MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021721	TTG	2	6	516114	516119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_021721	TGAAGA	2	12	516152	516163	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_021721	GTAG	2	8	516190	516197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_021721	ATAA	2	8	516204	516211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_021721	GCC	2	6	516212	516217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10006	NC_021721	TGC	2	6	516264	516269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_021721	GCTCG	2	10	516272	516281	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10008	NC_021721	GAC	2	6	516283	516288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_021721	TTG	2	6	516322	516327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_021721	CCA	2	6	516345	516350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_021721	AT	3	6	516438	516443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021721	TA	3	6	516453	516458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_021721	AAG	2	6	516524	516529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021721	GGT	2	6	516532	516537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_021721	AGG	2	6	516580	516585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_021721	GTT	2	6	516633	516638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_021721	AGCT	2	8	516703	516710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10018	NC_021721	AGC	2	6	516758	516763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_021721	TTG	2	6	516765	516770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_021721	AT	4	8	516815	516822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_021721	TTGA	2	8	516889	516896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_021721	GTG	2	6	516904	516909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_021721	AAT	2	6	517017	517022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512990
10024	NC_021721	GAAG	2	8	517094	517101	50 %	0 %	50 %	0 %	523512990
10025	NC_021721	GCA	2	6	517178	517183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512990
10026	NC_021721	GAA	2	6	517227	517232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512990
10027	NC_021721	AAT	2	6	517290	517295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512990
10028	NC_021721	ACGT	2	8	517408	517415	25 %	25 %	25 %	25 %	523512990
10029	NC_021721	GCG	2	6	517441	517446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512990
10030	NC_021721	GCA	2	6	517457	517462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512990
10031	NC_021721	AGCG	2	8	517487	517494	25 %	0 %	50 %	25 %	523512990
10032	NC_021721	AGC	2	6	517567	517572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512990
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10038	NC_021721	AGCG	2	8	517872	517879	25 %	0 %	50 %	25 %	523512990
10039	NC_021721	TTGA	2	8	517914	517921	25 %	50 %	25 %	0 %	523512990
10040	NC_021721	TTG	2	6	517928	517933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512990
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10043	NC_021721	GCA	2	6	518188	518193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512990
10044	NC_021721	CAT	2	6	518294	518299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512990
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10050	NC_021721	CTG	2	6	518601	518606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512990
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10053	NC_021721	TGG	2	6	518879	518884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512990
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10055	NC_021721	TGC	2	6	518930	518935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512990
10056	NC_021721	TTGA	2	8	519012	519019	25 %	50 %	25 %	0 %	523512990
10057	NC_021721	GGC	2	6	519048	519053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512990
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10064	NC_021721	TCCAG	2	10	519707	519716	20 %	20 %	20 %	40 %	523512990
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10068	NC_021721	GTT	2	6	519821	519826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_021721	ATC	2	6	519832	519837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10076	NC_021721	AGT	2	6	520186	520191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10078	NC_021721	AAAT	2	8	520229	520236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10080	NC_021721	GGA	3	9	520286	520294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10095	NC_021721	A	7	7	521037	521043	100 %	0 %	0 %	0 %	523512992
10096	NC_021721	GAA	2	6	521045	521050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512992
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10104	NC_021721	CGG	2	6	521419	521424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512993
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10109	NC_021721	GGC	2	6	521750	521755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512993
10110	NC_021721	CATTA	2	10	521772	521781	40 %	40 %	0 %	20 %	523512993
10111	NC_021721	TTG	2	6	521787	521792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512993
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10114	NC_021721	TGTT	2	8	522057	522064	0 %	75 %	25 %	0 %	523512993
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10118	NC_021721	CAT	2	6	522346	522351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_021721	A	6	6	522359	522364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_021721	GA	3	6	522378	522383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_021721	GTG	2	6	522443	522448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_021721	AAC	2	6	522499	522504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512994
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10244	NC_021721	TGC	2	6	528331	528336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513001
10245	NC_021721	AAGT	2	8	528436	528443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_021721	ACA	2	6	528477	528482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10247	NC_021721	TTG	2	6	528492	528497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_021721	AGA	2	6	528512	528517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_021721	GGTT	2	8	528851	528858	0 %	50 %	50 %	0 %	523513002
10250	NC_021721	GAT	2	6	528863	528868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513002
10251	NC_021721	CTG	2	6	528880	528885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513002
10252	NC_021721	GGT	2	6	528965	528970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513002
10253	NC_021721	CCT	2	6	528997	529002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_021721	ATTGAA	2	12	529069	529080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_021721	CGATCA	2	12	529210	529221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523513003
10256	NC_021721	GCT	2	6	529232	529237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513003
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10259	NC_021721	T	6	6	529477	529482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_021721	TCAT	2	8	529523	529530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10261	NC_021721	A	6	6	529539	529544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_021721	ATT	2	6	529569	529574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513004
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10265	NC_021721	GACT	2	8	529819	529826	25 %	25 %	25 %	25 %	523513004
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10267	NC_021721	TGA	2	6	529921	529926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513004
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10275	NC_021721	A	6	6	530222	530227	100 %	0 %	0 %	0 %	523513004
10276	NC_021721	ATC	2	6	530232	530237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513004
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10278	NC_021721	TCA	2	6	530277	530282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513004
10279	NC_021721	A	6	6	530311	530316	100 %	0 %	0 %	0 %	523513004
10280	NC_021721	TGAT	2	8	530355	530362	25 %	50 %	25 %	0 %	523513004
10281	NC_021721	ATTG	2	8	530384	530391	25 %	50 %	25 %	0 %	523513004
10282	NC_021721	CAT	2	6	530443	530448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10284	NC_021721	TGGCA	2	10	530643	530652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10285	NC_021721	TGG	2	6	530760	530765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10286	NC_021721	GTT	2	6	530833	530838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513005
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10319	NC_021721	AAAG	2	8	532372	532379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10320	NC_021721	TGT	2	6	532410	532415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10346	NC_021721	GCC	2	6	534020	534025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10347	NC_021721	GAA	2	6	534069	534074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10349	NC_021721	AGA	2	6	534153	534158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513008
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10359	NC_021721	ATG	2	6	534799	534804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513009
10360	NC_021721	GGC	2	6	534814	534819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513009
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10364	NC_021721	CAA	2	6	535106	535111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513009
10365	NC_021721	CAT	2	6	535125	535130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513009
10366	NC_021721	AGCA	2	8	535182	535189	50 %	0 %	25 %	25 %	523513009
10367	NC_021721	CGT	2	6	535223	535228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513009
10368	NC_021721	TGA	2	6	535301	535306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513009
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10370	NC_021721	TTG	2	6	535413	535418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513010
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10393	NC_021721	TG	3	6	536523	536528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10394	NC_021721	AAG	2	6	536577	536582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10398	NC_021721	GTT	2	6	536811	536816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10445	NC_021721	CT	3	6	539755	539760	0 %	50 %	0 %	50 %	523513013
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10452	NC_021721	CGG	2	6	540053	540058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513013
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10471	NC_021721	GTG	2	6	540850	540855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10472	NC_021721	ACCTGA	2	12	540861	540872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10473	NC_021721	TCAAA	2	10	540926	540935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10474	NC_021721	TGTT	2	8	540953	540960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10475	NC_021721	GAT	2	6	541004	541009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10476	NC_021721	ATGTC	2	10	541036	541045	20 %	40 %	20 %	20 %	523513014
10477	NC_021721	AT	3	6	541048	541053	50 %	50 %	0 %	0 %	523513014
10478	NC_021721	GAT	2	6	541056	541061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513014
10479	NC_021721	T	6	6	541068	541073	0 %	100 %	0 %	0 %	523513014
10480	NC_021721	TGC	2	6	541214	541219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513014
10481	NC_021721	GCA	3	9	541278	541286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513014
10482	NC_021721	GAC	2	6	541289	541294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513014
10483	NC_021721	A	7	7	541416	541422	100 %	0 %	0 %	0 %	523513014
10484	NC_021721	AGA	2	6	541496	541501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513014
10485	NC_021721	GAT	2	6	541512	541517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513014
10486	NC_021721	A	6	6	541599	541604	100 %	0 %	0 %	0 %	523513014
10487	NC_021721	GAC	2	6	541619	541624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513014
10488	NC_021721	ATC	2	6	541645	541650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513014
10489	NC_021721	GAT	2	6	541739	541744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513014
10490	NC_021721	AAAT	2	8	541785	541792	75 %	25 %	0 %	0 %	523513014
10491	NC_021721	TAGAA	2	10	541799	541808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_021721	AAAT	2	8	541811	541818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_021721	AAC	2	6	541880	541885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513015
10494	NC_021721	ATG	2	6	541905	541910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513015
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10496	NC_021721	TGA	2	6	541963	541968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513015
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10498	NC_021721	TGAT	2	8	542010	542017	25 %	50 %	25 %	0 %	523513015
10499	NC_021721	TGG	2	6	542032	542037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513015
10500	NC_021721	GAA	2	6	542066	542071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513015

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