MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 53710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_021723	CCA	2	6	1878960	1878965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517441
35003	NC_021723	CTTT	2	8	1879002	1879009	0 %	75 %	0 %	25 %	523517441
35004	NC_021723	CTC	2	6	1879011	1879016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523517441
35005	NC_021723	CT	3	6	1879064	1879069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35006	NC_021723	TTG	2	6	1879176	1879181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517442
35007	NC_021723	TCT	2	6	1879218	1879223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517442
35008	NC_021723	TCT	2	6	1879226	1879231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35009	NC_021723	CAAAA	2	10	1879233	1879242	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35010	NC_021723	CAA	2	6	1879250	1879255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35011	NC_021723	ATT	2	6	1879272	1879277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35012	NC_021723	TAG	2	6	1879289	1879294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35013	NC_021723	TAT	2	6	1879359	1879364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35014	NC_021723	CTTCA	2	10	1879438	1879447	20 %	40 %	0 %	40 %	523517443
35015	NC_021723	GCA	2	6	1879473	1879478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517443
35016	NC_021723	CGG	2	6	1879503	1879508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517443
35017	NC_021723	TTC	2	6	1879651	1879656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517443
35018	NC_021723	TCT	2	6	1879853	1879858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517443
35019	NC_021723	GCC	2	6	1879864	1879869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517443
35020	NC_021723	TGG	2	6	1879877	1879882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517443
35021	NC_021723	CTT	2	6	1879977	1879982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517443
35022	NC_021723	GAT	2	6	1880011	1880016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517443
35023	NC_021723	TGA	2	6	1880085	1880090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517443
35024	NC_021723	GCA	2	6	1880148	1880153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517443
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35026	NC_021723	GAG	2	6	1880248	1880253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523517443
35027	NC_021723	TTTG	2	8	1880292	1880299	0 %	75 %	25 %	0 %	523517443
35028	NC_021723	TGA	2	6	1880301	1880306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517443
35029	NC_021723	GTC	2	6	1880308	1880313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517443
35030	NC_021723	TCG	2	6	1880432	1880437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517443
35031	NC_021723	TGG	2	6	1880466	1880471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517443
35032	NC_021723	GTG	2	6	1880474	1880479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517443
35033	NC_021723	GGTCT	2	10	1880530	1880539	0 %	40 %	40 %	20 %	523517443
35034	NC_021723	CCG	2	6	1880630	1880635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517443
35035	NC_021723	AC	3	6	1880665	1880670	50 %	0 %	0 %	50 %	523517443
35036	NC_021723	TCA	2	6	1880705	1880710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517443
35037	NC_021723	ACC	2	6	1880746	1880751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517443
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35039	NC_021723	GAT	2	6	1880890	1880895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517443
35040	NC_021723	ACCA	2	8	1881092	1881099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35041	NC_021723	AT	3	6	1881195	1881200	50 %	50 %	0 %	0 %	523517444
35042	NC_021723	CAT	2	6	1881223	1881228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517444
35043	NC_021723	TAG	2	6	1881285	1881290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517444
35044	NC_021723	CAG	2	6	1881320	1881325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517444
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35046	NC_021723	CCGG	2	8	1881469	1881476	0 %	0 %	50 %	50 %	523517444
35047	NC_021723	ACC	2	6	1881540	1881545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517444
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35050	NC_021723	TTG	2	6	1881680	1881685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517444
35051	NC_021723	GCA	2	6	1881724	1881729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517444
35052	NC_021723	CG	3	6	1881732	1881737	0 %	0 %	50 %	50 %	523517444
35053	NC_021723	GTG	2	6	1881738	1881743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517444
35054	NC_021723	ATA	2	6	1881777	1881782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517444
35055	NC_021723	GT	3	6	1881787	1881792	0 %	50 %	50 %	0 %	523517444
35056	NC_021723	CAT	2	6	1881901	1881906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517444
35057	NC_021723	TCA	2	6	1881918	1881923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517444
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35059	NC_021723	AC	3	6	1882191	1882196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35060	NC_021723	CGC	2	6	1882224	1882229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35061	NC_021723	AAT	2	6	1882283	1882288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35062	NC_021723	TGC	2	6	1882343	1882348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35063	NC_021723	ATTTG	2	10	1882425	1882434	20 %	60 %	20 %	0 %	523517445
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35066	NC_021723	T	6	6	1882624	1882629	0 %	100 %	0 %	0 %	523517445
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35068	NC_021723	AGG	2	6	1882735	1882740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35069	NC_021723	CGC	2	6	1882815	1882820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517446
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35087	NC_021723	GCA	2	6	1884110	1884115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517447
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35091	NC_021723	CTT	2	6	1884447	1884452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517447
35092	NC_021723	ACCA	2	8	1884453	1884460	50 %	0 %	0 %	50 %	523517447
35093	NC_021723	AAT	2	6	1884498	1884503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35094	NC_021723	CTT	2	6	1884508	1884513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35095	NC_021723	TTTAC	2	10	1884563	1884572	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35096	NC_021723	CG	3	6	1884573	1884578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35097	NC_021723	A	6	6	1884615	1884620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35098	NC_021723	GTT	2	6	1884687	1884692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35099	NC_021723	ATG	2	6	1884760	1884765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35100	NC_021723	A	6	6	1884904	1884909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35101	NC_021723	TTGC	2	8	1884921	1884928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35102	NC_021723	GCA	2	6	1884967	1884972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35103	NC_021723	AGC	2	6	1885103	1885108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517448
35104	NC_021723	TGG	2	6	1885138	1885143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517448
35105	NC_021723	CGC	2	6	1885209	1885214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517448
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35108	NC_021723	CAA	2	6	1885547	1885552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517449
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35112	NC_021723	TGA	2	6	1885753	1885758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517449
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35115	NC_021723	TCA	2	6	1885899	1885904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517449
35116	NC_021723	CAC	2	6	1886030	1886035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517449
35117	NC_021723	AAC	2	6	1886055	1886060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517449
35118	NC_021723	GT	3	6	1886182	1886187	0 %	50 %	50 %	0 %	523517449
35119	NC_021723	TCA	2	6	1886199	1886204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517449
35120	NC_021723	GCCG	2	8	1886236	1886243	0 %	0 %	50 %	50 %	523517449
35121	NC_021723	AATCA	2	10	1886246	1886255	60 %	20 %	0 %	20 %	523517449
35122	NC_021723	GCT	2	6	1886364	1886369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517449
35123	NC_021723	GGCA	2	8	1886381	1886388	25 %	0 %	50 %	25 %	523517449
35124	NC_021723	AAG	2	6	1886493	1886498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517449
35125	NC_021723	TTG	2	6	1886540	1886545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517449
35126	NC_021723	TTC	2	6	1886558	1886563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517449
35127	NC_021723	CTT	2	6	1886584	1886589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517449
35128	NC_021723	AGA	2	6	1886701	1886706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517449
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35132	NC_021723	ATA	2	6	1886933	1886938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517449
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35134	NC_021723	GCT	2	6	1887032	1887037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517449
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35138	NC_021723	TCG	2	6	1887178	1887183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517449
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35140	NC_021723	GCC	2	6	1887368	1887373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517449
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35142	NC_021723	AATC	2	8	1887493	1887500	50 %	25 %	0 %	25 %	523517449
35143	NC_021723	GCT	2	6	1887544	1887549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517449
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35145	NC_021723	GCT	2	6	1887592	1887597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517449
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35148	NC_021723	GGTCTT	2	12	1887695	1887706	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	523517449
35149	NC_021723	TGC	3	9	1887768	1887776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517449
35150	NC_021723	ACG	2	6	1887801	1887806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517449
35151	NC_021723	TTA	2	6	1887823	1887828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35152	NC_021723	AAT	2	6	1887829	1887834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35153	NC_021723	CGC	2	6	1887865	1887870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35154	NC_021723	A	6	6	1887871	1887876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35155	NC_021723	CAA	2	6	1888252	1888257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517452
35156	NC_021723	CAA	2	6	1888339	1888344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517452
35157	NC_021723	AC	3	6	1888353	1888358	50 %	0 %	0 %	50 %	523517452
35158	NC_021723	GTT	2	6	1888541	1888546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517453
35159	NC_021723	CGC	2	6	1888549	1888554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517453
35160	NC_021723	CTG	2	6	1888591	1888596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517453
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35163	NC_021723	TCA	4	12	1888816	1888827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517453
35164	NC_021723	ATTC	2	8	1888853	1888860	25 %	50 %	0 %	25 %	523517453
35165	NC_021723	CAC	2	6	1888898	1888903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517453
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35169	NC_021723	CTG	2	6	1889082	1889087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517453
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35172	NC_021723	GCG	2	6	1889136	1889141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517453
35173	NC_021723	CAC	2	6	1889153	1889158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517453
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35177	NC_021723	TCA	2	6	1889434	1889439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517453
35178	NC_021723	GGCA	2	8	1889495	1889502	25 %	0 %	50 %	25 %	523517453
35179	NC_021723	CCA	4	12	1889512	1889523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517453
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35181	NC_021723	TG	3	6	1889619	1889624	0 %	50 %	50 %	0 %	523517453
35182	NC_021723	TTC	2	6	1889649	1889654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517453
35183	NC_021723	GGC	2	6	1889700	1889705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517453
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35186	NC_021723	CGTTG	2	10	1890047	1890056	0 %	40 %	40 %	20 %	523517453
35187	NC_021723	TGA	2	6	1890098	1890103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517453
35188	NC_021723	GAC	2	6	1890183	1890188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517453
35189	NC_021723	CTC	2	6	1890229	1890234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523517453
35190	NC_021723	ACC	2	6	1890262	1890267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517453
35191	NC_021723	TGC	2	6	1890333	1890338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35192	NC_021723	GCA	2	6	1890409	1890414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35193	NC_021723	T	6	6	1890420	1890425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35194	NC_021723	ATT	2	6	1890462	1890467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35195	NC_021723	A	7	7	1890473	1890479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35196	NC_021723	AAC	2	6	1890500	1890505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517454
35197	NC_021723	TGG	2	6	1890593	1890598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517454
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35200	NC_021723	ATT	2	6	1890700	1890705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517454
35201	NC_021723	A	6	6	1890723	1890728	100 %	0 %	0 %	0 %	523517454
35202	NC_021723	ATT	2	6	1890742	1890747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517454
35203	NC_021723	GAA	2	6	1890762	1890767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517454
35204	NC_021723	AAG	2	6	1890774	1890779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517454
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35206	NC_021723	TGG	2	6	1890889	1890894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517454
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35209	NC_021723	AT	3	6	1890965	1890970	50 %	50 %	0 %	0 %	523517454
35210	NC_021723	GAA	2	6	1890971	1890976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517454
35211	NC_021723	GTC	2	6	1891137	1891142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517454
35212	NC_021723	GGC	2	6	1891299	1891304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517454
35213	NC_021723	CAT	2	6	1891305	1891310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517454
35214	NC_021723	GCC	2	6	1891680	1891685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517455
35215	NC_021723	TAT	2	6	1891740	1891745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517455
35216	NC_021723	A	6	6	1891791	1891796	100 %	0 %	0 %	0 %	523517455
35217	NC_021723	CCG	2	6	1891837	1891842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517455
35218	NC_021723	CGCC	2	8	1891865	1891872	0 %	0 %	25 %	75 %	523517455
35219	NC_021723	CAA	2	6	1891969	1891974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35220	NC_021723	CAA	2	6	1892052	1892057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517456
35221	NC_021723	ATG	2	6	1892062	1892067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517456
35222	NC_021723	ATGATC	2	12	1892251	1892262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523517456
35223	NC_021723	AACC	2	8	1892274	1892281	50 %	0 %	0 %	50 %	523517456
35224	NC_021723	ACC	2	6	1892433	1892438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517456
35225	NC_021723	GTGGC	2	10	1892485	1892494	0 %	20 %	60 %	20 %	523517456
35226	NC_021723	ATAAA	2	10	1892505	1892514	80 %	20 %	0 %	0 %	523517456
35227	NC_021723	ATTA	2	8	1892541	1892548	50 %	50 %	0 %	0 %	523517456
35228	NC_021723	AGCGC	2	10	1892591	1892600	20 %	0 %	40 %	40 %	523517456
35229	NC_021723	TCA	2	6	1892626	1892631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517456
35230	NC_021723	CGG	2	6	1892635	1892640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517456
35231	NC_021723	TAA	2	6	1892709	1892714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517456
35232	NC_021723	CAA	2	6	1892762	1892767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517456
35233	NC_021723	CAC	2	6	1892793	1892798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517456
35234	NC_021723	AAT	2	6	1892811	1892816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517456
35235	NC_021723	ACC	2	6	1892887	1892892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517456
35236	NC_021723	AGC	2	6	1892911	1892916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517456
35237	NC_021723	AAT	2	6	1892941	1892946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517456
35238	NC_021723	CAT	2	6	1892994	1892999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517456
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35240	NC_021723	CGC	2	6	1893051	1893056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517456
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35242	NC_021723	ACC	2	6	1893085	1893090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517456
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35339	NC_021723	T	7	7	1899054	1899060	0 %	100 %	0 %	0 %	523517461
35340	NC_021723	GTTT	2	8	1899254	1899261	0 %	75 %	25 %	0 %	523517461
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35342	NC_021723	TGCT	2	8	1899346	1899353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35343	NC_021723	TTTA	2	8	1899355	1899362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35344	NC_021723	T	6	6	1899391	1899396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35345	NC_021723	CA	3	6	1899502	1899507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35346	NC_021723	CAA	2	6	1899557	1899562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35347	NC_021723	ATGA	2	8	1899625	1899632	50 %	25 %	25 %	0 %	523517462
35348	NC_021723	GAT	2	6	1899666	1899671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517462
35349	NC_021723	GAC	2	6	1899709	1899714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517462
35350	NC_021723	ATC	2	6	1899715	1899720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517462
35351	NC_021723	TGG	2	6	1899743	1899748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517462
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35353	NC_021723	GGC	2	6	1899838	1899843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517462
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