MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_021721	ATC	2	6	1561545	1561550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514023
30003	NC_021721	TGC	2	6	1561556	1561561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514023
30004	NC_021721	GCC	2	6	1561580	1561585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514023
30005	NC_021721	T	6	6	1561604	1561609	0 %	100 %	0 %	0 %	523514023
30006	NC_021721	GAGC	2	8	1561636	1561643	25 %	0 %	50 %	25 %	523514023
30007	NC_021721	TTAG	2	8	1561644	1561651	25 %	50 %	25 %	0 %	523514023
30008	NC_021721	CTT	2	6	1561676	1561681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514023
30009	NC_021721	TGT	2	6	1561705	1561710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514023
30010	NC_021721	CAAG	2	8	1561729	1561736	50 %	0 %	25 %	25 %	523514023
30011	NC_021721	CCTT	2	8	1561791	1561798	0 %	50 %	0 %	50 %	523514023
30012	NC_021721	CGC	2	6	1561834	1561839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514023
30013	NC_021721	GCAC	2	8	1561956	1561963	25 %	0 %	25 %	50 %	523514023
30014	NC_021721	T	6	6	1561990	1561995	0 %	100 %	0 %	0 %	523514023
30015	NC_021721	T	6	6	1562001	1562006	0 %	100 %	0 %	0 %	523514023
30016	NC_021721	TTAGC	2	10	1562048	1562057	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30017	NC_021721	GAT	2	6	1562061	1562066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30018	NC_021721	AATG	2	8	1562149	1562156	50 %	25 %	25 %	0 %	523514024
30019	NC_021721	TGC	2	6	1562164	1562169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514024
30020	NC_021721	TTTG	2	8	1562221	1562228	0 %	75 %	25 %	0 %	523514024
30021	NC_021721	CCA	2	6	1562344	1562349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514024
30022	NC_021721	AAAAT	2	10	1562427	1562436	80 %	20 %	0 %	0 %	523514024
30023	NC_021721	TAA	2	6	1562455	1562460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514024
30024	NC_021721	ACGG	2	8	1562522	1562529	25 %	0 %	50 %	25 %	523514024
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30027	NC_021721	CGAT	2	8	1562625	1562632	25 %	25 %	25 %	25 %	523514024
30028	NC_021721	AGA	2	6	1562685	1562690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514024
30029	NC_021721	GCG	2	6	1562704	1562709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514024
30030	NC_021721	TTTGA	2	10	1562711	1562720	20 %	60 %	20 %	0 %	523514024
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30032	NC_021721	T	6	6	1562812	1562817	0 %	100 %	0 %	0 %	523514024
30033	NC_021721	ATA	2	6	1562819	1562824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514024
30034	NC_021721	TGC	2	6	1562883	1562888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514024
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30037	NC_021721	A	6	6	1563003	1563008	100 %	0 %	0 %	0 %	523514024
30038	NC_021721	TCA	2	6	1563070	1563075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514024
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30040	NC_021721	GTC	2	6	1563208	1563213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514025
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30042	NC_021721	CG	3	6	1563243	1563248	0 %	0 %	50 %	50 %	523514025
30043	NC_021721	ACC	2	6	1563251	1563256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514025
30044	NC_021721	CAA	2	6	1563312	1563317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514025
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30046	NC_021721	GCA	2	6	1563414	1563419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514025
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30048	NC_021721	ATG	2	6	1563611	1563616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514025
30049	NC_021721	GCC	2	6	1563629	1563634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514025
30050	NC_021721	TTCTA	2	10	1563894	1563903	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30051	NC_021721	CAG	2	6	1563958	1563963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514026
30052	NC_021721	TCT	2	6	1563968	1563973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514026
30053	NC_021721	ATTT	2	8	1563982	1563989	25 %	75 %	0 %	0 %	523514026
30054	NC_021721	TGT	2	6	1564021	1564026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514026
30055	NC_021721	CGT	2	6	1564045	1564050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514026
30056	NC_021721	GT	3	6	1564120	1564125	0 %	50 %	50 %	0 %	523514026
30057	NC_021721	CGG	2	6	1564165	1564170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514026
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30060	NC_021721	TCTT	2	8	1564203	1564210	0 %	75 %	0 %	25 %	523514026
30061	NC_021721	TGC	2	6	1564237	1564242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514026
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30071	NC_021721	CTG	2	6	1564936	1564941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514026
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30089	NC_021721	TGA	2	6	1566305	1566310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514029
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30102	NC_021721	CGA	2	6	1566853	1566858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514030
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30107	NC_021721	GTT	2	6	1567151	1567156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30109	NC_021721	A	6	6	1567204	1567209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30110	NC_021721	TGG	2	6	1567237	1567242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30112	NC_021721	T	7	7	1567287	1567293	0 %	100 %	0 %	0 %	523514031
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30116	NC_021721	TGCC	2	8	1567527	1567534	0 %	25 %	25 %	50 %	523514031
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30119	NC_021721	TCA	2	6	1567801	1567806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514031
30120	NC_021721	TGG	2	6	1567824	1567829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514031
30121	NC_021721	TCAG	2	8	1567855	1567862	25 %	25 %	25 %	25 %	523514031
30122	NC_021721	ATT	2	6	1567884	1567889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514031
30123	NC_021721	CAAAGC	2	12	1567897	1567908	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	523514031
30124	NC_021721	AAC	2	6	1567986	1567991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514031
30125	NC_021721	A	6	6	1568071	1568076	100 %	0 %	0 %	0 %	523514031
30126	NC_021721	TCC	2	6	1568383	1568388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30127	NC_021721	CTT	2	6	1568498	1568503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514032
30128	NC_021721	ATC	2	6	1568615	1568620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514032
30129	NC_021721	GGC	2	6	1568630	1568635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514032
30130	NC_021721	TTC	2	6	1568654	1568659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514032
30131	NC_021721	T	8	8	1568665	1568672	0 %	100 %	0 %	0 %	523514032
30132	NC_021721	TGA	2	6	1568746	1568751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514032
30133	NC_021721	CTTTG	2	10	1568772	1568781	0 %	60 %	20 %	20 %	523514032
30134	NC_021721	CCTTC	2	10	1568799	1568808	0 %	40 %	0 %	60 %	523514033
30135	NC_021721	CGG	2	6	1568859	1568864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514033
30136	NC_021721	TGG	2	6	1568937	1568942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514033
30137	NC_021721	TGG	2	6	1569054	1569059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514033
30138	NC_021721	ATC	2	6	1569116	1569121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514033
30139	NC_021721	TGC	2	6	1569195	1569200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514034
30140	NC_021721	AGCC	2	8	1569203	1569210	25 %	0 %	25 %	50 %	523514034
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30142	NC_021721	CTG	2	6	1569245	1569250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514034
30143	NC_021721	GCC	2	6	1569261	1569266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514034
30144	NC_021721	CGG	2	6	1569290	1569295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514034
30145	NC_021721	GTT	2	6	1569302	1569307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514034
30146	NC_021721	CATC	2	8	1569347	1569354	25 %	25 %	0 %	50 %	523514034
30147	NC_021721	CAA	2	6	1569497	1569502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514034
30148	NC_021721	CAA	2	6	1569597	1569602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514034
30149	NC_021721	CCG	2	6	1569631	1569636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514034
30150	NC_021721	CG	3	6	1569698	1569703	0 %	0 %	50 %	50 %	523514034
30151	NC_021721	AAG	2	6	1569727	1569732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514034
30152	NC_021721	T	6	6	1569819	1569824	0 %	100 %	0 %	0 %	523514034
30153	NC_021721	TTTG	2	8	1569888	1569895	0 %	75 %	25 %	0 %	523514035
30154	NC_021721	GAT	2	6	1569937	1569942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514035
30155	NC_021721	GCT	2	6	1569944	1569949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514035
30156	NC_021721	GCC	2	6	1569997	1570002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514035
30157	NC_021721	GAT	2	6	1570009	1570014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514035
30158	NC_021721	CAT	2	6	1570072	1570077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514035
30159	NC_021721	CGC	2	6	1570116	1570121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514035
30160	NC_021721	GTT	2	6	1570122	1570127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514035
30161	NC_021721	CTG	2	6	1570156	1570161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514035
30162	NC_021721	TGG	2	6	1570164	1570169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514035
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30164	NC_021721	GCC	2	6	1570351	1570356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514035
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30166	NC_021721	T	6	6	1570645	1570650	0 %	100 %	0 %	0 %	523514036
30167	NC_021721	ATT	2	6	1570676	1570681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514036
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30170	NC_021721	GCA	2	6	1570797	1570802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514036
30171	NC_021721	AGTC	2	8	1570864	1570871	25 %	25 %	25 %	25 %	523514036
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30174	NC_021721	AGC	2	6	1571084	1571089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514036
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30177	NC_021721	CAA	2	6	1571182	1571187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514036
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30179	NC_021721	ATG	2	6	1571300	1571305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514037
30180	NC_021721	GAA	2	6	1571369	1571374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514037
30181	NC_021721	TCT	2	6	1571376	1571381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523514037
30182	NC_021721	GCC	2	6	1571399	1571404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514037
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30184	NC_021721	TGGTG	2	10	1571584	1571593	0 %	40 %	60 %	0 %	523514037
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30188	NC_021721	TGA	2	6	1571815	1571820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514038
30189	NC_021721	TGAA	2	8	1571907	1571914	50 %	25 %	25 %	0 %	523514038
30190	NC_021721	GTG	2	6	1571947	1571952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514038
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30193	NC_021721	TCA	2	6	1572127	1572132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514038
30194	NC_021721	TGC	2	6	1572188	1572193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514038
30195	NC_021721	CG	3	6	1572195	1572200	0 %	0 %	50 %	50 %	523514038
30196	NC_021721	CAT	2	6	1572281	1572286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514038
30197	NC_021721	CG	4	8	1572287	1572294	0 %	0 %	50 %	50 %	523514038
30198	NC_021721	AATCG	2	10	1572336	1572345	40 %	20 %	20 %	20 %	523514038
30199	NC_021721	CGG	2	6	1572349	1572354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514038
30200	NC_021721	TCG	2	6	1572357	1572362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514038
30201	NC_021721	ATG	2	6	1572366	1572371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514038
30202	NC_021721	AGC	2	6	1572506	1572511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514038
30203	NC_021721	AT	3	6	1572536	1572541	50 %	50 %	0 %	0 %	523514038
30204	NC_021721	GCT	2	6	1572567	1572572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514038
30205	NC_021721	GCG	2	6	1572601	1572606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514038
30206	NC_021721	TCA	2	6	1572658	1572663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514038
30207	NC_021721	TGG	2	6	1572667	1572672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514038
30208	NC_021721	AGC	2	6	1572680	1572685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514038
30209	NC_021721	GCC	2	6	1572689	1572694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514038
30210	NC_021721	T	6	6	1572730	1572735	0 %	100 %	0 %	0 %	523514038
30211	NC_021721	ATG	2	6	1572744	1572749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514038
30212	NC_021721	CGA	2	6	1572766	1572771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514038
30213	NC_021721	TGA	2	6	1572792	1572797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514038
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30216	NC_021721	TTG	2	6	1573037	1573042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514038
30217	NC_021721	CCT	2	6	1573086	1573091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514039
30218	NC_021721	GGT	2	6	1573212	1573217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514039
30219	NC_021721	AGTG	2	8	1573273	1573280	25 %	25 %	50 %	0 %	523514039
30220	NC_021721	TGA	2	6	1573308	1573313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514039
30221	NC_021721	ATC	2	6	1573585	1573590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514039
30222	NC_021721	CCT	2	6	1573718	1573723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523514040
30223	NC_021721	ATCA	2	8	1573734	1573741	50 %	25 %	0 %	25 %	523514040
30224	NC_021721	GTG	2	6	1573816	1573821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514040
30225	NC_021721	GCT	2	6	1573831	1573836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523514040
30226	NC_021721	CAA	2	6	1573947	1573952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514040
30227	NC_021721	TTG	2	6	1573956	1573961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514040
30228	NC_021721	CCG	2	6	1573990	1573995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523514040
30229	NC_021721	GAA	2	6	1574034	1574039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514040
30230	NC_021721	TAA	2	6	1574050	1574055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523514040
30231	NC_021721	TGG	2	6	1574061	1574066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523514040
30232	NC_021721	GATC	2	8	1574078	1574085	25 %	25 %	25 %	25 %	523514040
30233	NC_021721	TTG	2	6	1574130	1574135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523514040
30234	NC_021721	GAA	2	6	1574234	1574239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523514040
30235	NC_021721	GCG	2	6	1574264	1574269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514040
30236	NC_021721	AAAG	2	8	1574304	1574311	75 %	0 %	25 %	0 %	523514040
30237	NC_021721	CAT	2	6	1574336	1574341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514040
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30248	NC_021721	A	8	8	1574948	1574955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30249	NC_021721	CGAAAA	2	12	1574963	1574974	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30250	NC_021721	A	6	6	1574971	1574976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30251	NC_021721	ACC	2	6	1575006	1575011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30254	NC_021721	CTTA	2	8	1575116	1575123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30255	NC_021721	TG	3	6	1575146	1575151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30256	NC_021721	CT	3	6	1575188	1575193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30257	NC_021721	GATCAG	2	12	1575197	1575208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30258	NC_021721	TGTT	2	8	1575234	1575241	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30259	NC_021721	ATA	2	6	1575254	1575259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30264	NC_021721	ATG	2	6	1575352	1575357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30265	NC_021721	T	7	7	1575358	1575364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30266	NC_021721	ATT	3	9	1575381	1575389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30268	NC_021721	AGT	2	6	1575463	1575468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514041
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30284	NC_021721	TTAA	2	8	1576670	1576677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30323	NC_021721	CCATG	2	10	1578745	1578754	20 %	20 %	20 %	40 %	523514044
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30345	NC_021721	GCAA	2	8	1580001	1580008	50 %	0 %	25 %	25 %	523514044
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30347	NC_021721	A	6	6	1580018	1580023	100 %	0 %	0 %	0 %	523514044
30348	NC_021721	TGGG	2	8	1580087	1580094	0 %	25 %	75 %	0 %	523514044
30349	NC_021721	ATC	2	6	1580189	1580194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523514044
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30352	NC_021721	AT	3	6	1580514	1580519	50 %	50 %	0 %	0 %	523514045
30353	NC_021721	ACG	2	6	1580603	1580608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514045
30354	NC_021721	ATT	2	6	1580611	1580616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514045
30355	NC_021721	ACC	2	6	1580739	1580744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523514045
30356	NC_021721	A	7	7	1580800	1580806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30357	NC_021721	T	6	6	1580829	1580834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30358	NC_021721	ACA	2	6	1580862	1580867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523514046
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30454	NC_021721	ATT	2	6	1585948	1585953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523514050
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30464	NC_021721	GTA	2	6	1586278	1586283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523514050
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30466	NC_021721	AGC	2	6	1586326	1586331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523514050
30467	NC_021721	CGG	2	6	1586414	1586419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523514050
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30469	NC_021721	ACTC	2	8	1586512	1586519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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