MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_021721	TCA	2	6	1698089	1698094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514163
32502	NC_021721	ATA	2	6	1698124	1698129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514163
32503	NC_021721	TCC	2	6	1698151	1698156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32504	NC_021721	AGCAT	2	10	1698189	1698198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32505	NC_021721	CAAA	2	8	1698203	1698210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32506	NC_021721	CCGCG	2	10	1698220	1698229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32507	NC_021721	CTT	2	6	1698237	1698242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32508	NC_021721	ACA	2	6	1698252	1698257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32509	NC_021721	CTT	2	6	1698263	1698268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32510	NC_021721	TCG	3	9	1698270	1698278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32511	NC_021721	ATC	2	6	1698326	1698331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514164
32512	NC_021721	TGC	2	6	1698359	1698364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32513	NC_021721	GCTG	2	8	1698368	1698375	0 %	25 %	50 %	25 %	523514164
32514	NC_021721	GCC	2	6	1698377	1698382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514164
32515	NC_021721	CTG	2	6	1698389	1698394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32516	NC_021721	TTC	2	6	1698396	1698401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32517	NC_021721	GTT	2	6	1698482	1698487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514164
32518	NC_021721	TTG	2	6	1698491	1698496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514164
32519	NC_021721	CTT	2	6	1698500	1698505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32520	NC_021721	CTT	2	6	1698530	1698535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32521	NC_021721	TCT	2	6	1698540	1698545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32522	NC_021721	AGC	2	6	1698594	1698599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32523	NC_021721	CTT	3	9	1698625	1698633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32524	NC_021721	TCG	2	6	1698642	1698647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32525	NC_021721	CTTC	2	8	1698667	1698674	0 %	50 %	0 %	50 %	523514164
32526	NC_021721	TTC	2	6	1698689	1698694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32527	NC_021721	GTG	2	6	1698823	1698828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514164
32528	NC_021721	CTG	2	6	1698931	1698936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32529	NC_021721	AGA	2	6	1698943	1698948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514164
32530	NC_021721	ATCA	2	8	1698983	1698990	50 %	25 %	0 %	25 %	523514164
32531	NC_021721	GCA	2	6	1699095	1699100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32532	NC_021721	CTG	2	6	1699177	1699182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32533	NC_021721	ACC	2	6	1699196	1699201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514164
32534	NC_021721	TCTTGG	2	12	1699270	1699281	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	523514164
32535	NC_021721	CAG	2	6	1699357	1699362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514164
32536	NC_021721	CTT	2	6	1699409	1699414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32537	NC_021721	TGT	3	9	1699474	1699482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514164
32538	NC_021721	GAT	2	6	1699511	1699516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514164
32539	NC_021721	ATC	2	6	1699529	1699534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514164
32540	NC_021721	GGTT	2	8	1699691	1699698	0 %	50 %	50 %	0 %	523514164
32541	NC_021721	TGG	2	6	1699747	1699752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514164
32542	NC_021721	CGGTA	2	10	1699781	1699790	20 %	20 %	40 %	20 %	523514164
32543	NC_021721	CTT	2	6	1699835	1699840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514164
32544	NC_021721	ATC	2	6	1699854	1699859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514164
32545	NC_021721	CAA	2	6	1700014	1700019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514164
32546	NC_021721	CTT	2	6	1700144	1700149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32547	NC_021721	ATTA	2	8	1700159	1700166	50 %	50 %	0 %	0 %	523514165
32548	NC_021721	AC	3	6	1700196	1700201	50 %	0 %	0 %	50 %	523514165
32549	NC_021721	TAA	2	6	1700213	1700218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514165
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32551	NC_021721	CTT	2	6	1700389	1700394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514165
32552	NC_021721	CAA	2	6	1700451	1700456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514165
32553	NC_021721	CAT	2	6	1700487	1700492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514165
32554	NC_021721	TGC	2	6	1700507	1700512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514165
32555	NC_021721	GTC	2	6	1700578	1700583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514165
32556	NC_021721	GTT	2	6	1700628	1700633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514165
32557	NC_021721	TCT	2	6	1700666	1700671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514165
32558	NC_021721	CAG	2	6	1700694	1700699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514165
32559	NC_021721	CTTT	2	8	1700709	1700716	0 %	75 %	0 %	25 %	523514165
32560	NC_021721	GCG	2	6	1700717	1700722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514165
32561	NC_021721	TGC	2	6	1700725	1700730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514165
32562	NC_021721	TGCTT	2	10	1700732	1700741	0 %	60 %	20 %	20 %	523514165
32563	NC_021721	TCC	2	6	1700759	1700764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32564	NC_021721	A	6	6	1700821	1700826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32565	NC_021721	ATT	2	6	1700930	1700935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514166
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32578	NC_021721	GA	3	6	1701722	1701727	50 %	0 %	50 %	0 %	523514166
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32585	NC_021721	AAT	2	6	1702027	1702032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32586	NC_021721	AAC	2	6	1702114	1702119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32587	NC_021721	TCA	2	6	1702153	1702158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514167
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32600	NC_021721	CTGG	2	8	1703198	1703205	0 %	25 %	50 %	25 %	523514167
32601	NC_021721	TTG	2	6	1703221	1703226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514167
32602	NC_021721	AGT	2	6	1703234	1703239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514167
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32604	NC_021721	T	6	6	1703332	1703337	0 %	100 %	0 %	0 %	523514168
32605	NC_021721	ATCA	2	8	1703344	1703351	50 %	25 %	0 %	25 %	523514168
32606	NC_021721	TTCAC	2	10	1703372	1703381	20 %	40 %	0 %	40 %	523514168
32607	NC_021721	GTG	2	6	1703525	1703530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514168
32608	NC_021721	ATTG	2	8	1703596	1703603	25 %	50 %	25 %	0 %	523514168
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32612	NC_021721	GACC	2	8	1703880	1703887	25 %	0 %	25 %	50 %	523514168
32613	NC_021721	GCG	2	6	1703910	1703915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514168
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32617	NC_021721	TCT	2	6	1704105	1704110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514168
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32849	NC_021721	GCA	2	6	1714847	1714852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514177
32850	NC_021721	CCA	2	6	1714958	1714963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514177
32851	NC_021721	CTG	2	6	1714983	1714988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514177
32852	NC_021721	TCA	2	6	1715035	1715040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514177
32853	NC_021721	AATT	2	8	1715054	1715061	50 %	50 %	0 %	0 %	523514177
32854	NC_021721	GATC	2	8	1715087	1715094	25 %	25 %	25 %	25 %	523514177
32855	NC_021721	TTC	2	6	1715097	1715102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514177
32856	NC_021721	ATCA	2	8	1715109	1715116	50 %	25 %	0 %	25 %	523514177
32857	NC_021721	CAT	2	6	1715261	1715266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514177
32858	NC_021721	CAT	2	6	1715486	1715491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514177
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32861	NC_021721	TTG	2	6	1715787	1715792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514177
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32865	NC_021721	ACT	2	6	1715878	1715883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514177
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32876	NC_021721	GCC	2	6	1716409	1716414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514177
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32879	NC_021721	GTC	2	6	1716517	1716522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32880	NC_021721	TTC	2	6	1716594	1716599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514178
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32884	NC_021721	ACCG	2	8	1716669	1716676	25 %	0 %	25 %	50 %	523514178
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32906	NC_021721	CATTTT	2	12	1718049	1718060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	523514178
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32930	NC_021721	GAT	2	6	1719513	1719518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32945	NC_021721	AT	4	8	1720076	1720083	50 %	50 %	0 %	0 %	523514180
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32947	NC_021721	A	6	6	1720121	1720126	100 %	0 %	0 %	0 %	523514180
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32950	NC_021721	CCA	2	6	1720265	1720270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514180
32951	NC_021721	GTT	2	6	1720323	1720328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514180
32952	NC_021721	TAA	2	6	1720335	1720340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32953	NC_021721	TCC	2	6	1720342	1720347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32954	NC_021721	A	6	6	1720354	1720359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32955	NC_021721	T	7	7	1720371	1720377	0 %	100 %	0 %	0 %	523514181
32956	NC_021721	GCT	2	6	1720420	1720425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514181
32957	NC_021721	AAT	2	6	1720454	1720459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514181
32958	NC_021721	CGC	2	6	1720523	1720528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514181
32959	NC_021721	TCA	2	6	1720577	1720582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514181
32960	NC_021721	TCA	2	6	1720603	1720608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514181
32961	NC_021721	TGC	2	6	1720659	1720664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514181
32962	NC_021721	TAT	2	6	1720721	1720726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514181
32963	NC_021721	CTTG	2	8	1720753	1720760	0 %	50 %	25 %	25 %	523514181
32964	NC_021721	GTC	2	6	1720779	1720784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514181
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32966	NC_021721	GCG	2	6	1721019	1721024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514181
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