MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 59860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_021514	TAAG	2	8	2448984	2448991	50 %	25 %	25 %	0 %	513842137
48003	NC_021514	CAA	2	6	2449001	2449006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842137
48004	NC_021514	TAT	2	6	2449021	2449026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842137
48005	NC_021514	GTG	2	6	2449056	2449061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842137
48006	NC_021514	CGA	2	6	2449120	2449125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842137
48007	NC_021514	AAC	2	6	2449266	2449271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842137
48008	NC_021514	GCCAA	2	10	2449365	2449374	40 %	0 %	20 %	40 %	513842137
48009	NC_021514	ATT	2	6	2449421	2449426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842137
48010	NC_021514	CATC	2	8	2449428	2449435	25 %	25 %	0 %	50 %	513842137
48011	NC_021514	GCC	2	6	2449475	2449480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842137
48012	NC_021514	CAA	2	6	2449664	2449669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842137
48013	NC_021514	TGA	2	6	2449729	2449734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842137
48014	NC_021514	CAT	2	6	2449754	2449759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842137
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48017	NC_021514	CA	3	6	2449922	2449927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48018	NC_021514	ATTT	2	8	2450008	2450015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48020	NC_021514	AAAC	2	8	2450124	2450131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48021	NC_021514	CAA	3	9	2450191	2450199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842138
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48023	NC_021514	ACTC	2	8	2450320	2450327	25 %	25 %	0 %	50 %	513842138
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48027	NC_021514	CAAG	2	8	2450482	2450489	50 %	0 %	25 %	25 %	513842138
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48049	NC_021514	CCGC	2	8	2451466	2451473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48050	NC_021514	CT	5	10	2451479	2451488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48051	NC_021514	T	6	6	2451488	2451493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48052	NC_021514	GCT	2	6	2451596	2451601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842139
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48085	NC_021514	TAT	3	9	2452827	2452835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48106	NC_021514	CCT	2	6	2453757	2453762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48107	NC_021514	AATA	2	8	2453834	2453841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48108	NC_021514	TAT	2	6	2453876	2453881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48109	NC_021514	AATTA	2	10	2453889	2453898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48110	NC_021514	ATG	2	6	2453904	2453909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48115	NC_021514	CA	3	6	2454272	2454277	50 %	0 %	0 %	50 %	513842141
48116	NC_021514	A	8	8	2454432	2454439	100 %	0 %	0 %	0 %	513842141
48117	NC_021514	ATA	2	6	2454523	2454528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842141
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48119	NC_021514	AATT	2	8	2454628	2454635	50 %	50 %	0 %	0 %	513842141
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48123	NC_021514	ATT	2	6	2454806	2454811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48236	NC_021514	AAT	2	6	2460487	2460492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842145
48237	NC_021514	A	8	8	2460510	2460517	100 %	0 %	0 %	0 %	513842145
48238	NC_021514	ACG	2	6	2460528	2460533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842145
48239	NC_021514	CGA	2	6	2460577	2460582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842145
48240	NC_021514	ATC	2	6	2460647	2460652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842145
48241	NC_021514	CGT	2	6	2460683	2460688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842145
48242	NC_021514	CCG	2	6	2460807	2460812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842146
48243	NC_021514	CAT	2	6	2460829	2460834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842146
48244	NC_021514	ATA	2	6	2460854	2460859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842146
48245	NC_021514	TTG	2	6	2460884	2460889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842146
48246	NC_021514	TTGAT	2	10	2461035	2461044	20 %	60 %	20 %	0 %	513842146
48247	NC_021514	CAA	2	6	2461045	2461050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842146
48248	NC_021514	TCA	2	6	2461101	2461106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842146
48249	NC_021514	TTAAT	2	10	2461111	2461120	40 %	60 %	0 %	0 %	513842146
48250	NC_021514	TGG	2	6	2461128	2461133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842146
48251	NC_021514	T	8	8	2461213	2461220	0 %	100 %	0 %	0 %	513842146
48252	NC_021514	GTC	2	6	2461247	2461252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842146
48253	NC_021514	TTG	2	6	2461259	2461264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842146
48254	NC_021514	GTT	2	6	2461324	2461329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842146
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48256	NC_021514	A	8	8	2461466	2461473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48257	NC_021514	A	7	7	2461592	2461598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48258	NC_021514	TTA	2	6	2461599	2461604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48259	NC_021514	A	6	6	2461638	2461643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48260	NC_021514	CGT	2	6	2461647	2461652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48261	NC_021514	GAC	2	6	2461653	2461658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48262	NC_021514	GAC	2	6	2461716	2461721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842147
48263	NC_021514	ATA	2	6	2461753	2461758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842147
48264	NC_021514	GA	3	6	2461789	2461794	50 %	0 %	50 %	0 %	513842147
48265	NC_021514	ATCTT	2	10	2461798	2461807	20 %	60 %	0 %	20 %	513842147
48266	NC_021514	TTG	2	6	2461872	2461877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842147
48267	NC_021514	TTC	2	6	2461881	2461886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842147
48268	NC_021514	CAC	2	6	2461988	2461993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842147
48269	NC_021514	AAT	2	6	2462037	2462042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842147
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48272	NC_021514	GCCA	2	8	2462221	2462228	25 %	0 %	25 %	50 %	513842147
48273	NC_021514	GC	3	6	2462263	2462268	0 %	0 %	50 %	50 %	513842148
48274	NC_021514	ATC	2	6	2462279	2462284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842148
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48288	NC_021514	GTTC	2	8	2463062	2463069	0 %	50 %	25 %	25 %	513842148
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48299	NC_021514	GCA	2	6	2464001	2464006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842148
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48302	NC_021514	CTG	3	9	2464132	2464140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842148
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48309	NC_021514	AAC	2	6	2464307	2464312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842148
48310	NC_021514	AT	3	6	2464401	2464406	50 %	50 %	0 %	0 %	513842148
48311	NC_021514	GTT	2	6	2464418	2464423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842148
48312	NC_021514	ATTG	2	8	2464453	2464460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48313	NC_021514	TA	4	8	2464497	2464504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48314	NC_021514	T	6	6	2464630	2464635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48315	NC_021514	AATC	2	8	2464655	2464662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48316	NC_021514	AACC	2	8	2464676	2464683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48317	NC_021514	GCTT	2	8	2464692	2464699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48318	NC_021514	GTT	2	6	2464765	2464770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48319	NC_021514	GCG	2	6	2464809	2464814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48320	NC_021514	GGA	2	6	2464861	2464866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48321	NC_021514	GA	3	6	2464865	2464870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48322	NC_021514	A	6	6	2464881	2464886	100 %	0 %	0 %	0 %	513842149
48323	NC_021514	AAT	2	6	2464894	2464899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842149
48324	NC_021514	TTG	3	9	2464907	2464915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842149
48325	NC_021514	AC	3	6	2464950	2464955	50 %	0 %	0 %	50 %	513842149
48326	NC_021514	ATC	2	6	2465076	2465081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842149
48327	NC_021514	AACGTT	2	12	2465128	2465139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	513842149
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48329	NC_021514	CAC	2	6	2465287	2465292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842149
48330	NC_021514	CCACA	2	10	2465358	2465367	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
48331	NC_021514	TG	3	6	2465382	2465387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48332	NC_021514	GTG	2	6	2465391	2465396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48333	NC_021514	T	8	8	2465397	2465404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48334	NC_021514	GCTT	2	8	2465427	2465434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48335	NC_021514	CT	3	6	2465447	2465452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48336	NC_021514	AATTA	2	10	2465455	2465464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48337	NC_021514	GGA	2	6	2465480	2465485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48338	NC_021514	CGC	2	6	2465519	2465524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842150
48339	NC_021514	CTG	2	6	2465536	2465541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842150
48340	NC_021514	CGC	2	6	2465594	2465599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842150
48341	NC_021514	AC	3	6	2465600	2465605	50 %	0 %	0 %	50 %	513842150
48342	NC_021514	CAA	2	6	2465645	2465650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842150
48343	NC_021514	ATT	2	6	2465655	2465660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842150
48344	NC_021514	TGCAAT	2	12	2465681	2465692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	513842150
48345	NC_021514	ATC	2	6	2465713	2465718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842150
48346	NC_021514	AAGG	2	8	2465736	2465743	50 %	0 %	50 %	0 %	513842150
48347	NC_021514	CAA	3	9	2465826	2465834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842150
48348	NC_021514	ATT	2	6	2465859	2465864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842150
48349	NC_021514	CAG	2	6	2466033	2466038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842151
48350	NC_021514	TCA	2	6	2466053	2466058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842151
48351	NC_021514	TAGTGA	2	12	2466095	2466106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842151
48352	NC_021514	GGC	2	6	2466200	2466205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513842151
48353	NC_021514	GCC	2	6	2466231	2466236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842151
48354	NC_021514	AC	3	6	2466241	2466246	50 %	0 %	0 %	50 %	513842151
48355	NC_021514	ACA	2	6	2466275	2466280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842151
48356	NC_021514	AACG	2	8	2466369	2466376	50 %	0 %	25 %	25 %	513842151
48357	NC_021514	TGG	2	6	2466565	2466570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842151
48358	NC_021514	CAC	2	6	2466623	2466628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842151
48359	NC_021514	ACC	2	6	2466727	2466732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842151
48360	NC_021514	ACG	2	6	2466825	2466830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842151
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48362	NC_021514	AAC	2	6	2466910	2466915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842151
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48365	NC_021514	CTT	2	6	2467021	2467026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48383	NC_021514	ATA	2	6	2468217	2468222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48384	NC_021514	GGC	2	6	2468254	2468259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48385	NC_021514	AAT	2	6	2468321	2468326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48386	NC_021514	AT	3	6	2468473	2468478	50 %	50 %	0 %	0 %	513842153
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48390	NC_021514	AACTC	2	10	2468554	2468563	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48391	NC_021514	TAG	2	6	2468605	2468610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48394	NC_021514	ATT	3	9	2468667	2468675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48396	NC_021514	AAC	2	6	2468720	2468725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48397	NC_021514	T	6	6	2468743	2468748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48401	NC_021514	TTAA	2	8	2468861	2468868	50 %	50 %	0 %	0 %	513842154
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48429	NC_021514	ACTAA	2	10	2470125	2470134	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48430	NC_021514	ATG	2	6	2470171	2470176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48431	NC_021514	CTG	2	6	2470189	2470194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48432	NC_021514	ACCA	2	8	2470264	2470271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48433	NC_021514	CAA	2	6	2470274	2470279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48435	NC_021514	CCTC	2	8	2470326	2470333	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48436	NC_021514	AAT	2	6	2470368	2470373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48437	NC_021514	TTA	2	6	2470410	2470415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48439	NC_021514	TAGAA	2	10	2470528	2470537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48440	NC_021514	GAAC	2	8	2470684	2470691	50 %	0 %	25 %	25 %	513842155
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48443	NC_021514	ATC	2	6	2470761	2470766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842155
48444	NC_021514	ATG	2	6	2470799	2470804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842155
48445	NC_021514	TCA	2	6	2470845	2470850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842155
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48458	NC_021514	ACT	2	6	2471427	2471432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842155
48459	NC_021514	CAA	2	6	2471456	2471461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842155
48460	NC_021514	A	6	6	2471466	2471471	100 %	0 %	0 %	0 %	513842155
48461	NC_021514	T	6	6	2471512	2471517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48462	NC_021514	CCAAC	2	10	2471535	2471544	40 %	0 %	0 %	60 %	513842156
48463	NC_021514	CCG	2	6	2471589	2471594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842156
48464	NC_021514	TG	3	6	2471627	2471632	0 %	50 %	50 %	0 %	513842156
48465	NC_021514	CCA	2	6	2471639	2471644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842156
48466	NC_021514	TAA	2	6	2471860	2471865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842156
48467	NC_021514	ATT	2	6	2471914	2471919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842156
48468	NC_021514	CAC	2	6	2471931	2471936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842156
48469	NC_021514	CGATTG	2	12	2471946	2471957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	513842156
48470	NC_021514	TCA	3	9	2472039	2472047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842156
48471	NC_021514	CAAC	3	12	2472064	2472075	50 %	0 %	0 %	50 %	513842156
48472	NC_021514	AAT	2	6	2472130	2472135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842156
48473	NC_021514	CTTC	2	8	2472144	2472151	0 %	50 %	0 %	50 %	513842156
48474	NC_021514	ACC	2	6	2472160	2472165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842156
48475	NC_021514	TTG	3	9	2472175	2472183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842156
48476	NC_021514	GCA	2	6	2472392	2472397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842156
48477	NC_021514	ACC	2	6	2472455	2472460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842156
48478	NC_021514	ATGG	2	8	2472495	2472502	25 %	25 %	50 %	0 %	513842156
48479	NC_021514	AATG	2	8	2472580	2472587	50 %	25 %	25 %	0 %	513842156
48480	NC_021514	CGA	2	6	2472682	2472687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842156
48481	NC_021514	ATA	2	6	2472716	2472721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842156
48482	NC_021514	AACG	2	8	2472748	2472755	50 %	0 %	25 %	25 %	513842156
48483	NC_021514	GAC	2	6	2472784	2472789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842156
48484	NC_021514	TCA	2	6	2472792	2472797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842156
48485	NC_021514	AAG	2	6	2472848	2472853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842156
48486	NC_021514	AAT	2	6	2472856	2472861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842156
48487	NC_021514	C	6	6	2472946	2472951	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48488	NC_021514	GGC	2	6	2472975	2472980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48489	NC_021514	TCA	2	6	2473024	2473029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48490	NC_021514	ATCA	2	8	2473130	2473137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48491	NC_021514	GAT	2	6	2473210	2473215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842157
48492	NC_021514	CAT	2	6	2473282	2473287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842157
48493	NC_021514	TCA	2	6	2473311	2473316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842157
48494	NC_021514	GCAA	2	8	2473356	2473363	50 %	0 %	25 %	25 %	513842157
48495	NC_021514	ATG	2	6	2473416	2473421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842157
48496	NC_021514	TCA	2	6	2473423	2473428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842157
48497	NC_021514	ACC	3	9	2473433	2473441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842157
48498	NC_021514	CGG	2	6	2473445	2473450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513842157
48499	NC_021514	TTC	2	6	2473541	2473546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842157
48500	NC_021514	ATG	2	6	2473569	2473574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842157

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