MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 1477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021519	TAA	2	6	47766	47771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844375
1002	NC_021519	TG	3	6	47799	47804	0 %	50 %	50 %	0 %	513844375
1003	NC_021519	TAAA	2	8	47813	47820	75 %	25 %	0 %	0 %	513844375
1004	NC_021519	ATT	2	6	47894	47899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844375
1005	NC_021519	ATTGTG	2	12	47938	47949	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	513844375
1006	NC_021519	TAA	2	6	47970	47975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844375
1007	NC_021519	TGGCA	2	10	48004	48013	20 %	20 %	40 %	20 %	513844375
1008	NC_021519	ATT	2	6	48025	48030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844375
1009	NC_021519	TAG	2	6	48084	48089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844375
1010	NC_021519	CAAAG	2	10	48126	48135	60 %	0 %	20 %	20 %	513844375
1011	NC_021519	ATC	2	6	48169	48174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844376
1012	NC_021519	GGT	2	6	48214	48219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844376
1013	NC_021519	TTA	2	6	48286	48291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844376
1014	NC_021519	AAG	2	6	48292	48297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844376
1015	NC_021519	CGT	2	6	48318	48323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844376
1016	NC_021519	GGC	2	6	48324	48329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844376
1017	NC_021519	GGC	2	6	48345	48350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844376
1018	NC_021519	TA	3	6	48455	48460	50 %	50 %	0 %	0 %	513844376
1019	NC_021519	TGG	2	6	48644	48649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844376
1020	NC_021519	ATG	2	6	48722	48727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844376
1021	NC_021519	AGC	2	6	48734	48739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844376
1022	NC_021519	AGAA	2	8	48786	48793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021519	TAAAAA	2	12	48816	48827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021519	AACAT	2	10	48844	48853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_021519	TGG	2	6	48873	48878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021519	TAA	2	6	48978	48983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021519	AGTATT	2	12	49086	49097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021519	TTA	2	6	49104	49109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021519	AAG	2	6	49110	49115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021519	TG	3	6	49212	49217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021519	A	6	6	49224	49229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021519	AAG	2	6	49289	49294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021519	TAC	2	6	49332	49337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021519	CAG	2	6	49345	49350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021519	T	6	6	49468	49473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021519	GTTA	2	8	49474	49481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021519	CTGA	2	8	49495	49502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_021519	TAG	2	6	49508	49513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021519	AAC	2	6	49525	49530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_021519	GTT	2	6	49541	49546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021519	T	6	6	49550	49555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021519	AGG	2	6	49583	49588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021519	CAA	2	6	49618	49623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844377
1044	NC_021519	GTG	2	6	49624	49629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844377
1045	NC_021519	CAC	2	6	49674	49679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844377
1046	NC_021519	TCAG	2	8	49695	49702	25 %	25 %	25 %	25 %	513844377
1047	NC_021519	CAAT	2	8	49711	49718	50 %	25 %	0 %	25 %	513844377
1048	NC_021519	GAA	3	9	49918	49926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844377
1049	NC_021519	TGA	2	6	49971	49976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844377
1050	NC_021519	A	7	7	50004	50010	100 %	0 %	0 %	0 %	513844377
1051	NC_021519	GAA	2	6	50041	50046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844377
1052	NC_021519	A	6	6	50157	50162	100 %	0 %	0 %	0 %	513844377
1053	NC_021519	GAA	2	6	50200	50205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844377
1054	NC_021519	AGA	2	6	50244	50249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844377
1055	NC_021519	CAA	2	6	50320	50325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844377
1056	NC_021519	AAT	2	6	50341	50346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844377
1057	NC_021519	TCAA	2	8	50363	50370	50 %	25 %	0 %	25 %	513844377
1058	NC_021519	GCC	2	6	50380	50385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844377
1059	NC_021519	TTA	2	6	50470	50475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844377
1060	NC_021519	AAGAT	2	10	50483	50492	60 %	20 %	20 %	0 %	513844377
1061	NC_021519	ATG	2	6	50553	50558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844377
1062	NC_021519	AAC	2	6	50659	50664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844378
1063	NC_021519	ACG	2	6	50679	50684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844378
1064	NC_021519	CAA	2	6	50848	50853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844379
1065	NC_021519	GTT	2	6	50856	50861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844379
1066	NC_021519	TGAT	2	8	50879	50886	25 %	50 %	25 %	0 %	513844379
1067	NC_021519	ATT	2	6	50906	50911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844379
1068	NC_021519	GGT	2	6	50914	50919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844379
1069	NC_021519	ACCC	2	8	50944	50951	25 %	0 %	0 %	75 %	513844379
1070	NC_021519	TTA	2	6	51010	51015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844380
1071	NC_021519	GTG	2	6	51042	51047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844380
1072	NC_021519	ATG	2	6	51091	51096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844380
1073	NC_021519	CGG	2	6	51183	51188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844380
1074	NC_021519	CGT	2	6	51194	51199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844380
1075	NC_021519	A	7	7	51230	51236	100 %	0 %	0 %	0 %	513844380
1076	NC_021519	GGA	2	6	51269	51274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513844380
1077	NC_021519	TGG	2	6	51296	51301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844381
1078	NC_021519	TTAGT	2	10	51318	51327	20 %	60 %	20 %	0 %	513844381
1079	NC_021519	GTCGA	2	10	51385	51394	20 %	20 %	40 %	20 %	513844381
1080	NC_021519	CGA	2	6	51396	51401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844381
1081	NC_021519	GTT	2	6	51451	51456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844381
1082	NC_021519	TCAG	2	8	51531	51538	25 %	25 %	25 %	25 %	513844381
1083	NC_021519	TTG	2	6	51689	51694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021519	ATG	2	6	51725	51730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844382
1085	NC_021519	A	6	6	51731	51736	100 %	0 %	0 %	0 %	513844382
1086	NC_021519	TAT	2	6	51790	51795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844382
1087	NC_021519	CGG	2	6	51817	51822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844382
1088	NC_021519	ATT	2	6	51827	51832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844382
1089	NC_021519	ATG	2	6	51867	51872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844382
1090	NC_021519	GTG	2	6	51903	51908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844382
1091	NC_021519	ATA	2	6	51909	51914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844382
1092	NC_021519	GC	3	6	51915	51920	0 %	0 %	50 %	50 %	513844382
1093	NC_021519	CAA	2	6	51959	51964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844382
1094	NC_021519	CAC	2	6	52006	52011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844382
1095	NC_021519	GGT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844382
1096	NC_021519	GGTT	2	8	52155	52162	0 %	50 %	50 %	0 %	513844382
1097	NC_021519	AGAC	2	8	52241	52248	50 %	0 %	25 %	25 %	513844382
1098	NC_021519	ATG	2	6	52296	52301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844382
1099	NC_021519	CAA	2	6	52334	52339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844382
1100	NC_021519	AAAATT	2	12	52343	52354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844382
1101	NC_021519	CAA	2	6	52487	52492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844382
1102	NC_021519	A	6	6	52570	52575	100 %	0 %	0 %	0 %	513844382
1103	NC_021519	GGT	2	6	52654	52659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021519	TGG	2	6	52664	52669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021519	TGG	2	6	52686	52691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021519	TGG	2	6	52697	52702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021519	A	6	6	52713	52718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021519	TGGC	2	8	52763	52770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_021519	CTT	2	6	52812	52817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021519	GAG	2	6	52904	52909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021519	GATAAA	2	12	52967	52978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	513844383
1112	NC_021519	ATT	2	6	53036	53041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844383
1113	NC_021519	GTG	2	6	53048	53053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844383
1114	NC_021519	TGA	2	6	53121	53126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844383
1115	NC_021519	GAC	2	6	53188	53193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844383
1116	NC_021519	ATT	2	6	53208	53213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844383
1117	NC_021519	TAG	2	6	53261	53266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844384
1118	NC_021519	AAAAT	2	10	53383	53392	80 %	20 %	0 %	0 %	513844384
1119	NC_021519	TCA	3	9	53401	53409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844384
1120	NC_021519	GGGT	2	8	53612	53619	0 %	25 %	75 %	0 %	513844384
1121	NC_021519	CAA	2	6	53658	53663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844384
1122	NC_021519	GAT	2	6	53672	53677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844384
1123	NC_021519	ACA	2	6	53708	53713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844384
1124	NC_021519	GGGA	2	8	53722	53729	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021519	A	8	8	53765	53772	100 %	0 %	0 %	0 %	513844385
1126	NC_021519	GAA	2	6	53876	53881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844385
1127	NC_021519	ACA	2	6	53911	53916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844385
1128	NC_021519	AGA	2	6	53926	53931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844385
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1130	NC_021519	GAAA	2	8	54091	54098	75 %	0 %	25 %	0 %	513844385
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