MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22553	NC_021721	ATGC	2	8	1173672	1173679	25 %	25 %	25 %	25 %	523513631
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22613	NC_021721	ATC	2	6	1176329	1176334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22616	NC_021721	TA	3	6	1176431	1176436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22618	NC_021721	ATA	2	6	1176499	1176504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22735	NC_021721	TTG	2	6	1181885	1181890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513642
22736	NC_021721	GCTG	2	8	1181895	1181902	0 %	25 %	50 %	25 %	523513642
22737	NC_021721	AGC	2	6	1181909	1181914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513642
22738	NC_021721	GTC	2	6	1182032	1182037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513642
22739	NC_021721	CAT	2	6	1182082	1182087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513642
22740	NC_021721	TCC	2	6	1182099	1182104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523513643
22741	NC_021721	GCA	2	6	1182123	1182128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513643
22742	NC_021721	CG	3	6	1182166	1182171	0 %	0 %	50 %	50 %	523513643
22743	NC_021721	TCA	2	6	1182222	1182227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513643
22744	NC_021721	TTTG	2	8	1182283	1182290	0 %	75 %	25 %	0 %	523513643
22745	NC_021721	CGG	3	9	1182313	1182321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513643
22746	NC_021721	GTC	2	6	1182348	1182353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513643
22747	NC_021721	TGT	2	6	1182371	1182376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513643
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22752	NC_021721	GTCA	2	8	1182584	1182591	25 %	25 %	25 %	25 %	523513643
22753	NC_021721	GGT	2	6	1182617	1182622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513643
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22755	NC_021721	AG	3	6	1182659	1182664	50 %	0 %	50 %	0 %	523513643
22756	NC_021721	CGT	2	6	1182692	1182697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513643
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22760	NC_021721	CCAA	2	8	1182868	1182875	50 %	0 %	0 %	50 %	523513643
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22764	NC_021721	A	6	6	1183053	1183058	100 %	0 %	0 %	0 %	523513644
22765	NC_021721	TGAT	2	8	1183087	1183094	25 %	50 %	25 %	0 %	523513644
22766	NC_021721	CAA	2	6	1183191	1183196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513644
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22769	NC_021721	GCC	2	6	1183217	1183222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513644
22770	NC_021721	TGC	2	6	1183245	1183250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22771	NC_021721	GGA	3	9	1183295	1183303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22772	NC_021721	AG	4	8	1183387	1183394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22773	NC_021721	GCG	2	6	1183403	1183408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22774	NC_021721	GTG	2	6	1183418	1183423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22776	NC_021721	CGC	2	6	1183528	1183533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22777	NC_021721	CTCC	2	8	1183632	1183639	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22778	NC_021721	ATGA	2	8	1183731	1183738	50 %	25 %	25 %	0 %	523513645
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22791	NC_021721	ATG	2	6	1184593	1184598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513645
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22800	NC_021721	GATTC	2	10	1185265	1185274	20 %	40 %	20 %	20 %	523513645
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22817	NC_021721	GAA	2	6	1186049	1186054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513646
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22822	NC_021721	GTTGA	2	10	1186373	1186382	20 %	40 %	40 %	0 %	523513646
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22833	NC_021721	TCAT	2	8	1186995	1187002	25 %	50 %	0 %	25 %	523513646
22834	NC_021721	ATT	2	6	1187174	1187179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513646
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22837	NC_021721	TAA	2	6	1187503	1187508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513646
22838	NC_021721	CAA	2	6	1187524	1187529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513646
22839	NC_021721	TTGGG	2	10	1187562	1187571	0 %	40 %	60 %	0 %	523513646
22840	NC_021721	GCC	2	6	1187594	1187599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513646
22841	NC_021721	ATC	2	6	1187631	1187636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513646
22842	NC_021721	TGA	2	6	1187637	1187642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513646
22843	NC_021721	GACC	2	8	1187784	1187791	25 %	0 %	25 %	50 %	523513646
22844	NC_021721	TTG	2	6	1187814	1187819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513646
22845	NC_021721	AGC	2	6	1187880	1187885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513646
22846	NC_021721	CCT	2	6	1187935	1187940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523513646
22847	NC_021721	ATGA	2	8	1188002	1188009	50 %	25 %	25 %	0 %	523513646
22848	NC_021721	GAA	2	6	1188052	1188057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513647
22849	NC_021721	GCTG	2	8	1188076	1188083	0 %	25 %	50 %	25 %	523513647
22850	NC_021721	GTT	2	6	1188094	1188099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513647
22851	NC_021721	AGC	2	6	1188100	1188105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513647
22852	NC_021721	GCA	3	9	1188132	1188140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513647
22853	NC_021721	ACC	2	6	1188173	1188178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513647
22854	NC_021721	ATA	2	6	1188189	1188194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513647
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22857	NC_021721	GCA	2	6	1188259	1188264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513647
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22860	NC_021721	GTT	2	6	1188373	1188378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513647
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22864	NC_021721	GTC	2	6	1188677	1188682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513647
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22872	NC_021721	GCAA	2	8	1189073	1189080	50 %	0 %	25 %	25 %	523513647
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22930	NC_021721	TGT	2	6	1192502	1192507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22959	NC_021721	TGATGG	2	12	1193701	1193712	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	523513652
22960	NC_021721	A	6	6	1193875	1193880	100 %	0 %	0 %	0 %	523513653
22961	NC_021721	A	6	6	1194069	1194074	100 %	0 %	0 %	0 %	523513653
22962	NC_021721	TGC	2	6	1194094	1194099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513653
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22965	NC_021721	TGG	2	6	1194265	1194270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513653
22966	NC_021721	ATG	2	6	1194307	1194312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513653
22967	NC_021721	GC	3	6	1194314	1194319	0 %	0 %	50 %	50 %	523513653
22968	NC_021721	TAA	2	6	1194320	1194325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513653
22969	NC_021721	CAT	2	6	1194341	1194346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513653
22970	NC_021721	GAT	3	9	1194374	1194382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513653
22971	NC_021721	CAGT	2	8	1194586	1194593	25 %	25 %	25 %	25 %	523513653
22972	NC_021721	GCT	2	6	1194648	1194653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513653
22973	NC_021721	CTG	2	6	1194763	1194768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513653
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22975	NC_021721	CCG	2	6	1194897	1194902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513653
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22977	NC_021721	GCT	2	6	1195007	1195012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513653
22978	NC_021721	GCC	2	6	1195014	1195019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513653
22979	NC_021721	CCAG	2	8	1195043	1195050	25 %	0 %	25 %	50 %	523513653
22980	NC_021721	GCA	2	6	1195070	1195075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513653
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22982	NC_021721	ATTG	2	8	1195160	1195167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22983	NC_021721	GTG	2	6	1195286	1195291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22984	NC_021721	CCACT	2	10	1195356	1195365	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22985	NC_021721	CAC	2	6	1195377	1195382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22988	NC_021721	ACTG	2	8	1195481	1195488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22989	NC_021721	CCA	2	6	1195529	1195534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22990	NC_021721	GCA	2	6	1195711	1195716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513654
22991	NC_021721	AAC	2	6	1195792	1195797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513654
22992	NC_021721	GGTG	2	8	1195892	1195899	0 %	25 %	75 %	0 %	523513654
22993	NC_021721	ATGG	2	8	1195986	1195993	25 %	25 %	50 %	0 %	523513654
22994	NC_021721	CTG	2	6	1196006	1196011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513654
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22997	NC_021721	TGC	2	6	1196166	1196171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513654
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22999	NC_021721	TTG	2	6	1196237	1196242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513654
23000	NC_021721	TGCGAC	2	12	1196269	1196280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523513654

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