MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021721	CA	3	6	616492	616497	50 %	0 %	0 %	50 %	523513083
12002	NC_021721	AATT	2	8	616565	616572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_021721	TA	3	6	616594	616599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_021721	AAC	2	6	616605	616610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_021721	TTGA	2	8	616744	616751	25 %	50 %	25 %	0 %	523513084
12006	NC_021721	GAA	2	6	616789	616794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513084
12007	NC_021721	TCCT	2	8	616800	616807	0 %	50 %	0 %	50 %	523513084
12008	NC_021721	GGC	2	6	616833	616838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513084
12009	NC_021721	ATC	2	6	616856	616861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513084
12010	NC_021721	CTG	2	6	616868	616873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513084
12011	NC_021721	GAA	2	6	616924	616929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513084
12012	NC_021721	GCG	2	6	616948	616953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513084
12013	NC_021721	CTT	2	6	616983	616988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513084
12014	NC_021721	AAT	2	6	617002	617007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513084
12015	NC_021721	GAG	2	6	617027	617032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_021721	GGA	2	6	617069	617074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513085
12017	NC_021721	ATT	2	6	617078	617083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513085
12018	NC_021721	TCA	2	6	617222	617227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513085
12019	NC_021721	GAG	2	6	617238	617243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513085
12020	NC_021721	GGAC	2	8	617405	617412	25 %	0 %	50 %	25 %	523513085
12021	NC_021721	CA	3	6	617420	617425	50 %	0 %	0 %	50 %	523513085
12022	NC_021721	GCA	2	6	617489	617494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513085
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12025	NC_021721	GCG	2	6	617548	617553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513085
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12027	NC_021721	ACTG	2	8	617603	617610	25 %	25 %	25 %	25 %	523513085
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12030	NC_021721	AAG	2	6	617708	617713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513085
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12041	NC_021721	GGCG	2	8	618397	618404	0 %	0 %	75 %	25 %	523513086
12042	NC_021721	GA	3	6	618488	618493	50 %	0 %	50 %	0 %	523513086
12043	NC_021721	ATG	2	6	618527	618532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513086
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12057	NC_021721	TC	3	6	619613	619618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12058	NC_021721	TGT	2	6	619868	619873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513088
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12062	NC_021721	GC	3	6	620027	620032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12063	NC_021721	GT	3	6	620095	620100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12066	NC_021721	T	6	6	620205	620210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12121	NC_021721	GAT	2	6	622965	622970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513094
12122	NC_021721	GGA	2	6	623138	623143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513094
12123	NC_021721	ATG	2	6	623533	623538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513094
12124	NC_021721	ACAA	2	8	623543	623550	75 %	0 %	0 %	25 %	523513094
12125	NC_021721	CAA	2	6	623619	623624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513094
12126	NC_021721	ACA	2	6	623700	623705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513094
12127	NC_021721	GAC	2	6	623771	623776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513094
12128	NC_021721	ACA	2	6	623987	623992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513094
12129	NC_021721	AGG	2	6	624025	624030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513094
12130	NC_021721	CAT	2	6	624032	624037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513095
12131	NC_021721	ATC	2	6	624145	624150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513095
12132	NC_021721	AAG	2	6	624162	624167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513095
12133	NC_021721	GT	3	6	624268	624273	0 %	50 %	50 %	0 %	523513095
12134	NC_021721	GCC	2	6	624318	624323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513095
12135	NC_021721	TGA	2	6	624362	624367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513095
12136	NC_021721	CTAA	2	8	624372	624379	50 %	25 %	0 %	25 %	523513095
12137	NC_021721	CCA	2	6	624381	624386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513095
12138	NC_021721	AGG	2	6	624440	624445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513095
12139	NC_021721	AGG	2	6	624454	624459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513095
12140	NC_021721	GCGA	2	8	624466	624473	25 %	0 %	50 %	25 %	523513096
12141	NC_021721	ACC	2	6	624527	624532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513096
12142	NC_021721	TCGG	2	8	624545	624552	0 %	25 %	50 %	25 %	523513096
12143	NC_021721	GTG	2	6	624586	624591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513096
12144	NC_021721	TTG	2	6	624737	624742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513096
12145	NC_021721	T	6	6	624800	624805	0 %	100 %	0 %	0 %	523513096
12146	NC_021721	CAT	2	6	624841	624846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513096
12147	NC_021721	GGC	2	6	624865	624870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513096
12148	NC_021721	AT	3	6	624896	624901	50 %	50 %	0 %	0 %	523513096
12149	NC_021721	ATC	2	6	624941	624946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513096
12150	NC_021721	ATGG	2	8	625018	625025	25 %	25 %	50 %	0 %	523513096
12151	NC_021721	GTC	2	6	625029	625034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513096
12152	NC_021721	AGG	2	6	625058	625063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12153	NC_021721	A	6	6	625079	625084	100 %	0 %	0 %	0 %	523513097
12154	NC_021721	CAA	2	6	625107	625112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513097
12155	NC_021721	GGT	2	6	625150	625155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513097
12156	NC_021721	TGA	2	6	625205	625210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513097
12157	NC_021721	ACAA	2	8	625227	625234	75 %	0 %	0 %	25 %	523513097
12158	NC_021721	TAC	2	6	625247	625252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513097
12159	NC_021721	CTG	2	6	625288	625293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12160	NC_021721	TGT	2	6	625301	625306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513097
12161	NC_021721	TGGC	2	8	625310	625317	0 %	25 %	50 %	25 %	523513097
12162	NC_021721	CCATT	2	10	625448	625457	20 %	40 %	0 %	40 %	523513097
12163	NC_021721	TGT	2	6	625542	625547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513097
12164	NC_021721	GCA	2	6	625548	625553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12165	NC_021721	CAT	2	6	625573	625578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513097
12166	NC_021721	GGT	2	6	625633	625638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513097
12167	NC_021721	GCT	2	6	625852	625857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12168	NC_021721	TGT	2	6	625880	625885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513097
12169	NC_021721	AC	4	8	626007	626014	50 %	0 %	0 %	50 %	523513097
12170	NC_021721	TTC	2	6	626104	626109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513097
12171	NC_021721	CTTT	2	8	626303	626310	0 %	75 %	0 %	25 %	523513097
12172	NC_021721	TATC	2	8	626313	626320	25 %	50 %	0 %	25 %	523513097
12173	NC_021721	ACT	2	6	626339	626344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513097
12174	NC_021721	AGGT	2	8	626369	626376	25 %	25 %	50 %	0 %	523513097
12175	NC_021721	CGG	2	6	626405	626410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513097
12176	NC_021721	CTA	2	6	626520	626525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513097
12177	NC_021721	AAGG	2	8	626569	626576	50 %	0 %	50 %	0 %	523513097
12178	NC_021721	GCT	2	6	626578	626583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12179	NC_021721	AAT	2	6	626586	626591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513097
12180	NC_021721	CAA	2	6	626604	626609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513097
12181	NC_021721	GAT	2	6	626635	626640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513097
12182	NC_021721	ACA	2	6	626671	626676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513097
12183	NC_021721	AGA	2	6	626746	626751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513097
12184	NC_021721	ATG	2	6	626755	626760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513097
12185	NC_021721	TGA	2	6	626763	626768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513097
12186	NC_021721	GTG	2	6	626794	626799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513097
12187	NC_021721	GTA	2	6	626807	626812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513097
12188	NC_021721	GATCT	2	10	626819	626828	20 %	40 %	20 %	20 %	523513097
12189	NC_021721	CAA	2	6	626829	626834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513097
12190	NC_021721	AAG	2	6	626956	626961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513097
12191	NC_021721	A	7	7	626986	626992	100 %	0 %	0 %	0 %	523513097
12192	NC_021721	ATG	2	6	627038	627043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513097
12193	NC_021721	AGC	2	6	627129	627134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12194	NC_021721	AC	3	6	627167	627172	50 %	0 %	0 %	50 %	523513097
12195	NC_021721	A	7	7	627186	627192	100 %	0 %	0 %	0 %	523513097
12196	NC_021721	ATCAG	2	10	627210	627219	40 %	20 %	20 %	20 %	523513097
12197	NC_021721	GGAACC	2	12	627240	627251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12198	NC_021721	CAA	2	6	627289	627294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513097
12199	NC_021721	CGC	2	6	627299	627304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513097
12200	NC_021721	GCT	2	6	627360	627365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12201	NC_021721	CA	3	6	627366	627371	50 %	0 %	0 %	50 %	523513097
12202	NC_021721	TGC	2	6	627456	627461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513097
12203	NC_021721	AAG	2	6	627499	627504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513097
12204	NC_021721	AAG	2	6	627506	627511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513097
12205	NC_021721	TGGC	2	8	627602	627609	0 %	25 %	50 %	25 %	523513098
12206	NC_021721	ATT	2	6	627612	627617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513098
12207	NC_021721	TTG	2	6	627712	627717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513098
12208	NC_021721	ATG	2	6	627777	627782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513098
12209	NC_021721	GACT	2	8	627797	627804	25 %	25 %	25 %	25 %	523513098
12210	NC_021721	AGA	2	6	627811	627816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513098
12211	NC_021721	TGG	2	6	627829	627834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513098
12212	NC_021721	GTT	2	6	627836	627841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513098
12213	NC_021721	CGG	2	6	627928	627933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513098
12214	NC_021721	CAA	2	6	627947	627952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513098
12215	NC_021721	CAA	2	6	627974	627979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513098
12216	NC_021721	GAC	2	6	628032	628037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12217	NC_021721	TTC	2	6	628191	628196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513098
12218	NC_021721	TAC	2	6	628209	628214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513098
12219	NC_021721	ATC	2	6	628272	628277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513098
12220	NC_021721	TTA	2	6	628321	628326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513098
12221	NC_021721	TGT	2	6	628417	628422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513098
12222	NC_021721	ATCAA	2	10	628481	628490	60 %	20 %	0 %	20 %	523513098
12223	NC_021721	GTTT	2	8	628567	628574	0 %	75 %	25 %	0 %	523513098
12224	NC_021721	ATGG	2	8	628578	628585	25 %	25 %	50 %	0 %	523513098
12225	NC_021721	TTG	2	6	628612	628617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513098
12226	NC_021721	GTG	2	6	628618	628623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513098
12227	NC_021721	GCT	2	6	628638	628643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12228	NC_021721	GTG	2	6	628669	628674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513098
12229	NC_021721	GCT	2	6	628707	628712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12230	NC_021721	GTA	2	6	628780	628785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513098
12231	NC_021721	CCAT	2	8	628788	628795	25 %	25 %	0 %	50 %	523513098
12232	NC_021721	AGC	2	6	628814	628819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12233	NC_021721	CAAA	2	8	628820	628827	75 %	0 %	0 %	25 %	523513098
12234	NC_021721	ACA	2	6	628860	628865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513098
12235	NC_021721	CAAA	2	8	628880	628887	75 %	0 %	0 %	25 %	523513098
12236	NC_021721	GCA	2	6	629037	629042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12237	NC_021721	CCAG	2	8	629079	629086	25 %	0 %	25 %	50 %	523513098
12238	NC_021721	CAG	3	9	629095	629103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12239	NC_021721	ATG	2	6	629190	629195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513098
12240	NC_021721	CAG	2	6	629373	629378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12241	NC_021721	GGC	2	6	629415	629420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513098
12242	NC_021721	TGC	2	6	629489	629494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513098
12243	NC_021721	AGG	2	6	629571	629576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513098
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12246	NC_021721	ACA	2	6	629711	629716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513099
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12250	NC_021721	GTT	2	6	629824	629829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513099
12251	NC_021721	ACT	2	6	629878	629883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513099
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12254	NC_021721	CAA	2	6	630150	630155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513100
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12256	NC_021721	CGG	2	6	630225	630230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513100
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12260	NC_021721	AGAA	2	8	630365	630372	75 %	0 %	25 %	0 %	523513100
12261	NC_021721	ATG	2	6	630453	630458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513100
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12273	NC_021721	CTG	2	6	631010	631015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513101
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12282	NC_021721	GATC	2	8	631300	631307	25 %	25 %	25 %	25 %	523513101
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12290	NC_021721	TGA	2	6	631932	631937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513101
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12300	NC_021721	TTTTG	2	10	632479	632488	0 %	80 %	20 %	0 %	523513102
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12307	NC_021721	CAT	2	6	632797	632802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513102
12308	NC_021721	CGG	2	6	632838	632843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513102
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12310	NC_021721	ACG	2	6	633017	633022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513102
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12314	NC_021721	CGG	2	6	633235	633240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513102
12315	NC_021721	CAT	2	6	633305	633310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513102
12316	NC_021721	AGG	2	6	633426	633431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12317	NC_021721	ATG	2	6	633467	633472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513103
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12328	NC_021721	CTT	2	6	634139	634144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12329	NC_021721	AAG	2	6	634216	634221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513104
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12331	NC_021721	TAC	2	6	634237	634242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513104
12332	NC_021721	ACTT	2	8	634279	634286	25 %	50 %	0 %	25 %	523513104
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12345	NC_021721	GTC	2	6	634763	634768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513105
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12349	NC_021721	TTGT	2	8	634877	634884	0 %	75 %	25 %	0 %	523513105
12350	NC_021721	A	6	6	634898	634903	100 %	0 %	0 %	0 %	523513105
12351	NC_021721	GCA	2	6	635019	635024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513105
12352	NC_021721	AAG	2	6	635054	635059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513105
12353	NC_021721	ACG	2	6	635161	635166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513105
12354	NC_021721	ACAAG	2	10	635191	635200	60 %	0 %	20 %	20 %	523513105
12355	NC_021721	ATG	2	6	635374	635379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12356	NC_021721	A	7	7	635443	635449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12357	NC_021721	GTC	2	6	635497	635502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12358	NC_021721	TCT	2	6	635516	635521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12359	NC_021721	CCA	2	6	635595	635600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12360	NC_021721	CTTT	2	8	635657	635664	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12361	NC_021721	TCGA	2	8	635705	635712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12362	NC_021721	GGTT	2	8	635728	635735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12363	NC_021721	AGT	2	6	635793	635798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12482	NC_021721	TTC	2	6	642212	642217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513115
12483	NC_021721	TC	3	6	642223	642228	0 %	50 %	0 %	50 %	523513115
12484	NC_021721	CAA	2	6	642235	642240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513115
12485	NC_021721	CGTC	2	8	642322	642329	0 %	25 %	25 %	50 %	523513115
12486	NC_021721	ATA	2	6	642351	642356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513115
12487	NC_021721	GAT	2	6	642364	642369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513115
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12490	NC_021721	GTGA	2	8	642516	642523	25 %	25 %	50 %	0 %	523513116
12491	NC_021721	TCA	2	6	642541	642546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513116
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