MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35544	NC_021721	ACTG	2	8	1855565	1855572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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35618	NC_021721	TA	3	6	1859888	1859893	50 %	50 %	0 %	0 %	523514325
35619	NC_021721	TGA	2	6	1859956	1859961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514325
35620	NC_021721	CAA	2	6	1860033	1860038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514325
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35623	NC_021721	TG	3	6	1860302	1860307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35624	NC_021721	TTG	2	6	1860342	1860347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35625	NC_021721	TCA	2	6	1860502	1860507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514326
35626	NC_021721	TAACG	2	10	1860652	1860661	40 %	20 %	20 %	20 %	523514326
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35631	NC_021721	TTG	2	6	1860856	1860861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35632	NC_021721	AGTC	2	8	1860868	1860875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35633	NC_021721	TCT	2	6	1861014	1861019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514327
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35652	NC_021721	TG	3	6	1862199	1862204	0 %	50 %	50 %	0 %	523514327
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35664	NC_021721	TC	3	6	1862731	1862736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35665	NC_021721	GC	3	6	1862815	1862820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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35688	NC_021721	T	6	6	1863798	1863803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35689	NC_021721	AATCG	2	10	1863831	1863840	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35690	NC_021721	GT	3	6	1863896	1863901	0 %	50 %	50 %	0 %	523514330
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35716	NC_021721	A	7	7	1865357	1865363	100 %	0 %	0 %	0 %	523514332
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35720	NC_021721	ATTTT	2	10	1865490	1865499	20 %	80 %	0 %	0 %	523514332
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35723	NC_021721	TTA	2	6	1865576	1865581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514332
35724	NC_021721	CTC	2	6	1865607	1865612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514332
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35728	NC_021721	GCAG	2	8	1865872	1865879	25 %	0 %	50 %	25 %	523514332
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35730	NC_021721	TCT	2	6	1865941	1865946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514332
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35733	NC_021721	TGA	2	6	1866067	1866072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514332
35734	NC_021721	GTC	2	6	1866176	1866181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514332
35735	NC_021721	GGC	2	6	1866316	1866321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514332
35736	NC_021721	ATG	2	6	1866386	1866391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514332
35737	NC_021721	T	6	6	1866505	1866510	0 %	100 %	0 %	0 %	523514332
35738	NC_021721	AC	3	6	1866558	1866563	50 %	0 %	0 %	50 %	523514332
35739	NC_021721	AAC	2	6	1866568	1866573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514332
35740	NC_021721	GAT	2	6	1866650	1866655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514332
35741	NC_021721	ACA	2	6	1866719	1866724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514332
35742	NC_021721	ACC	2	6	1866738	1866743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514332
35743	NC_021721	TGA	2	6	1866790	1866795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514332
35744	NC_021721	A	6	6	1866830	1866835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35745	NC_021721	TGA	2	6	1866950	1866955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514333
35746	NC_021721	ATA	2	6	1867049	1867054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514333
35747	NC_021721	GCC	2	6	1867187	1867192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514333
35748	NC_021721	TCA	2	6	1867194	1867199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514333
35749	NC_021721	TGA	2	6	1867206	1867211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514333
35750	NC_021721	TTG	2	6	1867214	1867219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514333
35751	NC_021721	TCA	2	6	1867287	1867292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514333
35752	NC_021721	ATC	2	6	1867310	1867315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514333
35753	NC_021721	T	7	7	1867317	1867323	0 %	100 %	0 %	0 %	523514333
35754	NC_021721	GACT	2	8	1867356	1867363	25 %	25 %	25 %	25 %	523514333
35755	NC_021721	AGA	2	6	1867438	1867443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514333
35756	NC_021721	ATC	2	6	1867505	1867510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514333
35757	NC_021721	TTCCAT	2	12	1867550	1867561	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	523514333
35758	NC_021721	TGC	2	6	1867565	1867570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35759	NC_021721	TAC	2	6	1867622	1867627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35760	NC_021721	GC	3	6	1867689	1867694	0 %	0 %	50 %	50 %	523514334
35761	NC_021721	T	6	6	1867837	1867842	0 %	100 %	0 %	0 %	523514335
35762	NC_021721	AGT	2	6	1867854	1867859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514335
35763	NC_021721	TTG	2	6	1867865	1867870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514335
35764	NC_021721	AACC	2	8	1867927	1867934	50 %	0 %	0 %	50 %	523514335
35765	NC_021721	CAT	2	6	1867952	1867957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514335
35766	NC_021721	TTAA	2	8	1867998	1868005	50 %	50 %	0 %	0 %	523514335
35767	NC_021721	TCA	2	6	1868022	1868027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514335
35768	NC_021721	AAT	2	6	1868069	1868074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514335
35769	NC_021721	TTC	2	6	1868075	1868080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514335
35770	NC_021721	A	6	6	1868140	1868145	100 %	0 %	0 %	0 %	523514335
35771	NC_021721	ATTTT	2	10	1868166	1868175	20 %	80 %	0 %	0 %	523514335
35772	NC_021721	GC	4	8	1868187	1868194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35773	NC_021721	TA	3	6	1868224	1868229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35774	NC_021721	GCTC	2	8	1868244	1868251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35775	NC_021721	GTATA	2	10	1868286	1868295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35776	NC_021721	T	6	6	1868338	1868343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35777	NC_021721	CAA	2	6	1868392	1868397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35778	NC_021721	AATA	2	8	1868416	1868423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35779	NC_021721	TAA	2	6	1868434	1868439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35780	NC_021721	AATTG	2	10	1868522	1868531	40 %	40 %	20 %	0 %	523514336
35781	NC_021721	CAG	3	9	1868541	1868549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514336
35782	NC_021721	TGCT	2	8	1868554	1868561	0 %	50 %	25 %	25 %	523514336
35783	NC_021721	AAT	2	6	1868603	1868608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514336
35784	NC_021721	AACGTT	2	12	1868846	1868857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523514336
35785	NC_021721	AT	3	6	1868959	1868964	50 %	50 %	0 %	0 %	523514336
35786	NC_021721	ATA	2	6	1869004	1869009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514336
35787	NC_021721	ATG	2	6	1869043	1869048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514336
35788	NC_021721	CTG	2	6	1869091	1869096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514336
35789	NC_021721	GCC	2	6	1869112	1869117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514336
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35792	NC_021721	TCCT	2	8	1869237	1869244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35793	NC_021721	GGT	2	6	1869286	1869291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35794	NC_021721	GCA	2	6	1869321	1869326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514337
35795	NC_021721	CGCC	2	8	1869483	1869490	0 %	0 %	25 %	75 %	523514337
35796	NC_021721	GAC	2	6	1869638	1869643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514337
35797	NC_021721	ACT	2	6	1869678	1869683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514337
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35799	NC_021721	TCG	2	6	1869730	1869735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514337
35800	NC_021721	CG	3	6	1869734	1869739	0 %	0 %	50 %	50 %	523514337
35801	NC_021721	GGCT	2	8	1869763	1869770	0 %	25 %	50 %	25 %	523514337
35802	NC_021721	TGAT	2	8	1869777	1869784	25 %	50 %	25 %	0 %	523514337
35803	NC_021721	T	6	6	1869862	1869867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35804	NC_021721	ATT	2	6	1869911	1869916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35805	NC_021721	AATC	2	8	1869945	1869952	50 %	25 %	0 %	25 %	523514338
35806	NC_021721	A	6	6	1870011	1870016	100 %	0 %	0 %	0 %	523514338
35807	NC_021721	ATC	2	6	1870043	1870048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514338
35808	NC_021721	TTG	2	6	1870116	1870121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514338
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35813	NC_021721	CGG	2	6	1870515	1870520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514338
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35822	NC_021721	GTC	2	6	1871006	1871011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514338
35823	NC_021721	ACA	2	6	1871049	1871054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514338
35824	NC_021721	ATCGTA	2	12	1871072	1871083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523514338
35825	NC_021721	CA	3	6	1871088	1871093	50 %	0 %	0 %	50 %	523514338
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35833	NC_021721	CTG	2	6	1871452	1871457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514338
35834	NC_021721	TGC	2	6	1871502	1871507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514338
35835	NC_021721	AG	3	6	1871563	1871568	50 %	0 %	50 %	0 %	523514338
35836	NC_021721	GT	3	6	1871583	1871588	0 %	50 %	50 %	0 %	523514338
35837	NC_021721	AATC	2	8	1871635	1871642	50 %	25 %	0 %	25 %	523514338
35838	NC_021721	TC	3	6	1871751	1871756	0 %	50 %	0 %	50 %	523514338
35839	NC_021721	ACG	2	6	1871761	1871766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514338
35840	NC_021721	A	6	6	1871795	1871800	100 %	0 %	0 %	0 %	523514338
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35842	NC_021721	ATC	2	6	1871834	1871839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514338
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35845	NC_021721	TGC	2	6	1871947	1871952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514338
35846	NC_021721	CCT	2	6	1872027	1872032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514339
35847	NC_021721	AAT	2	6	1872056	1872061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514339
35848	NC_021721	A	6	6	1872068	1872073	100 %	0 %	0 %	0 %	523514339
35849	NC_021721	CTG	2	6	1872074	1872079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514339
35850	NC_021721	A	6	6	1872107	1872112	100 %	0 %	0 %	0 %	523514339
35851	NC_021721	TGA	2	6	1872124	1872129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514339
35852	NC_021721	GAT	2	6	1872131	1872136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514339
35853	NC_021721	T	6	6	1872190	1872195	0 %	100 %	0 %	0 %	523514339
35854	NC_021721	A	6	6	1872225	1872230	100 %	0 %	0 %	0 %	523514339
35855	NC_021721	TGC	2	6	1872236	1872241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514339
35856	NC_021721	CAA	2	6	1872275	1872280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514339
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35872	NC_021721	CTTC	2	8	1872978	1872985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35873	NC_021721	A	7	7	1873088	1873094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35874	NC_021721	TGA	2	6	1873139	1873144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35877	NC_021721	ATATGG	2	12	1873276	1873287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35881	NC_021721	TTA	2	6	1873554	1873559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35884	NC_021721	AGG	2	6	1873699	1873704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35923	NC_021721	T	6	6	1875600	1875605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35924	NC_021721	ATCAT	2	10	1875606	1875615	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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35932	NC_021721	CCA	2	6	1875881	1875886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514342
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35955	NC_021721	ACT	2	6	1877105	1877110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514342
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35961	NC_021721	TCA	2	6	1877449	1877454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514342
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35963	NC_021721	ATCC	2	8	1877600	1877607	25 %	25 %	0 %	50 %	523514342
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