MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_021721	TCA	2	6	2825526	2825531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515276
54502	NC_021721	GGC	2	6	2825549	2825554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515276
54503	NC_021721	CAAC	2	8	2825578	2825585	50 %	0 %	0 %	50 %	523515276
54504	NC_021721	TAAT	2	8	2825649	2825656	50 %	50 %	0 %	0 %	523515276
54505	NC_021721	TGGT	2	8	2825707	2825714	0 %	50 %	50 %	0 %	523515276
54506	NC_021721	CTG	2	6	2825807	2825812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515276
54507	NC_021721	AAG	2	6	2825850	2825855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515276
54508	NC_021721	GCC	2	6	2825862	2825867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515276
54509	NC_021721	CAGG	2	8	2825902	2825909	25 %	0 %	50 %	25 %	523515276
54510	NC_021721	CG	4	8	2825912	2825919	0 %	0 %	50 %	50 %	523515276
54511	NC_021721	CAG	2	6	2825927	2825932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515276
54512	NC_021721	GTC	2	6	2825942	2825947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515276
54513	NC_021721	ACA	2	6	2825974	2825979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515276
54514	NC_021721	CCA	2	6	2826021	2826026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515276
54515	NC_021721	ATCG	2	8	2826050	2826057	25 %	25 %	25 %	25 %	523515276
54516	NC_021721	GC	3	6	2826084	2826089	0 %	0 %	50 %	50 %	523515276
54517	NC_021721	ATCA	2	8	2826149	2826156	50 %	25 %	0 %	25 %	523515276
54518	NC_021721	ACC	2	6	2826285	2826290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515276
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54521	NC_021721	CAT	2	6	2826403	2826408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515276
54522	NC_021721	CAACC	2	10	2826412	2826421	40 %	0 %	0 %	60 %	523515276
54523	NC_021721	TGG	2	6	2826505	2826510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515276
54524	NC_021721	TCG	2	6	2826516	2826521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515276
54525	NC_021721	CAT	2	6	2826527	2826532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515276
54526	NC_021721	GGA	2	6	2826606	2826611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54527	NC_021721	TTG	3	9	2826778	2826786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54528	NC_021721	GCT	2	6	2826862	2826867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54529	NC_021721	CAAT	2	8	2826918	2826925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54530	NC_021721	TGA	3	9	2826995	2827003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515277
54531	NC_021721	CAAT	2	8	2827007	2827014	50 %	25 %	0 %	25 %	523515277
54532	NC_021721	ACC	2	6	2827026	2827031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515277
54533	NC_021721	CAGCAT	2	12	2827038	2827049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523515277
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54535	NC_021721	ACC	2	6	2827116	2827121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54536	NC_021721	T	6	6	2827222	2827227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54537	NC_021721	CT	3	6	2827279	2827284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54538	NC_021721	AGT	2	6	2827288	2827293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54539	NC_021721	AGTC	2	8	2827337	2827344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54540	NC_021721	CA	3	6	2827354	2827359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54541	NC_021721	ATG	2	6	2827387	2827392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54542	NC_021721	GAAA	2	8	2827626	2827633	75 %	0 %	25 %	0 %	523515278
54543	NC_021721	CG	3	6	2827717	2827722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54544	NC_021721	AC	3	6	2827962	2827967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54545	NC_021721	CAG	2	6	2827987	2827992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515279
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54550	NC_021721	CTTG	2	8	2828248	2828255	0 %	50 %	25 %	25 %	523515279
54551	NC_021721	GC	3	6	2828282	2828287	0 %	0 %	50 %	50 %	523515279
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54554	NC_021721	GTC	2	6	2828415	2828420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515279
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54560	NC_021721	TTC	2	6	2828652	2828657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515280
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54562	NC_021721	CTT	2	6	2828695	2828700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515280
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54565	NC_021721	GCA	2	6	2828955	2828960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515280
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54600	NC_021721	AAC	2	6	2831572	2831577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54601	NC_021721	CAA	2	6	2831673	2831678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515283
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54605	NC_021721	GCCTT	2	10	2831938	2831947	0 %	40 %	20 %	40 %	523515283
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54617	NC_021721	GTGTG	2	10	2832553	2832562	0 %	40 %	60 %	0 %	523515284
54618	NC_021721	TCC	2	6	2832693	2832698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54619	NC_021721	GCA	2	6	2832716	2832721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54620	NC_021721	CTG	2	6	2832723	2832728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54621	NC_021721	TCT	2	6	2832838	2832843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515285
54622	NC_021721	TTG	2	6	2832859	2832864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515285
54623	NC_021721	AAC	2	6	2833006	2833011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515285
54624	NC_021721	AAACC	2	10	2833031	2833040	60 %	0 %	0 %	40 %	523515285
54625	NC_021721	GCT	2	6	2833118	2833123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515285
54626	NC_021721	AATCA	2	10	2833234	2833243	60 %	20 %	0 %	20 %	523515285
54627	NC_021721	TGGT	2	8	2833267	2833274	0 %	50 %	50 %	0 %	523515285
54628	NC_021721	GCG	2	6	2833315	2833320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515285
54629	NC_021721	CGC	2	6	2833458	2833463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515285
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54631	NC_021721	GAAA	2	8	2833574	2833581	75 %	0 %	25 %	0 %	523515285
54632	NC_021721	ACA	2	6	2833652	2833657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515285
54633	NC_021721	ATG	2	6	2833781	2833786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515285
54634	NC_021721	CAG	2	6	2833824	2833829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515285
54635	NC_021721	AACG	2	8	2833872	2833879	50 %	0 %	25 %	25 %	523515285
54636	NC_021721	AGCA	2	8	2833903	2833910	50 %	0 %	25 %	25 %	523515285
54637	NC_021721	TGA	2	6	2833944	2833949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515285
54638	NC_021721	ACCA	2	8	2834057	2834064	50 %	0 %	0 %	50 %	523515285
54639	NC_021721	CTC	2	6	2834125	2834130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515285
54640	NC_021721	CTGAT	2	10	2834138	2834147	20 %	40 %	20 %	20 %	523515285
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54642	NC_021721	TCA	2	6	2834199	2834204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515285
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54648	NC_021721	AAC	2	6	2834537	2834542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515285
54649	NC_021721	CTC	2	6	2834584	2834589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515285
54650	NC_021721	TTC	2	6	2834590	2834595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515285
54651	NC_021721	TTC	2	6	2834617	2834622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515285
54652	NC_021721	CTCGC	2	10	2834671	2834680	0 %	20 %	20 %	60 %	523515285
54653	NC_021721	TGA	2	6	2834705	2834710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515285
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54658	NC_021721	TTC	2	6	2834843	2834848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515285
54659	NC_021721	AAC	2	6	2834850	2834855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515285
54660	NC_021721	TTCAAT	2	12	2834869	2834880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54661	NC_021721	CT	3	6	2834935	2834940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54662	NC_021721	CAA	2	6	2834986	2834991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54663	NC_021721	CAAAA	2	10	2835002	2835011	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54664	NC_021721	A	7	7	2835018	2835024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54665	NC_021721	AATC	2	8	2835068	2835075	50 %	25 %	0 %	25 %	523515286
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54671	NC_021721	GTT	4	12	2835366	2835377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515286
54672	NC_021721	C	6	6	2835393	2835398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54673	NC_021721	GCAA	2	8	2835436	2835443	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54674	NC_021721	TTG	2	6	2835445	2835450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54675	NC_021721	ATCAA	2	10	2835475	2835484	60 %	20 %	0 %	20 %	523515287
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54677	NC_021721	AGC	2	6	2835604	2835609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515287
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54679	NC_021721	TCTG	2	8	2835685	2835692	0 %	50 %	25 %	25 %	523515287
54680	NC_021721	CAG	2	6	2835695	2835700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515287
54681	NC_021721	CTG	2	6	2835740	2835745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515287
54682	NC_021721	TCT	2	6	2835764	2835769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515287
54683	NC_021721	CCA	2	6	2835822	2835827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515288
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54686	NC_021721	TTTG	2	8	2835878	2835885	0 %	75 %	25 %	0 %	523515288
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54704	NC_021721	CAA	2	6	2837008	2837013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515288
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54706	NC_021721	GCG	2	6	2837314	2837319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515289
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54708	NC_021721	TGAC	2	8	2837653	2837660	25 %	25 %	25 %	25 %	523515289
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54712	NC_021721	TGC	2	6	2837799	2837804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515289
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54716	NC_021721	CTG	2	6	2837968	2837973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515289
54717	NC_021721	CTGGT	2	10	2838070	2838079	0 %	40 %	40 %	20 %	523515289
54718	NC_021721	AAC	2	6	2838104	2838109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515289
54719	NC_021721	GCC	2	6	2838126	2838131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515289
54720	NC_021721	ACT	2	6	2838142	2838147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515289
54721	NC_021721	TGT	2	6	2838296	2838301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515290
54722	NC_021721	GCA	2	6	2838303	2838308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515290
54723	NC_021721	CGG	2	6	2838392	2838397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515290
54724	NC_021721	GTA	3	9	2838437	2838445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515290
54725	NC_021721	CAA	2	6	2838530	2838535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515290
54726	NC_021721	CAT	2	6	2838550	2838555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515290
54727	NC_021721	CAA	2	6	2838716	2838721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515290
54728	NC_021721	CAAA	2	8	2838742	2838749	75 %	0 %	0 %	25 %	523515290
54729	NC_021721	CGG	2	6	2838882	2838887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515290
54730	NC_021721	A	6	6	2838888	2838893	100 %	0 %	0 %	0 %	523515290
54731	NC_021721	ATG	2	6	2838908	2838913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515290
54732	NC_021721	CTGTTC	2	12	2838914	2838925	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	523515290
54733	NC_021721	AGC	2	6	2838972	2838977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515290
54734	NC_021721	TCATCG	2	12	2839089	2839100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523515290
54735	NC_021721	TCG	2	6	2839172	2839177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515290
54736	NC_021721	TGA	2	6	2839219	2839224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515290
54737	NC_021721	CAA	2	6	2839291	2839296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515290
54738	NC_021721	TCA	2	6	2839330	2839335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515290
54739	NC_021721	TCA	2	6	2839395	2839400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515290
54740	NC_021721	AGTG	2	8	2839409	2839416	25 %	25 %	50 %	0 %	523515290
54741	NC_021721	GCT	2	6	2839419	2839424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515290
54742	NC_021721	GATA	2	8	2839485	2839492	50 %	25 %	25 %	0 %	523515291
54743	NC_021721	TC	3	6	2839506	2839511	0 %	50 %	0 %	50 %	523515291
54744	NC_021721	CTG	2	6	2839626	2839631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515291
54745	NC_021721	TCGG	2	8	2839646	2839653	0 %	25 %	50 %	25 %	523515291
54746	NC_021721	GTG	2	6	2839796	2839801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515291
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54752	NC_021721	TTC	2	6	2840164	2840169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515291
54753	NC_021721	GC	3	6	2840183	2840188	0 %	0 %	50 %	50 %	523515291
54754	NC_021721	ATCA	2	8	2840206	2840213	50 %	25 %	0 %	25 %	523515291
54755	NC_021721	GAT	2	6	2840295	2840300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515291
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54762	NC_021721	CCCA	2	8	2840726	2840733	25 %	0 %	0 %	75 %	523515291
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54791	NC_021721	GCT	2	6	2842136	2842141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515292
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54811	NC_021721	T	6	6	2843545	2843550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54849	NC_021721	CAAA	2	8	2845659	2845666	75 %	0 %	0 %	25 %	523515295
54850	NC_021721	AGCAA	2	10	2845739	2845748	60 %	0 %	20 %	20 %	523515295
54851	NC_021721	ATG	2	6	2845782	2845787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515295
54852	NC_021721	CTGA	2	8	2845835	2845842	25 %	25 %	25 %	25 %	523515296
54853	NC_021721	CAT	2	6	2845873	2845878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515296
54854	NC_021721	GGC	2	6	2845904	2845909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515296
54855	NC_021721	CTT	2	6	2845910	2845915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515296
54856	NC_021721	TTCG	2	8	2845919	2845926	0 %	50 %	25 %	25 %	523515296
54857	NC_021721	CTG	2	6	2845989	2845994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515296
54858	NC_021721	CTTGAT	2	12	2846066	2846077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523515296
54859	NC_021721	CAC	2	6	2846136	2846141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515296
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54862	NC_021721	AAGT	2	8	2846271	2846278	50 %	25 %	25 %	0 %	523515296
54863	NC_021721	AAG	2	6	2846289	2846294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515296
54864	NC_021721	GTA	2	6	2846301	2846306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515296
54865	NC_021721	ATG	2	6	2846307	2846312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515296
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54869	NC_021721	TGA	2	6	2846380	2846385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515296
54870	NC_021721	TTA	2	6	2846799	2846804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515296
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54874	NC_021721	GCA	2	6	2847120	2847125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515296
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54878	NC_021721	CCT	2	6	2847398	2847403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54879	NC_021721	TAG	2	6	2847405	2847410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54880	NC_021721	CAG	2	6	2847428	2847433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515297
54881	NC_021721	TTC	2	6	2847442	2847447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515297
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54889	NC_021721	CAA	3	9	2847722	2847730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515297
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54924	NC_021721	TGAT	2	8	2849401	2849408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54925	NC_021721	A	8	8	2849466	2849473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54926	NC_021721	AGGT	2	8	2849496	2849503	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54939	NC_021721	T	6	6	2850499	2850504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54940	NC_021721	GCT	2	6	2850507	2850512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54941	NC_021721	A	6	6	2850539	2850544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54942	NC_021721	TAA	2	6	2850643	2850648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54943	NC_021721	GC	3	6	2850730	2850735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54944	NC_021721	GCT	2	6	2850786	2850791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54951	NC_021721	ATG	2	6	2851150	2851155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
54952	NC_021721	TAG	2	6	2851160	2851165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
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54955	NC_021721	ATG	2	6	2851414	2851419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
54956	NC_021721	TGG	2	6	2851423	2851428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515302
54957	NC_021721	TGA	2	6	2851497	2851502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
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54959	NC_021721	GAT	2	6	2851729	2851734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
54960	NC_021721	ACCA	2	8	2851856	2851863	50 %	0 %	0 %	50 %	523515302
54961	NC_021721	TGA	2	6	2851884	2851889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
54962	NC_021721	CGC	2	6	2851926	2851931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515302
54963	NC_021721	ATG	2	6	2851942	2851947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
54964	NC_021721	TCC	2	6	2852005	2852010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515302
54965	NC_021721	CAATG	2	10	2852138	2852147	40 %	20 %	20 %	20 %	523515302
54966	NC_021721	TCT	2	6	2852261	2852266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515302
54967	NC_021721	GCAA	2	8	2852288	2852295	50 %	0 %	25 %	25 %	523515302
54968	NC_021721	GAC	2	6	2852341	2852346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515302
54969	NC_021721	GAT	2	6	2852377	2852382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515302
54970	NC_021721	CAA	2	6	2852400	2852405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515302
54971	NC_021721	GTG	2	6	2852492	2852497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515302
54972	NC_021721	CAC	2	6	2852633	2852638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54973	NC_021721	CAC	2	6	2852673	2852678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54974	NC_021721	GTA	2	6	2852765	2852770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54976	NC_021721	CCCAA	2	10	2852812	2852821	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54977	NC_021721	CTC	2	6	2852836	2852841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54981	NC_021721	TGC	2	6	2853241	2853246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515303
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54994	NC_021721	CCAC	2	8	2853983	2853990	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54995	NC_021721	CCCAA	2	10	2854005	2854014	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54996	NC_021721	CTC	2	6	2854029	2854034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54998	NC_021721	CTTT	2	8	2854181	2854188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54999	NC_021721	CAC	2	6	2854377	2854382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515304
55000	NC_021721	GC	3	6	2854442	2854447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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