MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_021721	ACA	2	6	2363239	2363244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45503	NC_021721	T	6	6	2363363	2363368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45504	NC_021721	AAC	2	6	2363410	2363415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45505	NC_021721	A	6	6	2363416	2363421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45506	NC_021721	AAT	2	6	2363470	2363475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45507	NC_021721	GGAT	2	8	2363503	2363510	25 %	25 %	50 %	0 %	523514809
45508	NC_021721	ATG	2	6	2363517	2363522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514809
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45510	NC_021721	TTA	2	6	2363848	2363853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514809
45511	NC_021721	AACG	2	8	2363854	2363861	50 %	0 %	25 %	25 %	523514809
45512	NC_021721	TGT	2	6	2363921	2363926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514809
45513	NC_021721	TCA	2	6	2363974	2363979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514809
45514	NC_021721	CTTG	2	8	2364107	2364114	0 %	50 %	25 %	25 %	523514809
45515	NC_021721	CAG	2	6	2364231	2364236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514809
45516	NC_021721	TAA	2	6	2364248	2364253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514809
45517	NC_021721	ATCC	2	8	2364270	2364277	25 %	25 %	0 %	50 %	523514809
45518	NC_021721	ACCCG	2	10	2364287	2364296	20 %	0 %	20 %	60 %	523514809
45519	NC_021721	CAA	2	6	2364338	2364343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514809
45520	NC_021721	CTGG	2	8	2364369	2364376	0 %	25 %	50 %	25 %	523514809
45521	NC_021721	A	6	6	2364390	2364395	100 %	0 %	0 %	0 %	523514809
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45523	NC_021721	ACTC	2	8	2364704	2364711	25 %	25 %	0 %	50 %	523514810
45524	NC_021721	GAA	2	6	2364726	2364731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514810
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45533	NC_021721	CGTCA	2	10	2364990	2364999	20 %	20 %	20 %	40 %	523514810
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45535	NC_021721	A	6	6	2365054	2365059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45536	NC_021721	GTT	2	6	2365068	2365073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45537	NC_021721	T	6	6	2365097	2365102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45538	NC_021721	TTG	2	6	2365163	2365168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514811
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45544	NC_021721	TGC	2	6	2365475	2365480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514811
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45547	NC_021721	GCCAA	2	10	2365611	2365620	40 %	0 %	20 %	40 %	523514811
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45551	NC_021721	TCAA	2	8	2365935	2365942	50 %	25 %	0 %	25 %	523514812
45552	NC_021721	GTT	2	6	2365951	2365956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514812
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45554	NC_021721	TAA	2	6	2366067	2366072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514812
45555	NC_021721	TCA	2	6	2366199	2366204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514812
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45558	NC_021721	CAAT	2	8	2366366	2366373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45559	NC_021721	CTT	2	6	2366461	2366466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514813
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45577	NC_021721	CATCT	2	10	2367528	2367537	20 %	40 %	0 %	40 %	523514814
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45585	NC_021721	TGA	2	6	2367863	2367868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514814
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45587	NC_021721	GCT	2	6	2367943	2367948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514814
45588	NC_021721	CCT	2	6	2367962	2367967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45589	NC_021721	TGC	2	6	2368070	2368075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45591	NC_021721	AAT	2	6	2368177	2368182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514815
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45593	NC_021721	AAG	2	6	2368340	2368345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514815
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45599	NC_021721	GCTT	2	8	2368793	2368800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45600	NC_021721	TCA	2	6	2368829	2368834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45601	NC_021721	CTG	2	6	2368835	2368840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45602	NC_021721	G	6	6	2368852	2368857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45603	NC_021721	CTT	2	6	2368958	2368963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45604	NC_021721	TG	3	6	2368989	2368994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45605	NC_021721	TCTTT	2	10	2369020	2369029	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45606	NC_021721	CAAA	2	8	2369036	2369043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45607	NC_021721	GGC	2	6	2369103	2369108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45608	NC_021721	CAT	2	6	2369159	2369164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514816
45609	NC_021721	A	6	6	2369190	2369195	100 %	0 %	0 %	0 %	523514816
45610	NC_021721	T	6	6	2369241	2369246	0 %	100 %	0 %	0 %	523514816
45611	NC_021721	TCTT	2	8	2369259	2369266	0 %	75 %	0 %	25 %	523514816
45612	NC_021721	CATCA	2	10	2369287	2369296	40 %	20 %	0 %	40 %	523514816
45613	NC_021721	A	6	6	2369316	2369321	100 %	0 %	0 %	0 %	523514816
45614	NC_021721	TGC	3	9	2369349	2369357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45615	NC_021721	ACC	2	6	2369384	2369389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45616	NC_021721	CAA	2	6	2369410	2369415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45617	NC_021721	ATCA	2	8	2369440	2369447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45618	NC_021721	TCA	3	9	2369445	2369453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45620	NC_021721	TGT	3	9	2369472	2369480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45741	NC_021721	TGA	2	6	2374556	2374561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514821
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45745	NC_021721	ATC	2	6	2374705	2374710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514821
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45795	NC_021721	GCTGT	2	10	2377299	2377308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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45799	NC_021721	TATT	2	8	2377473	2377480	25 %	75 %	0 %	0 %	523514825
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45842	NC_021721	CGT	2	6	2379734	2379739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514826
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45846	NC_021721	CTT	3	9	2379993	2380001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514827
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45848	NC_021721	TTC	2	6	2380116	2380121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514827
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45850	NC_021721	TTG	2	6	2380134	2380139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514827
45851	NC_021721	GCG	2	6	2380151	2380156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514827
45852	NC_021721	CAT	2	6	2380293	2380298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514827
45853	NC_021721	CTC	2	6	2380326	2380331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514827
45854	NC_021721	AAT	2	6	2380446	2380451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514827
45855	NC_021721	CCATC	2	10	2380466	2380475	20 %	20 %	0 %	60 %	523514827
45856	NC_021721	TGCCG	2	10	2380482	2380491	0 %	20 %	40 %	40 %	523514827
45857	NC_021721	TCA	2	6	2380501	2380506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514827
45858	NC_021721	GCA	2	6	2380543	2380548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514827
45859	NC_021721	ATC	2	6	2380596	2380601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514827
45860	NC_021721	GCT	2	6	2380603	2380608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514827
45861	NC_021721	ATG	2	6	2380774	2380779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514827
45862	NC_021721	ACC	2	6	2380836	2380841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514827
45863	NC_021721	GCAT	2	8	2380867	2380874	25 %	25 %	25 %	25 %	523514827
45864	NC_021721	GGC	2	6	2380947	2380952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514827
45865	NC_021721	TTTC	2	8	2381063	2381070	0 %	75 %	0 %	25 %	523514827
45866	NC_021721	TTG	2	6	2381185	2381190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514827
45867	NC_021721	GT	3	6	2381204	2381209	0 %	50 %	50 %	0 %	523514827
45868	NC_021721	TTC	2	6	2381266	2381271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514827
45869	NC_021721	GGA	2	6	2381312	2381317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523514827
45870	NC_021721	CGG	2	6	2381343	2381348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514827
45871	NC_021721	AATC	2	8	2381370	2381377	50 %	25 %	0 %	25 %	523514827
45872	NC_021721	CAT	2	6	2381429	2381434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514827
45873	NC_021721	AGTC	2	8	2381562	2381569	25 %	25 %	25 %	25 %	523514827
45874	NC_021721	A	6	6	2381592	2381597	100 %	0 %	0 %	0 %	523514827
45875	NC_021721	ACA	2	6	2381723	2381728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514827
45876	NC_021721	CTG	2	6	2381752	2381757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514827
45877	NC_021721	TAC	2	6	2381777	2381782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514827
45878	NC_021721	AATA	2	8	2381869	2381876	75 %	25 %	0 %	0 %	523514827
45879	NC_021721	TCG	2	6	2381948	2381953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514827
45880	NC_021721	CTTG	2	8	2381990	2381997	0 %	50 %	25 %	25 %	523514827
45881	NC_021721	CGT	2	6	2382008	2382013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514827
45882	NC_021721	TGG	2	6	2382047	2382052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514827
45883	NC_021721	CTG	2	6	2382149	2382154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514827
45884	NC_021721	T	6	6	2382270	2382275	0 %	100 %	0 %	0 %	523514827
45885	NC_021721	TCC	2	6	2382280	2382285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514827
45886	NC_021721	GTG	2	6	2382351	2382356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514827
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45888	NC_021721	AAT	2	6	2382454	2382459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514827
45889	NC_021721	CTG	2	6	2382525	2382530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514827
45890	NC_021721	CAT	2	6	2382531	2382536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514827
45891	NC_021721	T	6	6	2382551	2382556	0 %	100 %	0 %	0 %	523514827
45892	NC_021721	CTTT	2	8	2382587	2382594	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45893	NC_021721	GTT	2	6	2382665	2382670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45894	NC_021721	A	6	6	2382782	2382787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45895	NC_021721	GATCA	2	10	2382789	2382798	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45896	NC_021721	AGT	2	6	2382820	2382825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45901	NC_021721	TTGGT	2	10	2382906	2382915	0 %	60 %	40 %	0 %	523514828
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45909	NC_021721	CG	4	8	2383193	2383200	0 %	0 %	50 %	50 %	523514828
45910	NC_021721	TGC	2	6	2383237	2383242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514828
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45914	NC_021721	AAC	2	6	2383754	2383759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514828
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45918	NC_021721	TTCTT	2	10	2383920	2383929	0 %	80 %	0 %	20 %	523514828
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45923	NC_021721	TCA	2	6	2384194	2384199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514828
45924	NC_021721	ATG	2	6	2384208	2384213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514828
45925	NC_021721	AATC	2	8	2384311	2384318	50 %	25 %	0 %	25 %	523514828
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45927	NC_021721	CGC	3	9	2384383	2384391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514828
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45931	NC_021721	AGA	2	6	2384612	2384617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514828
45932	NC_021721	CAT	2	6	2384654	2384659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514828
45933	NC_021721	ACAA	2	8	2384710	2384717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45934	NC_021721	CAA	2	6	2384803	2384808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45935	NC_021721	ATG	2	6	2384825	2384830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45936	NC_021721	A	6	6	2384834	2384839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45937	NC_021721	CAT	2	6	2384912	2384917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514829
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45939	NC_021721	AATC	2	8	2385023	2385030	50 %	25 %	0 %	25 %	523514829
45940	NC_021721	GAC	2	6	2385066	2385071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514829
45941	NC_021721	TAA	2	6	2385097	2385102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514829
45942	NC_021721	TA	3	6	2385122	2385127	50 %	50 %	0 %	0 %	523514829
45943	NC_021721	A	6	6	2385132	2385137	100 %	0 %	0 %	0 %	523514829
45944	NC_021721	TCA	2	6	2385230	2385235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514829
45945	NC_021721	T	8	8	2385245	2385252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45946	NC_021721	GTGAGC	2	12	2385255	2385266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45947	NC_021721	GC	3	6	2385269	2385274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45948	NC_021721	CGCTG	2	10	2385353	2385362	0 %	20 %	40 %	40 %	523514830
45949	NC_021721	GC	3	6	2385392	2385397	0 %	0 %	50 %	50 %	523514830
45950	NC_021721	GGTC	2	8	2385433	2385440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45951	NC_021721	TGC	2	6	2385476	2385481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45952	NC_021721	TGA	2	6	2385528	2385533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45953	NC_021721	CAT	2	6	2385548	2385553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45954	NC_021721	ACA	2	6	2385554	2385559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45955	NC_021721	AATG	2	8	2385581	2385588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45956	NC_021721	TTAA	2	8	2385622	2385629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45957	NC_021721	ACA	2	6	2385673	2385678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45958	NC_021721	TTG	2	6	2385706	2385711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45959	NC_021721	CAT	2	6	2385731	2385736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514831
45960	NC_021721	CTG	3	9	2385748	2385756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514831
45961	NC_021721	GCA	2	6	2385771	2385776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514831
45962	NC_021721	TTA	2	6	2385777	2385782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514831
45963	NC_021721	CAA	2	6	2385808	2385813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514831
45964	NC_021721	GTC	2	6	2385822	2385827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514831
45965	NC_021721	AGC	2	6	2385836	2385841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514831
45966	NC_021721	GCG	2	6	2385849	2385854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514831
45967	NC_021721	AAT	2	6	2385890	2385895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514831
45968	NC_021721	TCA	2	6	2385921	2385926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514831
45969	NC_021721	CTT	2	6	2385959	2385964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514831
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45999	NC_021721	ATT	2	6	2387390	2387395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46000	NC_021721	ATG	2	6	2387412	2387417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514832

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