MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23003	NC_021721	TTG	2	6	1196570	1196575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513654
23004	NC_021721	TA	3	6	1196591	1196596	50 %	50 %	0 %	0 %	523513654
23005	NC_021721	GAT	2	6	1196611	1196616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513654
23006	NC_021721	CAG	2	6	1196649	1196654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513654
23007	NC_021721	GATT	2	8	1196709	1196716	25 %	50 %	25 %	0 %	523513654
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23009	NC_021721	GTT	3	9	1196794	1196802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513654
23010	NC_021721	GGC	2	6	1196830	1196835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513654
23011	NC_021721	CAG	2	6	1196906	1196911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513654
23012	NC_021721	AG	3	6	1196953	1196958	50 %	0 %	50 %	0 %	523513655
23013	NC_021721	GCT	2	6	1197008	1197013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513655
23014	NC_021721	ACC	2	6	1197022	1197027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513655
23015	NC_021721	GCT	2	6	1197069	1197074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513655
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23017	NC_021721	GC	3	6	1197301	1197306	0 %	0 %	50 %	50 %	523513655
23018	NC_021721	GTG	2	6	1197321	1197326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513655
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23020	NC_021721	CTG	2	6	1197442	1197447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513655
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23022	NC_021721	CAT	2	6	1197467	1197472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513655
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23024	NC_021721	CTG	2	6	1197652	1197657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513655
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23039	NC_021721	CT	3	6	1198747	1198752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23040	NC_021721	GCAA	2	8	1198792	1198799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23041	NC_021721	GCTT	2	8	1198807	1198814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23042	NC_021721	AGG	2	6	1198853	1198858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_021721	CGA	2	6	1198876	1198881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23045	NC_021721	GAT	2	6	1198927	1198932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513657
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23083	NC_021721	TAAA	2	8	1200830	1200837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23084	NC_021721	TAG	2	6	1200846	1200851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23085	NC_021721	TG	3	6	1200885	1200890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23086	NC_021721	TTA	2	6	1200895	1200900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23106	NC_021721	GT	3	6	1201946	1201951	0 %	50 %	50 %	0 %	523513658
23107	NC_021721	GTT	2	6	1201961	1201966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513658
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23109	NC_021721	GAT	3	9	1202057	1202065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513658
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23112	NC_021721	A	7	7	1202360	1202366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23113	NC_021721	T	6	6	1202430	1202435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23114	NC_021721	CCAG	2	8	1202470	1202477	25 %	0 %	25 %	50 %	523513659
23115	NC_021721	TCA	2	6	1202564	1202569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513659
23116	NC_021721	GGC	2	6	1202613	1202618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513659
23117	NC_021721	CAT	2	6	1202640	1202645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513659
23118	NC_021721	TGA	2	6	1202646	1202651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513659
23119	NC_021721	CAA	2	6	1202653	1202658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513659
23120	NC_021721	AGC	2	6	1202779	1202784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513659
23121	NC_021721	TCA	2	6	1202795	1202800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513659
23122	NC_021721	ATA	2	6	1202827	1202832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513659
23123	NC_021721	ATA	2	6	1202847	1202852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513659
23124	NC_021721	CGT	2	6	1202862	1202867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513659
23125	NC_021721	CCT	2	6	1202901	1202906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23126	NC_021721	TTGA	2	8	1202965	1202972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23127	NC_021721	CAGA	2	8	1203001	1203008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23128	NC_021721	A	7	7	1203011	1203017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23129	NC_021721	AT	3	6	1203030	1203035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23130	NC_021721	GCA	2	6	1203086	1203091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23131	NC_021721	TGGCA	2	10	1203094	1203103	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23132	NC_021721	ATT	2	6	1203132	1203137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23133	NC_021721	GA	3	6	1203182	1203187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23134	NC_021721	TGGC	2	8	1203246	1203253	0 %	25 %	50 %	25 %	523513660
23135	NC_021721	TGG	2	6	1203256	1203261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513660
23136	NC_021721	GGC	2	6	1203299	1203304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513660
23137	NC_021721	GGC	2	6	1203329	1203334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513660
23138	NC_021721	ATG	2	6	1203357	1203362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513660
23139	NC_021721	TCA	2	6	1203402	1203407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513660
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23141	NC_021721	GCT	2	6	1203516	1203521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513660
23142	NC_021721	GCC	2	6	1203539	1203544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513660
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23144	NC_021721	TAAA	2	8	1203710	1203717	75 %	25 %	0 %	0 %	523513660
23145	NC_021721	AAC	2	6	1203741	1203746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513660
23146	NC_021721	GAA	2	6	1203842	1203847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513660
23147	NC_021721	GTT	2	6	1203879	1203884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513660
23148	NC_021721	GCT	2	6	1203904	1203909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513660
23149	NC_021721	ATG	2	6	1204001	1204006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513660
23150	NC_021721	GCA	2	6	1204034	1204039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513660
23151	NC_021721	T	6	6	1204172	1204177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23152	NC_021721	CAA	2	6	1204215	1204220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23153	NC_021721	A	6	6	1204276	1204281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23154	NC_021721	TCT	2	6	1204338	1204343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513661
23155	NC_021721	CTG	2	6	1204365	1204370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513661
23156	NC_021721	GA	3	6	1204381	1204386	50 %	0 %	50 %	0 %	523513661
23157	NC_021721	GCA	2	6	1204404	1204409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513661
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23159	NC_021721	TGATC	2	10	1204512	1204521	20 %	40 %	20 %	20 %	523513661
23160	NC_021721	GTTT	2	8	1204583	1204590	0 %	75 %	25 %	0 %	523513661
23161	NC_021721	GGCTTC	2	12	1204594	1204605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513661
23162	NC_021721	ATG	2	6	1204673	1204678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513661
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23172	NC_021721	CAT	2	6	1205418	1205423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513662
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23174	NC_021721	TCA	2	6	1205516	1205521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513662
23175	NC_021721	TGG	2	6	1205561	1205566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23176	NC_021721	TCA	2	6	1205572	1205577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23177	NC_021721	GAC	2	6	1205641	1205646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23178	NC_021721	A	7	7	1205788	1205794	100 %	0 %	0 %	0 %	523513663
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23181	NC_021721	GAT	2	6	1205991	1205996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23182	NC_021721	GAG	2	6	1206019	1206024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23183	NC_021721	TCA	2	6	1206074	1206079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513664
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23187	NC_021721	GCA	3	9	1206235	1206243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513664
23188	NC_021721	GCA	2	6	1206277	1206282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513664
23189	NC_021721	TGA	2	6	1206290	1206295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513664
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23191	NC_021721	AAG	2	6	1206468	1206473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513664
23192	NC_021721	CA	3	6	1206479	1206484	50 %	0 %	0 %	50 %	523513664
23193	NC_021721	GCA	2	6	1206524	1206529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513664
23194	NC_021721	ATC	2	6	1206535	1206540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513664
23195	NC_021721	CAC	2	6	1206604	1206609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513664
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23197	NC_021721	CGCA	2	8	1206691	1206698	25 %	0 %	25 %	50 %	523513664
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23200	NC_021721	ATA	2	6	1206879	1206884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23201	NC_021721	GAA	2	6	1206905	1206910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513665
23202	NC_021721	TTG	2	6	1206925	1206930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513665
23203	NC_021721	GGC	2	6	1206951	1206956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513665
23204	NC_021721	TGG	2	6	1206983	1206988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513665
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23207	NC_021721	ATG	2	6	1207090	1207095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513665
23208	NC_021721	GCA	2	6	1207109	1207114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513665
23209	NC_021721	GACC	2	8	1207137	1207144	25 %	0 %	25 %	50 %	523513665
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23211	NC_021721	A	6	6	1207185	1207190	100 %	0 %	0 %	0 %	523513665
23212	NC_021721	GCG	2	6	1207236	1207241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513665
23213	NC_021721	T	6	6	1207347	1207352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23214	NC_021721	CAG	2	6	1207371	1207376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23215	NC_021721	TGA	2	6	1207463	1207468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23216	NC_021721	AAT	2	6	1207486	1207491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513666
23217	NC_021721	TCG	2	6	1207514	1207519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513666
23218	NC_021721	TCG	2	6	1207541	1207546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513666
23219	NC_021721	TGA	2	6	1207551	1207556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513666
23220	NC_021721	ATGG	2	8	1207594	1207601	25 %	25 %	50 %	0 %	523513666
23221	NC_021721	CGA	2	6	1207608	1207613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513666
23222	NC_021721	TGT	2	6	1207632	1207637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513666
23223	NC_021721	TTG	2	6	1207682	1207687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513666
23224	NC_021721	TTC	2	6	1207724	1207729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513666
23225	NC_021721	GCCAAT	2	12	1207730	1207741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523513666
23226	NC_021721	TGA	3	9	1207772	1207780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513666
23227	NC_021721	A	6	6	1207814	1207819	100 %	0 %	0 %	0 %	523513666
23228	NC_021721	T	6	6	1207844	1207849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23229	NC_021721	CATTA	2	10	1207850	1207859	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23230	NC_021721	AAT	2	6	1207925	1207930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23231	NC_021721	GCGT	2	8	1208001	1208008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23232	NC_021721	TGA	2	6	1208018	1208023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23233	NC_021721	A	6	6	1208109	1208114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23234	NC_021721	GGC	2	6	1208224	1208229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513667
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23333	NC_021721	TAT	2	6	1213336	1213341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513672
23334	NC_021721	AAG	2	6	1213343	1213348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513672
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23340	NC_021721	TGG	2	6	1213808	1213813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513672
23341	NC_021721	GGT	2	6	1213837	1213842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513672
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23347	NC_021721	TGA	2	6	1214076	1214081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513672
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23350	NC_021721	CGG	2	6	1214313	1214318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513673
23351	NC_021721	ACG	2	6	1214360	1214365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513674
23352	NC_021721	CAT	2	6	1214410	1214415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513674
23353	NC_021721	CGTG	2	8	1214424	1214431	0 %	25 %	50 %	25 %	523513674
23354	NC_021721	TTGA	2	8	1214437	1214444	25 %	50 %	25 %	0 %	523513674
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23378	NC_021721	TAAA	2	8	1215660	1215667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23379	NC_021721	A	6	6	1215696	1215701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23380	NC_021721	A	7	7	1215709	1215715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23381	NC_021721	TTTG	2	8	1215732	1215739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23382	NC_021721	TTTC	2	8	1215749	1215756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23383	NC_021721	TGGAG	2	10	1215804	1215813	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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23467	NC_021721	CTT	2	6	1219883	1219888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513678
23468	NC_021721	AAT	2	6	1219890	1219895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513678
23469	NC_021721	GTT	2	6	1219911	1219916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513678
23470	NC_021721	TCC	2	6	1219967	1219972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23471	NC_021721	ACCGAC	2	12	1220101	1220112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23472	NC_021721	AACC	2	8	1220120	1220127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23473	NC_021721	TGT	2	6	1220141	1220146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23474	NC_021721	TGT	2	6	1220475	1220480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513679
23475	NC_021721	TGA	2	6	1220610	1220615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513679
23476	NC_021721	GTT	2	6	1220620	1220625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513679
23477	NC_021721	ATCGG	2	10	1220630	1220639	20 %	20 %	40 %	20 %	523513679
23478	NC_021721	GCT	2	6	1220650	1220655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513679
23479	NC_021721	GAT	2	6	1220674	1220679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513679
23480	NC_021721	GAT	2	6	1220817	1220822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513679
23481	NC_021721	TAC	2	6	1220878	1220883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513679
23482	NC_021721	CTG	2	6	1220888	1220893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513679
23483	NC_021721	GCA	2	6	1220897	1220902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513679
23484	NC_021721	TCA	2	6	1220930	1220935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513679
23485	NC_021721	TGA	2	6	1220979	1220984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513679
23486	NC_021721	AAT	2	6	1221026	1221031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513679
23487	NC_021721	A	6	6	1221069	1221074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23488	NC_021721	CGA	2	6	1221083	1221088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23489	NC_021721	AGCG	2	8	1221219	1221226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23490	NC_021721	AAAGG	2	10	1221282	1221291	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23491	NC_021721	ATT	2	6	1221420	1221425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513680
23492	NC_021721	GGC	2	6	1221467	1221472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513680
23493	NC_021721	CGA	2	6	1221590	1221595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513680
23494	NC_021721	CCA	2	6	1221619	1221624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513680
23495	NC_021721	CAC	2	6	1221643	1221648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513680
23496	NC_021721	TGG	2	6	1221658	1221663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513680
23497	NC_021721	ATT	2	6	1221670	1221675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513680
23498	NC_021721	CG	3	6	1221708	1221713	0 %	0 %	50 %	50 %	523513680
23499	NC_021721	ATT	2	6	1221803	1221808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513680
23500	NC_021721	TAT	3	9	1221930	1221938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513680

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