MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42505	NC_021721	TG	3	6	2205975	2205980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42506	NC_021721	GCTT	2	8	2205985	2205992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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42618	NC_021721	CAT	2	6	2211821	2211826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514668
42619	NC_021721	CTT	2	6	2211830	2211835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514668
42620	NC_021721	TTCA	2	8	2211945	2211952	25 %	50 %	0 %	25 %	523514668
42621	NC_021721	CGG	2	6	2212004	2212009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42622	NC_021721	CAA	2	6	2212070	2212075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514669
42623	NC_021721	CAT	2	6	2212120	2212125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514669
42624	NC_021721	ACA	2	6	2212191	2212196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514669
42625	NC_021721	CAT	2	6	2212222	2212227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514669
42626	NC_021721	CG	3	6	2212258	2212263	0 %	0 %	50 %	50 %	523514669
42627	NC_021721	CAC	2	6	2212297	2212302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514669
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42630	NC_021721	CTCG	2	8	2212424	2212431	0 %	25 %	25 %	50 %	523514669
42631	NC_021721	CGATCA	2	12	2212506	2212517	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523514669
42632	NC_021721	TCA	2	6	2212641	2212646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514669
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42634	NC_021721	ATG	2	6	2212719	2212724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514669
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42644	NC_021721	CCT	2	6	2213127	2213132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42645	NC_021721	T	6	6	2213148	2213153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42646	NC_021721	TTGC	2	8	2213170	2213177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42647	NC_021721	GT	3	6	2213203	2213208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42648	NC_021721	T	6	6	2213225	2213230	0 %	100 %	0 %	0 %	523514670
42649	NC_021721	TTG	2	6	2213308	2213313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514670
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42653	NC_021721	T	6	6	2213499	2213504	0 %	100 %	0 %	0 %	523514670
42654	NC_021721	TGCG	2	8	2213554	2213561	0 %	25 %	50 %	25 %	523514670
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42661	NC_021721	TTG	2	6	2213905	2213910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514672
42662	NC_021721	GCT	2	6	2213911	2213916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514672
42663	NC_021721	AATG	2	8	2214111	2214118	50 %	25 %	25 %	0 %	523514672
42664	NC_021721	TTCA	2	8	2214168	2214175	25 %	50 %	0 %	25 %	523514672
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42683	NC_021721	T	6	6	2215261	2215266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42684	NC_021721	TTA	2	6	2215287	2215292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42685	NC_021721	ATA	2	6	2215333	2215338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42686	NC_021721	TTA	2	6	2215343	2215348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42687	NC_021721	TTG	2	6	2215400	2215405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42688	NC_021721	GTG	2	6	2215450	2215455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42689	NC_021721	CAC	2	6	2215541	2215546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42690	NC_021721	CGC	2	6	2215556	2215561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42691	NC_021721	CT	3	6	2215570	2215575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42692	NC_021721	ACT	2	6	2215629	2215634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42693	NC_021721	CTT	2	6	2215667	2215672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42694	NC_021721	AT	3	6	2215677	2215682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42695	NC_021721	A	7	7	2215690	2215696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42696	NC_021721	AGAA	2	8	2215710	2215717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42697	NC_021721	GCG	3	9	2215730	2215738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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42700	NC_021721	CCAGC	2	10	2215853	2215862	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42701	NC_021721	CGC	2	6	2215863	2215868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42702	NC_021721	TAC	2	6	2215881	2215886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42703	NC_021721	CCA	2	6	2215894	2215899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42704	NC_021721	TCA	2	6	2215978	2215983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42705	NC_021721	CTCGCA	2	12	2215991	2216002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42706	NC_021721	CAT	2	6	2216022	2216027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42707	NC_021721	ATG	2	6	2216219	2216224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514673
42708	NC_021721	GAC	2	6	2216241	2216246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42709	NC_021721	ACGGTC	2	12	2216312	2216323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42710	NC_021721	GACA	2	8	2216532	2216539	50 %	0 %	25 %	25 %	523514673
42711	NC_021721	TGC	2	6	2216559	2216564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42712	NC_021721	GAC	2	6	2216584	2216589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42713	NC_021721	CGA	2	6	2216720	2216725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42714	NC_021721	ACA	2	6	2216828	2216833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514673
42715	NC_021721	AGC	2	6	2216910	2216915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42716	NC_021721	T	6	6	2216968	2216973	0 %	100 %	0 %	0 %	523514673
42717	NC_021721	TCATG	2	10	2216979	2216988	20 %	40 %	20 %	20 %	523514673
42718	NC_021721	ACA	2	6	2217017	2217022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514673
42719	NC_021721	TGA	2	6	2217114	2217119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514673
42720	NC_021721	CCAC	2	8	2217293	2217300	25 %	0 %	0 %	75 %	523514673
42721	NC_021721	TCAG	2	8	2217368	2217375	25 %	25 %	25 %	25 %	523514673
42722	NC_021721	CTAA	2	8	2217406	2217413	50 %	25 %	0 %	25 %	523514673
42723	NC_021721	ACC	2	6	2217492	2217497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514673
42724	NC_021721	CAA	2	6	2217502	2217507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514673
42725	NC_021721	CGG	2	6	2217603	2217608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514673
42726	NC_021721	GAT	2	6	2217627	2217632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514673
42727	NC_021721	CCG	2	6	2217835	2217840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514673
42728	NC_021721	CGG	2	6	2217866	2217871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514673
42729	NC_021721	TTG	2	6	2217969	2217974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514673
42730	NC_021721	CTG	2	6	2218060	2218065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42731	NC_021721	ACA	2	6	2218100	2218105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514673
42732	NC_021721	A	6	6	2218107	2218112	100 %	0 %	0 %	0 %	523514673
42733	NC_021721	AACC	2	8	2218203	2218210	50 %	0 %	0 %	50 %	523514673
42734	NC_021721	GCA	2	6	2218225	2218230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514673
42735	NC_021721	TTG	2	6	2218270	2218275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42736	NC_021721	TCGC	2	8	2218318	2218325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42737	NC_021721	ATC	2	6	2218335	2218340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514674
42738	NC_021721	AGCC	2	8	2218389	2218396	25 %	0 %	25 %	50 %	523514674
42739	NC_021721	TGC	2	6	2218426	2218431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514674
42740	NC_021721	CAA	2	6	2218437	2218442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514674
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42742	NC_021721	GCA	2	6	2218514	2218519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514674
42743	NC_021721	CAATAC	2	12	2218572	2218583	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	523514674
42744	NC_021721	GAC	2	6	2218602	2218607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514674
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42748	NC_021721	GTG	2	6	2218936	2218941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514674
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42752	NC_021721	GACC	2	8	2219117	2219124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42753	NC_021721	ATG	2	6	2219144	2219149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42755	NC_021721	CAT	2	6	2219162	2219167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42756	NC_021721	T	7	7	2219184	2219190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42757	NC_021721	CCA	2	6	2219211	2219216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42759	NC_021721	TCA	2	6	2219264	2219269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42761	NC_021721	GTTT	2	8	2219331	2219338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42762	NC_021721	AAT	2	6	2219353	2219358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514675
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42788	NC_021721	ATGA	2	8	2220417	2220424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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42850	NC_021721	TGC	2	6	2223735	2223740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42853	NC_021721	TAA	2	6	2223945	2223950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42855	NC_021721	TGCT	2	8	2223967	2223974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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42974	NC_021721	TGA	2	6	2231259	2231264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514684
42975	NC_021721	ATT	2	6	2231343	2231348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514684
42976	NC_021721	A	6	6	2231349	2231354	100 %	0 %	0 %	0 %	523514684
42977	NC_021721	TTATC	2	10	2231456	2231465	20 %	60 %	0 %	20 %	523514685
42978	NC_021721	GAT	2	6	2231490	2231495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514685
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42980	NC_021721	GTG	2	6	2231515	2231520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514685
42981	NC_021721	GTC	2	6	2231540	2231545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514685
42982	NC_021721	AACC	2	8	2231555	2231562	50 %	0 %	0 %	50 %	523514685
42983	NC_021721	TGA	2	6	2231618	2231623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514685
42984	NC_021721	TGCT	2	8	2231630	2231637	0 %	50 %	25 %	25 %	523514685
42985	NC_021721	TTTGA	2	10	2231730	2231739	20 %	60 %	20 %	0 %	523514685
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42988	NC_021721	AGC	2	6	2231935	2231940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514685
42989	NC_021721	AAT	2	6	2231945	2231950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514685
42990	NC_021721	CAA	2	6	2231976	2231981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514685
42991	NC_021721	TGC	2	6	2232111	2232116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514685
42992	NC_021721	TGA	2	6	2232127	2232132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514685
42993	NC_021721	GTC	2	6	2232142	2232147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514685
42994	NC_021721	GCG	2	6	2232163	2232168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514685
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42996	NC_021721	CCTT	2	8	2232292	2232299	0 %	50 %	0 %	50 %	523514685
42997	NC_021721	TG	3	6	2232340	2232345	0 %	50 %	50 %	0 %	523514685
42998	NC_021721	CCT	2	6	2232363	2232368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42999	NC_021721	TTG	2	6	2232453	2232458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43000	NC_021721	A	6	6	2232477	2232482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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