MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_021721	CAC	2	6	2854585	2854590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515305
55002	NC_021721	CTG	2	6	2854745	2854750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55003	NC_021721	CATAC	2	10	2854758	2854767	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55004	NC_021721	T	6	6	2854807	2854812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55005	NC_021721	CAAT	2	8	2854848	2854855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55006	NC_021721	AAT	2	6	2854866	2854871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55007	NC_021721	CTGG	2	8	2855029	2855036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55008	NC_021721	AGT	2	6	2855039	2855044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55009	NC_021721	AAT	2	6	2855055	2855060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55010	NC_021721	GCCA	2	8	2855089	2855096	25 %	0 %	25 %	50 %	523515306
55011	NC_021721	TCA	3	9	2855152	2855160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
55012	NC_021721	TGAT	2	8	2855186	2855193	25 %	50 %	25 %	0 %	523515306
55013	NC_021721	TGC	2	6	2855205	2855210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515306
55014	NC_021721	TCA	2	6	2855236	2855241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
55015	NC_021721	T	6	6	2855242	2855247	0 %	100 %	0 %	0 %	523515306
55016	NC_021721	TTA	2	6	2855331	2855336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515306
55017	NC_021721	TAA	2	6	2855366	2855371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515306
55018	NC_021721	TTG	2	6	2855533	2855538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515306
55019	NC_021721	AATT	2	8	2855548	2855555	50 %	50 %	0 %	0 %	523515306
55020	NC_021721	TGC	2	6	2855692	2855697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515306
55021	NC_021721	TAT	2	6	2855701	2855706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515306
55022	NC_021721	TCAC	2	8	2855769	2855776	25 %	25 %	0 %	50 %	523515306
55023	NC_021721	AAC	2	6	2855882	2855887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515306
55024	NC_021721	CTG	2	6	2855905	2855910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515306
55025	NC_021721	ATT	2	6	2855954	2855959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515306
55026	NC_021721	GTT	2	6	2856002	2856007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515306
55027	NC_021721	CAT	2	6	2856034	2856039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
55028	NC_021721	CAT	2	6	2856097	2856102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
55029	NC_021721	TGA	2	6	2856138	2856143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515306
55030	NC_021721	ACCC	2	8	2856163	2856170	25 %	0 %	0 %	75 %	523515306
55031	NC_021721	GTCAAA	2	12	2856221	2856232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523515306
55032	NC_021721	CAC	2	6	2856298	2856303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515306
55033	NC_021721	TGT	2	6	2856364	2856369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515306
55034	NC_021721	GCT	2	6	2856372	2856377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515306
55035	NC_021721	TGA	2	6	2856418	2856423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515306
55036	NC_021721	ATT	2	6	2856455	2856460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515306
55037	NC_021721	GGA	2	6	2856514	2856519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523515306
55038	NC_021721	CAT	2	6	2856532	2856537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
55039	NC_021721	CAG	2	6	2856580	2856585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515306
55040	NC_021721	ATA	3	9	2856606	2856614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515306
55041	NC_021721	ATG	2	6	2856692	2856697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515306
55042	NC_021721	TTG	2	6	2856702	2856707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515306
55043	NC_021721	GCA	2	6	2856771	2856776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515306
55044	NC_021721	CAT	2	6	2856850	2856855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
55045	NC_021721	GTT	2	6	2856978	2856983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515306
55046	NC_021721	T	7	7	2857004	2857010	0 %	100 %	0 %	0 %	523515306
55047	NC_021721	GAT	2	6	2857183	2857188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515306
55048	NC_021721	GTT	2	6	2857205	2857210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515306
55049	NC_021721	TTG	2	6	2857221	2857226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515306
55050	NC_021721	CAG	2	6	2857249	2857254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515306
55051	NC_021721	GCC	2	6	2857281	2857286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515306
55052	NC_021721	CAA	2	6	2857310	2857315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515306
55053	NC_021721	TCA	2	6	2857351	2857356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
55054	NC_021721	TTTTG	2	10	2857392	2857401	0 %	80 %	20 %	0 %	523515307
55055	NC_021721	GCT	2	6	2857407	2857412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515307
55056	NC_021721	GAA	2	6	2857423	2857428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515307
55057	NC_021721	AGC	2	6	2857436	2857441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515307
55058	NC_021721	T	6	6	2857442	2857447	0 %	100 %	0 %	0 %	523515307
55059	NC_021721	CTT	2	6	2857467	2857472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515307
55060	NC_021721	CAA	2	6	2857475	2857480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515307
55061	NC_021721	ATA	2	6	2857517	2857522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515307
55062	NC_021721	ATG	2	6	2857590	2857595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515307
55063	NC_021721	CAC	2	6	2857609	2857614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515307
55064	NC_021721	AGT	2	6	2857630	2857635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515307
55065	NC_021721	GTA	2	6	2857640	2857645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515307
55066	NC_021721	CTTATC	2	12	2857646	2857657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	523515307
55067	NC_021721	TCA	3	9	2857933	2857941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515307
55068	NC_021721	TG	3	6	2857948	2857953	0 %	50 %	50 %	0 %	523515307
55069	NC_021721	T	6	6	2857954	2857959	0 %	100 %	0 %	0 %	523515307
55070	NC_021721	TTC	2	6	2858004	2858009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515307
55071	NC_021721	T	6	6	2858034	2858039	0 %	100 %	0 %	0 %	523515307
55072	NC_021721	CAA	2	6	2858071	2858076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515307
55073	NC_021721	CTTGT	2	10	2858102	2858111	0 %	60 %	20 %	20 %	523515307
55074	NC_021721	CTG	2	6	2858117	2858122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515307
55075	NC_021721	TGT	2	6	2858168	2858173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515307
55076	NC_021721	AAGA	2	8	2858271	2858278	75 %	0 %	25 %	0 %	523515307
55077	NC_021721	T	6	6	2858352	2858357	0 %	100 %	0 %	0 %	523515307
55078	NC_021721	TCA	2	6	2858362	2858367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515307
55079	NC_021721	AAC	2	6	2858420	2858425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55080	NC_021721	CAA	2	6	2858536	2858541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515308
55081	NC_021721	AAT	2	6	2858569	2858574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515308
55082	NC_021721	CAT	2	6	2858578	2858583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515308
55083	NC_021721	TCA	2	6	2858619	2858624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515308
55084	NC_021721	TCA	2	6	2858631	2858636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515308
55085	NC_021721	A	6	6	2858695	2858700	100 %	0 %	0 %	0 %	523515308
55086	NC_021721	GAT	2	6	2858755	2858760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515308
55087	NC_021721	GTG	2	6	2858776	2858781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515308
55088	NC_021721	AAC	2	6	2858784	2858789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515308
55089	NC_021721	AT	3	6	2858803	2858808	50 %	50 %	0 %	0 %	523515308
55090	NC_021721	TC	3	6	2858810	2858815	0 %	50 %	0 %	50 %	523515308
55091	NC_021721	GCTA	2	8	2858828	2858835	25 %	25 %	25 %	25 %	523515308
55092	NC_021721	GCTT	2	8	2858859	2858866	0 %	50 %	25 %	25 %	523515308
55093	NC_021721	GTCAG	2	10	2858874	2858883	20 %	20 %	40 %	20 %	523515308
55094	NC_021721	GT	3	6	2858908	2858913	0 %	50 %	50 %	0 %	523515308
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55097	NC_021721	GATT	2	8	2858968	2858975	25 %	50 %	25 %	0 %	523515308
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55100	NC_021721	ACGT	2	8	2859192	2859199	25 %	25 %	25 %	25 %	523515308
55101	NC_021721	GCC	2	6	2859206	2859211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515308
55102	NC_021721	CATGAC	2	12	2859265	2859276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523515308
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55104	NC_021721	GCA	2	6	2859363	2859368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515308
55105	NC_021721	TTG	2	6	2859371	2859376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515308
55106	NC_021721	T	6	6	2859389	2859394	0 %	100 %	0 %	0 %	523515308
55107	NC_021721	TAA	2	6	2859428	2859433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515308
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55112	NC_021721	AGC	2	6	2859650	2859655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515308
55113	NC_021721	GCG	2	6	2859697	2859702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515308
55114	NC_021721	ACG	2	6	2859792	2859797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515308
55115	NC_021721	CAT	2	6	2859913	2859918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515308
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55117	NC_021721	TAA	2	6	2859989	2859994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515308
55118	NC_021721	A	6	6	2860057	2860062	100 %	0 %	0 %	0 %	523515308
55119	NC_021721	TGGG	2	8	2860221	2860228	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55120	NC_021721	A	6	6	2860254	2860259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55121	NC_021721	TAT	2	6	2860261	2860266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55122	NC_021721	TGT	2	6	2860308	2860313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515309
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55130	NC_021721	AAT	2	6	2860626	2860631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515309
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55133	NC_021721	TGC	2	6	2860761	2860766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515310
55134	NC_021721	GTG	2	6	2860837	2860842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515310
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55140	NC_021721	GTC	2	6	2861145	2861150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55145	NC_021721	TGCAA	2	10	2861657	2861666	40 %	20 %	20 %	20 %	523515311
55146	NC_021721	CG	3	6	2861761	2861766	0 %	0 %	50 %	50 %	523515311
55147	NC_021721	CGT	2	6	2861769	2861774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515311
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55152	NC_021721	T	6	6	2862016	2862021	0 %	100 %	0 %	0 %	523515311
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55157	NC_021721	AT	3	6	2862237	2862242	50 %	50 %	0 %	0 %	523515312
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55170	NC_021721	CAAAA	2	10	2862796	2862805	80 %	0 %	0 %	20 %	523515312
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55172	NC_021721	TCC	2	6	2862860	2862865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55173	NC_021721	C	7	7	2862904	2862910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55174	NC_021721	GT	3	6	2862987	2862992	0 %	50 %	50 %	0 %	523515313
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55183	NC_021721	ACTG	2	8	2863522	2863529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55184	NC_021721	TCA	2	6	2863660	2863665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515314
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55187	NC_021721	CATG	2	8	2863835	2863842	25 %	25 %	25 %	25 %	523515314
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55212	NC_021721	AAGC	2	8	2865401	2865408	50 %	0 %	25 %	25 %	523515315
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55218	NC_021721	A	6	6	2865678	2865683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55219	NC_021721	T	7	7	2865732	2865738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55220	NC_021721	ATA	2	6	2865773	2865778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55221	NC_021721	CAC	2	6	2865809	2865814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515316
55222	NC_021721	ACT	2	6	2865885	2865890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515316
55223	NC_021721	CCA	2	6	2865894	2865899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515316
55224	NC_021721	TTTG	2	8	2865981	2865988	0 %	75 %	25 %	0 %	523515316
55225	NC_021721	ATA	2	6	2866147	2866152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515316
55226	NC_021721	GAT	2	6	2866154	2866159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515316
55227	NC_021721	TTG	2	6	2866162	2866167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515316
55228	NC_021721	CCA	2	6	2866183	2866188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515316
55229	NC_021721	ATG	2	6	2866267	2866272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515316
55230	NC_021721	CGAT	2	8	2866390	2866397	25 %	25 %	25 %	25 %	523515316
55231	NC_021721	GAA	2	6	2866413	2866418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515316
55232	NC_021721	TGC	2	6	2866433	2866438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515316
55233	NC_021721	A	7	7	2866444	2866450	100 %	0 %	0 %	0 %	523515316
55234	NC_021721	AC	3	6	2866540	2866545	50 %	0 %	0 %	50 %	523515316
55235	NC_021721	AAAC	2	8	2866613	2866620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55236	NC_021721	TC	3	6	2866645	2866650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55237	NC_021721	T	6	6	2866684	2866689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55238	NC_021721	A	6	6	2866725	2866730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55239	NC_021721	TGA	2	6	2866773	2866778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55240	NC_021721	TA	3	6	2866805	2866810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55241	NC_021721	ATT	2	6	2866827	2866832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55242	NC_021721	ACCTAT	2	12	2866956	2866967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515317
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55312	NC_021721	CTT	2	6	2870397	2870402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55341	NC_021721	TTC	2	6	2872300	2872305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515323
55342	NC_021721	GCC	2	6	2872376	2872381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515323
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55345	NC_021721	GC	3	6	2872507	2872512	0 %	0 %	50 %	50 %	523515323
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55351	NC_021721	CTT	2	6	2872888	2872893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515323
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55469	NC_021721	TCC	2	6	2878548	2878553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55470	NC_021721	AGC	2	6	2878658	2878663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55471	NC_021721	AG	3	6	2878686	2878691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55472	NC_021721	AAG	2	6	2878748	2878753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55473	NC_021721	AAT	2	6	2878785	2878790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55474	NC_021721	CTC	2	6	2878805	2878810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55475	NC_021721	TCA	2	6	2878871	2878876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515330
55476	NC_021721	ATC	2	6	2878918	2878923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515330
55477	NC_021721	CTTC	2	8	2878929	2878936	0 %	50 %	0 %	50 %	523515330
55478	NC_021721	TGAT	2	8	2879000	2879007	25 %	50 %	25 %	0 %	523515330
55479	NC_021721	ATC	2	6	2879051	2879056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515330
55480	NC_021721	GTC	3	9	2879140	2879148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515330
55481	NC_021721	CACCG	2	10	2879158	2879167	20 %	0 %	20 %	60 %	523515330
55482	NC_021721	CGA	2	6	2879229	2879234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515330
55483	NC_021721	GGC	2	6	2879302	2879307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515330
55484	NC_021721	GC	3	6	2879348	2879353	0 %	0 %	50 %	50 %	523515330
55485	NC_021721	CCA	2	6	2879376	2879381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515330
55486	NC_021721	ATA	2	6	2879398	2879403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515330
55487	NC_021721	CAA	2	6	2879443	2879448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515330
55488	NC_021721	TTGC	2	8	2879469	2879476	0 %	50 %	25 %	25 %	523515330
55489	NC_021721	ATG	2	6	2879527	2879532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515330
55490	NC_021721	CCA	2	6	2879593	2879598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515330
55491	NC_021721	GAT	2	6	2879653	2879658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515330
55492	NC_021721	CCG	2	6	2879668	2879673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515330
55493	NC_021721	ATCA	2	8	2879809	2879816	50 %	25 %	0 %	25 %	523515330
55494	NC_021721	ATA	2	6	2879822	2879827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515330
55495	NC_021721	GACC	2	8	2879880	2879887	25 %	0 %	25 %	50 %	523515330
55496	NC_021721	GCC	2	6	2879935	2879940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515330
55497	NC_021721	CTTTT	2	10	2880025	2880034	0 %	80 %	0 %	20 %	523515330
55498	NC_021721	TCG	2	6	2880060	2880065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515330
55499	NC_021721	TCG	2	6	2880077	2880082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515330
55500	NC_021721	CAT	2	6	2880136	2880141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515330

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