MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021721	CCA	2	6	542290	542295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513015
10503	NC_021721	CAT	2	6	542366	542371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513015
10504	NC_021721	GTT	2	6	542429	542434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513015
10505	NC_021721	CAA	2	6	542501	542506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513015
10506	NC_021721	CAA	2	6	542516	542521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513015
10507	NC_021721	GCT	2	6	542716	542721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_021721	TTTA	2	8	542790	542797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_021721	T	6	6	542841	542846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_021721	AAT	2	6	542862	542867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_021721	AGG	2	6	542886	542891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_021721	AGC	2	6	542922	542927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513016
10513	NC_021721	GCTG	2	8	543025	543032	0 %	25 %	50 %	25 %	523513016
10514	NC_021721	TTG	2	6	543126	543131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513016
10515	NC_021721	A	6	6	543245	543250	100 %	0 %	0 %	0 %	523513016
10516	NC_021721	GTC	2	6	543251	543256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513016
10517	NC_021721	AGC	2	6	543258	543263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513016
10518	NC_021721	ATC	2	6	543333	543338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513016
10519	NC_021721	CATT	2	8	543396	543403	25 %	50 %	0 %	25 %	523513016
10520	NC_021721	CGAT	2	8	543411	543418	25 %	25 %	25 %	25 %	523513016
10521	NC_021721	TTA	2	6	543451	543456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513016
10522	NC_021721	TGAGC	2	10	543481	543490	20 %	20 %	40 %	20 %	523513016
10523	NC_021721	ATC	2	6	543545	543550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513016
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10527	NC_021721	CGG	2	6	543721	543726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513016
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10529	NC_021721	GGC	2	6	543961	543966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513016
10530	NC_021721	CCAG	2	8	544022	544029	25 %	0 %	25 %	50 %	523513016
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10534	NC_021721	TGC	2	6	544216	544221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513016
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10540	NC_021721	GAC	2	6	544460	544465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513017
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10542	NC_021721	ATGA	2	8	544598	544605	50 %	25 %	25 %	0 %	523513017
10543	NC_021721	GAT	2	6	544688	544693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513017
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10549	NC_021721	TTGA	2	8	544985	544992	25 %	50 %	25 %	0 %	523513017
10550	NC_021721	TGT	2	6	544998	545003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513017
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10554	NC_021721	GTG	2	6	545147	545152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513017
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10557	NC_021721	TGG	2	6	545379	545384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513017
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10559	NC_021721	AG	3	6	545603	545608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_021721	A	6	6	545759	545764	100 %	0 %	0 %	0 %	523513018
10561	NC_021721	TC	3	6	545788	545793	0 %	50 %	0 %	50 %	523513018
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10564	NC_021721	GGCT	2	8	546011	546018	0 %	25 %	50 %	25 %	523513018
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10598	NC_021721	TGA	2	6	547714	547719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10600	NC_021721	GAG	2	6	547753	547758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_021721	TAT	2	6	547763	547768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513020
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10605	NC_021721	GATC	2	8	547961	547968	25 %	25 %	25 %	25 %	523513020
10606	NC_021721	ATG	2	6	548017	548022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513020
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10611	NC_021721	GGA	2	6	548168	548173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513020
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10618	NC_021721	AC	3	6	548639	548644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10619	NC_021721	TCA	2	6	548885	548890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513021
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10622	NC_021721	ATC	2	6	549062	549067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513021
10623	NC_021721	TCA	2	6	549089	549094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513021
10624	NC_021721	GA	3	6	549101	549106	50 %	0 %	50 %	0 %	523513021
10625	NC_021721	TGG	2	6	549151	549156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513021
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10628	NC_021721	TGA	2	6	549303	549308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513021
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10632	NC_021721	TCA	2	6	549734	549739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513021
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10641	NC_021721	T	7	7	550318	550324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10646	NC_021721	ATCC	2	8	550472	550479	25 %	25 %	0 %	50 %	523513023
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10696	NC_021721	GCT	2	6	552617	552622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513025
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10714	NC_021721	CCTA	2	8	553654	553661	25 %	25 %	0 %	50 %	523513026
10715	NC_021721	TCA	3	9	553701	553709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513026
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10723	NC_021721	CCAA	2	8	553998	554005	50 %	0 %	0 %	50 %	523513026
10724	NC_021721	ATT	2	6	554021	554026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513026
10725	NC_021721	TCC	2	6	554028	554033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10726	NC_021721	CTT	2	6	554041	554046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513027
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10731	NC_021721	TGC	2	6	554277	554282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513027
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10734	NC_021721	GAG	2	6	554396	554401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10735	NC_021721	A	7	7	554416	554422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10736	NC_021721	GCAA	2	8	554469	554476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10737	NC_021721	T	6	6	554482	554487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10743	NC_021721	CAT	2	6	554798	554803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513028
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10863	NC_021721	ACG	2	6	560436	560441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513031
10864	NC_021721	GCA	2	6	560546	560551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513031
10865	NC_021721	TGC	2	6	560552	560557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513031
10866	NC_021721	CGG	2	6	560578	560583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513031
10867	NC_021721	TGTCA	2	10	560621	560630	20 %	40 %	20 %	20 %	523513031
10868	NC_021721	AATC	2	8	560649	560656	50 %	25 %	0 %	25 %	523513031
10869	NC_021721	ATTT	2	8	560665	560672	25 %	75 %	0 %	0 %	523513031
10870	NC_021721	GTC	2	6	560692	560697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513031
10871	NC_021721	A	6	6	560711	560716	100 %	0 %	0 %	0 %	523513031
10872	NC_021721	TTG	2	6	560739	560744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513031
10873	NC_021721	A	6	6	560826	560831	100 %	0 %	0 %	0 %	523513031
10874	NC_021721	A	6	6	560833	560838	100 %	0 %	0 %	0 %	523513031
10875	NC_021721	ACA	2	6	560974	560979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513032
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10882	NC_021721	AAG	2	6	561428	561433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513032
10883	NC_021721	AAAC	2	8	561665	561672	75 %	0 %	0 %	25 %	523513032
10884	NC_021721	ATG	2	6	561686	561691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513032
10885	NC_021721	CTG	2	6	561692	561697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513032
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10887	NC_021721	TAA	2	6	561870	561875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10888	NC_021721	CAAG	2	8	561887	561894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10889	NC_021721	TTGA	2	8	561968	561975	25 %	50 %	25 %	0 %	523513033
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10903	NC_021721	TGG	2	6	562700	562705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513033
10904	NC_021721	GGT	2	6	562741	562746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513033
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10907	NC_021721	GTG	2	6	562838	562843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513033
10908	NC_021721	TGAC	2	8	562890	562897	25 %	25 %	25 %	25 %	523513033
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10910	NC_021721	A	6	6	562988	562993	100 %	0 %	0 %	0 %	523513033
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10963	NC_021721	GTT	2	6	565819	565824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10975	NC_021721	A	6	6	566401	566406	100 %	0 %	0 %	0 %	523513036
10976	NC_021721	GAT	2	6	566430	566435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513036
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10980	NC_021721	A	7	7	566569	566575	100 %	0 %	0 %	0 %	523513037
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