAGC	2	8	2208314	2208321	25 %	0 %	25 %	50 %	523517747
41143	NC_021723	CAAA	2	8	2208350	2208357	75 %	0 %	0 %	25 %	523517747
41144	NC_021723	CAA	2	6	2208404	2208409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517747
41145	NC_021723	GCA	2	6	2208472	2208477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517748
41146	NC_021723	GGC	2	6	2208555	2208560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517748
41147	NC_021723	TAA	2	6	2208595	2208600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517748
41148	NC_021723	TCA	2	6	2208612	2208617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517748
41149	NC_021723	ATA	2	6	2208639	2208644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517748
41150	NC_021723	GTG	2	6	2208648	2208653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517748
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41153	NC_021723	GCT	2	6	2208722	2208727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517748
41154	NC_021723	ATA	2	6	2208774	2208779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517748
41155	NC_021723	TCC	2	6	2208780	2208785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41156	NC_021723	GTT	2	6	2208800	2208805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41157	NC_021723	CATTC	2	10	2208821	2208830	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41158	NC_021723	CGC	2	6	2208877	2208882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517749
41159	NC_021723	CCG	2	6	2208891	2208896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517749
41160	NC_021723	GCA	2	6	2208962	2208967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517749
41161	NC_021723	TGA	2	6	2209028	2209033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517749
41162	NC_021723	GATCC	2	10	2209039	2209048	20 %	20 %	20 %	40 %	523517749
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41165	NC_021723	T	6	6	2209493	2209498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41166	NC_021723	ATC	2	6	2209626	2209631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41169	NC_021723	GCC	2	6	2209901	2209906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517750
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41172	NC_021723	TCT	2	6	2209955	2209960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517750
41173	NC_021723	TCCT	2	8	2210000	2210007	0 %	50 %	0 %	50 %	523517751
41174	NC_021723	GC	3	6	2210112	2210117	0 %	0 %	50 %	50 %	523517751
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41182	NC_021723	TGG	2	6	2210709	2210714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41183	NC_021723	ATC	2	6	2210827	2210832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517752
41184	NC_021723	CAT	2	6	2210992	2210997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517752
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41188	NC_021723	GCT	2	6	2211226	2211231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517753
41189	NC_021723	GCT	2	6	2211345	2211350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517753
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41192	NC_021723	CGG	2	6	2211513	2211518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517753
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41200	NC_021723	TAA	2	6	2211833	2211838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517753
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41204	NC_021723	GTC	2	6	2212038	2212043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517753
41205	NC_021723	GCC	2	6	2212100	2212105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517753
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41207	NC_021723	TGC	2	6	2212133	2212138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517753
41208	NC_021723	ATC	2	6	2212139	2212144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517753
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41215	NC_021723	TCA	2	6	2212359	2212364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517753
41216	NC_021723	TCA	2	6	2212431	2212436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517753
41217	NC_021723	ATT	2	6	2212442	2212447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517753
41218	NC_021723	TTC	2	6	2212650	2212655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517753
41219	NC_021723	TGC	2	6	2212698	2212703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517753
41220	NC_021723	AGA	2	6	2212817	2212822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41221	NC_021723	ACA	2	6	2212837	2212842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41222	NC_021723	ACCT	2	8	2212905	2212912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41223	NC_021723	TGC	2	6	2212916	2212921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41224	NC_021723	TTCC	2	8	2212922	2212929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41225	NC_021723	CAT	2	6	2212953	2212958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41226	NC_021723	GGC	2	6	2213070	2213075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517754
41227	NC_021723	ACA	2	6	2213101	2213106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517754
41228	NC_021723	CAAA	2	8	2213255	2213262	75 %	0 %	0 %	25 %	523517754
41229	NC_021723	TCT	2	6	2213269	2213274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517754
41230	NC_021723	CGT	2	6	2213346	2213351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517754
41231	NC_021723	ACG	2	6	2213398	2213403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517754
41232	NC_021723	GCT	2	6	2213431	2213436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517754
41233	NC_021723	T	7	7	2213436	2213442	0 %	100 %	0 %	0 %	523517754
41234	NC_021723	AT	3	6	2213464	2213469	50 %	50 %	0 %	0 %	523517754
41235	NC_021723	TGAT	2	8	2213470	2213477	25 %	50 %	25 %	0 %	523517754
41236	NC_021723	AGC	2	6	2213507	2213512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41237	NC_021723	TTC	2	6	2213584	2213589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41238	NC_021723	TGC	2	6	2213695	2213700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517755
41239	NC_021723	TCA	2	6	2213813	2213818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517755
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41242	NC_021723	CAG	2	6	2213964	2213969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517755
41243	NC_021723	CTG	2	6	2213982	2213987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517755
41244	NC_021723	CACGT	2	10	2214046	2214055	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41245	NC_021723	TAA	2	6	2214088	2214093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517756
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41247	NC_021723	T	7	7	2214169	2214175	0 %	100 %	0 %	0 %	523517756
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41297	NC_021723	CCCG	2	8	2217469	2217476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41298	NC_021723	T	6	6	2217490	2217495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41299	NC_021723	ATC	2	6	2217585	2217590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41301	NC_021723	A	6	6	2217648	2217653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41302	NC_021723	GTTG	2	8	2217734	2217741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41303	NC_021723	AGA	2	6	2217746	2217751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41308	NC_021723	GCTCAC	2	12	2218015	2218026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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41312	NC_021723	CTG	2	6	2218355	2218360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517759
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41316	NC_021723	CG	3	6	2218631	2218636	0 %	0 %	50 %	50 %	523517760
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41333	NC_021723	TTGC	2	8	2219675	2219682	0 %	50 %	25 %	25 %	523517761
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41340	NC_021723	CAAAC	2	10	2220281	2220290	60 %	0 %	0 %	40 %	523517761
41341	NC_021723	GCA	2	6	2220342	2220347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517761
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41351	NC_021723	TCG	2	6	2220721	2220726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517761
41352	NC_021723	CCGAT	2	10	2220754	2220763	20 %	20 %	20 %	40 %	523517761
41353	NC_021723	GTT	2	6	2220849	2220854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517761
41354	NC_021723	ATC	2	6	2220878	2220883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517761
41355	NC_021723	GCC	2	6	2221013	2221018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517761
41356	NC_021723	CTG	3	9	2221045	2221053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517761
41357	NC_021723	CTT	2	6	2221072	2221077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517761
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41359	NC_021723	TGC	2	6	2221112	2221117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517761
41360	NC_021723	TCT	2	6	2221123	2221128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517761
41361	NC_021723	ATA	2	6	2221136	2221141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517761
41362	NC_021723	AAT	2	6	2221321	2221326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517761
41363	NC_021723	ATC	2	6	2221544	2221549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517761
41364	NC_021723	T	6	6	2221710	2221715	0 %	100 %	0 %	0 %	523517761
41365	NC_021723	CAT	2	6	2221726	2221731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517761
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41372	NC_021723	TCG	2	6	2222065	2222070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517761
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41438	NC_021723	TTA	2	6	2225733	2225738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41439	NC_021723	T	6	6	2225844	2225849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41440	NC_021723	GATT	2	8	2225902	2225909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41441	NC_021723	GAA	2	6	2225914	2225919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517762
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41443	NC_021723	ATG	2	6	2225948	2225953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517762
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41452	NC_021723	AACC	2	8	2226262	2226269	50 %	0 %	0 %	50 %	523517762
41453	NC_021723	A	6	6	2226289	2226294	100 %	0 %	0 %	0 %	523517762
41454	NC_021723	AAAG	2	8	2226298	2226305	75 %	0 %	25 %	0 %	523517762
41455	NC_021723	ATC	2	6	2226401	2226406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517762
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41457	NC_021723	ACG	2	6	2226434	2226439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517762
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41459	NC_021723	AAAGAT	2	12	2226755	2226766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	523517762
41460	NC_021723	TTC	2	6	2226842	2226847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41461	NC_021723	TGT	2	6	2226875	2226880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41462	NC_021723	CAT	2	6	2226899	2226904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41463	NC_021723	GTT	2	6	2226913	2226918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41464	NC_021723	ATT	2	6	2227015	2227020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517763
41465	NC_021723	CTT	2	6	2227042	2227047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517763
41466	NC_021723	CGT	2	6	2227072	2227077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517763
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41468	NC_021723	TAACCT	2	12	2227174	2227185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517763
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41471	NC_021723	GCC	2	6	2227256	2227261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517763
41472	NC_021723	AGC	2	6	2227262	2227267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517763
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41476	NC_021723	CATCTA	2	12	2227366	2227377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517763
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41492	NC_021723	TG	3	6	2228142	2228147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41493	NC_021723	TAAG	2	8	2228170	2228177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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