MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 60036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_021721	GTTC	2	8	2664874	2664881	0 %	50 %	25 %	25 %	523515143
51502	NC_021721	GTTT	2	8	2664885	2664892	0 %	75 %	25 %	0 %	523515143
51503	NC_021721	CAT	2	6	2664910	2664915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515143
51504	NC_021721	ATCA	2	8	2664947	2664954	50 %	25 %	0 %	25 %	523515143
51505	NC_021721	CCT	2	6	2665054	2665059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51506	NC_021721	CGCT	2	8	2665068	2665075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51507	NC_021721	CTT	3	9	2665246	2665254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515144
51508	NC_021721	CAC	2	6	2665320	2665325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515144
51509	NC_021721	GCC	2	6	2665366	2665371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515144
51510	NC_021721	ACA	2	6	2665382	2665387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515144
51511	NC_021721	AGAC	2	8	2665447	2665454	50 %	0 %	25 %	25 %	523515144
51512	NC_021721	CTT	2	6	2665489	2665494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515144
51513	NC_021721	CTT	3	9	2665561	2665569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515144
51514	NC_021721	TGT	2	6	2665572	2665577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515144
51515	NC_021721	TAG	2	6	2665650	2665655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515144
51516	NC_021721	TCCT	2	8	2665668	2665675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51517	NC_021721	CAT	2	6	2665683	2665688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51518	NC_021721	CA	3	6	2665699	2665704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51519	NC_021721	T	6	6	2665718	2665723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51520	NC_021721	A	7	7	2665729	2665735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51521	NC_021721	AACGGC	2	12	2665746	2665757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51522	NC_021721	A	6	6	2665800	2665805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51523	NC_021721	AAAG	2	8	2665852	2665859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51524	NC_021721	CG	3	6	2665872	2665877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51525	NC_021721	GAG	2	6	2665948	2665953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51526	NC_021721	ACC	2	6	2666049	2666054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51527	NC_021721	CGC	2	6	2666087	2666092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51528	NC_021721	GTG	2	6	2666173	2666178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51529	NC_021721	GTT	2	6	2666217	2666222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51530	NC_021721	AGA	2	6	2666322	2666327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51531	NC_021721	ACT	2	6	2666341	2666346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51532	NC_021721	GCC	2	6	2666404	2666409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515145
51533	NC_021721	TGC	2	6	2666422	2666427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51534	NC_021721	GCG	2	6	2666504	2666509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515145
51535	NC_021721	ATT	2	6	2666540	2666545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515145
51536	NC_021721	CAG	2	6	2666812	2666817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51537	NC_021721	CTT	2	6	2666825	2666830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51538	NC_021721	GCT	3	9	2666878	2666886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51539	NC_021721	GC	3	6	2666902	2666907	0 %	0 %	50 %	50 %	523515145
51540	NC_021721	AGT	3	9	2666998	2667006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515145
51541	NC_021721	CATTGC	2	12	2667076	2667087	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523515145
51542	NC_021721	ATC	2	6	2667242	2667247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51543	NC_021721	GTG	2	6	2667265	2667270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515145
51544	NC_021721	CAG	2	6	2667284	2667289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51545	NC_021721	GATCAT	2	12	2667307	2667318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523515145
51546	NC_021721	TGGT	2	8	2667339	2667346	0 %	50 %	50 %	0 %	523515145
51547	NC_021721	GTT	2	6	2667351	2667356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515145
51548	NC_021721	ACGATA	2	12	2667392	2667403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523515145
51549	NC_021721	ATC	2	6	2667449	2667454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51550	NC_021721	CTT	2	6	2667470	2667475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51551	NC_021721	CTT	2	6	2667497	2667502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51552	NC_021721	TCAGCT	2	12	2667517	2667528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523515145
51553	NC_021721	CGC	2	6	2667601	2667606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515145
51554	NC_021721	TGAG	2	8	2667721	2667728	25 %	25 %	50 %	0 %	523515145
51555	NC_021721	GCT	2	6	2667737	2667742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51556	NC_021721	TGC	2	6	2667743	2667748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51557	NC_021721	TTG	2	6	2667801	2667806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515145
51558	NC_021721	CAT	2	6	2667868	2667873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51559	NC_021721	TCT	2	6	2667877	2667882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51560	NC_021721	ATC	2	6	2667923	2667928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51561	NC_021721	GTG	2	6	2668092	2668097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515145
51562	NC_021721	GCA	2	6	2668147	2668152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51563	NC_021721	GTT	2	6	2668231	2668236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515145
51564	NC_021721	CTG	2	6	2668257	2668262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51565	NC_021721	CGTTTG	2	12	2668265	2668276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	523515145
51566	NC_021721	GGC	2	6	2668326	2668331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515145
51567	NC_021721	ATA	2	6	2668352	2668357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515145
51568	NC_021721	TGTC	2	8	2668402	2668409	0 %	50 %	25 %	25 %	523515145
51569	NC_021721	CGTA	2	8	2668453	2668460	25 %	25 %	25 %	25 %	523515145
51570	NC_021721	CGG	2	6	2668515	2668520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515145
51571	NC_021721	TCA	2	6	2668557	2668562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51572	NC_021721	TAG	2	6	2668702	2668707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515145
51573	NC_021721	CAG	2	6	2668978	2668983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51574	NC_021721	GCG	2	6	2669077	2669082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515145
51575	NC_021721	TTG	2	6	2669154	2669159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515145
51576	NC_021721	CTT	2	6	2669204	2669209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51577	NC_021721	ATC	2	6	2669222	2669227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51578	NC_021721	CTT	2	6	2669228	2669233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51579	NC_021721	TTA	2	6	2669289	2669294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515145
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51582	NC_021721	GTC	2	6	2669442	2669447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51583	NC_021721	TCTG	2	8	2669628	2669635	0 %	50 %	25 %	25 %	523515145
51584	NC_021721	CTG	2	6	2669713	2669718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51585	NC_021721	TAAAT	2	10	2669720	2669729	60 %	40 %	0 %	0 %	523515145
51586	NC_021721	TGACC	2	10	2669737	2669746	20 %	20 %	20 %	40 %	523515145
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51588	NC_021721	TCG	2	6	2669887	2669892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51589	NC_021721	TGGC	2	8	2670131	2670138	0 %	25 %	50 %	25 %	523515145
51590	NC_021721	CTGC	2	8	2670169	2670176	0 %	25 %	25 %	50 %	523515145
51591	NC_021721	TCT	2	6	2670202	2670207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
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51594	NC_021721	TTG	2	6	2670316	2670321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515145
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51600	NC_021721	GCC	2	6	2671046	2671051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515145
51601	NC_021721	TGG	2	6	2671102	2671107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515145
51602	NC_021721	ATT	2	6	2671130	2671135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515145
51603	NC_021721	ATC	2	6	2671223	2671228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51604	NC_021721	CTT	2	6	2671231	2671236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51605	NC_021721	GATCG	2	10	2671244	2671253	20 %	20 %	40 %	20 %	523515145
51606	NC_021721	TGG	2	6	2671285	2671290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515145
51607	NC_021721	TCGGT	2	10	2671504	2671513	0 %	40 %	40 %	20 %	523515145
51608	NC_021721	TTG	2	6	2671530	2671535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515145
51609	NC_021721	GC	3	6	2671569	2671574	0 %	0 %	50 %	50 %	523515145
51610	NC_021721	AAC	2	6	2671586	2671591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515145
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51612	NC_021721	TTG	2	6	2671634	2671639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515145
51613	NC_021721	GTTG	2	8	2671679	2671686	0 %	50 %	50 %	0 %	523515145
51614	NC_021721	TGCTG	2	10	2671698	2671707	0 %	40 %	40 %	20 %	523515145
51615	NC_021721	TGA	2	6	2671730	2671735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515145
51616	NC_021721	ATA	2	6	2671751	2671756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515145
51617	NC_021721	TTTC	2	8	2671771	2671778	0 %	75 %	0 %	25 %	523515145
51618	NC_021721	AGA	2	6	2671787	2671792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515145
51619	NC_021721	TTC	2	6	2671992	2671997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51620	NC_021721	CTT	2	6	2672017	2672022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51621	NC_021721	TGGTGT	2	12	2672024	2672035	0 %	50 %	50 %	0 %	523515145
51622	NC_021721	ACT	3	9	2672036	2672044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51623	NC_021721	TCA	3	9	2672061	2672069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51624	NC_021721	TGG	2	6	2672072	2672077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515145
51625	NC_021721	AGA	2	6	2672086	2672091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515145
51626	NC_021721	ATT	2	6	2672102	2672107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515145
51627	NC_021721	GAC	2	6	2672228	2672233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51628	NC_021721	CGT	2	6	2672422	2672427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515145
51629	NC_021721	TTC	2	6	2672535	2672540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
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51631	NC_021721	TTC	2	6	2672667	2672672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515145
51632	NC_021721	GT	3	6	2672713	2672718	0 %	50 %	50 %	0 %	523515145
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51637	NC_021721	ATT	2	6	2673062	2673067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515145
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51647	NC_021721	GCC	3	9	2673854	2673862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515145
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51649	NC_021721	TAC	2	6	2674129	2674134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515145
51650	NC_021721	CTGCCG	3	18	2674140	2674157	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	523515145
51651	NC_021721	AGT	2	6	2674191	2674196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515145
51652	NC_021721	CT	3	6	2674568	2674573	0 %	50 %	0 %	50 %	523515145
51653	NC_021721	TCC	2	6	2674588	2674593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51654	NC_021721	AT	4	8	2674730	2674737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51655	NC_021721	GTG	2	6	2674762	2674767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51656	NC_021721	A	6	6	2674810	2674815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51657	NC_021721	TTA	2	6	2674833	2674838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51658	NC_021721	T	6	6	2674881	2674886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51659	NC_021721	ATC	2	6	2674895	2674900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51660	NC_021721	AAG	2	6	2674917	2674922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51661	NC_021721	ATGCT	2	10	2674959	2674968	20 %	40 %	20 %	20 %	523515146
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51663	NC_021721	ATC	2	6	2675108	2675113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515146
51664	NC_021721	CTTT	2	8	2675148	2675155	0 %	75 %	0 %	25 %	523515146
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51673	NC_021721	TCGCAG	2	12	2675464	2675475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51674	NC_021721	A	6	6	2675571	2675576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51675	NC_021721	GCG	2	6	2675577	2675582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51676	NC_021721	CGC	2	6	2675605	2675610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51677	NC_021721	TTC	2	6	2675747	2675752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515147
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51680	NC_021721	GGCC	2	8	2675946	2675953	0 %	0 %	50 %	50 %	523515147
51681	NC_021721	ACC	2	6	2676218	2676223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515147
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51683	NC_021721	GCA	2	6	2676534	2676539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515147
51684	NC_021721	ATC	2	6	2676678	2676683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515147
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51686	NC_021721	TCATT	2	10	2676799	2676808	20 %	60 %	0 %	20 %	523515147
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51690	NC_021721	CAT	2	6	2677118	2677123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515147
51691	NC_021721	GTT	2	6	2677133	2677138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515147
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51700	NC_021721	TTCA	2	8	2677565	2677572	25 %	50 %	0 %	25 %	523515147
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51702	NC_021721	GTA	2	6	2677802	2677807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515147
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51721	NC_021721	GGTC	2	8	2679140	2679147	0 %	25 %	50 %	25 %	523515147
51722	NC_021721	T	6	6	2679215	2679220	0 %	100 %	0 %	0 %	523515147
51723	NC_021721	ATCA	2	8	2679296	2679303	50 %	25 %	0 %	25 %	523515147
51724	NC_021721	CCT	2	6	2679313	2679318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515148
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51727	NC_021721	CTT	2	6	2679383	2679388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515148
51728	NC_021721	TTC	2	6	2679389	2679394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515148
51729	NC_021721	CTG	2	6	2679395	2679400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515148
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51731	NC_021721	TCG	3	9	2679444	2679452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515148
51732	NC_021721	T	6	6	2679476	2679481	0 %	100 %	0 %	0 %	523515148
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51734	NC_021721	ACC	2	6	2679728	2679733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515148
51735	NC_021721	GTA	2	6	2679815	2679820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515148
51736	NC_021721	AGAC	2	8	2679877	2679884	50 %	0 %	25 %	25 %	523515148
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51739	NC_021721	CAT	2	6	2680202	2680207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515148
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51838	NC_021721	GAC	2	6	2685282	2685287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515149
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51840	NC_021721	TCT	2	6	2685315	2685320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515149
51841	NC_021721	TGC	2	6	2685376	2685381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515149
51842	NC_021721	CAAGC	2	10	2685403	2685412	40 %	0 %	20 %	40 %	523515149
51843	NC_021721	CAT	2	6	2685579	2685584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515149
51844	NC_021721	ATG	3	9	2685676	2685684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515149
51845	NC_021721	T	6	6	2685766	2685771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51846	NC_021721	TGA	2	6	2685778	2685783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51847	NC_021721	GGCG	2	8	2685921	2685928	0 %	0 %	75 %	25 %	523515150
51848	NC_021721	ATC	2	6	2686027	2686032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515150
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51976	NC_021721	GTCTT	2	10	2693239	2693248	0 %	60 %	20 %	20 %	523515152
51977	NC_021721	GCA	2	6	2693344	2693349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515152
51978	NC_021721	GGC	2	6	2693400	2693405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515152
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51981	NC_021721	TTG	2	6	2693647	2693652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515152
51982	NC_021721	CAT	2	6	2694021	2694026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515152
51983	NC_021721	CCGG	2	8	2694027	2694034	0 %	0 %	50 %	50 %	523515152
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51989	NC_021721	TGA	3	9	2694271	2694279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51991	NC_021721	GC	3	6	2694401	2694406	0 %	0 %	50 %	50 %	523515153
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51998	NC_021721	TGC	2	6	2694797	2694802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515153
51999	NC_021721	CTT	2	6	2694807	2694812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515153
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