MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_021721	T	6	6	2491771	2491776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48003	NC_021721	TGT	2	6	2491791	2491796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48004	NC_021721	GCT	2	6	2491817	2491822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48005	NC_021721	CATGAA	2	12	2491862	2491873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48006	NC_021721	ATC	2	6	2491962	2491967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514948
48007	NC_021721	CAG	2	6	2492028	2492033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514948
48008	NC_021721	CAA	2	6	2492034	2492039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514948
48009	NC_021721	GTC	2	6	2492067	2492072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514948
48010	NC_021721	GACT	2	8	2492104	2492111	25 %	25 %	25 %	25 %	523514948
48011	NC_021721	CAAA	2	8	2492305	2492312	75 %	0 %	0 %	25 %	523514948
48012	NC_021721	GGC	2	6	2492313	2492318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514948
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48014	NC_021721	ATT	2	6	2492414	2492419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514949
48015	NC_021721	CCT	2	6	2492422	2492427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514949
48016	NC_021721	CCGTTC	2	12	2492441	2492452	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	523514949
48017	NC_021721	CAT	2	6	2492497	2492502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514949
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48019	NC_021721	GGC	2	6	2492576	2492581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514949
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48021	NC_021721	GTCTT	2	10	2492618	2492627	0 %	60 %	20 %	20 %	523514949
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48032	NC_021721	GAT	2	6	2493110	2493115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514950
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48034	NC_021721	CAT	2	6	2493170	2493175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514950
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48045	NC_021721	GATCA	2	10	2493693	2493702	40 %	20 %	20 %	20 %	523514950
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48052	NC_021721	TGT	2	6	2494116	2494121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48053	NC_021721	AATTTA	2	12	2494193	2494204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48054	NC_021721	A	6	6	2494218	2494223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48055	NC_021721	AGC	2	6	2494253	2494258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48058	NC_021721	CAAAT	2	10	2494395	2494404	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48059	NC_021721	TGC	2	6	2494471	2494476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48068	NC_021721	GATT	2	8	2494892	2494899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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48071	NC_021721	GCCTT	2	10	2494969	2494978	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48072	NC_021721	CTGCG	2	10	2495004	2495013	0 %	20 %	40 %	40 %	523514952
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48111	NC_021721	T	6	6	2496787	2496792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48112	NC_021721	GAG	2	6	2496879	2496884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48116	NC_021721	CAA	2	6	2497001	2497006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48117	NC_021721	GC	3	6	2497068	2497073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48118	NC_021721	AC	3	6	2497081	2497086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48119	NC_021721	TC	3	6	2497093	2497098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48120	NC_021721	TTG	2	6	2497262	2497267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48121	NC_021721	AGA	2	6	2497373	2497378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48122	NC_021721	GTC	2	6	2497400	2497405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48123	NC_021721	ATT	2	6	2497433	2497438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514954
48124	NC_021721	A	6	6	2497457	2497462	100 %	0 %	0 %	0 %	523514954
48125	NC_021721	AAAAC	2	10	2497484	2497493	80 %	0 %	0 %	20 %	523514954
48126	NC_021721	GCT	2	6	2497532	2497537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514954
48127	NC_021721	CTA	2	6	2497644	2497649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48128	NC_021721	A	7	7	2497662	2497668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48129	NC_021721	T	6	6	2497730	2497735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48130	NC_021721	TCA	2	6	2497740	2497745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48131	NC_021721	ACT	2	6	2497774	2497779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514955
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48134	NC_021721	GCG	2	6	2497875	2497880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514955
48135	NC_021721	CTT	2	6	2497924	2497929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514955
48136	NC_021721	CG	3	6	2497939	2497944	0 %	0 %	50 %	50 %	523514955
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48146	NC_021721	TCG	2	6	2498416	2498421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514956
48147	NC_021721	CTG	2	6	2498704	2498709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514956
48148	NC_021721	TG	3	6	2498731	2498736	0 %	50 %	50 %	0 %	523514956
48149	NC_021721	ATC	2	6	2498804	2498809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514956
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48157	NC_021721	CTT	2	6	2499107	2499112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514957
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48190	NC_021721	ATTGT	2	10	2500875	2500884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48191	NC_021721	TCCT	2	8	2500907	2500914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48192	NC_021721	GGGC	2	8	2500966	2500973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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48195	NC_021721	A	6	6	2501055	2501060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48196	NC_021721	CAG	2	6	2501130	2501135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48219	NC_021721	TGC	2	6	2502143	2502148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514959
48220	NC_021721	ATTC	2	8	2502224	2502231	25 %	50 %	0 %	25 %	523514959
48221	NC_021721	CG	3	6	2502327	2502332	0 %	0 %	50 %	50 %	523514959
48222	NC_021721	AC	3	6	2502340	2502345	50 %	0 %	0 %	50 %	523514959
48223	NC_021721	CG	4	8	2502433	2502440	0 %	0 %	50 %	50 %	523514959
48224	NC_021721	ATC	2	6	2502446	2502451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514959
48225	NC_021721	CCT	2	6	2502541	2502546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48226	NC_021721	TAT	2	6	2502603	2502608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48227	NC_021721	GGT	2	6	2502645	2502650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48228	NC_021721	TAA	2	6	2502738	2502743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514960
48229	NC_021721	CAC	2	6	2502922	2502927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514960
48230	NC_021721	TG	3	6	2502977	2502982	0 %	50 %	50 %	0 %	523514960
48231	NC_021721	GAC	2	6	2503011	2503016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514960
48232	NC_021721	AGA	2	6	2503077	2503082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514960
48233	NC_021721	GCT	3	9	2503151	2503159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514960
48234	NC_021721	A	6	6	2503416	2503421	100 %	0 %	0 %	0 %	523514961
48235	NC_021721	TCG	2	6	2503443	2503448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48236	NC_021721	AACA	2	8	2503455	2503462	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48237	NC_021721	ACG	2	6	2503510	2503515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48238	NC_021721	TCA	2	6	2503627	2503632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48239	NC_021721	TGC	2	6	2503659	2503664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48240	NC_021721	AAAT	2	8	2503760	2503767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48241	NC_021721	CGT	2	6	2503794	2503799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48242	NC_021721	CACT	2	8	2503810	2503817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48243	NC_021721	AAC	2	6	2503826	2503831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48244	NC_021721	CCA	2	6	2503851	2503856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48246	NC_021721	CTT	2	6	2503899	2503904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48337	NC_021721	A	6	6	2508383	2508388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48338	NC_021721	GAT	2	6	2508393	2508398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48339	NC_021721	ATC	2	6	2508418	2508423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48340	NC_021721	TCA	2	6	2508503	2508508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514966
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48342	NC_021721	TAG	2	6	2508570	2508575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514966
48343	NC_021721	CTT	2	6	2508578	2508583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514966
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48346	NC_021721	ATG	2	6	2508691	2508696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514966
48347	NC_021721	CA	3	6	2508700	2508705	50 %	0 %	0 %	50 %	523514966
48348	NC_021721	AGT	2	6	2508739	2508744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514966
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48350	NC_021721	ATTA	2	8	2508867	2508874	50 %	50 %	0 %	0 %	523514966
48351	NC_021721	TTGG	2	8	2508982	2508989	0 %	50 %	50 %	0 %	523514966
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48353	NC_021721	GC	3	6	2509055	2509060	0 %	0 %	50 %	50 %	523514966
48354	NC_021721	A	7	7	2509144	2509150	100 %	0 %	0 %	0 %	523514966
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48464	NC_021721	A	6	6	2514648	2514653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48465	NC_021721	TTC	2	6	2514733	2514738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48467	NC_021721	AT	3	6	2514833	2514838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48468	NC_021721	TA	3	6	2514889	2514894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48469	NC_021721	TTTC	2	8	2514916	2514923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48470	NC_021721	AGCGA	2	10	2514928	2514937	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48471	NC_021721	TA	3	6	2514939	2514944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48472	NC_021721	T	8	8	2514949	2514956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48473	NC_021721	CTG	2	6	2514973	2514978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48474	NC_021721	ATC	2	6	2515027	2515032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48475	NC_021721	AAC	2	6	2515039	2515044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48476	NC_021721	T	7	7	2515060	2515066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48477	NC_021721	TTA	2	6	2515085	2515090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48478	NC_021721	AATTG	2	10	2515135	2515144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48479	NC_021721	GTC	2	6	2515188	2515193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48480	NC_021721	AAG	2	6	2515294	2515299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48481	NC_021721	GCC	2	6	2515330	2515335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48482	NC_021721	TC	3	6	2515359	2515364	0 %	50 %	0 %	50 %	523514971
48483	NC_021721	CAA	2	6	2515487	2515492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514971
48484	NC_021721	TGA	2	6	2515550	2515555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514971
48485	NC_021721	AGC	2	6	2515711	2515716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514971
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48487	NC_021721	CGG	2	6	2516035	2516040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514971
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48489	NC_021721	ACCC	2	8	2516085	2516092	25 %	0 %	0 %	75 %	523514971
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48491	NC_021721	ATG	3	9	2516119	2516127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514971
48492	NC_021721	TGC	2	6	2516184	2516189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514971
48493	NC_021721	ACA	2	6	2516225	2516230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514971
48494	NC_021721	TCT	2	6	2516258	2516263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514971
48495	NC_021721	CCAA	2	8	2516289	2516296	50 %	0 %	0 %	50 %	523514971
48496	NC_021721	CAG	2	6	2516313	2516318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514971
48497	NC_021721	CGC	2	6	2516327	2516332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514971
48498	NC_021721	CGG	2	6	2516400	2516405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514971
48499	NC_021721	GAT	2	6	2516445	2516450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514971
48500	NC_021721	TTC	2	6	2516464	2516469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514971

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