MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 53710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_021723	GTC	2	6	1341305	1341310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516935
25003	NC_021723	TTA	2	6	1341375	1341380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516935
25004	NC_021723	TTG	2	6	1341533	1341538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516935
25005	NC_021723	TGGTT	2	10	1341604	1341613	0 %	60 %	40 %	0 %	523516935
25006	NC_021723	AAGA	2	8	1341677	1341684	75 %	0 %	25 %	0 %	523516935
25007	NC_021723	ATG	2	6	1341717	1341722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516935
25008	NC_021723	ATT	2	6	1341737	1341742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516935
25009	NC_021723	CAA	2	6	1341751	1341756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516935
25010	NC_021723	GAA	2	6	1341926	1341931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516935
25011	NC_021723	ACC	2	6	1342011	1342016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516935
25012	NC_021723	CTT	2	6	1342024	1342029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516935
25013	NC_021723	GAA	2	6	1342043	1342048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516935
25014	NC_021723	GCC	2	6	1342097	1342102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516935
25015	NC_021723	TGA	2	6	1342114	1342119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516935
25016	NC_021723	GCT	2	6	1342156	1342161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516935
25017	NC_021723	CCG	2	6	1342233	1342238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516935
25018	NC_021723	GAA	2	6	1342346	1342351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516935
25019	NC_021723	CAG	2	6	1342406	1342411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516935
25020	NC_021723	ATT	2	6	1342430	1342435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516935
25021	NC_021723	CTG	2	6	1342475	1342480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516935
25022	NC_021723	CTT	2	6	1342486	1342491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516935
25023	NC_021723	GCC	2	6	1342543	1342548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516935
25024	NC_021723	AATG	2	8	1342681	1342688	50 %	25 %	25 %	0 %	523516935
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25028	NC_021723	ATC	2	6	1343178	1343183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516936
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25032	NC_021723	TGC	2	6	1343421	1343426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516936
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25034	NC_021723	CAT	2	6	1343611	1343616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516936
25035	NC_021723	CCGG	2	8	1343652	1343659	0 %	0 %	50 %	50 %	523516936
25036	NC_021723	CGG	2	6	1343704	1343709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516936
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25041	NC_021723	A	6	6	1343795	1343800	100 %	0 %	0 %	0 %	523516936
25042	NC_021723	A	6	6	1343867	1343872	100 %	0 %	0 %	0 %	523516936
25043	NC_021723	GCA	2	6	1344073	1344078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516936
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25049	NC_021723	GCA	2	6	1344396	1344401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516936
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25067	NC_021723	TAT	2	6	1345448	1345453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25069	NC_021723	T	7	7	1345498	1345504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25070	NC_021723	A	7	7	1345525	1345531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25071	NC_021723	AGG	2	6	1345630	1345635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25112	NC_021723	T	6	6	1347977	1347982	0 %	100 %	0 %	0 %	523516938
25113	NC_021723	TGAAA	2	10	1347990	1347999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25114	NC_021723	TATT	2	8	1348016	1348023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25115	NC_021723	GGC	2	6	1348033	1348038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25118	NC_021723	GTC	2	6	1348178	1348183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516939
25119	NC_021723	G	6	6	1348319	1348324	0 %	0 %	100 %	0 %	523516939
25120	NC_021723	GGT	2	6	1348427	1348432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516939
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25122	NC_021723	GAT	2	6	1348601	1348606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516939
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25124	NC_021723	TTC	2	6	1348719	1348724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516939
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25128	NC_021723	TAACG	2	10	1348908	1348917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25129	NC_021723	GCA	2	6	1348927	1348932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25130	NC_021723	T	8	8	1348944	1348951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25131	NC_021723	ATG	3	9	1348963	1348971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25132	NC_021723	GCC	2	6	1349008	1349013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25133	NC_021723	T	6	6	1349038	1349043	0 %	100 %	0 %	0 %	523516940
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25175	NC_021723	T	7	7	1350997	1351003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25176	NC_021723	TGA	2	6	1351065	1351070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25179	NC_021723	ACT	2	6	1351140	1351145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25181	NC_021723	GACA	2	8	1351255	1351262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25182	NC_021723	GA	3	6	1351277	1351282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25183	NC_021723	ATCA	2	8	1351376	1351383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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25191	NC_021723	T	6	6	1351772	1351777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25209	NC_021723	CGG	2	6	1353138	1353143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25210	NC_021723	ATA	2	6	1353155	1353160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25211	NC_021723	AAG	2	6	1353234	1353239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25220	NC_021723	TCA	2	6	1353876	1353881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25221	NC_021723	TCA	2	6	1353931	1353936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25222	NC_021723	ATT	2	6	1353953	1353958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25223	NC_021723	T	7	7	1354002	1354008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25224	NC_021723	TAA	2	6	1354010	1354015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25225	NC_021723	TTGA	2	8	1354122	1354129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25226	NC_021723	TGC	2	6	1354260	1354265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25227	NC_021723	TAG	2	6	1354314	1354319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25228	NC_021723	GAC	2	6	1354397	1354402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25229	NC_021723	AAAC	2	8	1354412	1354419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25230	NC_021723	CAAC	2	8	1354585	1354592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25231	NC_021723	GCA	2	6	1354681	1354686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25232	NC_021723	CGC	2	6	1354738	1354743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25233	NC_021723	AGC	3	9	1354764	1354772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25234	NC_021723	CAT	2	6	1354784	1354789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25235	NC_021723	GAT	2	6	1354817	1354822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25236	NC_021723	GTT	2	6	1354866	1354871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25238	NC_021723	GTC	2	6	1354906	1354911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25239	NC_021723	GTG	2	6	1355026	1355031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25356	NC_021723	T	6	6	1361706	1361711	0 %	100 %	0 %	0 %	523516952
25357	NC_021723	GT	3	6	1361769	1361774	0 %	50 %	50 %	0 %	523516952
25358	NC_021723	CG	3	6	1361812	1361817	0 %	0 %	50 %	50 %	523516952
25359	NC_021723	TGC	2	6	1361820	1361825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516952
25360	NC_021723	GCC	2	6	1361868	1361873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516952
25361	NC_021723	TGC	2	6	1361893	1361898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516952
25362	NC_021723	AGGC	2	8	1361909	1361916	25 %	0 %	50 %	25 %	523516952
25363	NC_021723	AGT	2	6	1361929	1361934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516952
25364	NC_021723	GTT	2	6	1361941	1361946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516952
25365	NC_021723	GCA	2	6	1362007	1362012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516952
25366	NC_021723	TCA	2	6	1362066	1362071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516952
25367	NC_021723	ACA	2	6	1362154	1362159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516952
25368	NC_021723	ATT	2	6	1362173	1362178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516952
25369	NC_021723	ATCA	2	8	1362269	1362276	50 %	25 %	0 %	25 %	523516952
25370	NC_021723	A	6	6	1362357	1362362	100 %	0 %	0 %	0 %	523516952
25371	NC_021723	CTG	2	6	1362518	1362523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516952
25372	NC_021723	TTC	2	6	1362590	1362595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516952
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25374	NC_021723	CCT	2	6	1362670	1362675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25375	NC_021723	GTTTG	2	10	1362685	1362694	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25376	NC_021723	GCTG	2	8	1362715	1362722	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25377	NC_021723	TTG	2	6	1362741	1362746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516953
25378	NC_021723	TCG	2	6	1362891	1362896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516953
25379	NC_021723	CAA	2	6	1362910	1362915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516953
25380	NC_021723	TCC	2	6	1362930	1362935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516953
25381	NC_021723	T	7	7	1362941	1362947	0 %	100 %	0 %	0 %	523516953
25382	NC_021723	CTGG	2	8	1363000	1363007	0 %	25 %	50 %	25 %	523516953
25383	NC_021723	TTTG	2	8	1363048	1363055	0 %	75 %	25 %	0 %	523516953
25384	NC_021723	CCTT	2	8	1363074	1363081	0 %	50 %	0 %	50 %	523516954
25385	NC_021723	AAC	2	6	1363101	1363106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516954
25386	NC_021723	TGA	2	6	1363149	1363154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516954
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25388	NC_021723	CTTG	2	8	1363323	1363330	0 %	50 %	25 %	25 %	523516954
25389	NC_021723	ATC	2	6	1363391	1363396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516954
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25392	NC_021723	CTTG	2	8	1363604	1363611	0 %	50 %	25 %	25 %	523516955
25393	NC_021723	TGCT	2	8	1363665	1363672	0 %	50 %	25 %	25 %	523516955
25394	NC_021723	CGCC	2	8	1363708	1363715	0 %	0 %	25 %	75 %	523516955
25395	NC_021723	ATC	2	6	1363720	1363725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516955
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25398	NC_021723	CCG	2	6	1363832	1363837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516955
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25402	NC_021723	GGT	2	6	1363983	1363988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516955
25403	NC_021723	AAGA	2	8	1364001	1364008	75 %	0 %	25 %	0 %	523516955
25404	NC_021723	T	6	6	1364094	1364099	0 %	100 %	0 %	0 %	523516955
25405	NC_021723	AAT	2	6	1364130	1364135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516955
25406	NC_021723	TCC	2	6	1364156	1364161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516956
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25412	NC_021723	CAGC	2	8	1364446	1364453	25 %	0 %	25 %	50 %	523516956
25413	NC_021723	GTG	2	6	1364546	1364551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516956
25414	NC_021723	CGAT	2	8	1364576	1364583	25 %	25 %	25 %	25 %	523516956
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25416	NC_021723	TTGA	2	8	1364683	1364690	25 %	50 %	25 %	0 %	523516956
25417	NC_021723	GACT	2	8	1364790	1364797	25 %	25 %	25 %	25 %	523516956
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25419	NC_021723	GGCC	2	8	1364832	1364839	0 %	0 %	50 %	50 %	523516956
25420	NC_021723	GTC	2	6	1364871	1364876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516957
25421	NC_021723	CAC	2	6	1364914	1364919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516957
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25423	NC_021723	GGT	2	6	1364993	1364998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516957
25424	NC_021723	AAGT	2	8	1365045	1365052	50 %	25 %	25 %	0 %	523516957
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25426	NC_021723	ACC	2	6	1365156	1365161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516957
25427	NC_021723	GCA	2	6	1365360	1365365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516957
25428	NC_021723	CAG	2	6	1365373	1365378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516957
25429	NC_021723	GTTG	2	8	1365391	1365398	0 %	50 %	50 %	0 %	523516957
25430	NC_021723	T	6	6	1365422	1365427	0 %	100 %	0 %	0 %	523516957
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25433	NC_021723	AAC	2	6	1365557	1365562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516958
25434	NC_021723	ATG	2	6	1365574	1365579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516958
25435	NC_021723	A	6	6	1365644	1365649	100 %	0 %	0 %	0 %	523516958
25436	NC_021723	TCC	2	6	1365673	1365678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516958
25437	NC_021723	CCA	3	9	1365735	1365743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516958
25438	NC_021723	CATC	2	8	1365759	1365766	25 %	25 %	0 %	50 %	523516958
25439	NC_021723	ATG	2	6	1365862	1365867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516958
25440	NC_021723	GAA	2	6	1365949	1365954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516958
25441	NC_021723	TATCAA	2	12	1365966	1365977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	523516958
25442	NC_021723	CCT	2	6	1366063	1366068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516958
25443	NC_021723	CAT	2	6	1366215	1366220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25444	NC_021723	TGAA	2	8	1366351	1366358	50 %	25 %	25 %	0 %	523516959
25445	NC_021723	GTG	2	6	1366391	1366396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516959
25446	NC_021723	CGG	2	6	1366466	1366471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516959
25447	NC_021723	GATTG	2	10	1366524	1366533	20 %	40 %	40 %	0 %	523516959
25448	NC_021723	TTGG	2	8	1366620	1366627	0 %	50 %	50 %	0 %	523516959
25449	NC_021723	GCT	2	6	1366633	1366638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516959
25450	NC_021723	GTC	2	6	1366717	1366722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516959
25451	NC_021723	GC	3	6	1366732	1366737	0 %	0 %	50 %	50 %	523516959
25452	NC_021723	CTG	2	6	1366793	1366798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516959
25453	NC_021723	ATC	2	6	1366800	1366805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516959
25454	NC_021723	AAT	2	6	1366809	1366814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516959
25455	NC_021723	T	6	6	1366869	1366874	0 %	100 %	0 %	0 %	523516959
25456	NC_021723	GCC	2	6	1367011	1367016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516959
25457	NC_021723	GGC	2	6	1367047	1367052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516959
25458	NC_021723	TCA	2	6	1367102	1367107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516959
25459	NC_021723	GCC	2	6	1367133	1367138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516959
25460	NC_021723	T	7	7	1367254	1367260	0 %	100 %	0 %	0 %	523516959
25461	NC_021723	TGC	2	6	1367274	1367279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516959
25462	NC_021723	GA	3	6	1367293	1367298	50 %	0 %	50 %	0 %	523516959
25463	NC_021723	T	6	6	1367420	1367425	0 %	100 %	0 %	0 %	523516959
25464	NC_021723	GGT	2	6	1367430	1367435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516959
25465	NC_021723	GGT	2	6	1367472	1367477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516959
25466	NC_021723	CCT	2	6	1367529	1367534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516960
25467	NC_021723	TTG	2	6	1367545	1367550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516960
25468	NC_021723	T	7	7	1367582	1367588	0 %	100 %	0 %	0 %	523516960
25469	NC_021723	ACC	2	6	1367609	1367614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516960
25470	NC_021723	GTT	2	6	1367656	1367661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516960
25471	NC_021723	GGT	2	6	1367671	1367676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516960
25472	NC_021723	GCG	2	6	1367721	1367726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516960
25473	NC_021723	TGG	2	6	1367811	1367816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516960
25474	NC_021723	CAAT	2	8	1367817	1367824	50 %	25 %	0 %	25 %	523516960
25475	NC_021723	T	6	6	1367835	1367840	0 %	100 %	0 %	0 %	523516960
25476	NC_021723	CCGG	2	8	1367881	1367888	0 %	0 %	50 %	50 %	523516960
25477	NC_021723	CTG	2	6	1367911	1367916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516960
25478	NC_021723	TTC	2	6	1367926	1367931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516960
25479	NC_021723	CTG	2	6	1368084	1368089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516960
25480	NC_021723	CATTG	2	10	1368151	1368160	20 %	40 %	20 %	20 %	523516960
25481	NC_021723	CCT	2	6	1368161	1368166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516961
25482	NC_021723	TGCG	2	8	1368249	1368256	0 %	25 %	50 %	25 %	523516961
25483	NC_021723	ATC	2	6	1368333	1368338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516961
25484	NC_021723	GCA	2	6	1368389	1368394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516961
25485	NC_021723	GAC	2	6	1368452	1368457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516961
25486	NC_021723	GTA	2	6	1368492	1368497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516961
25487	NC_021723	GAA	2	6	1368557	1368562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516961
25488	NC_021723	TGT	2	6	1368574	1368579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516961
25489	NC_021723	GGC	2	6	1368610	1368615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516961
25490	NC_021723	AAC	2	6	1368658	1368663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516961
25491	NC_021723	TGC	2	6	1368673	1368678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516961
25492	NC_021723	GTT	2	6	1368719	1368724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516961
25493	NC_021723	TGC	2	6	1368753	1368758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516961
25494	NC_021723	ACC	2	6	1369004	1369009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516961
25495	NC_021723	AGG	2	6	1369017	1369022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523516961
25496	NC_021723	TGG	2	6	1369031	1369036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516961
25497	NC_021723	CAT	2	6	1369097	1369102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516961
25498	NC_021723	GTT	2	6	1369118	1369123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516961
25499	NC_021723	AAT	2	6	1369165	1369170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516961
25500	NC_021723	TCA	2	6	1369214	1369219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516961

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