MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32003	NC_021721	CAG	2	6	1671425	1671430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514131
32004	NC_021721	CAC	2	6	1671476	1671481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514131
32005	NC_021721	ATG	2	6	1671489	1671494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514131
32006	NC_021721	GCA	2	6	1671532	1671537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514131
32007	NC_021721	GCA	2	6	1671544	1671549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514131
32008	NC_021721	AGT	2	6	1671552	1671557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514131
32009	NC_021721	GCG	2	6	1671599	1671604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514131
32010	NC_021721	ATC	2	6	1671650	1671655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514131
32011	NC_021721	CCAA	2	8	1671659	1671666	50 %	0 %	0 %	50 %	523514131
32012	NC_021721	GAA	2	6	1671674	1671679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514131
32013	NC_021721	ATC	2	6	1671711	1671716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514131
32014	NC_021721	CAAG	2	8	1671744	1671751	50 %	0 %	25 %	25 %	523514131
32015	NC_021721	CCA	3	9	1671776	1671784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514131
32016	NC_021721	TTG	2	6	1671830	1671835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514131
32017	NC_021721	GTT	2	6	1671845	1671850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514131
32018	NC_021721	ATC	2	6	1671872	1671877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514131
32019	NC_021721	TCA	2	6	1671985	1671990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514131
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32021	NC_021721	TG	3	6	1672056	1672061	0 %	50 %	50 %	0 %	523514131
32022	NC_021721	GCC	2	6	1672085	1672090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514131
32023	NC_021721	TCA	2	6	1672207	1672212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514131
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32039	NC_021721	GT	3	6	1672965	1672970	0 %	50 %	50 %	0 %	523514132
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32042	NC_021721	AAT	2	6	1673083	1673088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514132
32043	NC_021721	ATG	2	6	1673099	1673104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514132
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32048	NC_021721	CAT	2	6	1673397	1673402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514132
32049	NC_021721	CTG	2	6	1673410	1673415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514132
32050	NC_021721	T	6	6	1673442	1673447	0 %	100 %	0 %	0 %	523514132
32051	NC_021721	CAT	2	6	1673469	1673474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514132
32052	NC_021721	AAT	2	6	1673648	1673653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514132
32053	NC_021721	CCT	2	6	1673669	1673674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32054	NC_021721	TAA	2	6	1673691	1673696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32055	NC_021721	ATCA	2	8	1673708	1673715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32056	NC_021721	AAT	2	6	1673798	1673803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32057	NC_021721	GCA	2	6	1673846	1673851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32059	NC_021721	AGC	2	6	1673927	1673932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514133
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32062	NC_021721	TG	3	6	1674018	1674023	0 %	50 %	50 %	0 %	523514133
32063	NC_021721	ATC	2	6	1674055	1674060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514133
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32089	NC_021721	CAA	2	6	1675457	1675462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514134
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32099	NC_021721	AGGC	2	8	1675786	1675793	25 %	0 %	50 %	25 %	523514134
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32102	NC_021721	A	6	6	1675812	1675817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32103	NC_021721	T	6	6	1675855	1675860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32104	NC_021721	ATA	2	6	1675868	1675873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32105	NC_021721	AAT	2	6	1675888	1675893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514135
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32108	NC_021721	ATC	2	6	1676023	1676028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514135
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32110	NC_021721	CCACC	2	10	1676117	1676126	20 %	0 %	0 %	80 %	523514135
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32113	NC_021721	TCGC	2	8	1676222	1676229	0 %	25 %	25 %	50 %	523514135
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32115	NC_021721	GTC	2	6	1676341	1676346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514135
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32117	NC_021721	GTT	2	6	1676374	1676379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514135
32118	NC_021721	ACC	2	6	1676406	1676411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514135
32119	NC_021721	TGTC	2	8	1676414	1676421	0 %	50 %	25 %	25 %	523514135
32120	NC_021721	TCA	2	6	1676441	1676446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514135
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32128	NC_021721	ACC	2	6	1677022	1677027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32157	NC_021721	CGA	2	6	1679215	1679220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514137
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32162	NC_021721	GC	3	6	1679436	1679441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32163	NC_021721	AC	3	6	1679452	1679457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32164	NC_021721	A	7	7	1679612	1679618	100 %	0 %	0 %	0 %	523514138
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32211	NC_021721	TTCT	2	8	1681800	1681807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32212	NC_021721	TCC	3	9	1681857	1681865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514141
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32218	NC_021721	TAAAA	2	10	1682103	1682112	80 %	20 %	0 %	0 %	523514141
32219	NC_021721	TTTG	2	8	1682422	1682429	0 %	75 %	25 %	0 %	523514142
32220	NC_021721	TGTGA	2	10	1682452	1682461	20 %	40 %	40 %	0 %	523514142
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32224	NC_021721	TGC	2	6	1682600	1682605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514142
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32229	NC_021721	TTG	2	6	1682886	1682891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514142
32230	NC_021721	ATC	2	6	1682912	1682917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514142
32231	NC_021721	GCA	2	6	1682959	1682964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32232	NC_021721	GC	3	6	1683045	1683050	0 %	0 %	50 %	50 %	523514143
32233	NC_021721	ACAG	2	8	1683063	1683070	50 %	0 %	25 %	25 %	523514143
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32235	NC_021721	A	6	6	1683275	1683280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32341	NC_021721	CGT	2	6	1688577	1688582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514151
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32345	NC_021721	GTT	2	6	1688762	1688767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514151
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32347	NC_021721	ACAGGT	2	12	1688817	1688828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32348	NC_021721	GAC	2	6	1688845	1688850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32350	NC_021721	ACA	2	6	1688983	1688988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32351	NC_021721	TGT	2	6	1689011	1689016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514152
32352	NC_021721	ATT	2	6	1689136	1689141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32353	NC_021721	CTT	2	6	1689228	1689233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514153
32354	NC_021721	GCA	2	6	1689237	1689242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514153
32355	NC_021721	CGT	3	9	1689261	1689269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514153
32356	NC_021721	ATT	2	6	1689376	1689381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514153
32357	NC_021721	AAC	2	6	1689415	1689420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514153
32358	NC_021721	TCGA	2	8	1689433	1689440	25 %	25 %	25 %	25 %	523514153
32359	NC_021721	ATC	2	6	1689443	1689448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514153
32360	NC_021721	TCCT	2	8	1689539	1689546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32361	NC_021721	CAA	2	6	1689582	1689587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514154
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32364	NC_021721	T	6	6	1689811	1689816	0 %	100 %	0 %	0 %	523514154
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32369	NC_021721	C	6	6	1690057	1690062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32370	NC_021721	GCA	2	6	1690080	1690085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32371	NC_021721	TCA	2	6	1690128	1690133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514155
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32386	NC_021721	A	6	6	1691096	1691101	100 %	0 %	0 %	0 %	523514157
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32414	NC_021721	GCA	2	6	1693087	1693092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514157
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32417	NC_021721	CTGA	2	8	1693279	1693286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32418	NC_021721	TG	3	6	1693422	1693427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32419	NC_021721	AGG	2	6	1693453	1693458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32420	NC_021721	AGC	2	6	1693540	1693545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514158
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32425	NC_021721	TGA	2	6	1693774	1693779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514158
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32429	NC_021721	TAA	2	6	1693891	1693896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32430	NC_021721	AAC	2	6	1693897	1693902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32431	NC_021721	T	7	7	1693924	1693930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32432	NC_021721	A	6	6	1693954	1693959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32433	NC_021721	AGC	2	6	1694070	1694075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514159
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32439	NC_021721	T	7	7	1694187	1694193	0 %	100 %	0 %	0 %	523514160
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32444	NC_021721	AGAAA	2	10	1694672	1694681	80 %	0 %	20 %	0 %	523514161
32445	NC_021721	TACT	2	8	1694733	1694740	25 %	50 %	0 %	25 %	523514161
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32447	NC_021721	TGA	2	6	1694840	1694845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514161
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32449	NC_021721	A	7	7	1694875	1694881	100 %	0 %	0 %	0 %	523514161
32450	NC_021721	GAA	2	6	1694915	1694920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32451	NC_021721	TCA	2	6	1694988	1694993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514162
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32453	NC_021721	CTT	2	6	1695059	1695064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514162
32454	NC_021721	CGC	2	6	1695109	1695114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514162
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32456	NC_021721	TGC	2	6	1695394	1695399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514162
32457	NC_021721	ATC	2	6	1695407	1695412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514162
32458	NC_021721	GAA	2	6	1695413	1695418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514162
32459	NC_021721	AAT	2	6	1695478	1695483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514162
32460	NC_021721	CGC	2	6	1695499	1695504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514162
32461	NC_021721	T	6	6	1695634	1695639	0 %	100 %	0 %	0 %	523514162
32462	NC_021721	ATG	2	6	1695654	1695659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514162
32463	NC_021721	TCAAG	2	10	1695691	1695700	40 %	20 %	20 %	20 %	523514162
32464	NC_021721	GAC	2	6	1695728	1695733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514162
32465	NC_021721	GCA	2	6	1695742	1695747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514162
32466	NC_021721	CTG	2	6	1695937	1695942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514162
32467	NC_021721	TTGC	2	8	1696088	1696095	0 %	50 %	25 %	25 %	523514162
32468	NC_021721	TCA	2	6	1696102	1696107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514162
32469	NC_021721	CCTT	2	8	1696137	1696144	0 %	50 %	0 %	50 %	523514162
32470	NC_021721	ATC	2	6	1696329	1696334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514162
32471	NC_021721	CTGG	2	8	1696360	1696367	0 %	25 %	50 %	25 %	523514162
32472	NC_021721	GAT	2	6	1696400	1696405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514162
32473	NC_021721	TCA	2	6	1696413	1696418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514162
32474	NC_021721	GCC	2	6	1696500	1696505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514162
32475	NC_021721	GT	3	6	1696546	1696551	0 %	50 %	50 %	0 %	523514162
32476	NC_021721	CACGTT	2	12	1696630	1696641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523514162
32477	NC_021721	GAT	2	6	1696751	1696756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514162
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32480	NC_021721	TAT	2	6	1696850	1696855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32481	NC_021721	GCT	2	6	1696869	1696874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32482	NC_021721	A	6	6	1696952	1696957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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