MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16005	NC_021721	GAA	2	6	825884	825889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513291
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16069	NC_021721	A	6	6	828889	828894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16122	NC_021721	AAG	2	6	831271	831276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_021721	AGG	2	6	831330	831335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_021721	AAG	2	6	831385	831390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513298
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16147	NC_021721	TGA	2	6	832860	832865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513300
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16242	NC_021721	AGCACA	2	12	837580	837591	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	523513308
16243	NC_021721	GGT	2	6	837616	837621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513308
16244	NC_021721	TCAAA	2	10	837647	837656	60 %	20 %	0 %	20 %	523513308
16245	NC_021721	A	6	6	837707	837712	100 %	0 %	0 %	0 %	523513308
16246	NC_021721	TGG	2	6	837713	837718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513308
16247	NC_021721	GTA	2	6	837729	837734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513308
16248	NC_021721	ACT	2	6	837753	837758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513308
16249	NC_021721	A	6	6	837813	837818	100 %	0 %	0 %	0 %	523513308
16250	NC_021721	ATC	2	6	837895	837900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513308
16251	NC_021721	GCA	2	6	837938	837943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513308
16252	NC_021721	ACC	2	6	838046	838051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513308
16253	NC_021721	ATT	2	6	838155	838160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513309
16254	NC_021721	GCC	2	6	838164	838169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513309
16255	NC_021721	CTGC	2	8	838389	838396	0 %	25 %	25 %	50 %	523513309
16256	NC_021721	TCAA	2	8	838439	838446	50 %	25 %	0 %	25 %	523513309
16257	NC_021721	AAC	2	6	838525	838530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513309
16258	NC_021721	GC	3	6	838540	838545	0 %	0 %	50 %	50 %	523513309
16259	NC_021721	ACA	2	6	838602	838607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513309
16260	NC_021721	TGA	2	6	838656	838661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513309
16261	NC_021721	GAT	2	6	838705	838710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513309
16262	NC_021721	GCCA	2	8	838714	838721	25 %	0 %	25 %	50 %	523513309
16263	NC_021721	CG	3	6	838739	838744	0 %	0 %	50 %	50 %	523513309
16264	NC_021721	CGG	2	6	838752	838757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513309
16265	NC_021721	TCC	2	6	838779	838784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16266	NC_021721	TCA	2	6	838841	838846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513310
16267	NC_021721	GCAG	2	8	838881	838888	25 %	0 %	50 %	25 %	523513310
16268	NC_021721	GGC	2	6	838891	838896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513310
16269	NC_021721	CAT	2	6	838910	838915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513310
16270	NC_021721	CAT	2	6	838920	838925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513310
16271	NC_021721	GTCA	2	8	838930	838937	25 %	25 %	25 %	25 %	523513310
16272	NC_021721	T	6	6	838945	838950	0 %	100 %	0 %	0 %	523513310
16273	NC_021721	TCA	2	6	838955	838960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513310
16274	NC_021721	T	6	6	839018	839023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16275	NC_021721	GCT	2	6	839065	839070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513311
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16278	NC_021721	TAT	2	6	839172	839177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513311
16279	NC_021721	TGA	2	6	839233	839238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513311
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16281	NC_021721	TTGG	2	8	839250	839257	0 %	50 %	50 %	0 %	523513311
16282	NC_021721	GCT	2	6	839275	839280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513311
16283	NC_021721	GCTG	2	8	839299	839306	0 %	25 %	50 %	25 %	523513311
16284	NC_021721	TTC	2	6	839348	839353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513311
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16286	NC_021721	GTT	2	6	839425	839430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513311
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16290	NC_021721	CTG	3	9	839795	839803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513311
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16293	NC_021721	CCT	2	6	839950	839955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16294	NC_021721	TAACC	2	10	840027	840036	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16295	NC_021721	GGT	2	6	840132	840137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513312
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16300	NC_021721	GGC	2	6	840260	840265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513312
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16302	NC_021721	CGT	2	6	840400	840405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513312
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16314	NC_021721	GATA	2	8	841013	841020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16315	NC_021721	TAA	2	6	841026	841031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16316	NC_021721	CGA	2	6	841278	841283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513314
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16319	NC_021721	GATT	2	8	841377	841384	25 %	50 %	25 %	0 %	523513314
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16330	NC_021721	CGG	2	6	841793	841798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513314
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16340	NC_021721	TG	3	6	842166	842171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16341	NC_021721	CGTC	2	8	842172	842179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16342	NC_021721	GGCC	2	8	842219	842226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16343	NC_021721	TGACA	2	10	842313	842322	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16344	NC_021721	TGC	2	6	842354	842359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513315
16345	NC_021721	GCG	2	6	842386	842391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513315
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16347	NC_021721	A	6	6	842480	842485	100 %	0 %	0 %	0 %	523513315
16348	NC_021721	CCA	2	6	842505	842510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513315
16349	NC_021721	AAG	2	6	842518	842523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513315
16350	NC_021721	TGT	2	6	842570	842575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513315
16351	NC_021721	TAA	2	6	842694	842699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513315
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16353	NC_021721	AGT	2	6	842892	842897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513315
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16355	NC_021721	TGG	2	6	842908	842913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513315
16356	NC_021721	TTG	2	6	842930	842935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513315
16357	NC_021721	CTG	2	6	842956	842961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513315
16358	NC_021721	CTG	2	6	842974	842979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513315
16359	NC_021721	TGC	2	6	842998	843003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513315
16360	NC_021721	TGA	2	6	843038	843043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513315
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16362	NC_021721	GGT	2	6	843100	843105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513315
16363	NC_021721	GTTG	2	8	843110	843117	0 %	50 %	50 %	0 %	523513315
16364	NC_021721	CTGCT	2	10	843130	843139	0 %	40 %	20 %	40 %	523513315
16365	NC_021721	GT	3	6	843192	843197	0 %	50 %	50 %	0 %	523513315
16366	NC_021721	AGA	2	6	843235	843240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16367	NC_021721	CTG	2	6	843282	843287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16368	NC_021721	CTG	2	6	843324	843329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16369	NC_021721	AGA	2	6	843333	843338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16370	NC_021721	GCTG	2	8	843369	843376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16371	NC_021721	GCA	2	6	843403	843408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16372	NC_021721	TCGCAG	2	12	843518	843529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16379	NC_021721	GC	3	6	844026	844031	0 %	0 %	50 %	50 %	523513316
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16392	NC_021721	TCCA	2	8	844752	844759	25 %	25 %	0 %	50 %	523513316
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16423	NC_021721	CTT	2	6	846335	846340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16424	NC_021721	T	8	8	846339	846346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16425	NC_021721	TGA	2	6	846360	846365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513318
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16483	NC_021721	ATC	2	6	849040	849045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513321
16484	NC_021721	TCA	2	6	849151	849156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513321
16485	NC_021721	TTG	2	6	849160	849165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513321
16486	NC_021721	GCGTTT	2	12	849180	849191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	523513321
16487	NC_021721	ATT	2	6	849328	849333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513321
16488	NC_021721	GTT	2	6	849375	849380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513321
16489	NC_021721	CATC	2	8	849389	849396	25 %	25 %	0 %	50 %	523513321
16490	NC_021721	GTT	2	6	849428	849433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513321
16491	NC_021721	TAG	2	6	849446	849451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513321
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